MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 45446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022665	TAT	2	6	23804	23809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587625
502	NC_022665	GCT	2	6	23826	23831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587625
503	NC_022665	AGA	2	6	23849	23854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587625
504	NC_022665	AAC	2	6	23905	23910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587625
505	NC_022665	GTG	2	6	23986	23991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587625
506	NC_022665	TGG	2	6	24020	24025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587625
507	NC_022665	CGG	2	6	24061	24066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556587625
508	NC_022665	ATG	2	6	24160	24165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587625
509	NC_022665	TGA	2	6	24206	24211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587625
510	NC_022665	TGT	2	6	24230	24235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587625
511	NC_022665	CAAA	2	8	24384	24391	75 %	0 %	0 %	25 %	556587625
512	NC_022665	TTTAT	2	10	24436	24445	20 %	80 %	0 %	0 %	556587626
513	NC_022665	GGTC	2	8	24482	24489	0 %	25 %	50 %	25 %	556587626
514	NC_022665	ATT	2	6	24492	24497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587626
515	NC_022665	T	6	6	24533	24538	0 %	100 %	0 %	0 %	556587626
516	NC_022665	ATT	2	6	24567	24572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587626
517	NC_022665	CTA	2	6	24632	24637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587626
518	NC_022665	TCT	2	6	24671	24676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587626
519	NC_022665	TAG	2	6	24722	24727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587626
520	NC_022665	TTA	2	6	24746	24751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587626
521	NC_022665	TAA	2	6	24810	24815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587626
522	NC_022665	ATT	2	6	24867	24872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587626
523	NC_022665	AACA	2	8	24891	24898	75 %	0 %	0 %	25 %	556587626
524	NC_022665	TAA	2	6	24912	24917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_022665	T	7	7	24939	24945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022665	GA	3	6	24954	24959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022665	GAG	2	6	24973	24978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022665	GAA	2	6	24993	24998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587627
529	NC_022665	A	7	7	24997	25003	100 %	0 %	0 %	0 %	556587627
530	NC_022665	TCTA	2	8	25035	25042	25 %	50 %	0 %	25 %	556587627
531	NC_022665	ATG	2	6	25073	25078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587627
532	NC_022665	CAA	2	6	25094	25099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587627
533	NC_022665	A	6	6	25098	25103	100 %	0 %	0 %	0 %	556587627
534	NC_022665	CAA	2	6	25129	25134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587627
535	NC_022665	CAA	3	9	25144	25152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587627
536	NC_022665	AGA	2	6	25209	25214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587627
537	NC_022665	GGC	2	6	25248	25253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556587627
538	NC_022665	ATCA	2	8	25374	25381	50 %	25 %	0 %	25 %	556587627
539	NC_022665	AATGC	2	10	25402	25411	40 %	20 %	20 %	20 %	556587627
540	NC_022665	ATT	2	6	25417	25422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587627
541	NC_022665	TAA	2	6	25428	25433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587627
542	NC_022665	AAC	2	6	25445	25450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587627
543	NC_022665	TTG	2	6	25472	25477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587627
544	NC_022665	ACT	2	6	25507	25512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587627
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546	NC_022665	CTG	2	6	25616	25621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587627
547	NC_022665	TTG	2	6	25639	25644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587627
548	NC_022665	AGA	2	6	25662	25667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587627
549	NC_022665	AGC	2	6	25668	25673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587627
550	NC_022665	CAA	2	6	25732	25737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587627
551	NC_022665	TAG	2	6	25772	25777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587627
552	NC_022665	CAT	2	6	25862	25867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587627
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555	NC_022665	TAT	2	6	26080	26085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587627
556	NC_022665	TGT	2	6	26097	26102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587627
557	NC_022665	CAA	2	6	26120	26125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587627
558	NC_022665	GTT	2	6	26134	26139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587627
559	NC_022665	GTC	2	6	26156	26161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587627
560	NC_022665	GTG	2	6	26180	26185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587627
561	NC_022665	CAA	2	6	26198	26203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587627
562	NC_022665	TAC	2	6	26224	26229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587627
563	NC_022665	TTTG	2	8	26286	26293	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022665	AT	3	6	26333	26338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_022665	AGG	2	6	26339	26344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_022665	A	7	7	26416	26422	100 %	0 %	0 %	0 %	556587628
567	NC_022665	TTC	2	6	26519	26524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587628
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569	NC_022665	GTA	2	6	26614	26619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587628
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574	NC_022665	TTC	2	6	26764	26769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587628
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580	NC_022665	TAT	2	6	26925	26930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587628
581	NC_022665	CGT	2	6	26938	26943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587628
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592	NC_022665	T	6	6	27345	27350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022665	ATTT	2	8	27353	27360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022665	TAT	2	6	27369	27374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_022665	GCT	2	6	27564	27569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587629
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601	NC_022665	CT	3	6	27687	27692	0 %	50 %	0 %	50 %	556587629
602	NC_022665	TTC	2	6	27757	27762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587629
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605	NC_022665	ACG	2	6	27834	27839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587629
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607	NC_022665	ATT	2	6	27882	27887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587629
608	NC_022665	CAT	2	6	28166	28171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587629
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610	NC_022665	CAT	2	6	28310	28315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587629
611	NC_022665	CTT	2	6	28415	28420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587629
612	NC_022665	GAAA	2	8	28435	28442	75 %	0 %	25 %	0 %	556587629
613	NC_022665	GCA	2	6	28509	28514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587629
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615	NC_022665	TA	3	6	28601	28606	50 %	50 %	0 %	0 %	556587630
616	NC_022665	ATG	3	9	28754	28762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587630
617	NC_022665	TCA	2	6	28785	28790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587630
618	NC_022665	CTAC	2	8	28841	28848	25 %	25 %	0 %	50 %	556587630
619	NC_022665	CT	3	6	28898	28903	0 %	50 %	0 %	50 %	556587630
620	NC_022665	T	6	6	28908	28913	0 %	100 %	0 %	0 %	556587630
621	NC_022665	CAA	2	6	29101	29106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587630
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626	NC_022665	TCAA	2	8	29413	29420	50 %	25 %	0 %	25 %	556587631
627	NC_022665	TGA	2	6	29462	29467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587631
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629	NC_022665	GAT	2	6	29541	29546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587631
630	NC_022665	TCG	2	6	29564	29569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587631
631	NC_022665	AAGA	2	8	29571	29578	75 %	0 %	25 %	0 %	556587631
632	NC_022665	GGC	2	6	29663	29668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556587631
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658	NC_022665	A	7	7	30582	30588	100 %	0 %	0 %	0 %	556587632
659	NC_022665	T	6	6	30618	30623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
660	NC_022665	AAC	2	6	30628	30633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
661	NC_022665	TGT	2	6	30642	30647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
662	NC_022665	TG	3	6	30660	30665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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742	NC_022665	TCAG	2	8	34934	34941	25 %	25 %	25 %	25 %	556587634
743	NC_022665	GCCAT	2	10	35000	35009	20 %	20 %	20 %	40 %	556587634
744	NC_022665	ATC	2	6	35038	35043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587634
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746	NC_022665	AAAT	2	8	35149	35156	75 %	25 %	0 %	0 %	556587634
747	NC_022665	GAA	2	6	35184	35189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587635
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749	NC_022665	GCA	2	6	35258	35263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587635
750	NC_022665	AAG	2	6	35272	35277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587635
751	NC_022665	ATG	2	6	35296	35301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587635
752	NC_022665	TGC	2	6	35387	35392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587635
753	NC_022665	CAA	2	6	35435	35440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587635
754	NC_022665	A	7	7	35536	35542	100 %	0 %	0 %	0 %	556587635
755	NC_022665	TCT	4	12	35556	35567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587635
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757	NC_022665	TGC	2	6	35696	35701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587635
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877	NC_022665	A	6	6	41656	41661	100 %	0 %	0 %	0 %	556587640
878	NC_022665	CGG	3	9	41709	41717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556587641
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882	NC_022665	TCA	2	6	41927	41932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587641
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