MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 45446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022665	CTT	2	6	248188	248193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587844
5002	NC_022665	AAT	3	9	248241	248249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587844
5003	NC_022665	TG	3	6	248266	248271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_022665	ATTG	2	8	248315	248322	25 %	50 %	25 %	0 %	556587845
5005	NC_022665	TGG	2	6	248329	248334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587845
5006	NC_022665	TAGGGT	2	12	248372	248383	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	556587845
5007	NC_022665	TAAG	2	8	248465	248472	50 %	25 %	25 %	0 %	556587845
5008	NC_022665	TC	3	6	248488	248493	0 %	50 %	0 %	50 %	556587845
5009	NC_022665	TAG	2	6	248514	248519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587845
5010	NC_022665	CTA	2	6	248533	248538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587845
5011	NC_022665	T	6	6	248540	248545	0 %	100 %	0 %	0 %	556587845
5012	NC_022665	TGGT	2	8	248556	248563	0 %	50 %	50 %	0 %	556587845
5013	NC_022665	AAG	2	6	248657	248662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587845
5014	NC_022665	ACC	2	6	248846	248851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587845
5015	NC_022665	ACG	2	6	248987	248992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587845
5016	NC_022665	AG	4	8	249056	249063	50 %	0 %	50 %	0 %	556587845
5017	NC_022665	TTG	2	6	249108	249113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587845
5018	NC_022665	GTT	2	6	249140	249145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587845
5019	NC_022665	AGC	2	6	249236	249241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587845
5020	NC_022665	ATA	2	6	249324	249329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587845
5021	NC_022665	AAGC	2	8	249386	249393	50 %	0 %	25 %	25 %	556587846
5022	NC_022665	A	6	6	249421	249426	100 %	0 %	0 %	0 %	556587846
5023	NC_022665	CCA	2	6	249609	249614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556587846
5024	NC_022665	CTAG	2	8	249626	249633	25 %	25 %	25 %	25 %	556587846
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5026	NC_022665	CGTT	2	8	249697	249704	0 %	50 %	25 %	25 %	556587846
5027	NC_022665	GAA	2	6	249811	249816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587846
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5029	NC_022665	AGTTG	2	10	249867	249876	20 %	40 %	40 %	0 %	556587846
5030	NC_022665	TTG	2	6	249886	249891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587846
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5032	NC_022665	TCC	2	6	249899	249904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587846
5033	NC_022665	TTG	2	6	249914	249919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587846
5034	NC_022665	TGT	2	6	249924	249929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587846
5035	NC_022665	AGC	2	6	249943	249948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587846
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5039	NC_022665	ATG	2	6	250125	250130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587847
5040	NC_022665	TTC	2	6	250181	250186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587847
5041	NC_022665	AGT	2	6	250247	250252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587847
5042	NC_022665	AATT	2	8	250316	250323	50 %	50 %	0 %	0 %	556587847
5043	NC_022665	ATC	2	6	250355	250360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587847
5044	NC_022665	ATG	2	6	250377	250382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587847
5045	NC_022665	TCCTT	2	10	250428	250437	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5046	NC_022665	TGT	2	6	250438	250443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_022665	AT	3	6	250462	250467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_022665	AT	3	6	250481	250486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_022665	TA	3	6	250497	250502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_022665	AAAT	2	8	250521	250528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_022665	ATAA	2	8	250550	250557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_022665	AAT	2	6	250622	250627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_022665	AGT	2	6	250633	250638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_022665	TAA	2	6	250644	250649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_022665	TAG	2	6	250704	250709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_022665	GGT	2	6	250717	250722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_022665	ATT	2	6	250753	250758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587848
5058	NC_022665	TCC	2	6	250835	250840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587848
5059	NC_022665	AATT	2	8	250862	250869	50 %	50 %	0 %	0 %	556587848
5060	NC_022665	T	6	6	250899	250904	0 %	100 %	0 %	0 %	556587848
5061	NC_022665	T	7	7	250925	250931	0 %	100 %	0 %	0 %	556587848
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5063	NC_022665	ATT	2	6	250976	250981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587848
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5081	NC_022665	CAT	2	6	251746	251751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587849
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5091	NC_022665	AAAGAT	2	12	252041	252052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556587850
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5095	NC_022665	TAG	2	6	252319	252324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587850
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5099	NC_022665	CCAA	2	8	252413	252420	50 %	0 %	0 %	50 %	556587850
5100	NC_022665	CTG	2	6	252475	252480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587850
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5102	NC_022665	CAAA	2	8	252562	252569	75 %	0 %	0 %	25 %	556587850
5103	NC_022665	T	6	6	252575	252580	0 %	100 %	0 %	0 %	556587850
5104	NC_022665	T	6	6	252589	252594	0 %	100 %	0 %	0 %	556587850
5105	NC_022665	CTA	2	6	252651	252656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_022665	TAT	2	6	252704	252709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_022665	GTT	2	6	252723	252728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_022665	A	8	8	252733	252740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_022665	AT	3	6	252795	252800	50 %	50 %	0 %	0 %	556587851
5110	NC_022665	TTA	2	6	252827	252832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587851
5111	NC_022665	AAC	2	6	252883	252888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587851
5112	NC_022665	ATG	2	6	252931	252936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587851
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5115	NC_022665	GAAA	2	8	253179	253186	75 %	0 %	25 %	0 %	556587851
5116	NC_022665	TTC	2	6	253246	253251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587851
5117	NC_022665	GTTG	2	8	253290	253297	0 %	50 %	50 %	0 %	556587851
5118	NC_022665	ATTG	2	8	253302	253309	25 %	50 %	25 %	0 %	556587851
5119	NC_022665	TTG	2	6	253412	253417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587851
5120	NC_022665	TGG	2	6	253425	253430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587851
5121	NC_022665	CTGGTC	2	12	253436	253447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587851
5122	NC_022665	TGG	2	6	253534	253539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587851
5123	NC_022665	TCG	2	6	253633	253638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_022665	TTTTTC	2	12	253641	253652	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5125	NC_022665	TA	3	6	253666	253671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_022665	TCTGC	2	10	253678	253687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5251	NC_022665	A	6	6	259270	259275	100 %	0 %	0 %	0 %	556587857
5252	NC_022665	TTC	2	6	259314	259319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587857
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5255	NC_022665	A	6	6	259446	259451	100 %	0 %	0 %	0 %	556587857
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5364	NC_022665	TGACC	2	10	265233	265242	20 %	20 %	20 %	40 %	556587864
5365	NC_022665	ATG	2	6	265262	265267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587864
5366	NC_022665	TTTGGC	2	12	265306	265317	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	556587864
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5369	NC_022665	CAT	2	6	265542	265547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587864
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5372	NC_022665	AGA	2	6	265662	265667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587864
5373	NC_022665	AGT	2	6	265679	265684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587864
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5375	NC_022665	TTTTA	2	10	265699	265708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5410	NC_022665	AAATA	2	10	267166	267175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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