MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 2787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022655	TA	3	6	550	555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022655	GA	3	6	570	575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022655	TA	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022655	TG	3	6	3892	3897	0 %	50 %	50 %	0 %	556560058
5	NC_022655	GA	3	6	4400	4405	50 %	0 %	50 %	0 %	556560059
6	NC_022655	TG	3	6	4446	4451	0 %	50 %	50 %	0 %	556560059
7	NC_022655	TG	3	6	4926	4931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022655	GA	3	6	5131	5136	50 %	0 %	50 %	0 %	556561944
9	NC_022655	TA	3	6	5512	5517	50 %	50 %	0 %	0 %	556560060
10	NC_022655	GT	3	6	6117	6122	0 %	50 %	50 %	0 %	556560061
11	NC_022655	GA	3	6	7170	7175	50 %	0 %	50 %	0 %	556560061
12	NC_022655	AG	3	6	7658	7663	50 %	0 %	50 %	0 %	556560062
13	NC_022655	CT	3	6	8070	8075	0 %	50 %	0 %	50 %	556560063
14	NC_022655	CT	3	6	8691	8696	0 %	50 %	0 %	50 %	556560063
15	NC_022655	AT	3	6	8878	8883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022655	GA	3	6	9015	9020	50 %	0 %	50 %	0 %	556560064
17	NC_022655	TG	3	6	10193	10198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022655	AG	3	6	14692	14697	50 %	0 %	50 %	0 %	556560067
19	NC_022655	AT	3	6	14947	14952	50 %	50 %	0 %	0 %	556560068
20	NC_022655	AG	3	6	15158	15163	50 %	0 %	50 %	0 %	556560069
21	NC_022655	AC	3	6	15193	15198	50 %	0 %	0 %	50 %	556560069
22	NC_022655	GA	3	6	15200	15205	50 %	0 %	50 %	0 %	556560069
23	NC_022655	GA	3	6	15318	15323	50 %	0 %	50 %	0 %	556560069
24	NC_022655	AG	3	6	15325	15330	50 %	0 %	50 %	0 %	556560069
25	NC_022655	GA	3	6	15769	15774	50 %	0 %	50 %	0 %	556560069
26	NC_022655	GA	3	6	15864	15869	50 %	0 %	50 %	0 %	556560069
27	NC_022655	GC	3	6	15910	15915	0 %	0 %	50 %	50 %	556560069
28	NC_022655	GA	3	6	16832	16837	50 %	0 %	50 %	0 %	556560070
29	NC_022655	AT	3	6	17042	17047	50 %	50 %	0 %	0 %	556560070
30	NC_022655	GA	3	6	17315	17320	50 %	0 %	50 %	0 %	556560070
31	NC_022655	GT	3	6	17779	17784	0 %	50 %	50 %	0 %	556560071
32	NC_022655	GA	3	6	17867	17872	50 %	0 %	50 %	0 %	556560071
33	NC_022655	AG	3	6	18630	18635	50 %	0 %	50 %	0 %	556560072
34	NC_022655	AT	3	6	19428	19433	50 %	50 %	0 %	0 %	556560074
35	NC_022655	TA	3	6	20683	20688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022655	CT	3	6	21268	21273	0 %	50 %	0 %	50 %	556560077
37	NC_022655	AG	3	6	21966	21971	50 %	0 %	50 %	0 %	556560077
38	NC_022655	CT	3	6	22709	22714	0 %	50 %	0 %	50 %	556560077
39	NC_022655	CT	3	6	23604	23609	0 %	50 %	0 %	50 %	556560078
40	NC_022655	AG	3	6	25305	25310	50 %	0 %	50 %	0 %	556560080
41	NC_022655	AG	3	6	25318	25323	50 %	0 %	50 %	0 %	556560080
42	NC_022655	TG	3	6	26794	26799	0 %	50 %	50 %	0 %	556560080
43	NC_022655	CT	3	6	27685	27690	0 %	50 %	0 %	50 %	556560080
44	NC_022655	CT	3	6	27742	27747	0 %	50 %	0 %	50 %	556560080
45	NC_022655	CT	3	6	29432	29437	0 %	50 %	0 %	50 %	556560081
46	NC_022655	CT	3	6	30451	30456	0 %	50 %	0 %	50 %	556560081
47	NC_022655	TG	3	6	30807	30812	0 %	50 %	50 %	0 %	556560082
48	NC_022655	TG	3	6	30817	30822	0 %	50 %	50 %	0 %	556560082
49	NC_022655	TG	3	6	30936	30941	0 %	50 %	50 %	0 %	556560082
50	NC_022655	CA	3	6	33265	33270	50 %	0 %	0 %	50 %	556560085
51	NC_022655	AT	3	6	34760	34765	50 %	50 %	0 %	0 %	556560086
52	NC_022655	GC	3	6	34943	34948	0 %	0 %	50 %	50 %	556560086
53	NC_022655	CT	3	6	36441	36446	0 %	50 %	0 %	50 %	556560087
54	NC_022655	CT	3	6	36461	36466	0 %	50 %	0 %	50 %	556560087
55	NC_022655	CT	3	6	37273	37278	0 %	50 %	0 %	50 %	556560088
56	NC_022655	TC	3	6	37375	37380	0 %	50 %	0 %	50 %	556560088
57	NC_022655	CT	3	6	38018	38023	0 %	50 %	0 %	50 %	556560090
58	NC_022655	CT	3	6	38820	38825	0 %	50 %	0 %	50 %	556560090
59	NC_022655	GT	3	6	40138	40143	0 %	50 %	50 %	0 %	556560091
60	NC_022655	GA	3	6	41474	41479	50 %	0 %	50 %	0 %	556560091
61	NC_022655	GT	3	6	41743	41748	0 %	50 %	50 %	0 %	556560091
62	NC_022655	TA	3	6	43265	43270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022655	AT	5	10	43393	43402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022655	AT	3	6	43829	43834	50 %	50 %	0 %	0 %	556560092
65	NC_022655	TG	3	6	44478	44483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022655	AT	3	6	44966	44971	50 %	50 %	0 %	0 %	556560093
67	NC_022655	AG	3	6	45626	45631	50 %	0 %	50 %	0 %	556560093
68	NC_022655	CT	3	6	46249	46254	0 %	50 %	0 %	50 %	556560093
69	NC_022655	TA	3	6	49237	49242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022655	GA	3	6	49387	49392	50 %	0 %	50 %	0 %	556560098
71	NC_022655	CT	3	6	49866	49871	0 %	50 %	0 %	50 %	556560098
72	NC_022655	GA	3	6	50560	50565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022655	CT	3	6	50968	50973	0 %	50 %	0 %	50 %	556560099
74	NC_022655	TA	3	6	51780	51785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022655	AG	3	6	52009	52014	50 %	0 %	50 %	0 %	556560100
76	NC_022655	CA	3	6	52551	52556	50 %	0 %	0 %	50 %	556560100
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79	NC_022655	CT	3	6	55541	55546	0 %	50 %	0 %	50 %	556560106
80	NC_022655	TG	3	6	55629	55634	0 %	50 %	50 %	0 %	556560106
81	NC_022655	TC	3	6	55640	55645	0 %	50 %	0 %	50 %	556560106
82	NC_022655	CT	3	6	56203	56208	0 %	50 %	0 %	50 %	556560106
83	NC_022655	AG	4	8	57616	57623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022655	TG	3	6	57910	57915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022655	GA	3	6	62172	62177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022655	AT	3	6	62905	62910	50 %	50 %	0 %	0 %	556560110
87	NC_022655	GA	3	6	63521	63526	50 %	0 %	50 %	0 %	556560110
88	NC_022655	CT	3	6	63902	63907	0 %	50 %	0 %	50 %	556560110
89	NC_022655	TG	3	6	63970	63975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022655	TC	3	6	64790	64795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022655	TC	3	6	64951	64956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022655	TA	3	6	65429	65434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022655	GA	3	6	66277	66282	50 %	0 %	50 %	0 %	556560112
94	NC_022655	CA	3	6	66993	66998	50 %	0 %	0 %	50 %	556560112
95	NC_022655	CT	3	6	67302	67307	0 %	50 %	0 %	50 %	556560113
96	NC_022655	TC	3	6	67682	67687	0 %	50 %	0 %	50 %	556560113
97	NC_022655	TG	3	6	68162	68167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022655	AT	3	6	68224	68229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022655	AC	3	6	70537	70542	50 %	0 %	0 %	50 %	556560114
100	NC_022655	AT	3	6	71261	71266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022655	GA	3	6	71997	72002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022655	AT	3	6	72546	72551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022655	AT	3	6	72788	72793	50 %	50 %	0 %	0 %	556560115
104	NC_022655	AT	3	6	72911	72916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022655	AT	3	6	73169	73174	50 %	50 %	0 %	0 %	556560116
106	NC_022655	AT	4	8	73205	73212	50 %	50 %	0 %	0 %	556560116
107	NC_022655	CT	3	6	74349	74354	0 %	50 %	0 %	50 %	556560116
108	NC_022655	TC	3	6	74438	74443	0 %	50 %	0 %	50 %	556560116
109	NC_022655	GA	3	6	75038	75043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022655	TA	3	6	75180	75185	50 %	50 %	0 %	0 %	556560117
111	NC_022655	TA	3	6	75364	75369	50 %	50 %	0 %	0 %	556560117
112	NC_022655	CA	3	6	76561	76566	50 %	0 %	0 %	50 %	556560120
113	NC_022655	AG	3	6	76782	76787	50 %	0 %	50 %	0 %	556560120
114	NC_022655	TG	4	8	76923	76930	0 %	50 %	50 %	0 %	556560120
115	NC_022655	CT	3	6	77120	77125	0 %	50 %	0 %	50 %	556560120
116	NC_022655	GA	3	6	77280	77285	50 %	0 %	50 %	0 %	556560120
117	NC_022655	CT	3	6	77689	77694	0 %	50 %	0 %	50 %	556560121
118	NC_022655	CT	3	6	78423	78428	0 %	50 %	0 %	50 %	556560122
119	NC_022655	AG	3	6	78820	78825	50 %	0 %	50 %	0 %	556560122
120	NC_022655	CT	3	6	79127	79132	0 %	50 %	0 %	50 %	556560123
121	NC_022655	TA	4	8	79345	79352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022655	TA	4	8	79417	79424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022655	CT	3	6	82367	82372	0 %	50 %	0 %	50 %	556560126
124	NC_022655	AG	3	6	84445	84450	50 %	0 %	50 %	0 %	556560128
125	NC_022655	AT	3	6	84539	84544	50 %	50 %	0 %	0 %	556560128
126	NC_022655	GA	3	6	85371	85376	50 %	0 %	50 %	0 %	556560129
127	NC_022655	GA	4	8	85888	85895	50 %	0 %	50 %	0 %	556560130
128	NC_022655	TA	3	6	87671	87676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022655	CT	3	6	89192	89197	0 %	50 %	0 %	50 %	556560133
130	NC_022655	TC	3	6	89828	89833	0 %	50 %	0 %	50 %	556560133
131	NC_022655	TC	3	6	90446	90451	0 %	50 %	0 %	50 %	556560134
132	NC_022655	AG	4	8	90751	90758	50 %	0 %	50 %	0 %	556560134
133	NC_022655	AT	3	6	92545	92550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022655	AC	3	6	92656	92661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022655	TA	3	6	93230	93235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022655	TA	3	6	94268	94273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022655	TA	4	8	94302	94309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022655	AT	3	6	94495	94500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022655	AT	3	6	95282	95287	50 %	50 %	0 %	0 %	556560140
140	NC_022655	GA	3	6	95390	95395	50 %	0 %	50 %	0 %	556560140
141	NC_022655	TA	3	6	96622	96627	50 %	50 %	0 %	0 %	556560142
142	NC_022655	GT	3	6	96818	96823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022655	TA	3	6	97234	97239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022655	GA	3	6	97331	97336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022655	AT	3	6	97586	97591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022655	AT	3	6	97753	97758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022655	GA	3	6	98555	98560	50 %	0 %	50 %	0 %	556560144
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