MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 42864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022655	AAG	2	6	194192	194197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560251
4002	NC_022655	AAT	2	6	194210	194215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560251
4003	NC_022655	ATC	2	6	194228	194233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_022655	ACC	2	6	194235	194240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_022655	AAAC	2	8	194318	194325	75 %	0 %	0 %	25 %	556560252
4006	NC_022655	CT	3	6	194361	194366	0 %	50 %	0 %	50 %	556560252
4007	NC_022655	CTG	2	6	194371	194376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560252
4008	NC_022655	TGAT	2	8	194428	194435	25 %	50 %	25 %	0 %	556560252
4009	NC_022655	AAG	2	6	194479	194484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560252
4010	NC_022655	GTG	2	6	194568	194573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560252
4011	NC_022655	AGG	2	6	194656	194661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_022655	AGA	2	6	194701	194706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560253
4013	NC_022655	GTT	2	6	194738	194743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560253
4014	NC_022655	CGT	2	6	194753	194758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560253
4015	NC_022655	TTG	4	12	194775	194786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560253
4016	NC_022655	AAG	2	6	194829	194834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560253
4017	NC_022655	GAT	2	6	194861	194866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560253
4018	NC_022655	AAC	2	6	194902	194907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560253
4019	NC_022655	TTG	2	6	194951	194956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560253
4020	NC_022655	CTG	2	6	194961	194966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560253
4021	NC_022655	TGG	2	6	194989	194994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560253
4022	NC_022655	GAA	2	6	195119	195124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560253
4023	NC_022655	TGC	2	6	195127	195132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560253
4024	NC_022655	AAATTA	2	12	195187	195198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561946
4025	NC_022655	TGT	2	6	195245	195250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561946
4026	NC_022655	ACTTGG	2	12	195254	195265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556561946
4027	NC_022655	TTA	2	6	195283	195288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561946
4028	NC_022655	AAG	2	6	195289	195294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561946
4029	NC_022655	GCT	2	6	195300	195305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561946
4030	NC_022655	CAG	2	6	195322	195327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561946
4031	NC_022655	GAA	2	6	195348	195353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561946
4032	NC_022655	ATG	2	6	195418	195423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_022655	TCA	2	6	195576	195581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560254
4034	NC_022655	CGT	2	6	195681	195686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560254
4035	NC_022655	GTT	2	6	195786	195791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560254
4036	NC_022655	AGC	2	6	195878	195883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560254
4037	NC_022655	GAA	2	6	195903	195908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560254
4038	NC_022655	GGT	2	6	195924	195929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560254
4039	NC_022655	AG	3	6	195947	195952	50 %	0 %	50 %	0 %	556560254
4040	NC_022655	T	6	6	195963	195968	0 %	100 %	0 %	0 %	556560255
4041	NC_022655	ATT	2	6	195971	195976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560255
4042	NC_022655	TTTA	2	8	196016	196023	25 %	75 %	0 %	0 %	556560255
4043	NC_022655	CTT	2	6	196115	196120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560255
4044	NC_022655	A	6	6	196154	196159	100 %	0 %	0 %	0 %	556560255
4045	NC_022655	TTG	2	6	196207	196212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560255
4046	NC_022655	GAA	2	6	196279	196284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560255
4047	NC_022655	ATC	2	6	196425	196430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560255
4048	NC_022655	GTA	2	6	196441	196446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560255
4049	NC_022655	TTGG	2	8	196457	196464	0 %	50 %	50 %	0 %	556560255
4050	NC_022655	GAT	2	6	196544	196549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560255
4051	NC_022655	ACT	2	6	196567	196572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560255
4052	NC_022655	ATT	2	6	196629	196634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560255
4053	NC_022655	TTG	2	6	196641	196646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560255
4054	NC_022655	ATT	2	6	196647	196652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560255
4055	NC_022655	CAA	2	6	196671	196676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560255
4056	NC_022655	TCCAA	2	10	196691	196700	40 %	20 %	0 %	40 %	556560255
4057	NC_022655	CTG	2	6	196759	196764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560255
4058	NC_022655	TTC	2	6	196816	196821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560255
4059	NC_022655	ACT	2	6	196884	196889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560255
4060	NC_022655	ATT	2	6	196923	196928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560255
4061	NC_022655	TTC	2	6	196938	196943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560255
4062	NC_022655	AGC	2	6	196973	196978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560255
4063	NC_022655	AG	3	6	196979	196984	50 %	0 %	50 %	0 %	556560255
4064	NC_022655	GTG	2	6	196996	197001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560255
4065	NC_022655	AGA	2	6	197036	197041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560255
4066	NC_022655	AT	3	6	197042	197047	50 %	50 %	0 %	0 %	556560255
4067	NC_022655	CTT	2	6	197055	197060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560255
4068	NC_022655	CGT	2	6	197061	197066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560255
4069	NC_022655	TGT	2	6	197147	197152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560255
4070	NC_022655	TGG	2	6	197159	197164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560255
4071	NC_022655	ACAGA	2	10	197257	197266	60 %	0 %	20 %	20 %	556560255
4072	NC_022655	A	6	6	197374	197379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_022655	AGC	2	6	197468	197473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560256
4074	NC_022655	AT	3	6	197573	197578	50 %	50 %	0 %	0 %	556560256
4075	NC_022655	GAT	2	6	197643	197648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560256
4076	NC_022655	TAT	2	6	197750	197755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560256
4077	NC_022655	ATC	2	6	197805	197810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560256
4078	NC_022655	CCA	2	6	197850	197855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560256
4079	NC_022655	AGA	3	9	197867	197875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560256
4080	NC_022655	TAC	2	6	197877	197882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560256
4081	NC_022655	GAT	2	6	197892	197897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560256
4082	NC_022655	CGT	2	6	197916	197921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560256
4083	NC_022655	ATG	2	6	198013	198018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560256
4084	NC_022655	TCT	2	6	198019	198024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560256
4085	NC_022655	TTG	2	6	198122	198127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_022655	ATCGA	2	10	198145	198154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4087	NC_022655	TTGAAG	2	12	198195	198206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560257
4088	NC_022655	AGT	2	6	198211	198216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560257
4089	NC_022655	AAT	2	6	198390	198395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560257
4090	NC_022655	TCG	2	6	198469	198474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_022655	ACAA	2	8	198516	198523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4092	NC_022655	GTA	2	6	198595	198600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560258
4093	NC_022655	GCT	3	9	198655	198663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560258
4094	NC_022655	AGA	2	6	198672	198677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560258
4095	NC_022655	AAG	2	6	198707	198712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560258
4096	NC_022655	CGT	2	6	198721	198726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560258
4097	NC_022655	TCG	2	6	198759	198764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560258
4098	NC_022655	CGT	2	6	198826	198831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560258
4099	NC_022655	AAC	2	6	198862	198867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560258
4100	NC_022655	GTAAAG	2	12	198878	198889	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556560258
4101	NC_022655	A	6	6	198910	198915	100 %	0 %	0 %	0 %	556560258
4102	NC_022655	AGG	2	6	198922	198927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_022655	CGT	2	6	198957	198962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560259
4104	NC_022655	TAA	2	6	199010	199015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560259
4105	NC_022655	TCA	2	6	199062	199067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560259
4106	NC_022655	GCT	2	6	199113	199118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560259
4107	NC_022655	GCT	3	9	199134	199142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560259
4108	NC_022655	TGC	2	6	199229	199234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560259
4109	NC_022655	CA	3	6	199279	199284	50 %	0 %	0 %	50 %	556560259
4110	NC_022655	TCC	2	6	199295	199300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560259
4111	NC_022655	ATC	2	6	199319	199324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560259
4112	NC_022655	TGA	2	6	199397	199402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560260
4113	NC_022655	CT	3	6	199469	199474	0 %	50 %	0 %	50 %	556560260
4114	NC_022655	TCG	2	6	199475	199480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560260
4115	NC_022655	AGC	2	6	199505	199510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560260
4116	NC_022655	GT	3	6	199534	199539	0 %	50 %	50 %	0 %	556560260
4117	NC_022655	A	6	6	199636	199641	100 %	0 %	0 %	0 %	556560260
4118	NC_022655	CTG	2	6	199666	199671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560260
4119	NC_022655	TTC	2	6	199754	199759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560260
4120	NC_022655	CTG	2	6	199804	199809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560260
4121	NC_022655	GTAG	2	8	199908	199915	25 %	25 %	50 %	0 %	556560260
4122	NC_022655	ATG	2	6	199918	199923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560260
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4133	NC_022655	AATC	2	8	200391	200398	50 %	25 %	0 %	25 %	556560261
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4140	NC_022655	ATG	2	6	200532	200537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560261
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4143	NC_022655	ATC	2	6	200678	200683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560261
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4145	NC_022655	TTG	2	6	200707	200712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_022655	ATG	3	9	200719	200727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4177	NC_022655	GA	3	6	202007	202012	50 %	0 %	50 %	0 %	556560263
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4194	NC_022655	ATA	2	6	202732	202737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4213	NC_022655	AAGAT	2	10	203815	203824	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4228	NC_022655	TGGA	2	8	204428	204435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4229	NC_022655	TCC	2	6	204533	204538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4230	NC_022655	TAA	2	6	204547	204552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_022655	CAAG	2	8	204640	204647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4232	NC_022655	GCT	2	6	204650	204655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4233	NC_022655	AAC	2	6	204682	204687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4234	NC_022655	GCT	2	6	204728	204733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4235	NC_022655	TGA	2	6	204882	204887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4237	NC_022655	CATA	2	8	204993	205000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4238	NC_022655	AGT	2	6	205089	205094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_022655	AAAG	2	8	205105	205112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_022655	AAGA	2	8	205204	205211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_022655	GAA	2	6	205213	205218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_022655	AGG	2	6	205221	205226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_022655	T	6	6	205243	205248	0 %	100 %	0 %	0 %	556560265
4244	NC_022655	TTC	3	9	205355	205363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560265
4245	NC_022655	TTC	2	6	205373	205378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560265
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4374	NC_022655	TAT	2	6	211122	211127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_022655	TTA	2	6	211133	211138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4376	NC_022655	AGG	2	6	211145	211150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4377	NC_022655	GTTT	2	8	211172	211179	0 %	75 %	25 %	0 %	556560271
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4383	NC_022655	GATG	2	8	211492	211499	25 %	25 %	50 %	0 %	556560272
4384	NC_022655	GAT	2	6	211519	211524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560272
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4497	NC_022655	GCG	2	6	216826	216831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560275
4498	NC_022655	TCA	2	6	216873	216878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560275
4499	NC_022655	TAT	2	6	216923	216928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560275
4500	NC_022655	AGA	2	6	216945	216950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560275

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