MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 42864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022655	CTCG	2	8	169853	169860	0 %	25 %	25 %	50 %	556560218
3502	NC_022655	ACG	2	6	169870	169875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560218
3503	NC_022655	CTT	2	6	169958	169963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560218
3504	NC_022655	A	6	6	170044	170049	100 %	0 %	0 %	0 %	556560218
3505	NC_022655	TGTTCG	2	12	170094	170105	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	556560218
3506	NC_022655	ATG	2	6	170123	170128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560218
3507	NC_022655	AGCA	2	8	170155	170162	50 %	0 %	25 %	25 %	556560218
3508	NC_022655	AGG	2	6	170201	170206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560218
3509	NC_022655	GAC	2	6	170284	170289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560218
3510	NC_022655	GTT	3	9	170295	170303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560218
3511	NC_022655	TCTCT	2	10	170361	170370	0 %	60 %	0 %	40 %	556560218
3512	NC_022655	AGTG	2	8	170395	170402	25 %	25 %	50 %	0 %	556560218
3513	NC_022655	ACT	2	6	170510	170515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560218
3514	NC_022655	AGA	3	9	170586	170594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560218
3515	NC_022655	TTCCAT	2	12	170632	170643	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	556560218
3516	NC_022655	TGG	2	6	170658	170663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560218
3517	NC_022655	AAT	2	6	170701	170706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560218
3518	NC_022655	CGT	2	6	170713	170718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560218
3519	NC_022655	ATGA	2	8	170767	170774	50 %	25 %	25 %	0 %	556560218
3520	NC_022655	TGTC	2	8	170822	170829	0 %	50 %	25 %	25 %	556560218
3521	NC_022655	GGC	2	6	170836	170841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560218
3522	NC_022655	ACTTGG	2	12	170891	170902	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556560218
3523	NC_022655	CAT	2	6	170934	170939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560218
3524	NC_022655	CCTT	2	8	170978	170985	0 %	50 %	0 %	50 %	556560218
3525	NC_022655	AAT	2	6	170986	170991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560218
3526	NC_022655	CAG	2	6	171023	171028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560218
3527	NC_022655	GTG	2	6	171202	171207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560218
3528	NC_022655	ACG	2	6	171212	171217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560218
3529	NC_022655	TGG	2	6	171276	171281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560218
3530	NC_022655	TTG	2	6	171287	171292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560218
3531	NC_022655	CAG	2	6	171293	171298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560218
3532	NC_022655	AGA	2	6	171378	171383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560218
3533	NC_022655	AAC	2	6	171433	171438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560218
3534	NC_022655	GT	3	6	171491	171496	0 %	50 %	50 %	0 %	556560218
3535	NC_022655	A	6	6	171535	171540	100 %	0 %	0 %	0 %	556560218
3536	NC_022655	TGAT	2	8	171623	171630	25 %	50 %	25 %	0 %	556560218
3537	NC_022655	CGGA	2	8	171648	171655	25 %	0 %	50 %	25 %	556560218
3538	NC_022655	AAG	2	6	171748	171753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560218
3539	NC_022655	CTT	2	6	171831	171836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560218
3540	NC_022655	CAGC	2	8	172042	172049	25 %	0 %	25 %	50 %	556560218
3541	NC_022655	ACC	2	6	172051	172056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560218
3542	NC_022655	TAGC	2	8	172088	172095	25 %	25 %	25 %	25 %	556560218
3543	NC_022655	CGA	2	6	172145	172150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560218
3544	NC_022655	GAC	2	6	172207	172212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560218
3545	NC_022655	GGT	2	6	172300	172305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560218
3546	NC_022655	CAT	2	6	172311	172316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560218
3547	NC_022655	AGA	2	6	172332	172337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560218
3548	NC_022655	GAAAG	2	10	172377	172386	60 %	0 %	40 %	0 %	556560218
3549	NC_022655	CAT	2	6	172390	172395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560218
3550	NC_022655	ATC	3	9	172451	172459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560219
3551	NC_022655	TAT	2	6	172478	172483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560219
3552	NC_022655	ATC	2	6	172562	172567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560219
3553	NC_022655	TGA	2	6	172612	172617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560219
3554	NC_022655	TTA	2	6	172693	172698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560219
3555	NC_022655	GCAG	2	8	172708	172715	25 %	0 %	50 %	25 %	556560219
3556	NC_022655	CTAG	2	8	172946	172953	25 %	25 %	25 %	25 %	556560219
3557	NC_022655	TTC	2	6	172963	172968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560219
3558	NC_022655	CTAT	2	8	173073	173080	25 %	50 %	0 %	25 %	556560219
3559	NC_022655	GCAG	2	8	173101	173108	25 %	0 %	50 %	25 %	556560219
3560	NC_022655	TTGA	2	8	173144	173151	25 %	50 %	25 %	0 %	556560219
3561	NC_022655	AGGC	2	8	173160	173167	25 %	0 %	50 %	25 %	556560219
3562	NC_022655	ACT	2	6	173229	173234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560219
3563	NC_022655	GAT	2	6	173384	173389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560219
3564	NC_022655	ATT	2	6	173416	173421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560219
3565	NC_022655	GTT	2	6	173455	173460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560219
3566	NC_022655	A	6	6	173468	173473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_022655	A	6	6	173488	173493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_022655	A	8	8	173497	173504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_022655	T	6	6	173530	173535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_022655	GGTA	2	8	173578	173585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_022655	A	6	6	173626	173631	100 %	0 %	0 %	0 %	556560220
3572	NC_022655	AGTTA	2	10	173657	173666	40 %	40 %	20 %	0 %	556560220
3573	NC_022655	AAG	2	6	173687	173692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560220
3574	NC_022655	GA	3	6	173700	173705	50 %	0 %	50 %	0 %	556560220
3575	NC_022655	AGAA	2	8	174036	174043	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_022655	GAAA	2	8	174044	174051	75 %	0 %	25 %	0 %	556560221
3577	NC_022655	A	7	7	174054	174060	100 %	0 %	0 %	0 %	556560221
3578	NC_022655	TGGT	2	8	174094	174101	0 %	50 %	50 %	0 %	556560221
3579	NC_022655	A	6	6	174111	174116	100 %	0 %	0 %	0 %	556560221
3580	NC_022655	GAA	2	6	174188	174193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560221
3581	NC_022655	GAT	2	6	174231	174236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560221
3582	NC_022655	CAG	2	6	174243	174248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560221
3583	NC_022655	ACAA	2	8	174251	174258	75 %	0 %	0 %	25 %	556560221
3584	NC_022655	TTAC	2	8	174259	174266	25 %	50 %	0 %	25 %	556560221
3585	NC_022655	T	6	6	174278	174283	0 %	100 %	0 %	0 %	556560221
3586	NC_022655	CAA	2	6	174297	174302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560221
3587	NC_022655	TGA	2	6	174317	174322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560221
3588	NC_022655	TGGAG	2	10	174347	174356	20 %	20 %	60 %	0 %	556560221
3589	NC_022655	CTT	2	6	174372	174377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560221
3590	NC_022655	GGA	2	6	174383	174388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560221
3591	NC_022655	AAC	2	6	174470	174475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560221
3592	NC_022655	AAG	2	6	174507	174512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560221
3593	NC_022655	GAA	2	6	174533	174538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560221
3594	NC_022655	AT	3	6	174578	174583	50 %	50 %	0 %	0 %	556560221
3595	NC_022655	AGAT	2	8	174587	174594	50 %	25 %	25 %	0 %	556560221
3596	NC_022655	AAAT	2	8	174628	174635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_022655	GAA	2	6	174719	174724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560222
3598	NC_022655	A	6	6	174755	174760	100 %	0 %	0 %	0 %	556560222
3599	NC_022655	TAA	2	6	174877	174882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560222
3600	NC_022655	AAATC	2	10	174889	174898	60 %	20 %	0 %	20 %	556560222
3601	NC_022655	TGA	2	6	174913	174918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560222
3602	NC_022655	CTA	2	6	174940	174945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560222
3603	NC_022655	ATC	2	6	175064	175069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560223
3604	NC_022655	GAA	2	6	175079	175084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560223
3605	NC_022655	CG	3	6	175188	175193	0 %	0 %	50 %	50 %	556560223
3606	NC_022655	AGA	2	6	175225	175230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560223
3607	NC_022655	T	6	6	175232	175237	0 %	100 %	0 %	0 %	556560223
3608	NC_022655	ACA	2	6	175271	175276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560223
3609	NC_022655	GCT	2	6	175280	175285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560223
3610	NC_022655	TTGA	2	8	175295	175302	25 %	50 %	25 %	0 %	556560223
3611	NC_022655	AGC	2	6	175351	175356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560223
3612	NC_022655	ATT	2	6	175374	175379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560223
3613	NC_022655	TAGA	2	8	175380	175387	50 %	25 %	25 %	0 %	556560223
3614	NC_022655	ACCACG	2	12	175428	175439	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	556560224
3615	NC_022655	TAG	2	6	175461	175466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560224
3616	NC_022655	AGA	2	6	175519	175524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560224
3617	NC_022655	TTC	2	6	175542	175547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560224
3618	NC_022655	AGA	3	9	175564	175572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560224
3619	NC_022655	TCAT	2	8	175604	175611	25 %	50 %	0 %	25 %	556560224
3620	NC_022655	AGA	2	6	175654	175659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560224
3621	NC_022655	AGA	2	6	175663	175668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560224
3622	NC_022655	GAA	2	6	175685	175690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560224
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3749	NC_022655	AG	3	6	181984	181989	50 %	0 %	50 %	0 %	556560230
3750	NC_022655	AGA	2	6	182109	182114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560230
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3764	NC_022655	TAC	2	6	183113	183118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560230
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3771	NC_022655	AGAA	2	8	183736	183743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3813	NC_022655	AGA	2	6	185657	185662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3822	NC_022655	A	6	6	186143	186148	100 %	0 %	0 %	0 %	556560235
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3826	NC_022655	A	6	6	186398	186403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3857	NC_022655	CAAG	2	8	187814	187821	50 %	0 %	25 %	25 %	556560238
3858	NC_022655	GCT	2	6	187830	187835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560238
3859	NC_022655	A	6	6	187929	187934	100 %	0 %	0 %	0 %	556560238
3860	NC_022655	ATC	2	6	187938	187943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560238
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3864	NC_022655	AGG	2	6	188002	188007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3870	NC_022655	GGT	2	6	188177	188182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560239
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3986	NC_022655	GTTCA	2	10	193590	193599	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3993	NC_022655	GGTT	2	8	193950	193957	0 %	50 %	50 %	0 %	556560251
3994	NC_022655	CAA	3	9	194060	194068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560251
3995	NC_022655	GTT	2	6	194071	194076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560251
3996	NC_022655	AGT	2	6	194094	194099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560251
3997	NC_022655	GCT	2	6	194110	194115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560251
3998	NC_022655	TACG	2	8	194116	194123	25 %	25 %	25 %	25 %	556560251
3999	NC_022655	TAAAGG	2	12	194148	194159	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556560251
4000	NC_022655	TTCG	2	8	194179	194186	0 %	50 %	25 %	25 %	556560251

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