MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 42864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022655	GCA	2	6	49739	49744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560098
1002	NC_022655	TGA	2	6	49774	49779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560098
1003	NC_022655	TCTTGC	2	12	49788	49799	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	556560098
1004	NC_022655	ATG	2	6	49815	49820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560098
1005	NC_022655	ATG	2	6	49853	49858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560098
1006	NC_022655	CT	3	6	49866	49871	0 %	50 %	0 %	50 %	556560098
1007	NC_022655	AGA	2	6	49957	49962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560098
1008	NC_022655	TTG	2	6	49974	49979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560098
1009	NC_022655	ATCT	2	8	50000	50007	25 %	50 %	0 %	25 %	556560098
1010	NC_022655	CTTT	2	8	50019	50026	0 %	75 %	0 %	25 %	556560098
1011	NC_022655	AGCTC	2	10	50041	50050	20 %	20 %	20 %	40 %	556560098
1012	NC_022655	CTG	2	6	50067	50072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560098
1013	NC_022655	GTT	2	6	50147	50152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560098
1014	NC_022655	GACTTG	2	12	50192	50203	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556560098
1015	NC_022655	TCG	2	6	50233	50238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560098
1016	NC_022655	TGT	2	6	50239	50244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560098
1017	NC_022655	AAG	2	6	50283	50288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560098
1018	NC_022655	GTA	2	6	50432	50437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560098
1019	NC_022655	GTTT	2	8	50548	50555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022655	GA	3	6	50560	50565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022655	TGA	2	6	50759	50764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560099
1022	NC_022655	TAA	2	6	50879	50884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560099
1023	NC_022655	GAA	2	6	50943	50948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560099
1024	NC_022655	CT	3	6	50968	50973	0 %	50 %	0 %	50 %	556560099
1025	NC_022655	AGG	2	6	50996	51001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560099
1026	NC_022655	GAA	2	6	51042	51047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560099
1027	NC_022655	CCAA	2	8	51105	51112	50 %	0 %	0 %	50 %	556560099
1028	NC_022655	TTG	2	6	51273	51278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560099
1029	NC_022655	AGA	3	9	51293	51301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560099
1030	NC_022655	TCA	2	6	51466	51471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560099
1031	NC_022655	AGG	2	6	51473	51478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560099
1032	NC_022655	TTG	2	6	51610	51615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560099
1033	NC_022655	A	6	6	51622	51627	100 %	0 %	0 %	0 %	556560099
1034	NC_022655	TAAAAT	2	12	51645	51656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022655	TGA	2	6	51673	51678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_022655	TAT	2	6	51700	51705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_022655	TTATC	2	10	51719	51728	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1038	NC_022655	TA	3	6	51780	51785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_022655	TAA	2	6	51793	51798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022655	AAT	2	6	51800	51805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022655	ATTT	2	8	51854	51861	25 %	75 %	0 %	0 %	556560100
1042	NC_022655	TGG	2	6	51973	51978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560100
1043	NC_022655	AG	3	6	52009	52014	50 %	0 %	50 %	0 %	556560100
1044	NC_022655	CGG	2	6	52126	52131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560100
1045	NC_022655	GCG	2	6	52268	52273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560100
1046	NC_022655	CCAG	2	8	52374	52381	25 %	0 %	25 %	50 %	556560100
1047	NC_022655	CAT	3	9	52457	52465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560100
1048	NC_022655	GGA	2	6	52484	52489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560100
1049	NC_022655	CTA	2	6	52531	52536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560100
1050	NC_022655	CA	3	6	52551	52556	50 %	0 %	0 %	50 %	556560100
1051	NC_022655	A	6	6	52556	52561	100 %	0 %	0 %	0 %	556560100
1052	NC_022655	AAG	2	6	52590	52595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560100
1053	NC_022655	TAA	2	6	52698	52703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022655	AAG	2	6	52784	52789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_022655	GAA	2	6	52807	52812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022655	TG	3	6	52883	52888	0 %	50 %	50 %	0 %	556560101
1057	NC_022655	GAT	2	6	52899	52904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560101
1058	NC_022655	CAG	2	6	52946	52951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560101
1059	NC_022655	GAT	2	6	52980	52985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560101
1060	NC_022655	ATCA	2	8	53011	53018	50 %	25 %	0 %	25 %	556560101
1061	NC_022655	GAT	2	6	53026	53031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560101
1062	NC_022655	AAAT	2	8	53086	53093	75 %	25 %	0 %	0 %	556560101
1063	NC_022655	AAG	2	6	53157	53162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560102
1064	NC_022655	A	6	6	53167	53172	100 %	0 %	0 %	0 %	556560102
1065	NC_022655	A	7	7	53184	53190	100 %	0 %	0 %	0 %	556560102
1066	NC_022655	T	6	6	53235	53240	0 %	100 %	0 %	0 %	556560102
1067	NC_022655	TAT	2	6	53291	53296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560102
1068	NC_022655	TCCA	2	8	53424	53431	25 %	25 %	0 %	50 %	556560102
1069	NC_022655	AGC	2	6	53453	53458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560102
1070	NC_022655	TCT	2	6	53510	53515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_022655	CTC	2	6	53539	53544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_022655	ATT	2	6	53548	53553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560103
1073	NC_022655	ACC	2	6	53579	53584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560103
1074	NC_022655	CTC	2	6	53647	53652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560103
1075	NC_022655	TGCT	2	8	53916	53923	0 %	50 %	25 %	25 %	556560104
1076	NC_022655	T	6	6	53985	53990	0 %	100 %	0 %	0 %	556560104
1077	NC_022655	TCA	2	6	53998	54003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560104
1078	NC_022655	TCC	2	6	54007	54012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_022655	AGG	2	6	54054	54059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022655	TGA	2	6	54101	54106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560105
1081	NC_022655	GT	3	6	54167	54172	0 %	50 %	50 %	0 %	556560105
1082	NC_022655	T	6	6	54179	54184	0 %	100 %	0 %	0 %	556560105
1083	NC_022655	GAG	2	6	54189	54194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560105
1084	NC_022655	GAG	2	6	54291	54296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560105
1085	NC_022655	GTCT	2	8	54297	54304	0 %	50 %	25 %	25 %	556560105
1086	NC_022655	GCTCC	2	10	54322	54331	0 %	20 %	20 %	60 %	556560105
1087	NC_022655	AGC	2	6	54332	54337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560105
1088	NC_022655	TGC	2	6	54521	54526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560105
1089	NC_022655	GAA	2	6	54564	54569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560105
1090	NC_022655	GAC	2	6	54581	54586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560105
1091	NC_022655	GAA	2	6	54633	54638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560105
1092	NC_022655	GCTGT	2	10	54640	54649	0 %	40 %	40 %	20 %	556560105
1093	NC_022655	TTG	2	6	54714	54719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560105
1094	NC_022655	CAG	2	6	54724	54729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560105
1095	NC_022655	TAA	2	6	54785	54790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560105
1096	NC_022655	CAC	2	6	54819	54824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560105
1097	NC_022655	TATCA	2	10	54964	54973	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1098	NC_022655	TGA	2	6	54976	54981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_022655	T	6	6	55297	55302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_022655	T	6	6	55363	55368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_022655	A	6	6	55462	55467	100 %	0 %	0 %	0 %	556560106
1102	NC_022655	CGT	2	6	55500	55505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560106
1103	NC_022655	T	7	7	55507	55513	0 %	100 %	0 %	0 %	556560106
1104	NC_022655	CT	3	6	55541	55546	0 %	50 %	0 %	50 %	556560106
1105	NC_022655	ATC	2	6	55600	55605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560106
1106	NC_022655	CTG	2	6	55612	55617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560106
1107	NC_022655	TG	3	6	55629	55634	0 %	50 %	50 %	0 %	556560106
1108	NC_022655	TC	3	6	55640	55645	0 %	50 %	0 %	50 %	556560106
1109	NC_022655	AAT	2	6	55685	55690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560106
1110	NC_022655	GGT	2	6	55713	55718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560106
1111	NC_022655	AGCA	2	8	55758	55765	50 %	0 %	25 %	25 %	556560106
1112	NC_022655	TCTAT	2	10	55843	55852	20 %	60 %	0 %	20 %	556560106
1113	NC_022655	ATT	2	6	56061	56066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560106
1114	NC_022655	GGC	2	6	56070	56075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560106
1115	NC_022655	GAA	2	6	56116	56121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560106
1116	NC_022655	A	6	6	56124	56129	100 %	0 %	0 %	0 %	556560106
1117	NC_022655	TAT	3	9	56158	56166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560106
1118	NC_022655	TGT	2	6	56179	56184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560106
1119	NC_022655	ACT	2	6	56199	56204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560106
1120	NC_022655	CT	3	6	56203	56208	0 %	50 %	0 %	50 %	556560106
1121	NC_022655	T	6	6	56274	56279	0 %	100 %	0 %	0 %	556560106
1122	NC_022655	GGA	2	6	56388	56393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560106
1123	NC_022655	T	6	6	56421	56426	0 %	100 %	0 %	0 %	556560106
1124	NC_022655	ACGA	2	8	56486	56493	50 %	0 %	25 %	25 %	556560106
1125	NC_022655	CGC	2	6	56497	56502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556560106
1126	NC_022655	TAT	2	6	56531	56536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560106
1127	NC_022655	TGA	2	6	56542	56547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560106
1128	NC_022655	CTT	2	6	56549	56554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560106
1129	NC_022655	GATT	2	8	56560	56567	25 %	50 %	25 %	0 %	556560106
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1162	NC_022655	CTG	2	6	58627	58632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1165	NC_022655	CAG	2	6	58732	58737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1174	NC_022655	TCT	2	6	59294	59299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560108
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1253	NC_022655	CAG	2	6	63982	63987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1254	NC_022655	ATT	2	6	64097	64102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_022655	AGG	2	6	64109	64114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1260	NC_022655	AAC	2	6	64237	64242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560111
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1263	NC_022655	CGT	2	6	64399	64404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560111
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1275	NC_022655	A	6	6	64943	64948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1302	NC_022655	ATAG	2	8	66404	66411	50 %	25 %	25 %	0 %	556560112
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1377	NC_022655	ATAA	2	8	70076	70083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1378	NC_022655	A	6	6	70082	70087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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