MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 42864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022655	CTA	2	6	24407	24412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_022655	T	6	6	24435	24440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022655	T	6	6	24443	24448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022655	TTA	2	6	24555	24560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560079
505	NC_022655	AAG	2	6	24602	24607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560079
506	NC_022655	AAT	2	6	24635	24640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560079
507	NC_022655	AAC	2	6	24720	24725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560079
508	NC_022655	ATT	2	6	24743	24748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560079
509	NC_022655	CTG	2	6	24777	24782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560079
510	NC_022655	TAC	2	6	24848	24853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560079
511	NC_022655	ATG	2	6	24858	24863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560079
512	NC_022655	GAT	2	6	24869	24874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560079
513	NC_022655	ATG	2	6	24885	24890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560079
514	NC_022655	CAG	2	6	24923	24928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560079
515	NC_022655	GAAG	2	8	24940	24947	50 %	0 %	50 %	0 %	556560079
516	NC_022655	CGT	2	6	24953	24958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560079
517	NC_022655	ATTG	2	8	25003	25010	25 %	50 %	25 %	0 %	556560079
518	NC_022655	AAC	2	6	25197	25202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560079
519	NC_022655	A	7	7	25277	25283	100 %	0 %	0 %	0 %	556560080
520	NC_022655	AG	3	6	25305	25310	50 %	0 %	50 %	0 %	556560080
521	NC_022655	AG	3	6	25318	25323	50 %	0 %	50 %	0 %	556560080
522	NC_022655	ATG	2	6	25379	25384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560080
523	NC_022655	CTTT	2	8	25499	25506	0 %	75 %	0 %	25 %	556560080
524	NC_022655	TTG	2	6	25570	25575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560080
525	NC_022655	GTGAC	2	10	25586	25595	20 %	20 %	40 %	20 %	556560080
526	NC_022655	CTTT	2	8	25763	25770	0 %	75 %	0 %	25 %	556560080
527	NC_022655	CAG	2	6	25781	25786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560080
528	NC_022655	GAT	2	6	25834	25839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560080
529	NC_022655	ACT	2	6	25856	25861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560080
530	NC_022655	GGTC	2	8	26044	26051	0 %	25 %	50 %	25 %	556560080
531	NC_022655	GAT	2	6	26122	26127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560080
532	NC_022655	CTC	2	6	26203	26208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560080
533	NC_022655	TGG	2	6	26256	26261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560080
534	NC_022655	TGG	2	6	26277	26282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560080
535	NC_022655	CAA	2	6	26395	26400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560080
536	NC_022655	CAG	2	6	26414	26419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560080
537	NC_022655	TTC	2	6	26430	26435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560080
538	NC_022655	GTT	2	6	26524	26529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560080
539	NC_022655	TGT	2	6	26550	26555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560080
540	NC_022655	GTGAT	2	10	26576	26585	20 %	40 %	40 %	0 %	556560080
541	NC_022655	GGT	2	6	26623	26628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560080
542	NC_022655	CTG	2	6	26672	26677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560080
543	NC_022655	GAA	2	6	26707	26712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560080
544	NC_022655	AAG	2	6	26761	26766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560080
545	NC_022655	TG	3	6	26794	26799	0 %	50 %	50 %	0 %	556560080
546	NC_022655	CAA	2	6	26838	26843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560080
547	NC_022655	TGT	2	6	26979	26984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560080
548	NC_022655	CGT	2	6	27055	27060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560080
549	NC_022655	AGA	2	6	27129	27134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560080
550	NC_022655	CTG	2	6	27146	27151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560080
551	NC_022655	TGG	2	6	27267	27272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560080
552	NC_022655	TGC	2	6	27402	27407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560080
553	NC_022655	TGG	2	6	27437	27442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560080
554	NC_022655	CTG	2	6	27443	27448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560080
555	NC_022655	CAAG	2	8	27504	27511	50 %	0 %	25 %	25 %	556560080
556	NC_022655	GCC	2	6	27535	27540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556560080
557	NC_022655	GCTTG	2	10	27570	27579	0 %	40 %	40 %	20 %	556560080
558	NC_022655	GGT	2	6	27589	27594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560080
559	NC_022655	GAA	2	6	27619	27624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560080
560	NC_022655	GAC	2	6	27660	27665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560080
561	NC_022655	CT	3	6	27685	27690	0 %	50 %	0 %	50 %	556560080
562	NC_022655	CTA	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560080
563	NC_022655	CT	3	6	27742	27747	0 %	50 %	0 %	50 %	556560080
564	NC_022655	GATT	2	8	27753	27760	25 %	50 %	25 %	0 %	556560080
565	NC_022655	AAGC	2	8	27794	27801	50 %	0 %	25 %	25 %	556560080
566	NC_022655	GGT	2	6	27844	27849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560080
567	NC_022655	GGC	2	6	27943	27948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560080
568	NC_022655	GAA	2	6	27967	27972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560080
569	NC_022655	AGA	2	6	27986	27991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560080
570	NC_022655	ACTG	2	8	28017	28024	25 %	25 %	25 %	25 %	556560080
571	NC_022655	GAA	2	6	28081	28086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560080
572	NC_022655	AGA	2	6	28122	28127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560080
573	NC_022655	TGT	2	6	28149	28154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560080
574	NC_022655	AAG	2	6	28250	28255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560080
575	NC_022655	TGAA	2	8	28289	28296	50 %	25 %	25 %	0 %	556560080
576	NC_022655	TCT	2	6	28355	28360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560080
577	NC_022655	GTG	2	6	28469	28474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560080
578	NC_022655	ATG	2	6	28583	28588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560080
579	NC_022655	CCAA	2	8	28589	28596	50 %	0 %	0 %	50 %	556560080
580	NC_022655	TGG	2	6	28610	28615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560080
581	NC_022655	ATC	2	6	28864	28869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560080
582	NC_022655	ATAG	2	8	28998	29005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022655	TGA	2	6	29041	29046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022655	A	6	6	29068	29073	100 %	0 %	0 %	0 %	556560081
585	NC_022655	GAA	2	6	29100	29105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560081
586	NC_022655	TGC	2	6	29138	29143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560081
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588	NC_022655	CTG	2	6	29332	29337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560081
589	NC_022655	TGGCT	2	10	29396	29405	0 %	40 %	40 %	20 %	556560081
590	NC_022655	CT	3	6	29432	29437	0 %	50 %	0 %	50 %	556560081
591	NC_022655	AAGA	2	8	29439	29446	75 %	0 %	25 %	0 %	556560081
592	NC_022655	TCG	2	6	29510	29515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560081
593	NC_022655	GGT	2	6	29571	29576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560081
594	NC_022655	GGT	2	6	29672	29677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560081
595	NC_022655	TGA	2	6	29759	29764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560081
596	NC_022655	GAT	2	6	29793	29798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560081
597	NC_022655	TTC	2	6	29954	29959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560081
598	NC_022655	GAA	2	6	29985	29990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560081
599	NC_022655	AAATG	2	10	30002	30011	60 %	20 %	20 %	0 %	556560081
600	NC_022655	CTG	2	6	30097	30102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560081
601	NC_022655	TGG	2	6	30136	30141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560081
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606	NC_022655	TTGA	2	8	30369	30376	25 %	50 %	25 %	0 %	556560081
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608	NC_022655	CT	3	6	30451	30456	0 %	50 %	0 %	50 %	556560081
609	NC_022655	GAA	2	6	30465	30470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560081
610	NC_022655	GAA	2	6	30489	30494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560081
611	NC_022655	A	6	6	30543	30548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022655	GTT	2	6	30609	30614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560082
613	NC_022655	TGG	2	6	30671	30676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560082
614	NC_022655	TGG	2	6	30680	30685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560082
615	NC_022655	TG	3	6	30807	30812	0 %	50 %	50 %	0 %	556560082
616	NC_022655	TG	3	6	30817	30822	0 %	50 %	50 %	0 %	556560082
617	NC_022655	CAT	2	6	30830	30835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560082
618	NC_022655	TGC	2	6	30836	30841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560082
619	NC_022655	GAA	2	6	30884	30889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560082
620	NC_022655	AGCTA	2	10	30896	30905	40 %	20 %	20 %	20 %	556560082
621	NC_022655	TG	3	6	30936	30941	0 %	50 %	50 %	0 %	556560082
622	NC_022655	TGC	2	6	30950	30955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560082
623	NC_022655	GAC	2	6	31002	31007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560082
624	NC_022655	CGGT	2	8	31027	31034	0 %	25 %	50 %	25 %	556560082
625	NC_022655	GGT	2	6	31070	31075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560082
626	NC_022655	TTC	2	6	31087	31092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560082
627	NC_022655	TCG	2	6	31139	31144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560082
628	NC_022655	TCA	2	6	31255	31260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560082
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630	NC_022655	GGT	2	6	31296	31301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560082
631	NC_022655	GCT	2	6	31344	31349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560082
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636	NC_022655	A	7	7	31574	31580	100 %	0 %	0 %	0 %	556560082
637	NC_022655	GAA	2	6	31628	31633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560083
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641	NC_022655	TCA	2	6	31995	32000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560083
642	NC_022655	TGA	2	6	32026	32031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560083
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645	NC_022655	TTG	2	6	32166	32171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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879	NC_022655	AT	5	10	43393	43402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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