MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 42864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_022655	A	6	6	286928	286933	100 %	0 %	0 %	0 %	556560336
6003	NC_022655	GAC	2	6	286984	286989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560336
6004	NC_022655	GAT	2	6	287069	287074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560336
6005	NC_022655	TCT	2	6	287084	287089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560336
6006	NC_022655	TGAT	2	8	287208	287215	25 %	50 %	25 %	0 %	556560336
6007	NC_022655	GATAAA	2	12	287264	287275	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	556560336
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6009	NC_022655	TTA	2	6	287500	287505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560336
6010	NC_022655	TGGT	2	8	287728	287735	0 %	50 %	50 %	0 %	556560336
6011	NC_022655	ACA	2	6	287831	287836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560336
6012	NC_022655	AG	3	6	287850	287855	50 %	0 %	50 %	0 %	556560336
6013	NC_022655	GAT	2	6	287912	287917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560336
6014	NC_022655	CTG	2	6	288045	288050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560336
6015	NC_022655	AAG	2	6	288114	288119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560336
6016	NC_022655	AAG	2	6	288215	288220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560336
6017	NC_022655	TCAA	2	8	288390	288397	50 %	25 %	0 %	25 %	556560336
6018	NC_022655	ATG	2	6	288456	288461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560336
6019	NC_022655	ATG	2	6	288492	288497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560336
6020	NC_022655	CTA	2	6	288507	288512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560336
6021	NC_022655	CCAA	2	8	288516	288523	50 %	0 %	0 %	50 %	556560336
6022	NC_022655	AAG	2	6	288561	288566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560336
6023	NC_022655	CTA	2	6	288586	288591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560336
6024	NC_022655	AGCA	2	8	288645	288652	50 %	0 %	25 %	25 %	556560336
6025	NC_022655	AAAAG	2	10	288676	288685	80 %	0 %	20 %	0 %	556560336
6026	NC_022655	GTCA	2	8	288747	288754	25 %	25 %	25 %	25 %	556560336
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6032	NC_022655	A	7	7	289105	289111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_022655	A	6	6	289164	289169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_022655	AGT	2	6	289275	289280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_022655	ATG	2	6	289422	289427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560337
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6038	NC_022655	GAT	2	6	289563	289568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_022655	TTC	2	6	289569	289574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_022655	AT	3	6	289609	289614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_022655	AGAAC	2	10	289629	289638	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6042	NC_022655	CTA	2	6	289711	289716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_022655	AGCG	2	8	289843	289850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6044	NC_022655	CGC	2	6	289859	289864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_022655	GA	3	6	289867	289872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_022655	ACC	2	6	289896	289901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6055	NC_022655	TGA	2	6	290388	290393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560338
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6111	NC_022655	A	7	7	293182	293188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_022655	T	7	7	293249	293255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_022655	A	6	6	293257	293262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_022655	A	6	6	293323	293328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6122	NC_022655	AATG	2	8	293590	293597	50 %	25 %	25 %	0 %	556560342
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6124	NC_022655	TGA	2	6	293662	293667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560342
6125	NC_022655	GTT	2	6	293669	293674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560342
6126	NC_022655	AGT	2	6	293683	293688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560342
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6133	NC_022655	AGA	2	6	293859	293864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560343
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6136	NC_022655	AG	3	6	294101	294106	50 %	0 %	50 %	0 %	556560343
6137	NC_022655	CTT	2	6	294132	294137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560343
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6139	NC_022655	ATGGAG	2	12	294173	294184	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	556560343
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6141	NC_022655	TTGA	2	8	294220	294227	25 %	50 %	25 %	0 %	556560343
6142	NC_022655	GGT	2	6	294244	294249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560343
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6144	NC_022655	TGCT	2	8	294307	294314	0 %	50 %	25 %	25 %	556560343
6145	NC_022655	TAC	2	6	294364	294369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560343
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6150	NC_022655	GATTT	2	10	294655	294664	20 %	60 %	20 %	0 %	556560343
6151	NC_022655	ATG	2	6	294668	294673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560343
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6153	NC_022655	TTC	2	6	294693	294698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560343
6154	NC_022655	CTGT	2	8	294713	294720	0 %	50 %	25 %	25 %	556560343
6155	NC_022655	ATGC	2	8	294787	294794	25 %	25 %	25 %	25 %	556560343
6156	NC_022655	TGG	2	6	294843	294848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560343
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6193	NC_022655	TGC	2	6	296872	296877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560346
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6202	NC_022655	AGT	2	6	297368	297373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560347
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6208	NC_022655	GA	3	6	297741	297746	50 %	0 %	50 %	0 %	556560348
6209	NC_022655	TGA	2	6	297764	297769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560348
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6214	NC_022655	CT	3	6	297919	297924	0 %	50 %	0 %	50 %	556560348
6215	NC_022655	TCC	2	6	297972	297977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560348
6216	NC_022655	CTG	2	6	297999	298004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560348
6217	NC_022655	CTC	2	6	298049	298054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6219	NC_022655	CAT	2	6	298100	298105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560349
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6226	NC_022655	CCT	2	6	298426	298431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560349
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6228	NC_022655	GA	3	6	298520	298525	50 %	0 %	50 %	0 %	556560349
6229	NC_022655	CTT	2	6	298549	298554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560349
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6231	NC_022655	AG	3	6	298609	298614	50 %	0 %	50 %	0 %	556560349
6232	NC_022655	AGGG	2	8	298667	298674	25 %	0 %	75 %	0 %	556560349
6233	NC_022655	GTA	2	6	298724	298729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560349
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6238	NC_022655	AAGC	2	8	299131	299138	50 %	0 %	25 %	25 %	556560349
6239	NC_022655	CAA	2	6	299150	299155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560349
6240	NC_022655	GCG	2	6	299270	299275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560349
6241	NC_022655	A	6	6	299329	299334	100 %	0 %	0 %	0 %	556560349
6242	NC_022655	A	6	6	299342	299347	100 %	0 %	0 %	0 %	556560349
6243	NC_022655	ACC	2	6	299354	299359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560349
6244	NC_022655	TGA	2	6	299418	299423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560349
6245	NC_022655	CTTT	2	8	299450	299457	0 %	75 %	0 %	25 %	556560349
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6498	NC_022655	AGTC	2	8	310961	310968	25 %	25 %	25 %	25 %	556560360
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