MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 42864

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022655	AAT	2	6	242275	242280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_022655	AATG	2	8	242289	242296	50 %	25 %	25 %	0 %	556560293
5003	NC_022655	TGA	2	6	242316	242321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560293
5004	NC_022655	CTG	2	6	242337	242342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560293
5005	NC_022655	AAAG	2	8	242470	242477	75 %	0 %	25 %	0 %	556560293
5006	NC_022655	GAA	2	6	242486	242491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560293
5007	NC_022655	CTA	2	6	242569	242574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560293
5008	NC_022655	TATT	2	8	242664	242671	25 %	75 %	0 %	0 %	556560293
5009	NC_022655	AAG	2	6	242705	242710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560293
5010	NC_022655	ATC	2	6	242712	242717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560293
5011	NC_022655	AAC	2	6	242733	242738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560293
5012	NC_022655	GAA	2	6	242779	242784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560293
5013	NC_022655	AAC	2	6	242877	242882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560293
5014	NC_022655	CCT	2	6	242897	242902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560293
5015	NC_022655	A	6	6	242939	242944	100 %	0 %	0 %	0 %	556560293
5016	NC_022655	GAC	2	6	242998	243003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560293
5017	NC_022655	GTT	2	6	243032	243037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560293
5018	NC_022655	TCA	2	6	243165	243170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560293
5019	NC_022655	AGA	2	6	243171	243176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560293
5020	NC_022655	GTT	2	6	243260	243265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560293
5021	NC_022655	TTG	2	6	243369	243374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560293
5022	NC_022655	GCT	2	6	243380	243385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560293
5023	NC_022655	GGC	2	6	243454	243459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560293
5024	NC_022655	GGA	2	6	243508	243513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560293
5025	NC_022655	ACG	2	6	243587	243592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560293
5026	NC_022655	CTAT	2	8	243603	243610	25 %	50 %	0 %	25 %	556560293
5027	NC_022655	TGA	2	6	243670	243675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560293
5028	NC_022655	TAC	2	6	243709	243714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560293
5029	NC_022655	GAT	2	6	243734	243739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560293
5030	NC_022655	CAC	2	6	243992	243997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560293
5031	NC_022655	GTC	2	6	244026	244031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560293
5032	NC_022655	A	6	6	244124	244129	100 %	0 %	0 %	0 %	556560293
5033	NC_022655	AGGT	2	8	244167	244174	25 %	25 %	50 %	0 %	556560293
5034	NC_022655	A	6	6	244177	244182	100 %	0 %	0 %	0 %	556560293
5035	NC_022655	GCG	2	6	244340	244345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560293
5036	NC_022655	TAT	2	6	244361	244366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560293
5037	NC_022655	CTAT	2	8	244392	244399	25 %	50 %	0 %	25 %	556560293
5038	NC_022655	GGA	2	6	244435	244440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560293
5039	NC_022655	GAA	2	6	244532	244537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560293
5040	NC_022655	GAT	2	6	244582	244587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560293
5041	NC_022655	GAA	2	6	244802	244807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560293
5042	NC_022655	TTG	2	6	244869	244874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560293
5043	NC_022655	TGGT	2	8	244980	244987	0 %	50 %	50 %	0 %	556560293
5044	NC_022655	CT	4	8	245049	245056	0 %	50 %	0 %	50 %	556560293
5045	NC_022655	GTCAGT	2	12	245073	245084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556560293
5046	NC_022655	CCTT	2	8	245199	245206	0 %	50 %	0 %	50 %	556560293
5047	NC_022655	GAA	2	6	245300	245305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560293
5048	NC_022655	CGAG	2	8	245374	245381	25 %	0 %	50 %	25 %	556560293
5049	NC_022655	GCG	2	6	245432	245437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560293
5050	NC_022655	ACA	2	6	245450	245455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560293
5051	NC_022655	G	6	6	245467	245472	0 %	0 %	100 %	0 %	556560293
5052	NC_022655	GTT	2	6	245477	245482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560293
5053	NC_022655	CAG	2	6	245529	245534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560293
5054	NC_022655	ATG	2	6	245535	245540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560293
5055	NC_022655	CACT	2	8	245560	245567	25 %	25 %	0 %	50 %	556560293
5056	NC_022655	ATG	2	6	245619	245624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560293
5057	NC_022655	TAA	2	6	245671	245676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560293
5058	NC_022655	GTCTG	2	10	245857	245866	0 %	40 %	40 %	20 %	556560293
5059	NC_022655	TTGG	2	8	245884	245891	0 %	50 %	50 %	0 %	556560293
5060	NC_022655	GAC	2	6	245954	245959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560293
5061	NC_022655	CATG	2	8	245974	245981	25 %	25 %	25 %	25 %	556560293
5062	NC_022655	AGA	2	6	246052	246057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560293
5063	NC_022655	GA	3	6	246059	246064	50 %	0 %	50 %	0 %	556560293
5064	NC_022655	TAA	2	6	246091	246096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560293
5065	NC_022655	ATG	2	6	246173	246178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560293
5066	NC_022655	TATT	2	8	246214	246221	25 %	75 %	0 %	0 %	556560293
5067	NC_022655	ACT	2	6	246222	246227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560293
5068	NC_022655	TCA	2	6	246291	246296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560293
5069	NC_022655	GAA	2	6	246308	246313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560293
5070	NC_022655	GAA	2	6	246328	246333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560293
5071	NC_022655	CCA	2	6	246479	246484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560293
5072	NC_022655	ATGG	2	8	246494	246501	25 %	25 %	50 %	0 %	556560293
5073	NC_022655	GA	3	6	246507	246512	50 %	0 %	50 %	0 %	556560293
5074	NC_022655	CT	3	6	246557	246562	0 %	50 %	0 %	50 %	556560293
5075	NC_022655	GTG	2	6	246582	246587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560293
5076	NC_022655	TCA	2	6	246593	246598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560293
5077	NC_022655	GATG	2	8	246613	246620	25 %	25 %	50 %	0 %	556560293
5078	NC_022655	GTTT	2	8	246663	246670	0 %	75 %	25 %	0 %	556560293
5079	NC_022655	GTT	2	6	246676	246681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560293
5080	NC_022655	A	6	6	246684	246689	100 %	0 %	0 %	0 %	556560293
5081	NC_022655	TAA	2	6	246695	246700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_022655	CTTT	2	8	246744	246751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_022655	T	6	6	246749	246754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_022655	ACA	2	6	246874	246879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560294
5085	NC_022655	TAGAC	2	10	246936	246945	40 %	20 %	20 %	20 %	556560294
5086	NC_022655	GGA	2	6	247032	247037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560294
5087	NC_022655	A	6	6	247073	247078	100 %	0 %	0 %	0 %	556560295
5088	NC_022655	ATT	2	6	247117	247122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560295
5089	NC_022655	AGA	2	6	247123	247128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560295
5090	NC_022655	TCAT	2	8	247180	247187	25 %	50 %	0 %	25 %	556560295
5091	NC_022655	CCAG	2	8	247231	247238	25 %	0 %	25 %	50 %	556560295
5092	NC_022655	ATTT	2	8	247311	247318	25 %	75 %	0 %	0 %	556560295
5093	NC_022655	AAG	2	6	247378	247383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_022655	TTC	2	6	247421	247426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_022655	GAAA	2	8	247482	247489	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_022655	TTG	2	6	247561	247566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560296
5097	NC_022655	CT	4	8	247607	247614	0 %	50 %	0 %	50 %	556560296
5098	NC_022655	AAG	2	6	247655	247660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560296
5099	NC_022655	GAT	2	6	247702	247707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560296
5100	NC_022655	TCC	2	6	247727	247732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560296
5101	NC_022655	GTTC	2	8	247822	247829	0 %	50 %	25 %	25 %	556560296
5102	NC_022655	AGC	2	6	247953	247958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560296
5103	NC_022655	GCT	2	6	247960	247965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560296
5104	NC_022655	TGC	2	6	247998	248003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560296
5105	NC_022655	CGA	2	6	248007	248012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560296
5106	NC_022655	GGA	2	6	248088	248093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560296
5107	NC_022655	TAA	2	6	248130	248135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560296
5108	NC_022655	GAA	2	6	248242	248247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560296
5109	NC_022655	AGA	2	6	248268	248273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560296
5110	NC_022655	CGT	2	6	248296	248301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560296
5111	NC_022655	CTG	2	6	248402	248407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560296
5112	NC_022655	TCAG	2	8	248505	248512	25 %	25 %	25 %	25 %	556560296
5113	NC_022655	TCT	2	6	248519	248524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560296
5114	NC_022655	GTT	2	6	248590	248595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560296
5115	NC_022655	ATA	2	6	248762	248767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560297
5116	NC_022655	TAT	2	6	248934	248939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560297
5117	NC_022655	T	6	6	248975	248980	0 %	100 %	0 %	0 %	556560297
5118	NC_022655	AT	3	6	249108	249113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_022655	AGG	2	6	249170	249175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_022655	CCT	2	6	249192	249197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_022655	TGATA	2	10	249200	249209	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_022655	A	6	6	249313	249318	100 %	0 %	0 %	0 %	556560298
5123	NC_022655	TGA	2	6	249342	249347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560298
5124	NC_022655	A	6	6	249347	249352	100 %	0 %	0 %	0 %	556560298
5125	NC_022655	CTA	2	6	249402	249407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560298
5126	NC_022655	ATG	2	6	249409	249414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560298
5127	NC_022655	TTG	2	6	249475	249480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560298
5128	NC_022655	ATG	2	6	249560	249565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560298
5129	NC_022655	TTC	2	6	249581	249586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560298
5130	NC_022655	AAG	2	6	249647	249652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560298
5131	NC_022655	TCA	2	6	249783	249788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560298
5132	NC_022655	TGG	2	6	249800	249805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560298
5133	NC_022655	GTG	2	6	249823	249828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560298
5134	NC_022655	GAA	2	6	249907	249912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560298
5135	NC_022655	ATT	2	6	249934	249939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560298
5136	NC_022655	T	6	6	250097	250102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_022655	AGG	2	6	250148	250153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_022655	TGC	2	6	250239	250244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560299
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5141	NC_022655	CTT	2	6	250542	250547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560299
5142	NC_022655	CAA	2	6	250561	250566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560299
5143	NC_022655	TGG	2	6	250569	250574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560299
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5153	NC_022655	GTTTG	2	10	251098	251107	0 %	60 %	40 %	0 %	556560299
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5156	NC_022655	TGGA	2	8	251365	251372	25 %	25 %	50 %	0 %	556560299
5157	NC_022655	GTT	2	6	251392	251397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560299
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5160	NC_022655	A	6	6	251502	251507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5161	NC_022655	ATG	2	6	251553	251558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560300
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5163	NC_022655	ATA	2	6	251601	251606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560300
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5165	NC_022655	TAAG	2	8	251629	251636	50 %	25 %	25 %	0 %	556560300
5166	NC_022655	AAAGT	2	10	251644	251653	60 %	20 %	20 %	0 %	556560300
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5202	NC_022655	CAC	2	6	253026	253031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560301
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5207	NC_022655	TGGT	2	8	253198	253205	0 %	50 %	50 %	0 %	556560301
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5210	NC_022655	ATAA	2	8	253303	253310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5211	NC_022655	CAAA	2	8	253344	253351	75 %	0 %	0 %	25 %	556560302
5212	NC_022655	T	6	6	253354	253359	0 %	100 %	0 %	0 %	556560302
5213	NC_022655	T	6	6	253410	253415	0 %	100 %	0 %	0 %	556560302
5214	NC_022655	TCT	2	6	253430	253435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560302
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5216	NC_022655	CGC	2	6	253518	253523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556560302
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5221	NC_022655	GATT	2	8	253794	253801	25 %	50 %	25 %	0 %	556560302
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5230	NC_022655	GCA	2	6	254141	254146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560302
5231	NC_022655	TTA	2	6	254153	254158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560302
5232	NC_022655	ATC	2	6	254173	254178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560302
5233	NC_022655	CTGA	2	8	254244	254251	25 %	25 %	25 %	25 %	556560302
5234	NC_022655	CAG	2	6	254259	254264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560302
5235	NC_022655	AAT	2	6	254284	254289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560302
5236	NC_022655	ATT	2	6	254303	254308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560302
5237	NC_022655	TCC	2	6	254314	254319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5238	NC_022655	T	6	6	254320	254325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_022655	A	7	7	254382	254388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_022655	A	6	6	254404	254409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_022655	A	6	6	254412	254417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_022655	GAG	2	6	254452	254457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_022655	A	6	6	254489	254494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_022655	GAA	2	6	254499	254504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_022655	TCG	2	6	254589	254594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560303
5246	NC_022655	TCT	2	6	254610	254615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560303
5247	NC_022655	AAC	2	6	254630	254635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560303
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5368	NC_022655	A	6	6	260524	260529	100 %	0 %	0 %	0 %	556560308
5369	NC_022655	TCAT	2	8	260580	260587	25 %	50 %	0 %	25 %	556560308
5370	NC_022655	TGG	2	6	260670	260675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560308
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5372	NC_022655	AGCAG	2	10	260893	260902	40 %	0 %	40 %	20 %	556560308
5373	NC_022655	TAT	2	6	260911	260916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560308
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5378	NC_022655	TGA	2	6	261276	261281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560308
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5499	NC_022655	T	6	6	266677	266682	0 %	100 %	0 %	0 %	556560316
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