MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of strain 284/09 Stolbur phytoplasma draft

Total Repeats: 534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022588	AT	3	6	1028	1033	50 %	50 %	0 %	0 %	554085531
2	NC_022588	AT	3	6	1445	1450	50 %	50 %	0 %	0 %	554085531
3	NC_022588	AG	3	6	1605	1610	50 %	0 %	50 %	0 %	554085531
4	NC_022588	TA	3	6	1927	1932	50 %	50 %	0 %	0 %	554085531
5	NC_022588	AT	3	6	2244	2249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022588	AT	3	6	2258	2263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022588	TA	3	6	2577	2582	50 %	50 %	0 %	0 %	554085532
8	NC_022588	AT	3	6	3482	3487	50 %	50 %	0 %	0 %	554085533
9	NC_022588	TA	3	6	3873	3878	50 %	50 %	0 %	0 %	554085533
10	NC_022588	AC	3	6	6060	6065	50 %	0 %	0 %	50 %	554085534
11	NC_022588	TA	4	8	7808	7815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022588	GT	3	6	8642	8647	0 %	50 %	50 %	0 %	554085536
13	NC_022588	AT	3	6	11133	11138	50 %	50 %	0 %	0 %	554085539
14	NC_022588	AT	3	6	12931	12936	50 %	50 %	0 %	0 %	554085542
15	NC_022588	AT	3	6	12996	13001	50 %	50 %	0 %	0 %	554085542
16	NC_022588	TG	3	6	16112	16117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022588	AT	3	6	16428	16433	50 %	50 %	0 %	0 %	554085547
18	NC_022588	TA	3	6	17075	17080	50 %	50 %	0 %	0 %	554085548
19	NC_022588	TG	3	6	17498	17503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022588	AT	3	6	17812	17817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022588	CT	3	6	18239	18244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022588	TA	3	6	18864	18869	50 %	50 %	0 %	0 %	554085550
23	NC_022588	AT	3	6	20845	20850	50 %	50 %	0 %	0 %	554085553
24	NC_022588	AT	3	6	23408	23413	50 %	50 %	0 %	0 %	554085556
25	NC_022588	AT	3	6	25262	25267	50 %	50 %	0 %	0 %	554085557
26	NC_022588	AC	4	8	28565	28572	50 %	0 %	0 %	50 %	554085560
27	NC_022588	GT	3	6	29742	29747	0 %	50 %	50 %	0 %	554085561
28	NC_022588	AT	4	8	34214	34221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022588	AG	3	6	34550	34555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022588	AT	3	6	34685	34690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022588	AT	3	6	35957	35962	50 %	50 %	0 %	0 %	554085564
32	NC_022588	TA	4	8	36438	36445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022588	AT	3	6	36825	36830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022588	AT	3	6	38092	38097	50 %	50 %	0 %	0 %	554085565
35	NC_022588	TA	3	6	38867	38872	50 %	50 %	0 %	0 %	554085565
36	NC_022588	AT	3	6	38922	38927	50 %	50 %	0 %	0 %	554085565
37	NC_022588	TA	3	6	40845	40850	50 %	50 %	0 %	0 %	554085566
38	NC_022588	AG	3	6	43645	43650	50 %	0 %	50 %	0 %	554085568
39	NC_022588	AT	3	6	44478	44483	50 %	50 %	0 %	0 %	554085569
40	NC_022588	AT	3	6	45438	45443	50 %	50 %	0 %	0 %	554085570
41	NC_022588	TG	4	8	45547	45554	0 %	50 %	50 %	0 %	554085570
42	NC_022588	GT	3	6	45668	45673	0 %	50 %	50 %	0 %	554085570
43	NC_022588	AT	3	6	48201	48206	50 %	50 %	0 %	0 %	554085572
44	NC_022588	AT	3	6	48884	48889	50 %	50 %	0 %	0 %	554085573
45	NC_022588	TA	3	6	49349	49354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022588	TA	3	6	50434	50439	50 %	50 %	0 %	0 %	554085575
47	NC_022588	AT	3	6	50532	50537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022588	AG	3	6	50589	50594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022588	AC	3	6	50664	50669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022588	AC	3	6	51244	51249	50 %	0 %	0 %	50 %	554085576
51	NC_022588	TG	3	6	51323	51328	0 %	50 %	50 %	0 %	554085576
52	NC_022588	GT	3	6	52554	52559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022588	AT	3	6	52954	52959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022588	AC	3	6	54008	54013	50 %	0 %	0 %	50 %	554085578
55	NC_022588	GA	3	6	55299	55304	50 %	0 %	50 %	0 %	554085580
56	NC_022588	CA	3	6	56814	56819	50 %	0 %	0 %	50 %	554085581
57	NC_022588	AG	3	6	58536	58541	50 %	0 %	50 %	0 %	554085582
58	NC_022588	TA	3	6	59929	59934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022588	AC	3	6	60795	60800	50 %	0 %	0 %	50 %	554085585
60	NC_022588	AT	3	6	61230	61235	50 %	50 %	0 %	0 %	554085585
61	NC_022588	TA	3	6	61681	61686	50 %	50 %	0 %	0 %	554085586
62	NC_022588	AC	3	6	61698	61703	50 %	0 %	0 %	50 %	554085586
63	NC_022588	AT	3	6	64315	64320	50 %	50 %	0 %	0 %	554085589
64	NC_022588	TA	4	8	65460	65467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022588	TG	3	6	65679	65684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022588	AC	3	6	65961	65966	50 %	0 %	0 %	50 %	554085592
67	NC_022588	AT	3	6	67119	67124	50 %	50 %	0 %	0 %	554085592
68	NC_022588	TA	3	6	67311	67316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022588	TC	3	6	68606	68611	0 %	50 %	0 %	50 %	554085594
70	NC_022588	AT	3	6	69440	69445	50 %	50 %	0 %	0 %	554085597
71	NC_022588	GT	3	6	71844	71849	0 %	50 %	50 %	0 %	554085599
72	NC_022588	AT	3	6	72506	72511	50 %	50 %	0 %	0 %	554085600
73	NC_022588	AT	3	6	72669	72674	50 %	50 %	0 %	0 %	554085600
74	NC_022588	AC	4	8	75971	75978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_022588	AT	3	6	77658	77663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022588	AT	3	6	78180	78185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022588	CA	3	6	79776	79781	50 %	0 %	0 %	50 %	554085604
78	NC_022588	TA	4	8	80555	80562	50 %	50 %	0 %	0 %	554085604
79	NC_022588	GT	4	8	80833	80840	0 %	50 %	50 %	0 %	554085604
80	NC_022588	AT	3	6	81064	81069	50 %	50 %	0 %	0 %	554085604
81	NC_022588	TG	3	6	81485	81490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022588	AT	3	6	82707	82712	50 %	50 %	0 %	0 %	554085605
83	NC_022588	TG	3	6	83763	83768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022588	TA	3	6	83848	83853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022588	GT	3	6	86583	86588	0 %	50 %	50 %	0 %	554085607
86	NC_022588	AC	3	6	87913	87918	50 %	0 %	0 %	50 %	554085607
87	NC_022588	TA	3	6	89696	89701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022588	AT	3	6	90675	90680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022588	AC	3	6	91943	91948	50 %	0 %	0 %	50 %	554085609
90	NC_022588	AC	3	6	92270	92275	50 %	0 %	0 %	50 %	554085610
91	NC_022588	AT	3	6	93070	93075	50 %	50 %	0 %	0 %	554085610
92	NC_022588	AC	3	6	95776	95781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022588	AT	3	6	96987	96992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022588	AT	4	8	97820	97827	50 %	50 %	0 %	0 %	554085615
95	NC_022588	TA	3	6	97912	97917	50 %	50 %	0 %	0 %	554085615
96	NC_022588	TA	3	6	100044	100049	50 %	50 %	0 %	0 %	554085616
97	NC_022588	TA	3	6	100567	100572	50 %	50 %	0 %	0 %	554085616
98	NC_022588	TA	3	6	101109	101114	50 %	50 %	0 %	0 %	554085616
99	NC_022588	GC	3	6	102878	102883	0 %	0 %	50 %	50 %	554085617
100	NC_022588	AT	3	6	103657	103662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022588	CA	3	6	103776	103781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022588	TA	3	6	103817	103822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022588	TA	3	6	104141	104146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022588	AT	3	6	104383	104388	50 %	50 %	0 %	0 %	554085618
105	NC_022588	TA	3	6	105396	105401	50 %	50 %	0 %	0 %	554085618
106	NC_022588	AT	3	6	105501	105506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022588	AT	3	6	105543	105548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022588	TA	3	6	107074	107079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022588	GA	3	6	108835	108840	50 %	0 %	50 %	0 %	554085621
110	NC_022588	AT	3	6	109236	109241	50 %	50 %	0 %	0 %	554085621
111	NC_022588	CA	3	6	111229	111234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022588	AT	3	6	111608	111613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022588	TA	3	6	111741	111746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022588	GA	3	6	112330	112335	50 %	0 %	50 %	0 %	554085623
115	NC_022588	CA	3	6	112803	112808	50 %	0 %	0 %	50 %	554085623
116	NC_022588	AT	3	6	113435	113440	50 %	50 %	0 %	0 %	554085623
117	NC_022588	TA	3	6	114690	114695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022588	TA	3	6	116266	116271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022588	TA	3	6	116582	116587	50 %	50 %	0 %	0 %	554085627
120	NC_022588	AT	3	6	116742	116747	50 %	50 %	0 %	0 %	554085627
121	NC_022588	TC	5	10	119379	119388	0 %	50 %	0 %	50 %	554085629
122	NC_022588	TA	3	6	121370	121375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022588	AT	3	6	122333	122338	50 %	50 %	0 %	0 %	554085630
124	NC_022588	TA	3	6	123189	123194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022588	TA	3	6	123533	123538	50 %	50 %	0 %	0 %	554085631
126	NC_022588	GT	3	6	124335	124340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022588	TA	3	6	124427	124432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022588	TA	3	6	125565	125570	50 %	50 %	0 %	0 %	554085634
129	NC_022588	AC	6	12	125799	125810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022588	CA	3	6	125964	125969	50 %	0 %	0 %	50 %	554085635
131	NC_022588	AT	3	6	127123	127128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022588	GT	3	6	127341	127346	0 %	50 %	50 %	0 %	554085636
133	NC_022588	GT	3	6	127624	127629	0 %	50 %	50 %	0 %	554085636
134	NC_022588	TC	3	6	127873	127878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022588	TA	4	8	128897	128904	50 %	50 %	0 %	0 %	554085638
136	NC_022588	AT	3	6	128980	128985	50 %	50 %	0 %	0 %	554085638
137	NC_022588	AT	3	6	129043	129048	50 %	50 %	0 %	0 %	554085638
138	NC_022588	TA	3	6	129161	129166	50 %	50 %	0 %	0 %	554085639
139	NC_022588	AT	3	6	129287	129292	50 %	50 %	0 %	0 %	554085639
140	NC_022588	AT	3	6	129395	129400	50 %	50 %	0 %	0 %	554085639
141	NC_022588	AT	3	6	129753	129758	50 %	50 %	0 %	0 %	554085640
142	NC_022588	AT	3	6	129855	129860	50 %	50 %	0 %	0 %	554085640
143	NC_022588	AT	3	6	129887	129892	50 %	50 %	0 %	0 %	554085640
144	NC_022588	AT	3	6	130056	130061	50 %	50 %	0 %	0 %	554085640
145	NC_022588	AT	3	6	130208	130213	50 %	50 %	0 %	0 %	554085641
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