MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 plasmid pDT104

Total Repeats: 2047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022570	AGG	2	6	22235	22240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550903958
502	NC_022570	AGG	2	6	22339	22344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550903959
503	NC_022570	GGT	2	6	22348	22353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550903959
504	NC_022570	GCTG	2	8	22374	22381	0 %	25 %	50 %	25 %	550903959
505	NC_022570	CTG	2	6	22397	22402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903959
506	NC_022570	CGG	2	6	22444	22449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550903959
507	NC_022570	GCT	2	6	22453	22458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903959
508	NC_022570	CGA	2	6	22471	22476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550903959
509	NC_022570	GCCG	2	8	22511	22518	0 %	0 %	50 %	50 %	550903959
510	NC_022570	TGA	3	9	22524	22532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550903959
511	NC_022570	AGCCTG	2	12	22544	22555	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	550903959
512	NC_022570	CGC	2	6	22563	22568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550903959
513	NC_022570	TCCG	2	8	22572	22579	0 %	25 %	25 %	50 %	550903959
514	NC_022570	CTG	2	6	22583	22588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903959
515	NC_022570	GGC	2	6	22672	22677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550903959
516	NC_022570	GCC	2	6	22694	22699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550903959
517	NC_022570	G	6	6	22700	22705	0 %	0 %	100 %	0 %	550903959
518	NC_022570	GAC	2	6	22721	22726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550903959
519	NC_022570	GAT	2	6	22771	22776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550903959
520	NC_022570	GC	3	6	22778	22783	0 %	0 %	50 %	50 %	550903959
521	NC_022570	GGC	2	6	22849	22854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_022570	GC	3	6	22853	22858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
523	NC_022570	G	6	6	22870	22875	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022570	GCG	2	6	22899	22904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_022570	A	6	6	22944	22949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022570	GTT	2	6	23005	23010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550903960
527	NC_022570	GGCA	2	8	23027	23034	25 %	0 %	50 %	25 %	550903960
528	NC_022570	CCCTGT	2	12	23085	23096	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	550903960
529	NC_022570	TGG	2	6	23111	23116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550903960
530	NC_022570	CCG	2	6	23179	23184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550903960
531	NC_022570	GAC	3	9	23225	23233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550903960
532	NC_022570	GTG	2	6	23285	23290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550903960
533	NC_022570	CCCG	2	8	23310	23317	0 %	0 %	25 %	75 %	550903960
534	NC_022570	CCG	2	6	23326	23331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550903960
535	NC_022570	CCGG	2	8	23344	23351	0 %	0 %	50 %	50 %	550903960
536	NC_022570	GTGA	2	8	23360	23367	25 %	25 %	50 %	0 %	550903960
537	NC_022570	GCT	2	6	23398	23403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903960
538	NC_022570	CCCG	2	8	23406	23413	0 %	0 %	25 %	75 %	550903960
539	NC_022570	CGG	2	6	23416	23421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550903960
540	NC_022570	GCC	2	6	23438	23443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550903960
541	NC_022570	GGCA	2	8	23445	23452	25 %	0 %	50 %	25 %	550903960
542	NC_022570	CAT	2	6	23472	23477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550903960
543	NC_022570	GGT	2	6	23567	23572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550903961
544	NC_022570	CGC	2	6	23582	23587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550903961
545	NC_022570	GGCA	2	8	23589	23596	25 %	0 %	50 %	25 %	550903961
546	NC_022570	TGC	2	6	23603	23608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903961
547	NC_022570	GGC	2	6	23610	23615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550903961
548	NC_022570	GCT	2	6	23688	23693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903961
549	NC_022570	AGG	2	6	23700	23705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550903961
550	NC_022570	CTGC	2	8	23745	23752	0 %	25 %	25 %	50 %	550903961
551	NC_022570	CAG	2	6	23793	23798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550903961
552	NC_022570	GGC	2	6	23822	23827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550903961
553	NC_022570	CGA	2	6	23831	23836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550903961
554	NC_022570	TC	3	6	23844	23849	0 %	50 %	0 %	50 %	550903961
555	NC_022570	GCGA	2	8	23855	23862	25 %	0 %	50 %	25 %	550903961
556	NC_022570	TG	3	6	23870	23875	0 %	50 %	50 %	0 %	550903961
557	NC_022570	CG	3	6	23895	23900	0 %	0 %	50 %	50 %	550903961
558	NC_022570	CGC	2	6	23946	23951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550903961
559	NC_022570	GC	3	6	23953	23958	0 %	0 %	50 %	50 %	550903961
560	NC_022570	GCT	2	6	23972	23977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_022570	GCCT	2	8	23995	24002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_022570	GCG	2	6	24009	24014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_022570	ATG	2	6	24024	24029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_022570	CGC	2	6	24043	24048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_022570	CAG	2	6	24056	24061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_022570	GAC	2	6	24065	24070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_022570	AC	3	6	24123	24128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_022570	TCC	2	6	24164	24169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_022570	CCA	2	6	24221	24226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_022570	GCC	2	6	24319	24324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_022570	GGCGCA	2	12	24375	24386	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_022570	A	6	6	24409	24414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_022570	ACC	2	6	24449	24454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_022570	CGA	2	6	24465	24470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_022570	CGG	2	6	24482	24487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_022570	CGG	2	6	24498	24503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_022570	TGC	2	6	24543	24548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_022570	GCA	2	6	24576	24581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_022570	GCCA	2	8	24619	24626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_022570	GCC	3	9	24640	24648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_022570	CGG	2	6	24743	24748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550903962
582	NC_022570	GGA	2	6	24827	24832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550903962
583	NC_022570	CGT	2	6	24886	24891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903962
584	NC_022570	AGA	2	6	24970	24975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550903962
585	NC_022570	CCG	2	6	24991	24996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550903962
586	NC_022570	GCT	2	6	25019	25024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903962
587	NC_022570	AGC	2	6	25039	25044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550903962
588	NC_022570	GC	3	6	25043	25048	0 %	0 %	50 %	50 %	550903962
589	NC_022570	CAGC	2	8	25118	25125	25 %	0 %	25 %	50 %	550903962
590	NC_022570	CTGA	2	8	25179	25186	25 %	25 %	25 %	25 %	550903962
591	NC_022570	AGG	2	6	25222	25227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550903962
592	NC_022570	T	6	6	25470	25475	0 %	100 %	0 %	0 %	550903963
593	NC_022570	AT	3	6	25629	25634	50 %	50 %	0 %	0 %	550903963
594	NC_022570	AT	3	6	25674	25679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022570	TATT	2	8	25682	25689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022570	CAC	2	6	25724	25729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_022570	TTC	2	6	25746	25751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_022570	GTAA	2	8	25766	25773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022570	GATG	2	8	25896	25903	25 %	25 %	50 %	0 %	550903964
600	NC_022570	CTG	2	6	25924	25929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903964
601	NC_022570	AAT	2	6	25969	25974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550903964
602	NC_022570	TCG	2	6	25987	25992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903964
603	NC_022570	CAG	2	6	26005	26010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550903964
604	NC_022570	GCT	2	6	26043	26048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550903964
605	NC_022570	GGT	2	6	26080	26085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550903964
606	NC_022570	CAGA	2	8	26118	26125	50 %	0 %	25 %	25 %	550903964
607	NC_022570	CCCG	2	8	26177	26184	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
608	NC_022570	CT	3	6	26220	26225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_022570	A	6	6	26256	26261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022570	TCA	2	6	26279	26284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550903965
611	NC_022570	TGA	3	9	26308	26316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550903965
612	NC_022570	T	7	7	26323	26329	0 %	100 %	0 %	0 %	550903965
613	NC_022570	T	6	6	26392	26397	0 %	100 %	0 %	0 %	550903965
614	NC_022570	ATT	2	6	26447	26452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550903965
615	NC_022570	CAA	2	6	26592	26597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550903965
616	NC_022570	TTC	2	6	26633	26638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550903965
617	NC_022570	AT	3	6	26646	26651	50 %	50 %	0 %	0 %	550903965
618	NC_022570	ATGT	2	8	26662	26669	25 %	50 %	25 %	0 %	550903965
619	NC_022570	ATA	2	6	26688	26693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550903965
620	NC_022570	GTAT	2	8	26719	26726	25 %	50 %	25 %	0 %	550903965
621	NC_022570	TC	3	6	26788	26793	0 %	50 %	0 %	50 %	550903965
622	NC_022570	ATT	3	9	26845	26853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550903965
623	NC_022570	T	6	6	26858	26863	0 %	100 %	0 %	0 %	550903965
624	NC_022570	ATA	2	6	26960	26965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_022570	A	6	6	26972	26977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_022570	G	6	6	27069	27074	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
627	NC_022570	TAA	2	6	27106	27111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_022570	TACT	2	8	27174	27181	25 %	50 %	0 %	25 %	550903966
629	NC_022570	TCA	2	6	27185	27190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550903966
630	NC_022570	CCA	2	6	27235	27240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550903966
631	NC_022570	ACG	2	6	27389	27394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550903966
632	NC_022570	CTGGT	2	10	27414	27423	0 %	40 %	40 %	20 %	550903966
633	NC_022570	TA	3	6	27426	27431	50 %	50 %	0 %	0 %	550903966
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