MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 11225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022544	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022544	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	549722730
3	NC_022544	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	549722730
4	NC_022544	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	549722731
5	NC_022544	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	549722732
6	NC_022544	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	549722732
7	NC_022544	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	549722732
8	NC_022544	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	549722732
9	NC_022544	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	549722734
10	NC_022544	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	549722734
11	NC_022544	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	549722735
12	NC_022544	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	549722735
13	NC_022544	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_022544	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	549722737
15	NC_022544	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	549722738
16	NC_022544	TTGA	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	549722739
17	NC_022544	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	549722739
18	NC_022544	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	549722739
19	NC_022544	TCTG	2	8	11389	11396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022544	ATGG	2	8	11647	11654	25 %	25 %	50 %	0 %	549722740
21	NC_022544	TGGT	2	8	11738	11745	0 %	50 %	50 %	0 %	549722740
22	NC_022544	CAAC	2	8	12251	12258	50 %	0 %	0 %	50 %	549722740
23	NC_022544	AAGA	2	8	12325	12332	75 %	0 %	25 %	0 %	549722740
24	NC_022544	CCAT	2	8	12902	12909	25 %	25 %	0 %	50 %	549722740
25	NC_022544	GCGT	2	8	12930	12937	0 %	25 %	50 %	25 %	549722740
26	NC_022544	GGCT	2	8	13422	13429	0 %	25 %	50 %	25 %	549722740
27	NC_022544	CGGT	2	8	14592	14599	0 %	25 %	50 %	25 %	549722741
28	NC_022544	TCAG	2	8	15243	15250	25 %	25 %	25 %	25 %	549722742
29	NC_022544	TTTG	2	8	15533	15540	0 %	75 %	25 %	0 %	549722742
30	NC_022544	CGAA	2	8	15748	15755	50 %	0 %	25 %	25 %	549722742
31	NC_022544	ATTG	2	8	15760	15767	25 %	50 %	25 %	0 %	549722742
32	NC_022544	ATTA	2	8	16428	16435	50 %	50 %	0 %	0 %	549722743
33	NC_022544	ATAA	2	8	16520	16527	75 %	25 %	0 %	0 %	549722744
34	NC_022544	AATA	2	8	17996	18003	75 %	25 %	0 %	0 %	549722746
35	NC_022544	GGGC	2	8	18582	18589	0 %	0 %	75 %	25 %	549722746
36	NC_022544	CGTG	2	8	19282	19289	0 %	25 %	50 %	25 %	549722746
37	NC_022544	CCAA	2	8	21283	21290	50 %	0 %	0 %	50 %	549722747
38	NC_022544	GACG	2	8	21629	21636	25 %	0 %	50 %	25 %	549722747
39	NC_022544	TGGC	2	8	22282	22289	0 %	25 %	50 %	25 %	549722747
40	NC_022544	TGGC	2	8	22388	22395	0 %	25 %	50 %	25 %	549722747
41	NC_022544	CGCC	2	8	22654	22661	0 %	0 %	25 %	75 %	549722747
42	NC_022544	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	549722747
43	NC_022544	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022544	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	549722748
45	NC_022544	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	549722748
46	NC_022544	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	549722749
47	NC_022544	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	549722749
48	NC_022544	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	549722750
49	NC_022544	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	549722750
50	NC_022544	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	549722751
51	NC_022544	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	549722751
52	NC_022544	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	549722751
53	NC_022544	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	549722751
54	NC_022544	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	549722751
55	NC_022544	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	549722751
56	NC_022544	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	549722751
57	NC_022544	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	549722751
58	NC_022544	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	549722752
59	NC_022544	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	549722752
60	NC_022544	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	549722753
61	NC_022544	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	549722755
62	NC_022544	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	549722755
63	NC_022544	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	549722755
64	NC_022544	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	549722755
65	NC_022544	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	549722756
66	NC_022544	ACCG	2	8	32226	32233	25 %	0 %	25 %	50 %	549722757
67	NC_022544	AGGC	2	8	32264	32271	25 %	0 %	50 %	25 %	549722757
68	NC_022544	CCTG	2	8	32700	32707	0 %	25 %	25 %	50 %	549722758
69	NC_022544	CGCA	2	8	32890	32897	25 %	0 %	25 %	50 %	549722758
70	NC_022544	TAAA	2	8	32960	32967	75 %	25 %	0 %	0 %	549722758
71	NC_022544	CCAG	2	8	33346	33353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022544	TTAT	2	8	33529	33536	25 %	75 %	0 %	0 %	549722759
73	NC_022544	TTGG	2	8	33913	33920	0 %	50 %	50 %	0 %	549722759
74	NC_022544	CTTT	2	8	34293	34300	0 %	75 %	0 %	25 %	549722759
75	NC_022544	GAAG	2	8	34333	34340	50 %	0 %	50 %	0 %	549722759
76	NC_022544	TAAA	2	8	34385	34392	75 %	25 %	0 %	0 %	549722760
77	NC_022544	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	549722760
78	NC_022544	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	549722760
79	NC_022544	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	549722760
80	NC_022544	TGAT	2	8	35032	35039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022544	TGGA	2	8	35549	35556	25 %	25 %	50 %	0 %	549722761
82	NC_022544	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	549722761
83	NC_022544	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	549722762
84	NC_022544	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	549722762
85	NC_022544	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	549722762
86	NC_022544	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	549722762
87	NC_022544	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	549722762
88	NC_022544	ATTA	2	8	38765	38772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022544	AATT	2	8	40048	40055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022544	GCGG	2	8	40539	40546	0 %	0 %	75 %	25 %	549722764
91	NC_022544	CTGG	2	8	40757	40764	0 %	25 %	50 %	25 %	549722764
92	NC_022544	CCGA	2	8	41274	41281	25 %	0 %	25 %	50 %	549722764
93	NC_022544	ATCG	2	8	41430	41437	25 %	25 %	25 %	25 %	549722764
94	NC_022544	TCAA	2	8	41491	41498	50 %	25 %	0 %	25 %	549722764
95	NC_022544	ACCG	2	8	41758	41765	25 %	0 %	25 %	50 %	549722765
96	NC_022544	GAAA	2	8	41809	41816	75 %	0 %	25 %	0 %	549722765
97	NC_022544	GGTC	2	8	42381	42388	0 %	25 %	50 %	25 %	549722765
98	NC_022544	TTTG	2	8	42905	42912	0 %	75 %	25 %	0 %	549722765
99	NC_022544	GTAT	2	8	43200	43207	25 %	50 %	25 %	0 %	549722766
100	NC_022544	TCCG	2	8	43594	43601	0 %	25 %	25 %	50 %	549722766
101	NC_022544	ATGA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	25 %	0 %	549722767
102	NC_022544	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	549722767
103	NC_022544	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_022544	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	549722768
105	NC_022544	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	549722768
106	NC_022544	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	549722768
107	NC_022544	CACG	2	8	47810	47817	25 %	0 %	25 %	50 %	549722769
108	NC_022544	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	549722769
109	NC_022544	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	549722769
110	NC_022544	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022544	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	549722770
112	NC_022544	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	549722770
113	NC_022544	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	549722770
114	NC_022544	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	549722770
115	NC_022544	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	549722771
116	NC_022544	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	549722771
117	NC_022544	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	549722771
118	NC_022544	TCTT	2	8	51363	51370	0 %	75 %	0 %	25 %	549722771
119	NC_022544	AGTA	2	8	51937	51944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022544	ATCA	2	8	51977	51984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022544	GAAA	2	8	52097	52104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022544	AGGG	2	8	52130	52137	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022544	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	549722774
124	NC_022544	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	549722774
125	NC_022544	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	549722774
126	NC_022544	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	549722775
127	NC_022544	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	549722777
128	NC_022544	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	549722777
129	NC_022544	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	549722777
130	NC_022544	TGAT	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	549722778
131	NC_022544	TGGA	2	8	58994	59001	25 %	25 %	50 %	0 %	549722779
132	NC_022544	CCTG	2	8	59030	59037	0 %	25 %	25 %	50 %	549722779
133	NC_022544	GATT	2	8	59392	59399	25 %	50 %	25 %	0 %	549722779
134	NC_022544	GATC	2	8	59761	59768	25 %	25 %	25 %	25 %	549722779
135	NC_022544	CTGG	2	8	60886	60893	0 %	25 %	50 %	25 %	549722780
136	NC_022544	GTGG	2	8	61051	61058	0 %	25 %	75 %	0 %	549722780
137	NC_022544	CTGC	2	8	61261	61268	0 %	25 %	25 %	50 %	549722781
138	NC_022544	ACCA	2	8	61897	61904	50 %	0 %	0 %	50 %	549722782
139	NC_022544	GTGG	2	8	61932	61939	0 %	25 %	75 %	0 %	549722782
140	NC_022544	CATT	2	8	62122	62129	25 %	50 %	0 %	25 %	549722782
141	NC_022544	TCAA	2	8	63163	63170	50 %	25 %	0 %	25 %	549722782
142	NC_022544	TACT	2	8	63482	63489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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