MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022544	GGGC	2	8	163692	163699	0 %	0 %	75 %	25 %	549722865
3502	NC_022544	GC	3	6	163720	163725	0 %	0 %	50 %	50 %	549722865
3503	NC_022544	ATA	2	6	163727	163732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722865
3504	NC_022544	CCG	2	6	163802	163807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722865
3505	NC_022544	CTA	2	6	163913	163918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_022544	A	7	7	163950	163956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_022544	GAA	2	6	164065	164070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722866
3508	NC_022544	CTG	2	6	164273	164278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722866
3509	NC_022544	GAA	2	6	164299	164304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722866
3510	NC_022544	A	6	6	164387	164392	100 %	0 %	0 %	0 %	549722866
3511	NC_022544	TCG	2	6	164477	164482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722866
3512	NC_022544	ACG	2	6	164614	164619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722866
3513	NC_022544	CGG	2	6	164654	164659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722866
3514	NC_022544	GGC	2	6	164713	164718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722866
3515	NC_022544	GGC	3	9	164752	164760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722866
3516	NC_022544	GGC	2	6	164779	164784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722866
3517	NC_022544	AG	3	6	164802	164807	50 %	0 %	50 %	0 %	549722866
3518	NC_022544	CGG	2	6	164808	164813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722866
3519	NC_022544	AGA	2	6	164823	164828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722866
3520	NC_022544	CGG	2	6	164892	164897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722866
3521	NC_022544	CG	3	6	164911	164916	0 %	0 %	50 %	50 %	549722866
3522	NC_022544	CAC	2	6	165045	165050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722866
3523	NC_022544	CTGG	2	8	165104	165111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_022544	ATCCC	2	10	165132	165141	20 %	20 %	0 %	60 %	549722867
3525	NC_022544	TGA	2	6	165213	165218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722867
3526	NC_022544	GCCAGC	2	12	165257	165268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549722867
3527	NC_022544	GCA	2	6	165300	165305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722867
3528	NC_022544	T	6	6	165377	165382	0 %	100 %	0 %	0 %	549722867
3529	NC_022544	GAA	2	6	165489	165494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722867
3530	NC_022544	AGA	2	6	165590	165595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722867
3531	NC_022544	CGCTGC	2	12	165596	165607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549722867
3532	NC_022544	AAT	2	6	165712	165717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722867
3533	NC_022544	AGA	2	6	165728	165733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722867
3534	NC_022544	GGC	2	6	165763	165768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722867
3535	NC_022544	GCA	2	6	165789	165794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722867
3536	NC_022544	GGC	2	6	165811	165816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722867
3537	NC_022544	AAT	2	6	165826	165831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722867
3538	NC_022544	AGCGC	2	10	165840	165849	20 %	0 %	40 %	40 %	549722867
3539	NC_022544	AGC	2	6	165906	165911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722867
3540	NC_022544	ATC	2	6	165947	165952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722867
3541	NC_022544	GCG	2	6	165963	165968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722867
3542	NC_022544	ATGA	2	8	166117	166124	50 %	25 %	25 %	0 %	549722867
3543	NC_022544	TGA	2	6	166136	166141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722867
3544	NC_022544	CTT	2	6	166161	166166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722867
3545	NC_022544	GCG	2	6	166175	166180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722867
3546	NC_022544	TGA	2	6	166233	166238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722867
3547	NC_022544	TGCC	2	8	166562	166569	0 %	25 %	25 %	50 %	549722868
3548	NC_022544	CAC	2	6	166607	166612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722868
3549	NC_022544	ACC	2	6	166671	166676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722868
3550	NC_022544	ATC	2	6	166695	166700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722868
3551	NC_022544	TGC	2	6	166719	166724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722868
3552	NC_022544	TGG	2	6	166744	166749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722868
3553	NC_022544	GCC	2	6	166791	166796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722868
3554	NC_022544	ATG	3	9	166842	166850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722868
3555	NC_022544	GC	4	8	166870	166877	0 %	0 %	50 %	50 %	549722868
3556	NC_022544	GGAT	2	8	166908	166915	25 %	25 %	50 %	0 %	549722868
3557	NC_022544	GC	3	6	167002	167007	0 %	0 %	50 %	50 %	549722868
3558	NC_022544	CAA	2	6	167153	167158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722868
3559	NC_022544	GAC	2	6	167165	167170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722868
3560	NC_022544	CTT	2	6	167179	167184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722868
3561	NC_022544	CGCC	2	8	167221	167228	0 %	0 %	25 %	75 %	549722868
3562	NC_022544	GAA	2	6	167350	167355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722868
3563	NC_022544	GAT	2	6	167521	167526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722868
3564	NC_022544	CA	3	6	167550	167555	50 %	0 %	0 %	50 %	549722868
3565	NC_022544	ACC	2	6	167619	167624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722868
3566	NC_022544	TGA	2	6	167667	167672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722868
3567	NC_022544	TGAGC	2	10	167689	167698	20 %	20 %	40 %	20 %	549722868
3568	NC_022544	TGT	2	6	167754	167759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722869
3569	NC_022544	CCAG	2	8	167795	167802	25 %	0 %	25 %	50 %	549722869
3570	NC_022544	GGCG	2	8	167825	167832	0 %	0 %	75 %	25 %	549722869
3571	NC_022544	ATG	2	6	167835	167840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722869
3572	NC_022544	TGA	2	6	167878	167883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722869
3573	NC_022544	TGA	2	6	167920	167925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722869
3574	NC_022544	CGCAT	2	10	167951	167960	20 %	20 %	20 %	40 %	549722869
3575	NC_022544	CCA	2	6	167970	167975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722869
3576	NC_022544	GAT	2	6	168098	168103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722869
3577	NC_022544	GTT	2	6	168142	168147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722869
3578	NC_022544	AAT	2	6	168307	168312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_022544	GA	3	6	168392	168397	50 %	0 %	50 %	0 %	549722870
3580	NC_022544	GC	4	8	168402	168409	0 %	0 %	50 %	50 %	549722870
3581	NC_022544	GC	3	6	168423	168428	0 %	0 %	50 %	50 %	549722870
3582	NC_022544	ATA	2	6	168572	168577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722870
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3584	NC_022544	ATA	2	6	168698	168703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722870
3585	NC_022544	GAT	2	6	168744	168749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722870
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3587	NC_022544	GCCA	2	8	168838	168845	25 %	0 %	25 %	50 %	549722870
3588	NC_022544	GCG	2	6	168859	168864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722870
3589	NC_022544	GTTCA	2	10	168946	168955	20 %	40 %	20 %	20 %	549722870
3590	NC_022544	TTGG	2	8	168964	168971	0 %	50 %	50 %	0 %	549722870
3591	NC_022544	CAT	2	6	169014	169019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722870
3592	NC_022544	CGCC	2	8	169020	169027	0 %	0 %	25 %	75 %	549722870
3593	NC_022544	CGG	2	6	169191	169196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_022544	GTCG	2	8	169236	169243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_022544	GGC	2	6	169262	169267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_022544	AGC	2	6	169322	169327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_022544	CAC	2	6	169334	169339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_022544	GTTG	2	8	169373	169380	0 %	50 %	50 %	0 %	549722871
3599	NC_022544	TGG	2	6	169448	169453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722871
3600	NC_022544	ATA	2	6	169457	169462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722871
3601	NC_022544	C	6	6	169471	169476	0 %	0 %	0 %	100 %	549722871
3602	NC_022544	ATT	2	6	169506	169511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722871
3603	NC_022544	T	7	7	169542	169548	0 %	100 %	0 %	0 %	549722871
3604	NC_022544	TCG	2	6	169590	169595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722871
3605	NC_022544	GCGT	2	8	169632	169639	0 %	25 %	50 %	25 %	549722871
3606	NC_022544	CAG	2	6	169747	169752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722871
3607	NC_022544	GCC	2	6	169756	169761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722871
3608	NC_022544	GCTA	2	8	169780	169787	25 %	25 %	25 %	25 %	549722871
3609	NC_022544	TCG	2	6	169897	169902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722871
3610	NC_022544	ATGAC	2	10	169912	169921	40 %	20 %	20 %	20 %	549722871
3611	NC_022544	ATC	2	6	169990	169995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722872
3612	NC_022544	TGG	2	6	170068	170073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722872
3613	NC_022544	GCT	2	6	170105	170110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722872
3614	NC_022544	TGG	2	6	170128	170133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722872
3615	NC_022544	GCG	2	6	170205	170210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722872
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3619	NC_022544	CTGG	2	8	170435	170442	0 %	25 %	50 %	25 %	549722872
3620	NC_022544	CGC	2	6	170455	170460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722872
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3623	NC_022544	GGCG	2	8	170525	170532	0 %	0 %	75 %	25 %	549722872
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3868	NC_022544	GCTG	2	8	181213	181220	0 %	25 %	50 %	25 %	549722879
3869	NC_022544	CGG	2	6	181303	181308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722879
3870	NC_022544	AAAGTG	2	12	181334	181345	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549722879
3871	NC_022544	TGGAAG	2	12	181383	181394	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549722879
3872	NC_022544	ATC	2	6	181433	181438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722879
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3874	NC_022544	AAG	2	6	181524	181529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722879
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3880	NC_022544	ATG	2	6	181800	181805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722879
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3882	NC_022544	GAC	2	6	181877	181882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722879
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3887	NC_022544	CGG	2	6	182236	182241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722879
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3891	NC_022544	GTA	2	6	182391	182396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722879
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3894	NC_022544	A	6	6	182467	182472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3895	NC_022544	T	7	7	182489	182495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3896	NC_022544	ATG	2	6	182521	182526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3897	NC_022544	GCA	2	6	182563	182568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3898	NC_022544	TGTC	2	8	182606	182613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3899	NC_022544	TCA	2	6	182662	182667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3900	NC_022544	ATA	2	6	182692	182697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3901	NC_022544	AT	3	6	182719	182724	50 %	50 %	0 %	0 %	549722880
3902	NC_022544	ACA	2	6	182738	182743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722880
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3915	NC_022544	CGT	2	6	183221	183226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722881
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3919	NC_022544	CTG	2	6	183405	183410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722881
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3936	NC_022544	GGCG	2	8	184061	184068	0 %	0 %	75 %	25 %	549722882
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3971	NC_022544	GTC	2	6	184874	184879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722882
3972	NC_022544	CGG	2	6	184884	184889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722882
3973	NC_022544	GAGC	2	8	184959	184966	25 %	0 %	50 %	25 %	549722882
3974	NC_022544	CATC	2	8	184986	184993	25 %	25 %	0 %	50 %	549722882
3975	NC_022544	TGGC	2	8	185114	185121	0 %	25 %	50 %	25 %	549722882
3976	NC_022544	CG	3	6	185163	185168	0 %	0 %	50 %	50 %	549722882
3977	NC_022544	GCC	2	6	185348	185353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722882
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3979	NC_022544	TC	3	6	185468	185473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3980	NC_022544	TGCC	2	8	185503	185510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3981	NC_022544	T	6	6	185680	185685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3982	NC_022544	T	6	6	185693	185698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3983	NC_022544	CTA	2	6	185763	185768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3984	NC_022544	ACT	2	6	185769	185774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3985	NC_022544	CAA	2	6	185806	185811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3986	NC_022544	GAG	2	6	185838	185843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3987	NC_022544	TCG	2	6	185847	185852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3988	NC_022544	AGA	2	6	185857	185862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722883
3989	NC_022544	TGC	2	6	185887	185892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3990	NC_022544	GCT	2	6	185947	185952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3991	NC_022544	GAA	3	9	185972	185980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722883
3992	NC_022544	TCC	2	6	186010	186015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722883
3993	NC_022544	GCT	2	6	186056	186061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3994	NC_022544	ACC	2	6	186077	186082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722883
3995	NC_022544	CTG	2	6	186116	186121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3996	NC_022544	ACA	2	6	186141	186146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722883
3997	NC_022544	TGAT	2	8	186156	186163	25 %	50 %	25 %	0 %	549722883
3998	NC_022544	TGC	2	6	186193	186198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
3999	NC_022544	CTG	2	6	186218	186223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722883
4000	NC_022544	ACG	2	6	186240	186245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722883

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