MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022544	TGA	2	6	45790	45795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722767
1002	NC_022544	GCT	2	6	45871	45876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722767
1003	NC_022544	TAC	2	6	45941	45946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722767
1004	NC_022544	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	549722767
1005	NC_022544	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_022544	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_022544	A	6	6	46056	46061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022544	A	6	6	46090	46095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022544	TCA	2	6	46104	46109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_022544	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022544	TAG	2	6	46150	46155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022544	GAA	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_022544	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022544	T	6	6	46208	46213	0 %	100 %	0 %	0 %	549722768
1015	NC_022544	AGC	2	6	46214	46219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722768
1016	NC_022544	CAT	2	6	46234	46239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722768
1017	NC_022544	TCA	2	6	46242	46247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722768
1018	NC_022544	CGC	2	6	46249	46254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722768
1019	NC_022544	CAA	2	6	46354	46359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722768
1020	NC_022544	TGT	2	6	46368	46373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722768
1021	NC_022544	GCC	2	6	46487	46492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722768
1022	NC_022544	CGG	2	6	46495	46500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722768
1023	NC_022544	GAT	2	6	46501	46506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722768
1024	NC_022544	ACT	2	6	46536	46541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722768
1025	NC_022544	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	549722768
1026	NC_022544	ATC	2	6	46670	46675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722768
1027	NC_022544	GAT	2	6	46676	46681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722768
1028	NC_022544	TTA	2	6	46695	46700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722768
1029	NC_022544	GGC	2	6	46747	46752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722768
1030	NC_022544	GCT	2	6	46774	46779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722768
1031	NC_022544	GCG	2	6	46788	46793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722768
1032	NC_022544	TA	3	6	46809	46814	50 %	50 %	0 %	0 %	549722768
1033	NC_022544	CGG	2	6	46839	46844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722768
1034	NC_022544	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	549722768
1035	NC_022544	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	549722768
1036	NC_022544	TGC	2	6	47049	47054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722768
1037	NC_022544	ATT	2	6	47063	47068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722768
1038	NC_022544	CTG	2	6	47075	47080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722768
1039	NC_022544	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	549722768
1040	NC_022544	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	549722768
1041	NC_022544	TTA	2	6	47259	47264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722768
1042	NC_022544	GTG	2	6	47309	47314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722768
1043	NC_022544	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	549722768
1044	NC_022544	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022544	TAT	2	6	47451	47456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722769
1046	NC_022544	AAG	2	6	47473	47478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722769
1047	NC_022544	CGC	2	6	47515	47520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722769
1048	NC_022544	TGT	2	6	47701	47706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722769
1049	NC_022544	CAG	2	6	47747	47752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722769
1050	NC_022544	GCG	2	6	47763	47768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722769
1051	NC_022544	GTG	3	9	47769	47777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722769
1052	NC_022544	CACG	2	8	47810	47817	25 %	0 %	25 %	50 %	549722769
1053	NC_022544	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	549722769
1054	NC_022544	GCA	2	6	47888	47893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722769
1055	NC_022544	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	549722769
1056	NC_022544	GTT	2	6	48035	48040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722769
1057	NC_022544	TGA	2	6	48089	48094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722769
1058	NC_022544	GAA	2	6	48219	48224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722769
1059	NC_022544	GA	3	6	48243	48248	50 %	0 %	50 %	0 %	549722769
1060	NC_022544	CGG	2	6	48262	48267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722769
1061	NC_022544	ACT	2	6	48289	48294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722769
1062	NC_022544	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_022544	CAG	2	6	48381	48386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722770
1064	NC_022544	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	549722770
1065	NC_022544	CCT	2	6	48460	48465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722770
1066	NC_022544	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	549722770
1067	NC_022544	CAG	2	6	48561	48566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722770
1068	NC_022544	TCC	2	6	48670	48675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722770
1069	NC_022544	CCA	2	6	48928	48933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722770
1070	NC_022544	CCG	2	6	48940	48945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722770
1071	NC_022544	CGT	2	6	48951	48956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722770
1072	NC_022544	CCA	2	6	48957	48962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722770
1073	NC_022544	GCA	2	6	48994	48999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722770
1074	NC_022544	GAG	2	6	49024	49029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722770
1075	NC_022544	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	549722770
1076	NC_022544	A	6	6	49134	49139	100 %	0 %	0 %	0 %	549722770
1077	NC_022544	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	549722770
1078	NC_022544	GTCGTA	2	12	49209	49220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549722770
1079	NC_022544	CG	4	8	49310	49317	0 %	0 %	50 %	50 %	549722770
1080	NC_022544	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	549722770
1081	NC_022544	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	549722770
1082	NC_022544	CG	3	6	49523	49528	0 %	0 %	50 %	50 %	549722770
1083	NC_022544	AAG	2	6	49564	49569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722770
1084	NC_022544	GCG	2	6	49599	49604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722770
1085	NC_022544	CAG	2	6	49626	49631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722770
1086	NC_022544	CAT	2	6	49689	49694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722770
1087	NC_022544	CGG	2	6	49695	49700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722770
1088	NC_022544	AGT	2	6	49763	49768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722770
1089	NC_022544	GTT	2	6	49839	49844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722770
1090	NC_022544	T	6	6	49973	49978	0 %	100 %	0 %	0 %	549722770
1091	NC_022544	GAT	2	6	50083	50088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722770
1092	NC_022544	TG	3	6	50141	50146	0 %	50 %	50 %	0 %	549722770
1093	NC_022544	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	549722770
1094	NC_022544	TGG	2	6	50218	50223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722770
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1096	NC_022544	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	549722770
1097	NC_022544	TTG	2	6	50394	50399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722770
1098	NC_022544	TGG	2	6	50411	50416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722770
1099	NC_022544	TCT	2	6	50483	50488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722771
1100	NC_022544	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	549722771
1101	NC_022544	AGT	2	6	50518	50523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722771
1102	NC_022544	GCA	2	6	50593	50598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722771
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1104	NC_022544	GGC	2	6	50820	50825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722771
1105	NC_022544	TGT	2	6	50840	50845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722771
1106	NC_022544	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	549722771
1107	NC_022544	CAT	2	6	50859	50864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722771
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1109	NC_022544	CAG	2	6	50886	50891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722771
1110	NC_022544	AAG	2	6	50932	50937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722771
1111	NC_022544	GAT	2	6	50946	50951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722771
1112	NC_022544	TCG	2	6	50966	50971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722771
1113	NC_022544	ATA	2	6	51024	51029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722771
1114	NC_022544	GCT	2	6	51047	51052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722771
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1116	NC_022544	CGC	2	6	51117	51122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722771
1117	NC_022544	T	7	7	51128	51134	0 %	100 %	0 %	0 %	549722771
1118	NC_022544	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	549722771
1119	NC_022544	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	549722771
1120	NC_022544	ATC	2	6	51261	51266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722771
1121	NC_022544	A	6	6	51277	51282	100 %	0 %	0 %	0 %	549722771
1122	NC_022544	TAA	2	6	51312	51317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722771
1123	NC_022544	TCTT	2	8	51363	51370	0 %	75 %	0 %	25 %	549722771
1124	NC_022544	TCA	2	6	51383	51388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722771
1125	NC_022544	GTG	2	6	51407	51412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722771
1126	NC_022544	TGC	2	6	51456	51461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722771
1127	NC_022544	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	549722771
1128	NC_022544	GAC	2	6	51554	51559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722771
1129	NC_022544	GAT	3	9	51588	51596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722771
1130	NC_022544	ATA	2	6	51625	51630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722771
1131	NC_022544	CAG	3	9	51636	51644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722771
1132	NC_022544	CAG	2	6	51723	51728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722771
1133	NC_022544	GTA	2	6	51767	51772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722771
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1136	NC_022544	ATT	2	6	51894	51899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022544	AGTA	2	8	51937	51944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022544	AGT	2	6	51959	51964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_022544	ATCA	2	8	51977	51984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1140	NC_022544	ATT	2	6	51985	51990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_022544	TTA	2	6	52013	52018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_022544	GGT	2	6	52051	52056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_022544	T	6	6	52062	52067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1145	NC_022544	AGGG	2	8	52130	52137	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_022544	A	6	6	52145	52150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_022544	A	7	7	52227	52233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_022544	TTG	2	6	52290	52295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722772
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1154	NC_022544	CTT	2	6	52607	52612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1155	NC_022544	GCA	2	6	52651	52656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722773
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1159	NC_022544	TTAACC	2	12	52814	52825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722773
1160	NC_022544	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	549722774
1161	NC_022544	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	549722774
1162	NC_022544	GT	3	6	52919	52924	0 %	50 %	50 %	0 %	549722774
1163	NC_022544	GAA	2	6	52989	52994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722774
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1165	NC_022544	GCG	2	6	53122	53127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722774
1166	NC_022544	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	549722774
1167	NC_022544	CGC	2	6	53157	53162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722774
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1171	NC_022544	TTA	2	6	53283	53288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722774
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1177	NC_022544	CAA	2	6	53628	53633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722774
1178	NC_022544	CTG	2	6	53646	53651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722774
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1182	NC_022544	TGA	2	6	53853	53858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
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1187	NC_022544	A	7	7	53996	54002	100 %	0 %	0 %	0 %	549722775
1188	NC_022544	ATG	2	6	54015	54020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
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1197	NC_022544	A	6	6	55044	55049	100 %	0 %	0 %	0 %	549722775
1198	NC_022544	GCA	2	6	55051	55056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722775
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1210	NC_022544	TGC	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
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1212	NC_022544	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	549722775
1213	NC_022544	CTG	2	6	55844	55849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
1214	NC_022544	TGG	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722775
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1219	NC_022544	TGA	2	6	56173	56178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
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1227	NC_022544	GCT	2	6	56580	56585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722775
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1229	NC_022544	AAC	2	6	56670	56675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722775
1230	NC_022544	TGA	2	6	56687	56692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722775
1231	NC_022544	GTA	2	6	56734	56739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722776
1232	NC_022544	GCA	2	6	56762	56767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722776
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1234	NC_022544	GCG	2	6	56879	56884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722776
1235	NC_022544	TGA	2	6	56942	56947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722776
1236	NC_022544	ATC	2	6	56998	57003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722776
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1238	NC_022544	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	549722776
1239	NC_022544	TGT	2	6	57048	57053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722776
1240	NC_022544	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	549722776
1241	NC_022544	AGCGC	2	10	57234	57243	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1242	NC_022544	GTG	2	6	57256	57261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_022544	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	549722777
1244	NC_022544	GAT	2	6	57401	57406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722777
1245	NC_022544	CGG	2	6	57414	57419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722777
1246	NC_022544	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	549722777
1247	NC_022544	AGC	3	9	57489	57497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722777
1248	NC_022544	AAG	2	6	57510	57515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722777
1249	NC_022544	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	549722777
1250	NC_022544	CGC	2	6	57547	57552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722777
1251	NC_022544	GGC	2	6	57607	57612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722777
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1253	NC_022544	TTG	2	6	57857	57862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722778
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1255	NC_022544	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	549722778
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1373	NC_022544	CGG	2	6	64133	64138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1374	NC_022544	CGC	2	6	64172	64177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1375	NC_022544	CAG	2	6	64193	64198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1376	NC_022544	CGC	2	6	64246	64251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1377	NC_022544	GCC	3	9	64266	64274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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