MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022544	CGG	2	6	22994	22999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722747
502	NC_022544	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	549722747
503	NC_022544	TAT	2	6	23025	23030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722747
504	NC_022544	ATA	2	6	23051	23056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722747
505	NC_022544	TTA	2	6	23166	23171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022544	TCTTAA	2	12	23203	23214	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_022544	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022544	A	7	7	23338	23344	100 %	0 %	0 %	0 %	549722748
509	NC_022544	TGA	2	6	23345	23350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722748
510	NC_022544	ACG	2	6	23351	23356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722748
511	NC_022544	ATA	2	6	23369	23374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722748
512	NC_022544	CTTTT	2	10	23393	23402	0 %	80 %	0 %	20 %	549722748
513	NC_022544	T	6	6	23399	23404	0 %	100 %	0 %	0 %	549722748
514	NC_022544	CAG	2	6	23407	23412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722748
515	NC_022544	TTG	2	6	23452	23457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722748
516	NC_022544	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	549722748
517	NC_022544	GTT	2	6	23548	23553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722748
518	NC_022544	ATG	2	6	23564	23569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722748
519	NC_022544	AT	3	6	23582	23587	50 %	50 %	0 %	0 %	549722748
520	NC_022544	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	549722748
521	NC_022544	ACG	2	6	23753	23758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722748
522	NC_022544	TGA	2	6	23789	23794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722748
523	NC_022544	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	549722748
524	NC_022544	GCT	2	6	23847	23852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722748
525	NC_022544	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	549722748
526	NC_022544	A	7	7	23967	23973	100 %	0 %	0 %	0 %	549722748
527	NC_022544	GGC	2	6	23999	24004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722748
528	NC_022544	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022544	GTT	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022544	ACA	2	6	24195	24200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_022544	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_022544	TAA	2	6	24259	24264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022544	TAA	2	6	24266	24271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022544	ACG	2	6	24306	24311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_022544	AAG	2	6	24353	24358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022544	T	7	7	24363	24369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022544	GAA	2	6	24399	24404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022544	CAG	2	6	24409	24414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_022544	A	6	6	24425	24430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_022544	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	549722749
541	NC_022544	TGT	2	6	24521	24526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722749
542	NC_022544	TAC	2	6	24543	24548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722749
543	NC_022544	CGGTA	2	10	24561	24570	20 %	20 %	40 %	20 %	549722749
544	NC_022544	CGC	2	6	24594	24599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722749
545	NC_022544	CTGTT	2	10	24600	24609	0 %	60 %	20 %	20 %	549722749
546	NC_022544	TGG	2	6	24680	24685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722749
547	NC_022544	AGA	2	6	24696	24701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722749
548	NC_022544	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	549722749
549	NC_022544	GCG	2	6	24748	24753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722749
550	NC_022544	CGA	2	6	24824	24829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722749
551	NC_022544	ATG	2	6	24905	24910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722749
552	NC_022544	T	7	7	25025	25031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_022544	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_022544	A	8	8	25115	25122	100 %	0 %	0 %	0 %	549722750
555	NC_022544	ATT	2	6	25141	25146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722750
556	NC_022544	CTG	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722750
557	NC_022544	CGG	2	6	25158	25163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722750
558	NC_022544	CCT	2	6	25245	25250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722750
559	NC_022544	ATT	2	6	25256	25261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722750
560	NC_022544	TTC	2	6	25264	25269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722750
561	NC_022544	T	7	7	25281	25287	0 %	100 %	0 %	0 %	549722750
562	NC_022544	CGC	2	6	25344	25349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722750
563	NC_022544	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	549722750
564	NC_022544	A	6	6	25370	25375	100 %	0 %	0 %	0 %	549722750
565	NC_022544	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	549722750
566	NC_022544	TAT	2	6	25390	25395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722750
567	NC_022544	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	549722750
568	NC_022544	TATTT	2	10	25434	25443	20 %	80 %	0 %	0 %	549722750
569	NC_022544	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	549722750
570	NC_022544	TAC	2	6	25631	25636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722750
571	NC_022544	A	6	6	25667	25672	100 %	0 %	0 %	0 %	549722750
572	NC_022544	CCG	2	6	25691	25696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722750
573	NC_022544	ACG	2	6	25766	25771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722750
574	NC_022544	ATG	2	6	25795	25800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722750
575	NC_022544	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	549722751
576	NC_022544	GGC	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
577	NC_022544	ACG	2	6	26070	26075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
578	NC_022544	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
579	NC_022544	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	549722751
580	NC_022544	GGC	3	9	26180	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
581	NC_022544	GCC	2	6	26223	26228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722751
582	NC_022544	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
583	NC_022544	GGC	2	6	26279	26284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
584	NC_022544	GGC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
585	NC_022544	ACT	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722751
586	NC_022544	GCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
587	NC_022544	AGCGAC	2	12	26508	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
588	NC_022544	GCA	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
589	NC_022544	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722751
590	NC_022544	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	549722751
591	NC_022544	GAC	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
592	NC_022544	CAT	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722751
593	NC_022544	GCC	2	6	26768	26773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722751
594	NC_022544	CCG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722751
595	NC_022544	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
596	NC_022544	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722751
597	NC_022544	GGC	2	6	26908	26913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
598	NC_022544	GCG	2	6	26922	26927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
599	NC_022544	TAG	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
600	NC_022544	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	549722751
601	NC_022544	GCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
602	NC_022544	ATA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722751
603	NC_022544	GAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
604	NC_022544	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722751
605	NC_022544	TTA	2	6	27356	27361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722751
606	NC_022544	AGG	2	6	27366	27371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722751
607	NC_022544	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	549722751
608	NC_022544	TTA	2	6	27424	27429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722751
609	NC_022544	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	549722751
610	NC_022544	TGA	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
611	NC_022544	TTG	2	6	27474	27479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722751
612	NC_022544	ACA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722751
613	NC_022544	TGA	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
614	NC_022544	CTG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722751
615	NC_022544	ACA	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722751
616	NC_022544	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
617	NC_022544	CAG	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722751
618	NC_022544	GGC	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722751
619	NC_022544	TGG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722751
620	NC_022544	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	549722751
621	NC_022544	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
622	NC_022544	GGT	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722751
623	NC_022544	ACA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722751
624	NC_022544	GAT	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
625	NC_022544	TGA	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722751
626	NC_022544	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	549722751
627	NC_022544	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
628	NC_022544	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	549722751
629	NC_022544	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549722751
630	NC_022544	TTG	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722751
631	NC_022544	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	549722751
632	NC_022544	ATC	2	6	28369	28374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722751
633	NC_022544	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	549722751
634	NC_022544	TCC	2	6	28380	28385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722751
635	NC_022544	ACA	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722751
636	NC_022544	CTG	2	6	28449	28454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722752
637	NC_022544	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	549722752
638	NC_022544	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	549722752
639	NC_022544	A	6	6	28591	28596	100 %	0 %	0 %	0 %	549722752
640	NC_022544	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	549722752
641	NC_022544	CCG	2	6	28627	28632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722752
642	NC_022544	TTC	2	6	28760	28765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722752
643	NC_022544	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	549722752
644	NC_022544	ATG	2	6	28810	28815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722752
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646	NC_022544	CCG	2	6	28945	28950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722752
647	NC_022544	A	6	6	29118	29123	100 %	0 %	0 %	0 %	549722752
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652	NC_022544	ATG	2	6	29812	29817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722753
653	NC_022544	AAT	2	6	29838	29843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722753
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662	NC_022544	GCG	2	6	30261	30266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722754
663	NC_022544	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	549722754
664	NC_022544	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	549722754
665	NC_022544	GGC	2	6	30450	30455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722754
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674	NC_022544	GGT	2	6	30786	30791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722755
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699	NC_022544	AAG	2	6	31920	31925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722756
700	NC_022544	AGC	2	6	31931	31936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722756
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753	NC_022544	TTGG	2	8	33913	33920	0 %	50 %	50 %	0 %	549722759
754	NC_022544	A	6	6	33926	33931	100 %	0 %	0 %	0 %	549722759
755	NC_022544	TA	3	6	33938	33943	50 %	50 %	0 %	0 %	549722759
756	NC_022544	TGC	2	6	33951	33956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722759
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758	NC_022544	TTA	2	6	34059	34064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722759
759	NC_022544	TTG	2	6	34094	34099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722759
760	NC_022544	A	6	6	34100	34105	100 %	0 %	0 %	0 %	549722759
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883	NC_022544	TGT	2	6	39717	39722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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887	NC_022544	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
888	NC_022544	AAT	2	6	39980	39985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
889	NC_022544	GAA	2	6	40011	40016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
890	NC_022544	AT	5	10	40033	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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