MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022544	AT	3	6	209785	209790	50 %	50 %	0 %	0 %	549722903
4502	NC_022544	GTT	2	6	209801	209806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722903
4503	NC_022544	ACG	2	6	209870	209875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722903
4504	NC_022544	GCC	2	6	209882	209887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722903
4505	NC_022544	ATT	2	6	209973	209978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722903
4506	NC_022544	TGG	2	6	210168	210173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722903
4507	NC_022544	ATT	2	6	210191	210196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722903
4508	NC_022544	GGCT	2	8	210252	210259	0 %	25 %	50 %	25 %	549722903
4509	NC_022544	ATC	2	6	210312	210317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722903
4510	NC_022544	TGA	2	6	210328	210333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722903
4511	NC_022544	CCA	2	6	210360	210365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722903
4512	NC_022544	TTCGG	2	10	210370	210379	0 %	40 %	40 %	20 %	549722903
4513	NC_022544	GGA	2	6	210445	210450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722903
4514	NC_022544	GC	4	8	210479	210486	0 %	0 %	50 %	50 %	549722903
4515	NC_022544	TGA	2	6	210502	210507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722903
4516	NC_022544	TAT	2	6	210577	210582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722903
4517	NC_022544	T	6	6	210697	210702	0 %	100 %	0 %	0 %	549722903
4518	NC_022544	CGC	2	6	210722	210727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722903
4519	NC_022544	TA	3	6	210735	210740	50 %	50 %	0 %	0 %	549722903
4520	NC_022544	ATA	2	6	210753	210758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722903
4521	NC_022544	CGG	2	6	210782	210787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722903
4522	NC_022544	TCTT	2	8	210820	210827	0 %	75 %	0 %	25 %	549722903
4523	NC_022544	AGC	2	6	210862	210867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722903
4524	NC_022544	TGC	2	6	210936	210941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722903
4525	NC_022544	CTT	2	6	211114	211119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722904
4526	NC_022544	GCC	2	6	211179	211184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722904
4527	NC_022544	GAT	2	6	211199	211204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722904
4528	NC_022544	CTTGC	2	10	211379	211388	0 %	40 %	20 %	40 %	549722904
4529	NC_022544	CTT	2	6	211408	211413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_022544	GGC	2	6	211554	211559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722905
4531	NC_022544	CAG	2	6	211599	211604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722905
4532	NC_022544	GTC	2	6	211629	211634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722905
4533	NC_022544	TTCA	2	8	211650	211657	25 %	50 %	0 %	25 %	549722905
4534	NC_022544	GGCAAT	2	12	211668	211679	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549722905
4535	NC_022544	TCA	2	6	211730	211735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722905
4536	NC_022544	GCT	2	6	211763	211768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722905
4537	NC_022544	TGAGC	2	10	211791	211800	20 %	20 %	40 %	20 %	549722905
4538	NC_022544	AAT	2	6	211821	211826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722905
4539	NC_022544	CGA	2	6	211835	211840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722905
4540	NC_022544	CCA	2	6	211865	211870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722905
4541	NC_022544	CGC	2	6	211967	211972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722905
4542	NC_022544	AG	3	6	212010	212015	50 %	0 %	50 %	0 %	549722905
4543	NC_022544	ACGT	2	8	212029	212036	25 %	25 %	25 %	25 %	549722905
4544	NC_022544	CAC	2	6	212202	212207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722905
4545	NC_022544	CGT	2	6	212249	212254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722905
4546	NC_022544	TGG	2	6	212267	212272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722905
4547	NC_022544	GAC	2	6	212306	212311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722905
4548	NC_022544	GCA	2	6	212324	212329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722905
4549	NC_022544	CAA	2	6	212354	212359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722905
4550	NC_022544	TGA	2	6	212376	212381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_022544	GCGCT	2	10	212394	212403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4552	NC_022544	CGCGT	2	10	212446	212455	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4553	NC_022544	TTC	2	6	212495	212500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722906
4554	NC_022544	CTG	2	6	212537	212542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722906
4555	NC_022544	CGG	2	6	212545	212550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722906
4556	NC_022544	CCG	2	6	212604	212609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722906
4557	NC_022544	GCCGAT	2	12	212666	212677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549722906
4558	NC_022544	GCAC	2	8	212725	212732	25 %	0 %	25 %	50 %	549722906
4559	NC_022544	CCAGCA	2	12	212734	212745	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549722906
4560	NC_022544	CAG	2	6	212783	212788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722906
4561	NC_022544	GCC	2	6	212825	212830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722906
4562	NC_022544	CCAG	2	8	212914	212921	25 %	0 %	25 %	50 %	549722906
4563	NC_022544	GCC	2	6	212924	212929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722906
4564	NC_022544	CGCA	2	8	212954	212961	25 %	0 %	25 %	50 %	549722906
4565	NC_022544	GC	3	6	213043	213048	0 %	0 %	50 %	50 %	549722906
4566	NC_022544	CG	3	6	213059	213064	0 %	0 %	50 %	50 %	549722906
4567	NC_022544	CAGG	2	8	213094	213101	25 %	0 %	50 %	25 %	549722906
4568	NC_022544	AG	3	6	213132	213137	50 %	0 %	50 %	0 %	549722906
4569	NC_022544	TCG	2	6	213165	213170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722906
4570	NC_022544	T	6	6	213221	213226	0 %	100 %	0 %	0 %	549722906
4571	NC_022544	CTTG	2	8	213229	213236	0 %	50 %	25 %	25 %	549722906
4572	NC_022544	GCA	2	6	213244	213249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722906
4573	NC_022544	TGG	3	9	213256	213264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722906
4574	NC_022544	G	6	6	213326	213331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_022544	GCA	2	6	213411	213416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722907
4576	NC_022544	AGATC	2	10	213460	213469	40 %	20 %	20 %	20 %	549722907
4577	NC_022544	CGGT	2	8	213540	213547	0 %	25 %	50 %	25 %	549722907
4578	NC_022544	TTC	2	6	213665	213670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722907
4579	NC_022544	GCG	3	9	213736	213744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722907
4580	NC_022544	GAA	2	6	213756	213761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722907
4581	NC_022544	CGA	2	6	213766	213771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722907
4582	NC_022544	GGC	2	6	213806	213811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722907
4583	NC_022544	CGCGG	2	10	213882	213891	0 %	0 %	60 %	40 %	549722908
4584	NC_022544	CG	3	6	213892	213897	0 %	0 %	50 %	50 %	549722908
4585	NC_022544	ACG	2	6	213913	213918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722908
4586	NC_022544	GCG	2	6	213919	213924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722908
4587	NC_022544	TCG	2	6	213935	213940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722908
4588	NC_022544	CGG	2	6	213970	213975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722908
4589	NC_022544	CAC	2	6	213998	214003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722908
4590	NC_022544	TAT	2	6	214026	214031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722908
4591	NC_022544	GC	3	6	214043	214048	0 %	0 %	50 %	50 %	549722908
4592	NC_022544	CGCGG	2	10	214066	214075	0 %	0 %	60 %	40 %	549722908
4593	NC_022544	CAT	2	6	214212	214217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722908
4594	NC_022544	CGT	2	6	214236	214241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722908
4595	NC_022544	T	6	6	214269	214274	0 %	100 %	0 %	0 %	549722908
4596	NC_022544	CAG	2	6	214285	214290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722908
4597	NC_022544	GGC	2	6	214306	214311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722908
4598	NC_022544	TTC	2	6	214364	214369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722908
4599	NC_022544	ATG	2	6	214382	214387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722908
4600	NC_022544	AAC	2	6	214439	214444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722908
4601	NC_022544	GGT	2	6	214455	214460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722908
4602	NC_022544	GTT	2	6	214470	214475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722908
4603	NC_022544	GC	3	6	214531	214536	0 %	0 %	50 %	50 %	549722908
4604	NC_022544	GGA	2	6	214538	214543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722908
4605	NC_022544	GC	3	6	214631	214636	0 %	0 %	50 %	50 %	549722908
4606	NC_022544	CTT	2	6	214698	214703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722908
4607	NC_022544	CCG	2	6	214718	214723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722908
4608	NC_022544	GTA	2	6	214756	214761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722908
4609	NC_022544	TCT	2	6	214796	214801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722908
4610	NC_022544	TGT	2	6	214818	214823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722908
4611	NC_022544	GCA	3	9	214827	214835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722908
4612	NC_022544	ATG	2	6	214885	214890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722908
4613	NC_022544	ACG	2	6	214951	214956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722908
4614	NC_022544	CCA	2	6	214959	214964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722908
4615	NC_022544	AAT	2	6	214979	214984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722908
4616	NC_022544	CGC	3	9	215061	215069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722908
4617	NC_022544	CTC	2	6	215215	215220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722908
4618	NC_022544	TAA	2	6	215291	215296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_022544	AG	3	6	215341	215346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_022544	CAT	2	6	215368	215373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_022544	CGC	2	6	215377	215382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_022544	GCA	2	6	215510	215515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722909
4623	NC_022544	CTC	2	6	215517	215522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722909
4624	NC_022544	ACG	2	6	215545	215550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722909
4625	NC_022544	GCCA	2	8	215693	215700	25 %	0 %	25 %	50 %	549722909
4626	NC_022544	TCG	2	6	215785	215790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722909
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4643	NC_022544	CAGC	2	8	216421	216428	25 %	0 %	25 %	50 %	549722910
4644	NC_022544	GGC	2	6	216472	216477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722910
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4649	NC_022544	GGC	2	6	216647	216652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722910
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4652	NC_022544	TAA	2	6	217002	217007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4653	NC_022544	GTTC	2	8	217044	217051	0 %	50 %	25 %	25 %	549722911
4654	NC_022544	T	6	6	217059	217064	0 %	100 %	0 %	0 %	549722911
4655	NC_022544	GCA	2	6	217185	217190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722911
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4738	NC_022544	GCGAA	2	10	220554	220563	40 %	0 %	40 %	20 %	549722913
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4740	NC_022544	CG	3	6	220641	220646	0 %	0 %	50 %	50 %	549722913
4741	NC_022544	GAA	2	6	220762	220767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722913
4742	NC_022544	GA	3	6	220841	220846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4743	NC_022544	TCT	3	9	220849	220857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4744	NC_022544	GTC	2	6	220858	220863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4745	NC_022544	GAA	2	6	220869	220874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4746	NC_022544	TGC	2	6	220901	220906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4747	NC_022544	CGT	2	6	220990	220995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722914
4748	NC_022544	GCA	2	6	220998	221003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722914
4749	NC_022544	GAC	2	6	221005	221010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722914
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4752	NC_022544	GGCT	2	8	221092	221099	0 %	25 %	50 %	25 %	549722914
4753	NC_022544	A	6	6	221168	221173	100 %	0 %	0 %	0 %	549722914
4754	NC_022544	CGG	3	9	221210	221218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722914
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4848	NC_022544	CTA	2	6	224557	224562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722915
4849	NC_022544	GGCT	2	8	224564	224571	0 %	25 %	50 %	25 %	549722915
4850	NC_022544	ACA	2	6	224646	224651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722915
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4852	NC_022544	A	6	6	224757	224762	100 %	0 %	0 %	0 %	549722915
4853	NC_022544	GCG	2	6	224783	224788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722915
4854	NC_022544	ATGCGT	2	12	224921	224932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549722915
4855	NC_022544	GC	3	6	224958	224963	0 %	0 %	50 %	50 %	549722915
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4858	NC_022544	GGAAT	2	10	225076	225085	40 %	20 %	40 %	0 %	549722915
4859	NC_022544	CGG	2	6	225103	225108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722915
4860	NC_022544	AT	3	6	225172	225177	50 %	50 %	0 %	0 %	549722915
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4864	NC_022544	CCAA	2	8	225434	225441	50 %	0 %	0 %	50 %	549722915
4865	NC_022544	AGC	2	6	225502	225507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722915
4866	NC_022544	CGT	2	6	225618	225623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722915
4867	NC_022544	GCAGC	2	10	225735	225744	20 %	0 %	40 %	40 %	549722915
4868	NC_022544	GATG	2	8	225748	225755	25 %	25 %	50 %	0 %	549722915
4869	NC_022544	GTC	2	6	225758	225763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722915
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4873	NC_022544	ACC	2	6	225998	226003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722916
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4923	NC_022544	GCC	2	6	228087	228092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722918
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4981	NC_022544	A	6	6	230177	230182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4982	NC_022544	AAAT	2	8	230194	230201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4983	NC_022544	A	8	8	230220	230227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4984	NC_022544	T	6	6	230240	230245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4985	NC_022544	T	8	8	230247	230254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4986	NC_022544	AAAT	2	8	230272	230279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4987	NC_022544	TA	3	6	230295	230300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4988	NC_022544	T	7	7	230322	230328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4989	NC_022544	T	7	7	230351	230357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4990	NC_022544	CTTG	2	8	230369	230376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4991	NC_022544	TTTG	2	8	230378	230385	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4992	NC_022544	T	6	6	230386	230391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4993	NC_022544	TAT	2	6	230408	230413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4994	NC_022544	TAAA	2	8	230432	230439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_022544	A	6	6	230437	230442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_022544	TTAT	2	8	230494	230501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_022544	GTT	2	6	230508	230513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_022544	CTT	2	6	230516	230521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4999	NC_022544	ATATA	2	10	230555	230564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_022544	CTA	2	6	230568	230573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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