MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 10918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022525	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022525	ACCA	2	8	467	474	50 %	0 %	0 %	50 %	549478130
3	NC_022525	ATGA	2	8	3129	3136	50 %	25 %	25 %	0 %	549481666
4	NC_022525	GATG	2	8	4634	4641	25 %	25 %	50 %	0 %	549478131
5	NC_022525	CAGC	2	8	4643	4650	25 %	0 %	25 %	50 %	549478131
6	NC_022525	CTGA	2	8	4701	4708	25 %	25 %	25 %	25 %	549478131
7	NC_022525	AAAG	2	8	4881	4888	75 %	0 %	25 %	0 %	549478131
8	NC_022525	CTGC	2	8	4971	4978	0 %	25 %	25 %	50 %	549478131
9	NC_022525	GCCA	2	8	6665	6672	25 %	0 %	25 %	50 %	549478133
10	NC_022525	GGCG	2	8	6791	6798	0 %	0 %	75 %	25 %	549478133
11	NC_022525	TGAA	2	8	7291	7298	50 %	25 %	25 %	0 %	549478133
12	NC_022525	GCGT	2	8	8157	8164	0 %	25 %	50 %	25 %	549478134
13	NC_022525	AAGA	2	8	8239	8246	75 %	0 %	25 %	0 %	549478134
14	NC_022525	CTGT	2	8	8667	8674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_022525	CCTT	2	8	8675	8682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022525	TGGC	2	8	8820	8827	0 %	25 %	50 %	25 %	549478135
17	NC_022525	TCCG	2	8	9280	9287	0 %	25 %	25 %	50 %	549478135
18	NC_022525	GAAC	2	8	9719	9726	50 %	0 %	25 %	25 %	549478136
19	NC_022525	CAGG	2	8	10123	10130	25 %	0 %	50 %	25 %	549478137
20	NC_022525	TTGA	2	8	10978	10985	25 %	50 %	25 %	0 %	549478138
21	NC_022525	TGGC	2	8	11005	11012	0 %	25 %	50 %	25 %	549478138
22	NC_022525	TCGT	2	8	11125	11132	0 %	50 %	25 %	25 %	549478138
23	NC_022525	ATTT	2	8	11371	11378	25 %	75 %	0 %	0 %	549481667
24	NC_022525	TCTG	2	8	11391	11398	0 %	50 %	25 %	25 %	549481667
25	NC_022525	ATGG	2	8	11649	11656	25 %	25 %	50 %	0 %	549478139
26	NC_022525	TGGT	2	8	11740	11747	0 %	50 %	50 %	0 %	549478139
27	NC_022525	CAAC	2	8	12253	12260	50 %	0 %	0 %	50 %	549478139
28	NC_022525	AAGA	2	8	12327	12334	75 %	0 %	25 %	0 %	549478139
29	NC_022525	CCAT	2	8	12904	12911	25 %	25 %	0 %	50 %	549478139
30	NC_022525	GGCT	2	8	13424	13431	0 %	25 %	50 %	25 %	549478139
31	NC_022525	CGGT	2	8	14594	14601	0 %	25 %	50 %	25 %	549478140
32	NC_022525	TCAG	2	8	15246	15253	25 %	25 %	25 %	25 %	549478141
33	NC_022525	TTTG	2	8	15536	15543	0 %	75 %	25 %	0 %	549478141
34	NC_022525	CGAA	2	8	15751	15758	50 %	0 %	25 %	25 %	549478141
35	NC_022525	ATTG	2	8	15763	15770	25 %	50 %	25 %	0 %	549478141
36	NC_022525	ATTA	2	8	16431	16438	50 %	50 %	0 %	0 %	549478142
37	NC_022525	ATAA	2	8	16523	16530	75 %	25 %	0 %	0 %	549478143
38	NC_022525	AATA	2	8	17999	18006	75 %	25 %	0 %	0 %	549478145
39	NC_022525	GGGC	2	8	18585	18592	0 %	0 %	75 %	25 %	549478145
40	NC_022525	CGTG	2	8	19285	19292	0 %	25 %	50 %	25 %	549478145
41	NC_022525	CCAA	2	8	21286	21293	50 %	0 %	0 %	50 %	549478146
42	NC_022525	GACG	2	8	21632	21639	25 %	0 %	50 %	25 %	549478146
43	NC_022525	TGGC	2	8	22285	22292	0 %	25 %	50 %	25 %	549478146
44	NC_022525	TGGC	2	8	22391	22398	0 %	25 %	50 %	25 %	549478146
45	NC_022525	CGCC	2	8	22657	22664	0 %	0 %	25 %	75 %	549478146
46	NC_022525	CTGG	2	8	23003	23010	0 %	25 %	50 %	25 %	549478146
47	NC_022525	TTAT	2	8	23268	23275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022525	TTTA	2	8	23501	23508	25 %	75 %	0 %	0 %	549478147
49	NC_022525	CTGA	2	8	23854	23861	25 %	25 %	25 %	25 %	549478147
50	NC_022525	TCTG	2	8	23958	23965	0 %	50 %	25 %	25 %	549478147
51	NC_022525	TGAA	2	8	24469	24476	50 %	25 %	25 %	0 %	549478148
52	NC_022525	CCAG	2	8	24740	24747	25 %	0 %	25 %	50 %	549478148
53	NC_022525	ACCG	2	8	25417	25424	25 %	0 %	25 %	50 %	549478149
54	NC_022525	AAAT	2	8	25477	25484	75 %	25 %	0 %	0 %	549478149
55	NC_022525	TCTG	2	8	25934	25941	0 %	50 %	25 %	25 %	549478150
56	NC_022525	GCCT	2	8	26115	26122	0 %	25 %	25 %	50 %	549478150
57	NC_022525	CCTT	2	8	26621	26628	0 %	50 %	0 %	50 %	549478150
58	NC_022525	TCAG	2	8	26980	26987	25 %	25 %	25 %	25 %	549478150
59	NC_022525	ATCA	2	8	27393	27400	50 %	25 %	0 %	25 %	549478150
60	NC_022525	CAGC	2	8	27437	27444	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
61	NC_022525	AGCC	2	8	27927	27934	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
62	NC_022525	CCGA	2	8	28134	28141	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
63	NC_022525	ATTA	2	8	28527	28534	50 %	50 %	0 %	0 %	549478151
64	NC_022525	GGCG	2	8	28769	28776	0 %	0 %	75 %	25 %	549478151
65	NC_022525	ATGA	2	8	29974	29981	50 %	25 %	25 %	0 %	549478152
66	NC_022525	TGCT	2	8	30544	30551	0 %	50 %	25 %	25 %	549478154
67	NC_022525	TATC	2	8	30600	30607	25 %	50 %	0 %	25 %	549478154
68	NC_022525	GTAA	2	8	30637	30644	50 %	25 %	25 %	0 %	549478154
69	NC_022525	TTCG	2	8	30899	30906	0 %	50 %	25 %	25 %	549478154
70	NC_022525	GTCA	2	8	31408	31415	25 %	25 %	25 %	25 %	549478155
71	NC_022525	ACCG	2	8	32228	32235	25 %	0 %	25 %	50 %	549481668
72	NC_022525	AGGC	2	8	32266	32273	25 %	0 %	50 %	25 %	549481668
73	NC_022525	CCTG	2	8	32702	32709	0 %	25 %	25 %	50 %	549478156
74	NC_022525	AACA	2	8	32718	32725	75 %	0 %	0 %	25 %	549478156
75	NC_022525	CGCA	2	8	32892	32899	25 %	0 %	25 %	50 %	549478156
76	NC_022525	TAAA	2	8	32962	32969	75 %	25 %	0 %	0 %	549478156
77	NC_022525	CCAG	2	8	33348	33355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_022525	TTAT	2	8	33531	33538	25 %	75 %	0 %	0 %	549481669
79	NC_022525	TTGG	2	8	33915	33922	0 %	50 %	50 %	0 %	549481669
80	NC_022525	CTTT	2	8	34295	34302	0 %	75 %	0 %	25 %	549481669
81	NC_022525	GAAG	2	8	34335	34342	50 %	0 %	50 %	0 %	549481669
82	NC_022525	TAAA	2	8	34387	34394	75 %	25 %	0 %	0 %	549478157
83	NC_022525	ATAA	2	8	34666	34673	75 %	25 %	0 %	0 %	549478157
84	NC_022525	GTGC	2	8	34789	34796	0 %	25 %	50 %	25 %	549478157
85	NC_022525	TTAA	2	8	34799	34806	50 %	50 %	0 %	0 %	549478157
86	NC_022525	TGAT	2	8	35034	35041	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022525	TGGA	2	8	35551	35558	25 %	25 %	50 %	0 %	549481670
88	NC_022525	GGGA	2	8	36495	36502	25 %	0 %	75 %	0 %	549481670
89	NC_022525	ATAC	2	8	37480	37487	50 %	25 %	0 %	25 %	549478158
90	NC_022525	GAAG	2	8	37552	37559	50 %	0 %	50 %	0 %	549478158
91	NC_022525	CACG	2	8	38115	38122	25 %	0 %	25 %	50 %	549478158
92	NC_022525	TAAT	2	8	38217	38224	50 %	50 %	0 %	0 %	549478158
93	NC_022525	CCAT	2	8	38673	38680	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_022525	ATTA	2	8	38767	38774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022525	AATT	2	8	40048	40055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022525	GCGG	2	8	40539	40546	0 %	0 %	75 %	25 %	549478160
97	NC_022525	CTGG	2	8	40757	40764	0 %	25 %	50 %	25 %	549478160
98	NC_022525	CCGA	2	8	41274	41281	25 %	0 %	25 %	50 %	549478160
99	NC_022525	ATCG	2	8	41430	41437	25 %	25 %	25 %	25 %	549478160
100	NC_022525	TCAA	2	8	41491	41498	50 %	25 %	0 %	25 %	549478160
101	NC_022525	AACC	2	8	41757	41764	50 %	0 %	0 %	50 %	549478161
102	NC_022525	GAAA	2	8	41809	41816	75 %	0 %	25 %	0 %	549478161
103	NC_022525	GGTC	2	8	42381	42388	0 %	25 %	50 %	25 %	549478161
104	NC_022525	TTTG	2	8	42905	42912	0 %	75 %	25 %	0 %	549478161
105	NC_022525	GTAT	2	8	43200	43207	25 %	50 %	25 %	0 %	549478162
106	NC_022525	TCCG	2	8	43594	43601	0 %	25 %	25 %	50 %	549478162
107	NC_022525	ATGA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	25 %	0 %	549481672
108	NC_022525	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	549481672
109	NC_022525	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_022525	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	549478163
111	NC_022525	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	549478163
112	NC_022525	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	549478163
113	NC_022525	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	549478164
114	NC_022525	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	549478164
115	NC_022525	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022525	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	549478165
117	NC_022525	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	549478165
118	NC_022525	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	549478165
119	NC_022525	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	549478165
120	NC_022525	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	549481673
121	NC_022525	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	549481673
122	NC_022525	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	549481673
123	NC_022525	AGTA	2	8	51937	51944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022525	ATCA	2	8	51977	51984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_022525	GAAA	2	8	52097	52104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022525	AGGG	2	8	52130	52137	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022525	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	549478166
128	NC_022525	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	549478166
129	NC_022525	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	549478166
130	NC_022525	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	549478167
131	NC_022525	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	549478169
132	NC_022525	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	549478169
133	NC_022525	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	549478169
134	NC_022525	TGAT	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	549478170
135	NC_022525	TGGA	2	8	58994	59001	25 %	25 %	50 %	0 %	549478171
136	NC_022525	CCTG	2	8	59030	59037	0 %	25 %	25 %	50 %	549478171
137	NC_022525	GATT	2	8	59392	59399	25 %	50 %	25 %	0 %	549478171
138	NC_022525	GATC	2	8	59761	59768	25 %	25 %	25 %	25 %	549478171
139	NC_022525	CTGG	2	8	60886	60893	0 %	25 %	50 %	25 %	549478172
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141	NC_022525	CTGC	2	8	61261	61268	0 %	25 %	25 %	50 %	549478173
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