MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022525	TCG	2	6	186456	186461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
4002	NC_022525	TGC	2	6	186475	186480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
4003	NC_022525	AAC	2	6	186483	186488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481684
4004	NC_022525	GGT	2	6	186494	186499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481684
4005	NC_022525	CTG	2	6	186548	186553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
4006	NC_022525	CGG	2	6	186578	186583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481684
4007	NC_022525	ACC	2	6	186642	186647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481684
4008	NC_022525	TGA	2	6	186670	186675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481684
4009	NC_022525	TGG	2	6	186709	186714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481684
4010	NC_022525	GTC	2	6	186717	186722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
4011	NC_022525	CGG	2	6	186727	186732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481684
4012	NC_022525	GAGC	2	8	186802	186809	25 %	0 %	50 %	25 %	549481684
4013	NC_022525	CATC	2	8	186829	186836	25 %	25 %	0 %	50 %	549481684
4014	NC_022525	TGGC	2	8	186957	186964	0 %	25 %	50 %	25 %	549481684
4015	NC_022525	CG	3	6	187006	187011	0 %	0 %	50 %	50 %	549481684
4016	NC_022525	GCC	2	6	187191	187196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481684
4017	NC_022525	CA	3	6	187266	187271	50 %	0 %	0 %	50 %	549481684
4018	NC_022525	TC	3	6	187311	187316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_022525	TGCC	2	8	187346	187353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_022525	T	6	6	187523	187528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_022525	T	6	6	187536	187541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_022525	CTA	2	6	187606	187611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_022525	ACT	2	6	187612	187617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_022525	CAA	2	6	187649	187654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_022525	GAG	2	6	187681	187686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_022525	TCG	2	6	187690	187695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
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4028	NC_022525	TGC	2	6	187730	187735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
4029	NC_022525	GCT	2	6	187790	187795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
4030	NC_022525	GAA	3	9	187815	187823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478270
4031	NC_022525	TCC	2	6	187853	187858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478270
4032	NC_022525	GCT	2	6	187899	187904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
4033	NC_022525	ACC	2	6	187920	187925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478270
4034	NC_022525	CTG	2	6	187959	187964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
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4037	NC_022525	TGC	2	6	188036	188041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
4038	NC_022525	CTG	2	6	188061	188066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
4039	NC_022525	ACG	2	6	188083	188088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478270
4040	NC_022525	AGA	2	6	188090	188095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478270
4041	NC_022525	CCG	2	6	188172	188177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478270
4042	NC_022525	A	6	6	188185	188190	100 %	0 %	0 %	0 %	549478270
4043	NC_022525	TCACCG	2	12	188191	188202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549478270
4044	NC_022525	CGA	2	6	188231	188236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478270
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4046	NC_022525	CAAA	2	8	188354	188361	75 %	0 %	0 %	25 %	549478270
4047	NC_022525	A	6	6	188376	188381	100 %	0 %	0 %	0 %	549478270
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4052	NC_022525	TCT	2	6	188536	188541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478270
4053	NC_022525	CGA	2	6	188702	188707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478270
4054	NC_022525	GTGC	2	8	188709	188716	0 %	25 %	50 %	25 %	549478270
4055	NC_022525	GGT	2	6	188718	188723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478270
4056	NC_022525	ACC	2	6	188754	188759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478270
4057	NC_022525	AGC	2	6	188826	188831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478270
4058	NC_022525	GGTC	2	8	188858	188865	0 %	25 %	50 %	25 %	549478270
4059	NC_022525	TCCG	2	8	188887	188894	0 %	25 %	25 %	50 %	549478270
4060	NC_022525	CGA	2	6	188960	188965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478270
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4064	NC_022525	TC	3	6	189103	189108	0 %	50 %	0 %	50 %	549478270
4065	NC_022525	TGC	3	9	189151	189159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
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4068	NC_022525	TCTGG	2	10	189228	189237	0 %	40 %	40 %	20 %	549478270
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4070	NC_022525	CTG	2	6	189378	189383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
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4080	NC_022525	CTG	2	6	189663	189668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
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4084	NC_022525	CGA	2	6	189800	189805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478270
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4086	NC_022525	GCT	2	6	189860	189865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478270
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4089	NC_022525	GAA	2	6	189942	189947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478270
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4093	NC_022525	GGC	2	6	190133	190138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478270
4094	NC_022525	CGG	2	6	190201	190206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478270
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4099	NC_022525	GAC	2	6	190441	190446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481685
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4103	NC_022525	AAG	2	6	190657	190662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481685
4104	NC_022525	GTG	2	6	190711	190716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481685
4105	NC_022525	CCG	2	6	190734	190739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481685
4106	NC_022525	GTT	2	6	190746	190751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481685
4107	NC_022525	TTG	2	6	190765	190770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481685
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4110	NC_022525	AGT	2	6	190910	190915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481685
4111	NC_022525	TCT	2	6	190928	190933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481685
4112	NC_022525	AT	3	6	191042	191047	50 %	50 %	0 %	0 %	549481685
4113	NC_022525	TAA	2	6	191109	191114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481685
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4117	NC_022525	TAA	2	6	191253	191258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481685
4118	NC_022525	GAA	2	6	191360	191365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_022525	TAT	2	6	191374	191379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481686
4120	NC_022525	TAT	2	6	191387	191392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481686
4121	NC_022525	TAA	2	6	191393	191398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481686
4122	NC_022525	GAA	2	6	191419	191424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481686
4123	NC_022525	AT	3	6	191460	191465	50 %	50 %	0 %	0 %	549481686
4124	NC_022525	GAA	2	6	191485	191490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481686
4125	NC_022525	GCG	2	6	191517	191522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481686
4126	NC_022525	TAA	2	6	191561	191566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481686
4127	NC_022525	ATC	2	6	191609	191614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481686
4128	NC_022525	CGC	2	6	191690	191695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481686
4129	NC_022525	CGC	2	6	191760	191765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481686
4130	NC_022525	TCG	2	6	191906	191911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481686
4131	NC_022525	T	7	7	191976	191982	0 %	100 %	0 %	0 %	549481686
4132	NC_022525	ATG	2	6	191987	191992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481686
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4134	NC_022525	CGT	2	6	192012	192017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481686
4135	NC_022525	A	6	6	192022	192027	100 %	0 %	0 %	0 %	549481686
4136	NC_022525	GCT	2	6	192066	192071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481686
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4139	NC_022525	GGAG	2	8	192162	192169	25 %	0 %	75 %	0 %	549481686
4140	NC_022525	CAG	2	6	192199	192204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481686
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4142	NC_022525	AGC	3	9	192275	192283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481686
4143	NC_022525	CTGG	2	8	192284	192291	0 %	25 %	50 %	25 %	549481686
4144	NC_022525	CAA	2	6	192339	192344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481686
4145	NC_022525	A	6	6	192355	192360	100 %	0 %	0 %	0 %	549481686
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4150	NC_022525	GCG	2	6	192511	192516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4151	NC_022525	GAT	2	6	192551	192556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_022525	GC	4	8	192589	192596	0 %	0 %	50 %	50 %	549481687
4153	NC_022525	CAG	2	6	192721	192726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481687
4154	NC_022525	TTCT	2	8	192734	192741	0 %	75 %	0 %	25 %	549481687
4155	NC_022525	TGAG	2	8	192788	192795	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_022525	CAT	2	6	192811	192816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481688
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4161	NC_022525	CTG	2	6	193080	193085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481688
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4166	NC_022525	CTG	2	6	193218	193223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481688
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4171	NC_022525	CTG	2	6	193362	193367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481688
4172	NC_022525	TAC	2	6	193404	193409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481688
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4175	NC_022525	ATA	2	6	193762	193767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4176	NC_022525	TAT	2	6	193779	193784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4199	NC_022525	A	6	6	194676	194681	100 %	0 %	0 %	0 %	549481689
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4215	NC_022525	GTA	2	6	195323	195328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481691
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4227	NC_022525	ATT	2	6	195646	195651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481691
4228	NC_022525	TCCT	2	8	195675	195682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4229	NC_022525	A	6	6	195706	195711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_022525	CTG	2	6	195732	195737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4231	NC_022525	CAA	2	6	195785	195790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4232	NC_022525	GAT	2	6	195809	195814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_022525	TGA	2	6	195861	195866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_022525	A	6	6	195873	195878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4235	NC_022525	CT	3	6	195943	195948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4236	NC_022525	ATA	2	6	195957	195962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_022525	GC	3	6	195979	195984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4238	NC_022525	GTC	2	6	196002	196007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4239	NC_022525	GAT	2	6	196050	196055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4240	NC_022525	TCG	2	6	196148	196153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481692
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4242	NC_022525	ACG	2	6	196192	196197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481692
4243	NC_022525	T	7	7	196281	196287	0 %	100 %	0 %	0 %	549481692
4244	NC_022525	GCG	2	6	196333	196338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481692
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4246	NC_022525	CATT	2	8	196395	196402	25 %	50 %	0 %	25 %	549481692
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4367	NC_022525	CCT	2	6	202076	202081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4368	NC_022525	CGG	2	6	202176	202181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478277
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4490	NC_022525	GCA	2	6	208579	208584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478282
4491	NC_022525	CAT	2	6	208588	208593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478282
4492	NC_022525	TGG	2	6	208657	208662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478282
4493	NC_022525	GCA	2	6	208780	208785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478282
4494	NC_022525	TTA	2	6	208791	208796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478282
4495	NC_022525	CCG	2	6	208836	208841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478282
4496	NC_022525	ATA	2	6	208863	208868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478282
4497	NC_022525	GA	3	6	208908	208913	50 %	0 %	50 %	0 %	549478282
4498	NC_022525	AACA	2	8	208958	208965	75 %	0 %	0 %	25 %	549478282
4499	NC_022525	ATCCA	2	10	209020	209029	40 %	20 %	0 %	40 %	549478282
4500	NC_022525	TTGCGC	2	12	209045	209056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478282

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