MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022525	CGG	2	6	163487	163492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481682
3502	NC_022525	AACG	2	8	163591	163598	50 %	0 %	25 %	25 %	549481682
3503	NC_022525	CGC	2	6	163718	163723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481682
3504	NC_022525	TCA	2	6	163739	163744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481682
3505	NC_022525	TC	3	6	163872	163877	0 %	50 %	0 %	50 %	549481682
3506	NC_022525	CGC	2	6	163878	163883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481682
3507	NC_022525	GAG	2	6	163966	163971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481682
3508	NC_022525	CTGC	2	8	163975	163982	0 %	25 %	25 %	50 %	549481682
3509	NC_022525	TAT	2	6	164002	164007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481682
3510	NC_022525	CG	3	6	164014	164019	0 %	0 %	50 %	50 %	549481682
3511	NC_022525	TATT	2	8	164042	164049	25 %	75 %	0 %	0 %	549481682
3512	NC_022525	ATT	2	6	164051	164056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481682
3513	NC_022525	GTC	2	6	164118	164123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478251
3514	NC_022525	CGC	2	6	164138	164143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478251
3515	NC_022525	CGG	2	6	164165	164170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478251
3516	NC_022525	C	6	6	164234	164239	0 %	0 %	0 %	100 %	549478251
3517	NC_022525	GAC	2	6	164241	164246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478251
3518	NC_022525	ACG	2	6	164272	164277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478251
3519	NC_022525	GCA	2	6	164441	164446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3520	NC_022525	CGT	2	6	164453	164458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3521	NC_022525	GATCA	2	10	164520	164529	40 %	20 %	20 %	20 %	549478252
3522	NC_022525	TGT	2	6	164605	164610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478252
3523	NC_022525	GCC	2	6	164655	164660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478252
3524	NC_022525	GCT	2	6	164711	164716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3525	NC_022525	CCG	2	6	164750	164755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478252
3526	NC_022525	CTG	2	6	164763	164768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3527	NC_022525	GCT	2	6	164831	164836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3528	NC_022525	CAG	2	6	164853	164858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478252
3529	NC_022525	A	6	6	164914	164919	100 %	0 %	0 %	0 %	549478252
3530	NC_022525	TCT	2	6	165002	165007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478252
3531	NC_022525	TTA	2	6	165138	165143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478253
3532	NC_022525	GC	3	6	165170	165175	0 %	0 %	50 %	50 %	549478253
3533	NC_022525	CG	3	6	165217	165222	0 %	0 %	50 %	50 %	549478253
3534	NC_022525	CAT	2	6	165226	165231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478253
3535	NC_022525	CGTCA	2	10	165266	165275	20 %	20 %	20 %	40 %	549478253
3536	NC_022525	ACC	2	6	165276	165281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478253
3537	NC_022525	CAG	2	6	165320	165325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478253
3538	NC_022525	CTG	2	6	165383	165388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478253
3539	NC_022525	TTC	2	6	165425	165430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478253
3540	NC_022525	A	6	6	165439	165444	100 %	0 %	0 %	0 %	549478253
3541	NC_022525	CGG	2	6	165481	165486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478253
3542	NC_022525	GGGC	2	8	165526	165533	0 %	0 %	75 %	25 %	549478253
3543	NC_022525	GC	3	6	165554	165559	0 %	0 %	50 %	50 %	549478253
3544	NC_022525	ATA	2	6	165561	165566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478253
3545	NC_022525	CCG	2	6	165636	165641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478253
3546	NC_022525	CTA	2	6	165747	165752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_022525	A	7	7	165784	165790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_022525	GAA	2	6	165899	165904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478254
3549	NC_022525	ATT	2	6	166034	166039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478254
3550	NC_022525	CTG	2	6	166107	166112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478254
3551	NC_022525	A	6	6	166221	166226	100 %	0 %	0 %	0 %	549478254
3552	NC_022525	TCG	2	6	166311	166316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478254
3553	NC_022525	ACG	2	6	166448	166453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478254
3554	NC_022525	CGG	2	6	166488	166493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478254
3555	NC_022525	GGC	2	6	166526	166531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478254
3556	NC_022525	GGC	2	6	166547	166552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478254
3557	NC_022525	CGG	3	9	166585	166593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478254
3558	NC_022525	GGC	2	6	166613	166618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478254
3559	NC_022525	AG	3	6	166636	166641	50 %	0 %	50 %	0 %	549478254
3560	NC_022525	CGG	2	6	166642	166647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478254
3561	NC_022525	AGA	2	6	166657	166662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478254
3562	NC_022525	CGG	2	6	166726	166731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478254
3563	NC_022525	CG	3	6	166745	166750	0 %	0 %	50 %	50 %	549478254
3564	NC_022525	CCGC	2	8	166800	166807	0 %	0 %	25 %	75 %	549478254
3565	NC_022525	GGC	2	6	166817	166822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478254
3566	NC_022525	CAC	2	6	166879	166884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478254
3567	NC_022525	CTGG	2	8	166938	166945	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_022525	ATCCC	2	10	166966	166975	20 %	20 %	0 %	60 %	549478255
3569	NC_022525	CCA	3	9	167017	167025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478255
3570	NC_022525	TGA	2	6	167047	167052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478255
3571	NC_022525	GCCAGC	2	12	167091	167102	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549478255
3572	NC_022525	GCA	2	6	167134	167139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478255
3573	NC_022525	T	6	6	167211	167216	0 %	100 %	0 %	0 %	549478255
3574	NC_022525	GAA	2	6	167323	167328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478255
3575	NC_022525	AGA	2	6	167424	167429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478255
3576	NC_022525	CGCTGC	2	12	167430	167441	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549478255
3577	NC_022525	ATA	2	6	167547	167552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478255
3578	NC_022525	CG	3	6	167554	167559	0 %	0 %	50 %	50 %	549478255
3579	NC_022525	AGA	2	6	167562	167567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478255
3580	NC_022525	GGC	2	6	167597	167602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478255
3581	NC_022525	GCA	2	6	167623	167628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478255
3582	NC_022525	GGC	2	6	167645	167650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478255
3583	NC_022525	AAT	2	6	167660	167665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478255
3584	NC_022525	AGCGC	2	10	167674	167683	20 %	0 %	40 %	40 %	549478255
3585	NC_022525	AGC	2	6	167740	167745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478255
3586	NC_022525	ATC	2	6	167781	167786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478255
3587	NC_022525	GCG	2	6	167797	167802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478255
3588	NC_022525	ATGA	2	8	167951	167958	50 %	25 %	25 %	0 %	549478255
3589	NC_022525	TGA	2	6	167970	167975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478255
3590	NC_022525	CTT	2	6	167995	168000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478255
3591	NC_022525	GCG	2	6	168009	168014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478255
3592	NC_022525	TGA	2	6	168067	168072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478255
3593	NC_022525	TGCC	2	8	168396	168403	0 %	25 %	25 %	50 %	549478256
3594	NC_022525	GC	3	6	168413	168418	0 %	0 %	50 %	50 %	549478256
3595	NC_022525	ACC	2	6	168505	168510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478256
3596	NC_022525	ATC	2	6	168529	168534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478256
3597	NC_022525	TGC	2	6	168553	168558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478256
3598	NC_022525	TGG	2	6	168578	168583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478256
3599	NC_022525	GCC	2	6	168625	168630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478256
3600	NC_022525	ATG	3	9	168676	168684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478256
3601	NC_022525	GC	4	8	168704	168711	0 %	0 %	50 %	50 %	549478256
3602	NC_022525	GGAT	2	8	168742	168749	25 %	25 %	50 %	0 %	549478256
3603	NC_022525	GC	3	6	168836	168841	0 %	0 %	50 %	50 %	549478256
3604	NC_022525	CAA	2	6	168987	168992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478256
3605	NC_022525	GAC	2	6	168999	169004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478256
3606	NC_022525	CTT	2	6	169013	169018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478256
3607	NC_022525	GAA	2	6	169184	169189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478256
3608	NC_022525	GAT	2	6	169355	169360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478256
3609	NC_022525	CA	3	6	169384	169389	50 %	0 %	0 %	50 %	549478256
3610	NC_022525	ACC	2	6	169453	169458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478256
3611	NC_022525	TGA	2	6	169501	169506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478256
3612	NC_022525	TGAGC	2	10	169523	169532	20 %	20 %	40 %	20 %	549478256
3613	NC_022525	TGT	2	6	169588	169593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478257
3614	NC_022525	GGCG	2	8	169659	169666	0 %	0 %	75 %	25 %	549478257
3615	NC_022525	ATG	2	6	169669	169674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478257
3616	NC_022525	TGA	2	6	169712	169717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478257
3617	NC_022525	TGA	2	6	169754	169759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478257
3618	NC_022525	CGCAT	2	10	169785	169794	20 %	20 %	20 %	40 %	549478257
3619	NC_022525	CCA	2	6	169804	169809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478257
3620	NC_022525	CGG	2	6	169832	169837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478257
3621	NC_022525	GAT	2	6	169932	169937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478257
3622	NC_022525	GTT	2	6	169976	169981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478257
3623	NC_022525	AAT	2	6	170141	170146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_022525	GA	3	6	170226	170231	50 %	0 %	50 %	0 %	549478258
3625	NC_022525	GC	4	8	170236	170243	0 %	0 %	50 %	50 %	549478258
3626	NC_022525	GC	3	6	170257	170262	0 %	0 %	50 %	50 %	549478258
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3643	NC_022525	GTTG	2	8	171207	171214	0 %	50 %	50 %	0 %	549478259
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3714	NC_022525	T	8	8	175102	175109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3716	NC_022525	T	6	6	175243	175248	0 %	100 %	0 %	0 %	549478263
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3723	NC_022525	CAT	2	6	175442	175447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478263
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3736	NC_022525	GATA	2	8	175861	175868	50 %	25 %	25 %	0 %	549478263
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3988	NC_022525	TGC	2	6	186204	186209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3989	NC_022525	CGC	2	6	186223	186228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481684
3990	NC_022525	TGG	2	6	186235	186240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481684
3991	NC_022525	TAT	2	6	186262	186267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481684
3992	NC_022525	TGC	2	6	186303	186308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481684
3993	NC_022525	ATT	2	6	186356	186361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481684
3994	NC_022525	ACC	2	6	186404	186409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481684
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3997	NC_022525	ATG	2	6	186428	186433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481684
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3999	NC_022525	TGG	2	6	186444	186449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481684
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