MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022525	ATG	2	6	116185	116190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_022525	TA	3	6	116195	116200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_022525	CAG	2	6	116201	116206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_022525	TTTA	2	8	116243	116250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_022525	A	6	6	116358	116363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_022525	T	6	6	116370	116375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_022525	GTTT	2	8	116376	116383	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_022525	ATA	2	6	116441	116446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_022525	TAAA	2	8	116467	116474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_022525	TCG	2	6	116494	116499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_022525	CT	3	6	116504	116509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_022525	TAATT	2	10	116513	116522	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_022525	ATTTT	2	10	116539	116548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_022525	CGGGTG	2	12	116555	116566	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2515	NC_022525	T	6	6	116701	116706	0 %	100 %	0 %	0 %	549478216
2516	NC_022525	ACAGA	2	10	116722	116731	60 %	0 %	20 %	20 %	549478216
2517	NC_022525	ATT	2	6	116746	116751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478216
2518	NC_022525	T	7	7	116766	116772	0 %	100 %	0 %	0 %	549478216
2519	NC_022525	A	6	6	116793	116798	100 %	0 %	0 %	0 %	549478216
2520	NC_022525	ATT	2	6	116815	116820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478216
2521	NC_022525	CAA	2	6	116852	116857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478216
2522	NC_022525	TTC	2	6	116872	116877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478216
2523	NC_022525	GGAA	2	8	116886	116893	50 %	0 %	50 %	0 %	549478216
2524	NC_022525	ATT	2	6	116920	116925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478216
2525	NC_022525	AT	3	6	116973	116978	50 %	50 %	0 %	0 %	549478216
2526	NC_022525	TCA	2	6	116991	116996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478216
2527	NC_022525	C	6	6	117002	117007	0 %	0 %	0 %	100 %	549478216
2528	NC_022525	CAG	2	6	117081	117086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478217
2529	NC_022525	TGC	2	6	117091	117096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478217
2530	NC_022525	GCG	2	6	117110	117115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478217
2531	NC_022525	GGC	2	6	117122	117127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478217
2532	NC_022525	AGA	2	6	117128	117133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478217
2533	NC_022525	CTT	2	6	117149	117154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478217
2534	NC_022525	GCG	2	6	117244	117249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478217
2535	NC_022525	CAA	2	6	117275	117280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478217
2536	NC_022525	GTGG	2	8	117372	117379	0 %	25 %	75 %	0 %	549478217
2537	NC_022525	GT	3	6	117439	117444	0 %	50 %	50 %	0 %	549478217
2538	NC_022525	GCC	2	6	117450	117455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478217
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2540	NC_022525	GAC	2	6	117502	117507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478217
2541	NC_022525	ACC	3	9	117550	117558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478217
2542	NC_022525	CGC	2	6	117614	117619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478217
2543	NC_022525	TCT	2	6	117715	117720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478217
2544	NC_022525	CAGCG	2	10	117897	117906	20 %	0 %	40 %	40 %	549478218
2545	NC_022525	GC	3	6	118024	118029	0 %	0 %	50 %	50 %	549478218
2546	NC_022525	GCCA	2	8	118031	118038	25 %	0 %	25 %	50 %	549478218
2547	NC_022525	GCG	2	6	118120	118125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478218
2548	NC_022525	CAG	2	6	118151	118156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478218
2549	NC_022525	CGA	2	6	118189	118194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478218
2550	NC_022525	GCCGG	2	10	118197	118206	0 %	0 %	60 %	40 %	549478218
2551	NC_022525	GCC	2	6	118244	118249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478218
2552	NC_022525	GGAC	2	8	118298	118305	25 %	0 %	50 %	25 %	549478218
2553	NC_022525	AC	3	6	118304	118309	50 %	0 %	0 %	50 %	549478218
2554	NC_022525	CGAGC	2	10	118322	118331	20 %	0 %	40 %	40 %	549478218
2555	NC_022525	TCC	2	6	118368	118373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478218
2556	NC_022525	GCC	2	6	118385	118390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478218
2557	NC_022525	GCG	2	6	118431	118436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478218
2558	NC_022525	GTT	2	6	118507	118512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478218
2559	NC_022525	GTC	2	6	118536	118541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478218
2560	NC_022525	GC	3	6	118595	118600	0 %	0 %	50 %	50 %	549478218
2561	NC_022525	GGCG	2	8	118643	118650	0 %	0 %	75 %	25 %	549478218
2562	NC_022525	GCT	2	6	118661	118666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478218
2563	NC_022525	TCGCCG	2	12	118695	118706	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549478218
2564	NC_022525	CAC	2	6	118715	118720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478218
2565	NC_022525	ATTTG	2	10	118765	118774	20 %	60 %	20 %	0 %	549478218
2566	NC_022525	GTCA	2	8	118793	118800	25 %	25 %	25 %	25 %	549478218
2567	NC_022525	GAC	2	6	118928	118933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478218
2568	NC_022525	TGC	2	6	118938	118943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478218
2569	NC_022525	CG	3	6	118953	118958	0 %	0 %	50 %	50 %	549478218
2570	NC_022525	CCG	2	6	118980	118985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478218
2571	NC_022525	GGTTCA	2	12	118996	119007	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549478218
2572	NC_022525	GCG	2	6	119040	119045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478218
2573	NC_022525	AGT	2	6	119067	119072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478218
2574	NC_022525	ACC	2	6	119136	119141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478218
2575	NC_022525	GCTG	2	8	119320	119327	0 %	25 %	50 %	25 %	549478218
2576	NC_022525	TGT	2	6	119443	119448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478219
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2578	NC_022525	GGT	2	6	119477	119482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478219
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2580	NC_022525	CGG	2	6	119594	119599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478219
2581	NC_022525	GCG	2	6	119608	119613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478219
2582	NC_022525	CGA	2	6	119639	119644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478219
2583	NC_022525	GCA	2	6	119670	119675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478219
2584	NC_022525	GCC	2	6	119709	119714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478219
2585	NC_022525	GC	5	10	119770	119779	0 %	0 %	50 %	50 %	549478219
2586	NC_022525	GCG	2	6	119883	119888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478219
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2588	NC_022525	GCT	2	6	119969	119974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478219
2589	NC_022525	CTGG	2	8	119976	119983	0 %	25 %	50 %	25 %	549478219
2590	NC_022525	TGC	2	6	120010	120015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478219
2591	NC_022525	CAC	2	6	120114	120119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478219
2592	NC_022525	CGC	2	6	120275	120280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478219
2593	NC_022525	CGG	2	6	120353	120358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478219
2594	NC_022525	TCA	2	6	120415	120420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478219
2595	NC_022525	AAG	2	6	120421	120426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478219
2596	NC_022525	GGC	2	6	120433	120438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478219
2597	NC_022525	CGG	2	6	120493	120498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478219
2598	NC_022525	GTG	2	6	120514	120519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478219
2599	NC_022525	AGC	2	6	120526	120531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478219
2600	NC_022525	CA	3	6	120545	120550	50 %	0 %	0 %	50 %	549478219
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2602	NC_022525	GCC	2	6	120642	120647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478219
2603	NC_022525	AGT	2	6	120659	120664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478219
2604	NC_022525	TCG	2	6	120700	120705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478219
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2606	NC_022525	GCG	2	6	120865	120870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478219
2607	NC_022525	CG	3	6	120923	120928	0 %	0 %	50 %	50 %	549478219
2608	NC_022525	GAT	2	6	120929	120934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478219
2609	NC_022525	GTT	2	6	120945	120950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478219
2610	NC_022525	CTT	2	6	120971	120976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478219
2611	NC_022525	TGG	2	6	121001	121006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478219
2612	NC_022525	TCG	2	6	121012	121017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478219
2613	NC_022525	GC	3	6	121042	121047	0 %	0 %	50 %	50 %	549478219
2614	NC_022525	CAATTG	2	12	121073	121084	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549478219
2615	NC_022525	TCCA	2	8	121097	121104	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2616	NC_022525	AG	3	6	121129	121134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_022525	CAGG	2	8	121151	121158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2618	NC_022525	AATGCT	2	12	121181	121192	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2619	NC_022525	TCA	2	6	121333	121338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_022525	TCT	2	6	121398	121403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_022525	G	6	6	121413	121418	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_022525	T	7	7	121527	121533	0 %	100 %	0 %	0 %	549478220
2623	NC_022525	ATCG	2	8	121534	121541	25 %	25 %	25 %	25 %	549478220
2624	NC_022525	AT	3	6	121560	121565	50 %	50 %	0 %	0 %	549478220
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2992	NC_022525	GCC	2	6	139479	139484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2993	NC_022525	CAAA	2	8	139487	139494	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2994	NC_022525	AAT	2	6	139520	139525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2995	NC_022525	ATT	2	6	139530	139535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_022525	T	6	6	139558	139563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_022525	CTTT	2	8	139569	139576	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2998	NC_022525	TTGTT	2	10	139633	139642	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2999	NC_022525	TCG	2	6	139659	139664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3000	NC_022525	CGG	2	6	139839	139844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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