MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2006	NC_022525	GCA	2	6	92173	92178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478197
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2132	NC_022525	GCC	2	6	98383	98388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478202
2133	NC_022525	AGG	2	6	98393	98398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478202
2134	NC_022525	CG	4	8	98405	98412	0 %	0 %	50 %	50 %	549478202
2135	NC_022525	GCA	2	6	98427	98432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478202
2136	NC_022525	CCT	2	6	98455	98460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478202
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2138	NC_022525	CTG	2	6	98542	98547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478202
2139	NC_022525	CGG	2	6	98562	98567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478202
2140	NC_022525	GCC	2	6	98664	98669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478202
2141	NC_022525	TGCAC	2	10	98678	98687	20 %	20 %	20 %	40 %	549478202
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2145	NC_022525	CGG	2	6	98811	98816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478203
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2152	NC_022525	AATG	2	8	99166	99173	50 %	25 %	25 %	0 %	549478203
2153	NC_022525	TGG	2	6	99252	99257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478203
2154	NC_022525	GAT	2	6	99259	99264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478203
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2159	NC_022525	TGG	2	6	99348	99353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478203
2160	NC_022525	GCGCT	2	10	99383	99392	0 %	20 %	40 %	40 %	549478203
2161	NC_022525	CG	3	6	99397	99402	0 %	0 %	50 %	50 %	549478203
2162	NC_022525	GGCG	2	8	99508	99515	0 %	0 %	75 %	25 %	549478203
2163	NC_022525	CTG	2	6	99518	99523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478203
2164	NC_022525	GCT	3	9	99577	99585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478203
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2166	NC_022525	TGG	2	6	99633	99638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478203
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2194	NC_022525	T	8	8	100804	100811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2230	NC_022525	TCATGG	2	12	103189	103200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549478207
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2237	NC_022525	CAG	2	6	103722	103727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478208
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2239	NC_022525	ATG	2	6	103781	103786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478208
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2242	NC_022525	T	6	6	104017	104022	0 %	100 %	0 %	0 %	549478208
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2251	NC_022525	GAC	2	6	104392	104397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478208
2252	NC_022525	CGG	2	6	104415	104420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478208
2253	NC_022525	AAC	2	6	104437	104442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478208
2254	NC_022525	GC	3	6	104491	104496	0 %	0 %	50 %	50 %	549478209
2255	NC_022525	CGC	2	6	104514	104519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478209
2256	NC_022525	TTC	2	6	104520	104525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478209
2257	NC_022525	TCA	2	6	104540	104545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478209
2258	NC_022525	GC	3	6	104645	104650	0 %	0 %	50 %	50 %	549478209
2259	NC_022525	CCCAA	2	10	104717	104726	40 %	0 %	0 %	60 %	549478209
2260	NC_022525	CGC	2	6	104772	104777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478209
2261	NC_022525	GGT	2	6	104787	104792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478209
2262	NC_022525	TTC	2	6	104820	104825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478209
2263	NC_022525	GC	3	6	104835	104840	0 %	0 %	50 %	50 %	549478209
2264	NC_022525	CTG	2	6	104841	104846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478209
2265	NC_022525	TTC	2	6	104992	104997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478209
2266	NC_022525	CTG	2	6	105075	105080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478209
2267	NC_022525	CTT	2	6	105131	105136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478209
2268	NC_022525	CAA	2	6	105137	105142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478209
2269	NC_022525	CGT	2	6	105164	105169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478209
2270	NC_022525	CTT	2	6	105278	105283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478209
2271	NC_022525	CGA	2	6	105304	105309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478209
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2273	NC_022525	ATC	2	6	105337	105342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478209
2274	NC_022525	TTGTT	2	10	105424	105433	0 %	80 %	20 %	0 %	549478209
2275	NC_022525	TCT	2	6	105488	105493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478209
2276	NC_022525	CGT	2	6	105557	105562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478209
2277	NC_022525	GCT	2	6	105569	105574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478209
2278	NC_022525	CCTG	2	8	105577	105584	0 %	25 %	25 %	50 %	549478209
2279	NC_022525	ACG	2	6	105637	105642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478209
2280	NC_022525	ATT	2	6	105645	105650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478209
2281	NC_022525	GAC	2	6	105651	105656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478209
2282	NC_022525	G	6	6	105680	105685	0 %	0 %	100 %	0 %	549478209
2283	NC_022525	AGC	2	6	105724	105729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478209
2284	NC_022525	TTC	2	6	105739	105744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478209
2285	NC_022525	ATCA	2	8	105790	105797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2286	NC_022525	GTT	2	6	105922	105927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478210
2287	NC_022525	AGC	2	6	105979	105984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478210
2288	NC_022525	AGT	2	6	106042	106047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478210
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2290	NC_022525	AT	3	6	106164	106169	50 %	50 %	0 %	0 %	549478210
2291	NC_022525	GCT	4	12	106232	106243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478210
2292	NC_022525	GTC	2	6	106352	106357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478210
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2294	NC_022525	TAG	2	6	106404	106409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478210
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2307	NC_022525	ATA	2	6	107349	107354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478210
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2323	NC_022525	TATT	2	8	108167	108174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2324	NC_022525	CAT	2	6	108179	108184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2329	NC_022525	CCA	2	6	108580	108585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478211
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2331	NC_022525	TGATC	2	10	108791	108800	20 %	40 %	20 %	20 %	549478211
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2345	NC_022525	AATG	2	8	109269	109276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2346	NC_022525	AAGCG	2	10	109287	109296	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2347	NC_022525	CAC	2	6	109522	109527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478212
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2353	NC_022525	CCG	2	6	109659	109664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478212
2354	NC_022525	GGGA	2	8	109665	109672	25 %	0 %	75 %	0 %	549478212
2355	NC_022525	CG	3	6	109683	109688	0 %	0 %	50 %	50 %	549478212
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2362	NC_022525	GCG	2	6	109953	109958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478212
2363	NC_022525	GAC	2	6	110004	110009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2364	NC_022525	GCCT	2	8	110037	110044	0 %	25 %	25 %	50 %	549478213
2365	NC_022525	CTG	2	6	110064	110069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2366	NC_022525	TCG	3	9	110095	110103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2367	NC_022525	GC	3	6	110122	110127	0 %	0 %	50 %	50 %	549478213
2368	NC_022525	CG	3	6	110179	110184	0 %	0 %	50 %	50 %	549478213
2369	NC_022525	ATCA	2	8	110187	110194	50 %	25 %	0 %	25 %	549478213
2370	NC_022525	TGC	2	6	110276	110281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2371	NC_022525	GCTGA	2	10	110301	110310	20 %	20 %	40 %	20 %	549478213
2372	NC_022525	GGC	2	6	110337	110342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478213
2373	NC_022525	TTG	2	6	110347	110352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478213
2374	NC_022525	CGG	2	6	110385	110390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478213
2375	NC_022525	ACG	2	6	110434	110439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2376	NC_022525	CAG	2	6	110454	110459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2377	NC_022525	TGC	3	9	110501	110509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2378	NC_022525	TAA	2	6	110567	110572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478213
2379	NC_022525	CGC	2	6	110696	110701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478213
2380	NC_022525	CGA	2	6	110720	110725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2381	NC_022525	GTC	3	9	110763	110771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2382	NC_022525	TTC	2	6	110775	110780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478213
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2384	NC_022525	CAG	2	6	110832	110837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2385	NC_022525	TTC	2	6	110922	110927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478213
2386	NC_022525	CG	3	6	110976	110981	0 %	0 %	50 %	50 %	549478213
2387	NC_022525	T	6	6	111053	111058	0 %	100 %	0 %	0 %	549478213
2388	NC_022525	GAC	2	6	111110	111115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478213
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2390	NC_022525	CAG	2	6	111129	111134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478213
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2392	NC_022525	TCT	2	6	111238	111243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478213
2393	NC_022525	GGC	3	9	111255	111263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478213
2394	NC_022525	CGG	2	6	111302	111307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478213
2395	NC_022525	TTCGCG	2	12	111318	111329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478213
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2399	NC_022525	CGGCAG	2	12	111576	111587	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549478213
2400	NC_022525	TCA	2	6	111694	111699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478213
2401	NC_022525	GGC	2	6	111702	111707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478213
2402	NC_022525	CGT	2	6	111713	111718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2403	NC_022525	TCG	2	6	111793	111798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478213
2404	NC_022525	CAG	2	6	111819	111824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478213
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2406	NC_022525	TGGCG	2	10	111951	111960	0 %	20 %	60 %	20 %	549478213
2407	NC_022525	CAG	2	6	111963	111968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478213
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2409	NC_022525	GAT	2	6	112046	112051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478213
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2412	NC_022525	GCT	2	6	112106	112111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478213
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2422	NC_022525	CG	3	6	112382	112387	0 %	0 %	50 %	50 %	549478213
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2425	NC_022525	AGCGC	2	10	112511	112520	20 %	0 %	40 %	40 %	549478213
2426	NC_022525	TCGA	2	8	112533	112540	25 %	25 %	25 %	25 %	549478213
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2429	NC_022525	CATC	2	8	112820	112827	25 %	25 %	0 %	50 %	549478213
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2432	NC_022525	AGT	2	6	113097	113102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478214
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2480	NC_022525	GCCA	2	8	115347	115354	25 %	0 %	25 %	50 %	549478214
2481	NC_022525	GCG	2	6	115375	115380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478214
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2483	NC_022525	GAT	2	6	115424	115429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2484	NC_022525	A	6	6	115439	115444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2485	NC_022525	TAA	2	6	115525	115530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478215
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2494	NC_022525	CG	3	6	115857	115862	0 %	0 %	50 %	50 %	549478215
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2496	NC_022525	CG	3	6	115973	115978	0 %	0 %	50 %	50 %	549478215
2497	NC_022525	CTGA	2	8	115989	115996	25 %	25 %	25 %	25 %	549478215
2498	NC_022525	TGCC	2	8	116051	116058	0 %	25 %	25 %	50 %	549478215
2499	NC_022525	ATGA	2	8	116086	116093	50 %	25 %	25 %	0 %	549478215
2500	NC_022525	GTTC	2	8	116094	116101	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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