MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022525	TGA	2	6	45592	45597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481672
1002	NC_022525	CCG	2	6	45614	45619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481672
1003	NC_022525	GTG	2	6	45647	45652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481672
1004	NC_022525	ATGA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	25 %	0 %	549481672
1005	NC_022525	GC	3	6	45705	45710	0 %	0 %	50 %	50 %	549481672
1006	NC_022525	CAG	2	6	45746	45751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481672
1007	NC_022525	TGA	2	6	45790	45795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481672
1008	NC_022525	GCT	2	6	45871	45876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481672
1009	NC_022525	TAC	2	6	45941	45946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481672
1010	NC_022525	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	549481672
1011	NC_022525	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_022525	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_022525	A	6	6	46056	46061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022525	A	6	6	46090	46095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022525	TCA	2	6	46104	46109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_022525	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022525	TAG	2	6	46150	46155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_022525	GAA	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_022525	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_022525	T	6	6	46208	46213	0 %	100 %	0 %	0 %	549478163
1021	NC_022525	AGC	2	6	46214	46219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478163
1022	NC_022525	CAT	2	6	46234	46239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478163
1023	NC_022525	TCA	2	6	46242	46247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478163
1024	NC_022525	CGC	2	6	46249	46254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478163
1025	NC_022525	CAA	2	6	46354	46359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478163
1026	NC_022525	TGT	2	6	46368	46373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478163
1027	NC_022525	GCC	2	6	46487	46492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478163
1028	NC_022525	CGG	2	6	46495	46500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478163
1029	NC_022525	GAT	2	6	46501	46506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478163
1030	NC_022525	ACT	2	6	46536	46541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478163
1031	NC_022525	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	549478163
1032	NC_022525	ATC	2	6	46670	46675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478163
1033	NC_022525	GAT	2	6	46676	46681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478163
1034	NC_022525	TTA	2	6	46695	46700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478163
1035	NC_022525	GGC	2	6	46747	46752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478163
1036	NC_022525	GCT	2	6	46774	46779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478163
1037	NC_022525	GCG	2	6	46788	46793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478163
1038	NC_022525	TA	3	6	46809	46814	50 %	50 %	0 %	0 %	549478163
1039	NC_022525	CGG	2	6	46839	46844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478163
1040	NC_022525	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	549478163
1041	NC_022525	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	549478163
1042	NC_022525	TGC	2	6	47049	47054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478163
1043	NC_022525	ATT	2	6	47063	47068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478163
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1045	NC_022525	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	549478163
1046	NC_022525	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	549478163
1047	NC_022525	TTA	2	6	47259	47264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478163
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1049	NC_022525	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	549478163
1050	NC_022525	TTA	2	6	47450	47455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478164
1051	NC_022525	AAG	2	6	47473	47478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478164
1052	NC_022525	CGC	2	6	47515	47520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478164
1053	NC_022525	TGT	2	6	47701	47706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478164
1054	NC_022525	CAG	2	6	47747	47752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478164
1055	NC_022525	GCG	2	6	47763	47768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478164
1056	NC_022525	GTG	2	6	47769	47774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478164
1057	NC_022525	GCT	2	6	47797	47802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478164
1058	NC_022525	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	549478164
1059	NC_022525	GCA	2	6	47888	47893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478164
1060	NC_022525	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	549478164
1061	NC_022525	TTG	2	6	48036	48041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478164
1062	NC_022525	TGA	2	6	48089	48094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478164
1063	NC_022525	GAA	2	6	48219	48224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478164
1064	NC_022525	GA	3	6	48243	48248	50 %	0 %	50 %	0 %	549478164
1065	NC_022525	CGG	2	6	48262	48267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478164
1066	NC_022525	ACT	2	6	48289	48294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478164
1067	NC_022525	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_022525	CAG	2	6	48381	48386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478165
1069	NC_022525	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	549478165
1070	NC_022525	CCT	2	6	48460	48465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478165
1071	NC_022525	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	549478165
1072	NC_022525	CAG	2	6	48561	48566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478165
1073	NC_022525	TCC	2	6	48670	48675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478165
1074	NC_022525	CCG	2	6	48940	48945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478165
1075	NC_022525	CGT	2	6	48951	48956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478165
1076	NC_022525	CCA	2	6	48957	48962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478165
1077	NC_022525	CGG	2	6	48992	48997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478165
1078	NC_022525	GAG	2	6	49024	49029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478165
1079	NC_022525	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	549478165
1080	NC_022525	A	6	6	49134	49139	100 %	0 %	0 %	0 %	549478165
1081	NC_022525	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	549478165
1082	NC_022525	GTCGTA	2	12	49209	49220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549478165
1083	NC_022525	CG	4	8	49310	49317	0 %	0 %	50 %	50 %	549478165
1084	NC_022525	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	549478165
1085	NC_022525	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	549478165
1086	NC_022525	CG	3	6	49523	49528	0 %	0 %	50 %	50 %	549478165
1087	NC_022525	AAG	2	6	49564	49569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478165
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1089	NC_022525	CAG	2	6	49626	49631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478165
1090	NC_022525	CAT	2	6	49689	49694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478165
1091	NC_022525	CGG	2	6	49695	49700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478165
1092	NC_022525	AGT	2	6	49763	49768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478165
1093	NC_022525	GTT	2	6	49839	49844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478165
1094	NC_022525	T	6	6	49973	49978	0 %	100 %	0 %	0 %	549478165
1095	NC_022525	GAT	2	6	50083	50088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478165
1096	NC_022525	TG	3	6	50141	50146	0 %	50 %	50 %	0 %	549478165
1097	NC_022525	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	549478165
1098	NC_022525	TGG	2	6	50218	50223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478165
1099	NC_022525	TGC	2	6	50368	50373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478165
1100	NC_022525	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	549478165
1101	NC_022525	TTG	2	6	50394	50399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478165
1102	NC_022525	TGG	2	6	50411	50416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478165
1103	NC_022525	TCT	2	6	50483	50488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481673
1104	NC_022525	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	549481673
1105	NC_022525	AGT	2	6	50518	50523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481673
1106	NC_022525	GCA	2	6	50593	50598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481673
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1108	NC_022525	TGC	2	6	50690	50695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481673
1109	NC_022525	GGC	2	6	50820	50825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481673
1110	NC_022525	TGT	2	6	50840	50845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481673
1111	NC_022525	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	549481673
1112	NC_022525	CAT	2	6	50859	50864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481673
1113	NC_022525	CGC	2	6	50867	50872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481673
1114	NC_022525	CAG	2	6	50886	50891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481673
1115	NC_022525	AAG	2	6	50932	50937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481673
1116	NC_022525	GAT	2	6	50946	50951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481673
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1118	NC_022525	ATA	2	6	51024	51029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481673
1119	NC_022525	GCT	2	6	51047	51052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481673
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1121	NC_022525	CGC	2	6	51117	51122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481673
1122	NC_022525	T	7	7	51128	51134	0 %	100 %	0 %	0 %	549481673
1123	NC_022525	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	549481673
1124	NC_022525	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	549481673
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1126	NC_022525	A	6	6	51277	51282	100 %	0 %	0 %	0 %	549481673
1127	NC_022525	TAA	2	6	51312	51317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481673
1128	NC_022525	TCA	2	6	51383	51388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481673
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1130	NC_022525	TGC	2	6	51456	51461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481673
1131	NC_022525	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	549481673
1132	NC_022525	GAC	2	6	51554	51559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481673
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1141	NC_022525	AGTA	2	8	51937	51944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_022525	AGT	2	6	51959	51964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_022525	ATCA	2	8	51977	51984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1144	NC_022525	ATT	2	6	51985	51990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_022525	TTA	2	6	52013	52018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_022525	GGT	2	6	52051	52056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1148	NC_022525	GAAA	2	8	52097	52104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_022525	TAT	2	6	52117	52122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1151	NC_022525	A	6	6	52145	52150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_022525	GCT	2	6	52154	52159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_022525	A	7	7	52227	52233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1162	NC_022525	GCG	2	6	52737	52742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1163	NC_022525	TCT	2	6	52782	52787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1164	NC_022525	TCA	2	6	52795	52800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1166	NC_022525	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	549478166
1167	NC_022525	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	549478166
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1246	NC_022525	TGT	2	6	57048	57053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478168
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1248	NC_022525	GCGCC	2	10	57235	57244	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1249	NC_022525	GTG	2	6	57256	57261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1250	NC_022525	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	549478169
1251	NC_022525	GAT	2	6	57401	57406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478169
1252	NC_022525	CGG	2	6	57414	57419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478169
1253	NC_022525	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	549478169
1254	NC_022525	AGC	3	9	57489	57497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478169
1255	NC_022525	AAG	2	6	57510	57515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478169
1256	NC_022525	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	549478169
1257	NC_022525	CGC	2	6	57547	57552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478169
1258	NC_022525	GGC	2	6	57607	57612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478169
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1260	NC_022525	TTG	2	6	57857	57862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478170
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1265	NC_022525	TGG	2	6	58223	58228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478170
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1267	NC_022525	TCG	2	6	58358	58363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478170
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1273	NC_022525	AGG	2	6	58550	58555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478170
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1280	NC_022525	GTC	2	6	58844	58849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1283	NC_022525	TGGA	2	8	58994	59001	25 %	25 %	50 %	0 %	549478171
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1353	NC_022525	ACA	2	6	62834	62839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478174
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1359	NC_022525	TGG	2	6	63329	63334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478174
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1361	NC_022525	TTTC	2	8	63490	63497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1362	NC_022525	A	6	6	63500	63505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1363	NC_022525	CGCC	2	8	63577	63584	0 %	0 %	25 %	75 %	549478175
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1374	NC_022525	CAG	2	6	63989	63994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478175
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1377	NC_022525	CCA	2	6	64021	64026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478175
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