MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022525	CGG	2	6	22745	22750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478146
502	NC_022525	T	6	6	22755	22760	0 %	100 %	0 %	0 %	549478146
503	NC_022525	CT	3	6	22797	22802	0 %	50 %	0 %	50 %	549478146
504	NC_022525	GGT	2	6	22950	22955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478146
505	NC_022525	CTA	2	6	22957	22962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478146
506	NC_022525	CGG	2	6	22997	23002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478146
507	NC_022525	CTGG	2	8	23003	23010	0 %	25 %	50 %	25 %	549478146
508	NC_022525	TAT	2	6	23028	23033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478146
509	NC_022525	ATA	2	6	23054	23059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478146
510	NC_022525	TTA	2	6	23169	23174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022525	TCTTAA	2	12	23206	23217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
512	NC_022525	TTAT	2	8	23268	23275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022525	A	7	7	23341	23347	100 %	0 %	0 %	0 %	549478147
514	NC_022525	TGA	2	6	23348	23353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478147
515	NC_022525	ACG	2	6	23354	23359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478147
516	NC_022525	ATA	2	6	23372	23377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478147
517	NC_022525	CTTTT	2	10	23396	23405	0 %	80 %	0 %	20 %	549478147
518	NC_022525	T	6	6	23402	23407	0 %	100 %	0 %	0 %	549478147
519	NC_022525	CAG	2	6	23410	23415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478147
520	NC_022525	TTG	2	6	23455	23460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478147
521	NC_022525	TTTA	2	8	23501	23508	25 %	75 %	0 %	0 %	549478147
522	NC_022525	ATG	2	6	23516	23521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478147
523	NC_022525	GTT	2	6	23551	23556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478147
524	NC_022525	ATG	2	6	23567	23572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478147
525	NC_022525	AT	3	6	23585	23590	50 %	50 %	0 %	0 %	549478147
526	NC_022525	CG	3	6	23655	23660	0 %	0 %	50 %	50 %	549478147
527	NC_022525	ACG	2	6	23756	23761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478147
528	NC_022525	TGA	2	6	23792	23797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478147
529	NC_022525	GC	4	8	23798	23805	0 %	0 %	50 %	50 %	549478147
530	NC_022525	CTGA	2	8	23854	23861	25 %	25 %	25 %	25 %	549478147
531	NC_022525	TCTG	2	8	23958	23965	0 %	50 %	25 %	25 %	549478147
532	NC_022525	A	7	7	23970	23976	100 %	0 %	0 %	0 %	549478147
533	NC_022525	GGC	2	6	24002	24007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478147
534	NC_022525	AT	3	6	24059	24064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022525	GTT	2	6	24119	24124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022525	GAT	2	6	24235	24240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_022525	TAA	2	6	24262	24267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022525	TAA	2	6	24269	24274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022525	ACG	2	6	24309	24314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_022525	AAG	2	6	24356	24361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022525	T	7	7	24366	24372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022525	GAA	2	6	24402	24407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022525	CAG	2	6	24412	24417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_022525	A	6	6	24428	24433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022525	TGAA	2	8	24469	24476	50 %	25 %	25 %	0 %	549478148
546	NC_022525	TGT	2	6	24524	24529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478148
547	NC_022525	TAC	2	6	24546	24551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478148
548	NC_022525	CGGTA	2	10	24564	24573	20 %	20 %	40 %	20 %	549478148
549	NC_022525	CGC	2	6	24597	24602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478148
550	NC_022525	CTGTT	2	10	24603	24612	0 %	60 %	20 %	20 %	549478148
551	NC_022525	TGG	2	6	24683	24688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478148
552	NC_022525	AGA	2	6	24699	24704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478148
553	NC_022525	CCAG	2	8	24740	24747	25 %	0 %	25 %	50 %	549478148
554	NC_022525	GCG	2	6	24751	24756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478148
555	NC_022525	CGA	2	6	24827	24832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478148
556	NC_022525	T	7	7	25028	25034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_022525	CG	3	6	25067	25072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_022525	A	8	8	25118	25125	100 %	0 %	0 %	0 %	549478149
559	NC_022525	ATT	2	6	25144	25149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478149
560	NC_022525	CTG	2	6	25154	25159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478149
561	NC_022525	CGG	2	6	25161	25166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478149
562	NC_022525	CCT	2	6	25248	25253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478149
563	NC_022525	ATT	2	6	25259	25264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478149
564	NC_022525	TTC	2	6	25267	25272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478149
565	NC_022525	T	7	7	25284	25290	0 %	100 %	0 %	0 %	549478149
566	NC_022525	CGC	2	6	25347	25352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478149
567	NC_022525	CT	3	6	25353	25358	0 %	50 %	0 %	50 %	549478149
568	NC_022525	A	6	6	25373	25378	100 %	0 %	0 %	0 %	549478149
569	NC_022525	AT	3	6	25383	25388	50 %	50 %	0 %	0 %	549478149
570	NC_022525	TAT	2	6	25393	25398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478149
571	NC_022525	ACCG	2	8	25417	25424	25 %	0 %	25 %	50 %	549478149
572	NC_022525	TATTT	2	10	25437	25446	20 %	80 %	0 %	0 %	549478149
573	NC_022525	AAAT	2	8	25477	25484	75 %	25 %	0 %	0 %	549478149
574	NC_022525	TAC	2	6	25634	25639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478149
575	NC_022525	A	6	6	25670	25675	100 %	0 %	0 %	0 %	549478149
576	NC_022525	CCG	2	6	25694	25699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478149
577	NC_022525	ACG	2	6	25769	25774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478149
578	NC_022525	ATG	2	6	25798	25803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478149
579	NC_022525	TCTG	2	8	25934	25941	0 %	50 %	25 %	25 %	549478150
580	NC_022525	GGC	2	6	25991	25996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
581	NC_022525	ACG	2	6	26073	26078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
582	NC_022525	GC	3	6	26086	26091	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
583	NC_022525	GCCT	2	8	26115	26122	0 %	25 %	25 %	50 %	549478150
584	NC_022525	GGC	3	9	26183	26191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
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586	NC_022525	GCA	2	6	26252	26257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
587	NC_022525	GGC	2	6	26282	26287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
588	NC_022525	GGC	2	6	26400	26405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
589	NC_022525	ACT	2	6	26473	26478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478150
590	NC_022525	GCG	2	6	26497	26502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
591	NC_022525	AGCGAC	2	12	26511	26522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
592	NC_022525	GCA	2	6	26525	26530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
593	NC_022525	ATT	2	6	26609	26614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478150
594	NC_022525	CCTT	2	8	26621	26628	0 %	50 %	0 %	50 %	549478150
595	NC_022525	GAC	2	6	26652	26657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
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598	NC_022525	CCG	2	6	26809	26814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478150
599	NC_022525	GCG	2	6	26818	26823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
600	NC_022525	CCG	2	6	26884	26889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478150
601	NC_022525	GGC	2	6	26911	26916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
602	NC_022525	GCG	2	6	26925	26930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
603	NC_022525	TAG	2	6	26954	26959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478150
604	NC_022525	TCAG	2	8	26980	26987	25 %	25 %	25 %	25 %	549478150
605	NC_022525	GCG	2	6	27076	27081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
606	NC_022525	ATA	2	6	27145	27150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478150
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608	NC_022525	ATT	2	6	27346	27351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478150
609	NC_022525	TAT	2	6	27360	27365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478150
610	NC_022525	AGG	2	6	27369	27374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478150
611	NC_022525	ATCA	2	8	27393	27400	50 %	25 %	0 %	25 %	549478150
612	NC_022525	TTA	2	6	27427	27432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478150
613	NC_022525	CAGC	2	8	27437	27444	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
614	NC_022525	TGA	2	6	27461	27466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478150
615	NC_022525	TTG	2	6	27477	27482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478150
616	NC_022525	ACA	2	6	27532	27537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478150
617	NC_022525	GAT	2	6	27621	27626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478150
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619	NC_022525	ACA	2	6	27745	27750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478150
620	NC_022525	GCG	2	6	27787	27792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
621	NC_022525	CAG	2	6	27867	27872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478150
622	NC_022525	GCG	2	6	27889	27894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478150
623	NC_022525	AGCC	2	8	27927	27934	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
624	NC_022525	CG	3	6	28016	28021	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
625	NC_022525	GGT	2	6	28031	28036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478150
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628	NC_022525	TGA	2	6	28109	28114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478150
629	NC_022525	CCGA	2	8	28134	28141	25 %	0 %	25 %	50 %	549478150
630	NC_022525	GC	3	6	28144	28149	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
631	NC_022525	GC	3	6	28180	28185	0 %	0 %	50 %	50 %	549478150
632	NC_022525	ACGGTG	2	12	28236	28247	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549478150
633	NC_022525	TTG	2	6	28270	28275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478150
634	NC_022525	GT	3	6	28358	28363	0 %	50 %	50 %	0 %	549478150
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640	NC_022525	GT	3	6	28494	28499	0 %	50 %	50 %	0 %	549478151
641	NC_022525	ATTA	2	8	28527	28534	50 %	50 %	0 %	0 %	549478151
642	NC_022525	A	6	6	28594	28599	100 %	0 %	0 %	0 %	549478151
643	NC_022525	GT	3	6	28623	28628	0 %	50 %	50 %	0 %	549478151
644	NC_022525	CCG	2	6	28630	28635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478151
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652	NC_022525	ATG	2	6	29287	29292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478151
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692	NC_022525	GTCA	2	8	31408	31415	25 %	25 %	25 %	25 %	549478155
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739	NC_022525	T	6	6	33188	33193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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