MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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68003	NC_022525	GCG	2	6	3225068	3225073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549480579
68004	NC_022525	GACT	2	8	3225102	3225109	25 %	25 %	25 %	25 %	549480579
68005	NC_022525	GC	3	6	3225113	3225118	0 %	0 %	50 %	50 %	549480579
68006	NC_022525	CAA	2	6	3225203	3225208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549480579
68007	NC_022525	GC	3	6	3225228	3225233	0 %	0 %	50 %	50 %	549480579
68008	NC_022525	CG	3	6	3225313	3225318	0 %	0 %	50 %	50 %	549480579
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68011	NC_022525	TACC	2	8	3225431	3225438	25 %	25 %	0 %	50 %	549480579
68012	NC_022525	CGCC	2	8	3225443	3225450	0 %	0 %	25 %	75 %	549480579
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68023	NC_022525	GC	3	6	3225881	3225886	0 %	0 %	50 %	50 %	549480579
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68033	NC_022525	ATA	2	6	3226354	3226359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68108	NC_022525	GGC	2	6	3229241	3229246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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68117	NC_022525	CGG	2	6	3229738	3229743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549480581
68118	NC_022525	TCG	2	6	3229759	3229764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480581
68119	NC_022525	CCA	2	6	3229821	3229826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480581
68120	NC_022525	TCG	2	6	3229887	3229892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480581
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68124	NC_022525	CAG	2	6	3230093	3230098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480581
68125	NC_022525	GC	3	6	3230121	3230126	0 %	0 %	50 %	50 %	549480581
68126	NC_022525	CGC	2	6	3230131	3230136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480581
68127	NC_022525	CTG	2	6	3230220	3230225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480581
68128	NC_022525	CGG	2	6	3230299	3230304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549480581
68129	NC_022525	CCG	2	6	3230329	3230334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480581
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68131	NC_022525	CGGC	2	8	3230412	3230419	0 %	0 %	50 %	50 %	549480581
68132	NC_022525	CAC	2	6	3230452	3230457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480581
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68138	NC_022525	CGT	2	6	3230587	3230592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480581
68139	NC_022525	ATT	2	6	3230687	3230692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68140	NC_022525	GAT	2	6	3230783	3230788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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68175	NC_022525	GCGCT	2	10	3232820	3232829	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68176	NC_022525	CGC	2	6	3232869	3232874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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68193	NC_022525	CAG	2	6	3233602	3233607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480584
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68198	NC_022525	A	6	6	3233790	3233795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68199	NC_022525	ATT	2	6	3233802	3233807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68200	NC_022525	ATT	2	6	3233822	3233827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549480585
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68209	NC_022525	TAT	2	6	3234227	3234232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68210	NC_022525	TAAA	2	8	3234245	3234252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68211	NC_022525	CGA	2	6	3234406	3234411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480586
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68219	NC_022525	CAT	2	6	3234807	3234812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480586
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68222	NC_022525	CG	3	6	3234990	3234995	0 %	0 %	50 %	50 %	549482230
68223	NC_022525	CCA	2	6	3235004	3235009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482230
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68225	NC_022525	TGT	2	6	3235071	3235076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549482230
68226	NC_022525	ATG	2	6	3235115	3235120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482230
68227	NC_022525	CGC	2	6	3235143	3235148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480587
68228	NC_022525	CCG	2	6	3235196	3235201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480587
68229	NC_022525	CGCC	2	8	3235205	3235212	0 %	0 %	25 %	75 %	549480587
68230	NC_022525	ATC	2	6	3235240	3235245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480587
68231	NC_022525	GC	3	6	3235272	3235277	0 %	0 %	50 %	50 %	549480587
68232	NC_022525	CGC	2	6	3235289	3235294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480587
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68350	NC_022525	TGC	2	6	3240405	3240410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480590
68351	NC_022525	GAA	2	6	3240452	3240457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549480590
68352	NC_022525	CGAAG	2	10	3240502	3240511	40 %	0 %	40 %	20 %	549480590
68353	NC_022525	TGC	2	6	3240549	3240554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480590
68354	NC_022525	CGA	2	6	3240565	3240570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480590
68355	NC_022525	CGC	2	6	3240577	3240582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68356	NC_022525	CGC	3	9	3240594	3240602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68357	NC_022525	GGC	2	6	3240605	3240610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68358	NC_022525	T	7	7	3240612	3240618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68359	NC_022525	TCG	2	6	3240805	3240810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480591
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68369	NC_022525	CAA	2	6	3241658	3241663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549480592
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68374	NC_022525	CCG	2	6	3241867	3241872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480592
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68386	NC_022525	T	6	6	3242335	3242340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68387	NC_022525	CGT	2	6	3242359	3242364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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68448	NC_022525	TAA	2	6	3244851	3244856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68451	NC_022525	AATA	2	8	3244939	3244946	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68452	NC_022525	ATT	2	6	3244951	3244956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68453	NC_022525	CT	3	6	3244980	3244985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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68469	NC_022525	ATC	2	6	3245573	3245578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480594
68470	NC_022525	CGC	2	6	3245621	3245626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480594
68471	NC_022525	GCC	2	6	3245634	3245639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480594
68472	NC_022525	GT	3	6	3245748	3245753	0 %	50 %	50 %	0 %	549480594
68473	NC_022525	CAGC	2	8	3245834	3245841	25 %	0 %	25 %	50 %	549480594
68474	NC_022525	CAAGC	2	10	3245849	3245858	40 %	0 %	20 %	40 %	549480594
68475	NC_022525	TGT	2	6	3245907	3245912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549480594
68476	NC_022525	AAC	2	6	3246060	3246065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549480594
68477	NC_022525	ATA	2	6	3246096	3246101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549480594
68478	NC_022525	ACC	2	6	3246159	3246164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480594
68479	NC_022525	TAC	2	6	3246184	3246189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480594
68480	NC_022525	CGG	2	6	3246226	3246231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549480594
68481	NC_022525	TCA	2	6	3246237	3246242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480594
68482	NC_022525	AT	3	6	3246267	3246272	50 %	50 %	0 %	0 %	549480594
68483	NC_022525	ATC	2	6	3246294	3246299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480594
68484	NC_022525	AAT	2	6	3246322	3246327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549480594
68485	NC_022525	GTGA	2	8	3246506	3246513	25 %	25 %	50 %	0 %	549480594
68486	NC_022525	GGTC	2	8	3246526	3246533	0 %	25 %	50 %	25 %	549480594
68487	NC_022525	ATC	3	9	3246551	3246559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480594
68488	NC_022525	GCTG	2	8	3246574	3246581	0 %	25 %	50 %	25 %	549480594
68489	NC_022525	GTT	2	6	3246679	3246684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68490	NC_022525	CGC	2	6	3246828	3246833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68491	NC_022525	AC	3	6	3246844	3246849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68492	NC_022525	TGT	2	6	3246910	3246915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68493	NC_022525	ATT	2	6	3246925	3246930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68494	NC_022525	GC	3	6	3247071	3247076	0 %	0 %	50 %	50 %	549480595
68495	NC_022525	ACT	2	6	3247149	3247154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480595
68496	NC_022525	CCG	2	6	3247203	3247208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480595
68497	NC_022525	G	6	6	3247295	3247300	0 %	0 %	100 %	0 %	549480595
68498	NC_022525	TGT	2	6	3247333	3247338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549480595
68499	NC_022525	CCG	2	6	3247344	3247349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480595
68500	NC_022525	AAC	2	6	3247368	3247373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549480595

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