MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 99598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_022525	CG	3	6	277672	277677	0 %	0 %	50 %	50 %	549478332
6003	NC_022525	CTT	2	6	277892	277897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478332
6004	NC_022525	CGACAC	2	12	277907	277918	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549478332
6005	NC_022525	GCG	2	6	278020	278025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478332
6006	NC_022525	CAG	2	6	278046	278051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478332
6007	NC_022525	GGT	2	6	278169	278174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478332
6008	NC_022525	TCT	2	6	278179	278184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478332
6009	NC_022525	GAC	2	6	278202	278207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478332
6010	NC_022525	CAA	2	6	278228	278233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478332
6011	NC_022525	TACGG	2	10	278238	278247	20 %	20 %	40 %	20 %	549478332
6012	NC_022525	ACA	2	6	278278	278283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478332
6013	NC_022525	CTG	2	6	278377	278382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478332
6014	NC_022525	CAG	2	6	278387	278392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478332
6015	NC_022525	TGA	2	6	278402	278407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478332
6016	NC_022525	GACG	2	8	278462	278469	25 %	0 %	50 %	25 %	549478332
6017	NC_022525	CG	3	6	278473	278478	0 %	0 %	50 %	50 %	549478332
6018	NC_022525	TAC	2	6	278523	278528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478332
6019	NC_022525	GTGG	2	8	278579	278586	0 %	25 %	75 %	0 %	549478332
6020	NC_022525	GGC	2	6	278625	278630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478332
6021	NC_022525	GGT	2	6	278664	278669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478332
6022	NC_022525	CGTG	2	8	278678	278685	0 %	25 %	50 %	25 %	549478332
6023	NC_022525	ATG	2	6	278755	278760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478332
6024	NC_022525	GAT	2	6	278799	278804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478332
6025	NC_022525	GGT	2	6	278811	278816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478332
6026	NC_022525	TTA	2	6	278845	278850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478332
6027	NC_022525	TCA	2	6	278863	278868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478332
6028	NC_022525	CCT	2	6	278896	278901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478332
6029	NC_022525	TCT	2	6	278902	278907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478332
6030	NC_022525	TCT	2	6	279046	279051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478332
6031	NC_022525	TTA	2	6	279263	279268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478333
6032	NC_022525	GCT	2	6	279308	279313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478333
6033	NC_022525	AGA	2	6	279363	279368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478333
6034	NC_022525	A	6	6	279423	279428	100 %	0 %	0 %	0 %	549478333
6035	NC_022525	TCG	2	6	279568	279573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478333
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6037	NC_022525	CAA	2	6	279589	279594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478333
6038	NC_022525	A	6	6	279623	279628	100 %	0 %	0 %	0 %	549478333
6039	NC_022525	TGG	2	6	279654	279659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478333
6040	NC_022525	ACA	2	6	279681	279686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478333
6041	NC_022525	TCA	2	6	279810	279815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478334
6042	NC_022525	CAA	2	6	279840	279845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478334
6043	NC_022525	GCG	2	6	279953	279958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478334
6044	NC_022525	CG	3	6	279988	279993	0 %	0 %	50 %	50 %	549478334
6045	NC_022525	TAC	2	6	280012	280017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478334
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6047	NC_022525	TCG	2	6	280161	280166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478334
6048	NC_022525	A	6	6	280168	280173	100 %	0 %	0 %	0 %	549478334
6049	NC_022525	TCCAG	2	10	280254	280263	20 %	20 %	20 %	40 %	549478334
6050	NC_022525	ATT	2	6	280343	280348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478334
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6053	NC_022525	ATT	2	6	280427	280432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478334
6054	NC_022525	CGT	2	6	280459	280464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478334
6055	NC_022525	GGC	2	6	280541	280546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478334
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6058	NC_022525	CTG	2	6	280686	280691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478334
6059	NC_022525	TGA	2	6	280698	280703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478334
6060	NC_022525	TGA	2	6	280708	280713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478334
6061	NC_022525	CAA	2	6	280754	280759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478334
6062	NC_022525	TTA	2	6	280831	280836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_022525	ACT	2	6	280874	280879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478335
6064	NC_022525	GAA	2	6	280967	280972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478335
6065	NC_022525	TGCG	2	8	280983	280990	0 %	25 %	50 %	25 %	549478335
6066	NC_022525	TAT	2	6	281141	281146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478335
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6069	NC_022525	GGT	2	6	281182	281187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478335
6070	NC_022525	GAT	2	6	281200	281205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478335
6071	NC_022525	ATG	2	6	281297	281302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478335
6072	NC_022525	TG	3	6	281301	281306	0 %	50 %	50 %	0 %	549478335
6073	NC_022525	TGAT	2	8	281331	281338	25 %	50 %	25 %	0 %	549478336
6074	NC_022525	TTG	2	6	281421	281426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478336
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6081	NC_022525	TCA	2	6	281806	281811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478336
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6084	NC_022525	TGG	2	6	281964	281969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478336
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6087	NC_022525	CG	3	6	282099	282104	0 %	0 %	50 %	50 %	549478336
6088	NC_022525	GGC	2	6	282120	282125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478337
6089	NC_022525	GC	3	6	282208	282213	0 %	0 %	50 %	50 %	549478337
6090	NC_022525	TTG	2	6	282311	282316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478337
6091	NC_022525	TTG	2	6	282340	282345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478337
6092	NC_022525	CCG	2	6	282366	282371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478337
6093	NC_022525	CATT	2	8	282468	282475	25 %	50 %	0 %	25 %	549478337
6094	NC_022525	CCGT	2	8	282484	282491	0 %	25 %	25 %	50 %	549478337
6095	NC_022525	ATGCC	2	10	282626	282635	20 %	20 %	20 %	40 %	549478337
6096	NC_022525	GCG	2	6	282655	282660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478337
6097	NC_022525	CG	3	6	282659	282664	0 %	0 %	50 %	50 %	549478337
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6101	NC_022525	A	6	6	282842	282847	100 %	0 %	0 %	0 %	549478337
6102	NC_022525	GC	3	6	282898	282903	0 %	0 %	50 %	50 %	549478337
6103	NC_022525	GAT	2	6	282909	282914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478337
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6105	NC_022525	CTGG	2	8	283017	283024	0 %	25 %	50 %	25 %	549478337
6106	NC_022525	CTG	2	6	283066	283071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478337
6107	NC_022525	CAG	2	6	283204	283209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478337
6108	NC_022525	GGC	2	6	283233	283238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478337
6109	NC_022525	CA	3	6	283282	283287	50 %	0 %	0 %	50 %	549478338
6110	NC_022525	TGG	2	6	283330	283335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478338
6111	NC_022525	CCG	3	9	283348	283356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478338
6112	NC_022525	TCG	2	6	283381	283386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478338
6113	NC_022525	A	6	6	283401	283406	100 %	0 %	0 %	0 %	549478338
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6118	NC_022525	GC	3	6	283538	283543	0 %	0 %	50 %	50 %	549478338
6119	NC_022525	GTG	2	6	283626	283631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478338
6120	NC_022525	GCG	2	6	283662	283667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478338
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6122	NC_022525	GCA	2	6	283742	283747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478338
6123	NC_022525	CAC	2	6	283806	283811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478338
6124	NC_022525	ACT	2	6	283923	283928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478339
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6143	NC_022525	GAA	2	6	284813	284818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478339
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6190	NC_022525	TGA	2	6	287161	287166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478339
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6193	NC_022525	TC	3	6	287289	287294	0 %	50 %	0 %	50 %	549478339
6194	NC_022525	GCC	2	6	287454	287459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478340
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6201	NC_022525	TGA	2	6	287665	287670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478340
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6204	NC_022525	TGA	2	6	287715	287720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478340
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6207	NC_022525	TCG	2	6	287761	287766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478340
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6211	NC_022525	GCT	2	6	288116	288121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478340
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6214	NC_022525	CAT	2	6	288175	288180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478340
6215	NC_022525	GCG	2	6	288195	288200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478340
6216	NC_022525	GGC	2	6	288223	288228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478340
6217	NC_022525	GCT	2	6	288244	288249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478340
6218	NC_022525	GAT	2	6	288284	288289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478340
6219	NC_022525	A	6	6	288292	288297	100 %	0 %	0 %	0 %	549478340
6220	NC_022525	CGT	2	6	288299	288304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478340
6221	NC_022525	TGA	2	6	288315	288320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478340
6222	NC_022525	T	8	8	288382	288389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6223	NC_022525	GCAG	2	8	288485	288492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6224	NC_022525	A	6	6	288528	288533	100 %	0 %	0 %	0 %	549478341
6225	NC_022525	GCCGC	2	10	288590	288599	0 %	0 %	40 %	60 %	549478341
6226	NC_022525	AGT	2	6	288608	288613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478341
6227	NC_022525	GGC	2	6	288643	288648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478341
6228	NC_022525	GC	3	6	288745	288750	0 %	0 %	50 %	50 %	549478341
6229	NC_022525	GC	4	8	288823	288830	0 %	0 %	50 %	50 %	549478341
6230	NC_022525	TACT	2	8	288838	288845	25 %	50 %	0 %	25 %	549478341
6231	NC_022525	CGG	2	6	288876	288881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478341
6232	NC_022525	CTA	2	6	288939	288944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478341
6233	NC_022525	GGC	2	6	289058	289063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478341
6234	NC_022525	CTG	2	6	289229	289234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478341
6235	NC_022525	TGG	2	6	289248	289253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478341
6236	NC_022525	TCT	3	9	289284	289292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478341
6237	NC_022525	GCC	2	6	289306	289311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478341
6238	NC_022525	ATC	2	6	289409	289414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478341
6239	NC_022525	GGC	2	6	289418	289423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478341
6240	NC_022525	GCG	3	9	289431	289439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478341
6241	NC_022525	CTA	2	6	289474	289479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478341
6242	NC_022525	GTGCCG	2	12	289505	289516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549478341
6243	NC_022525	GGC	2	6	289562	289567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478341
6244	NC_022525	AGTT	2	8	289647	289654	25 %	50 %	25 %	0 %	549478341
6245	NC_022525	ACA	2	6	289708	289713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478341
6246	NC_022525	GTC	2	6	289730	289735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478341
6247	NC_022525	GAT	2	6	289736	289741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478341
6248	NC_022525	CG	3	6	289810	289815	0 %	0 %	50 %	50 %	549478341
6249	NC_022525	GCCGG	2	10	289820	289829	0 %	0 %	60 %	40 %	549478341
6250	NC_022525	CGAC	2	8	289878	289885	25 %	0 %	25 %	50 %	549478341
6251	NC_022525	GCC	2	6	290075	290080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478341
6252	NC_022525	ACC	2	6	290102	290107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478341
6253	NC_022525	CCTG	2	8	290114	290121	0 %	25 %	25 %	50 %	549478341
6254	NC_022525	AGC	3	9	290123	290131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478341
6255	NC_022525	GCCT	2	8	290221	290228	0 %	25 %	25 %	50 %	549478341
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6258	NC_022525	CAT	2	6	290362	290367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478342
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6261	NC_022525	GCG	2	6	290514	290519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478342
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6263	NC_022525	T	6	6	290660	290665	0 %	100 %	0 %	0 %	549478342
6264	NC_022525	GCTG	2	8	290680	290687	0 %	25 %	50 %	25 %	549478342
6265	NC_022525	TCA	2	6	290707	290712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478342
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6283	NC_022525	TGA	2	6	291733	291738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478342
6284	NC_022525	GCCGAT	2	12	291785	291796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549478342
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6323	NC_022525	CTGC	2	8	294002	294009	0 %	25 %	25 %	50 %	549478344
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6333	NC_022525	GCGCT	2	10	294301	294310	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6334	NC_022525	CAC	2	6	294358	294363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6335	NC_022525	CAA	2	6	294371	294376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6336	NC_022525	ATG	2	6	294568	294573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481703
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6341	NC_022525	CGT	2	6	295056	295061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478345
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6344	NC_022525	ATC	2	6	295247	295252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478345
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6349	NC_022525	GC	3	6	295394	295399	0 %	0 %	50 %	50 %	549478345
6350	NC_022525	CGA	2	6	295487	295492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478345
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6352	NC_022525	CG	3	6	295629	295634	0 %	0 %	50 %	50 %	549478346
6353	NC_022525	GGT	2	6	295644	295649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478346
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6358	NC_022525	CGC	2	6	295917	295922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478346
6359	NC_022525	TCT	2	6	295944	295949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478346
6360	NC_022525	TCG	2	6	295973	295978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478346
6361	NC_022525	TAA	2	6	296085	296090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6362	NC_022525	GGC	2	6	296124	296129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6363	NC_022525	GCA	2	6	296145	296150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481705
6364	NC_022525	GCG	2	6	296159	296164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481705
6365	NC_022525	TGC	2	6	296165	296170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481705
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6376	NC_022525	CGCAG	2	10	296735	296744	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6486	NC_022525	CCG	2	6	301960	301965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478351
6487	NC_022525	CAG	2	6	302016	302021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478351
6488	NC_022525	GT	3	6	302054	302059	0 %	50 %	50 %	0 %	549478351
6489	NC_022525	AG	3	6	302106	302111	50 %	0 %	50 %	0 %	549478351
6490	NC_022525	CCG	2	6	302194	302199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478351
6491	NC_022525	AAGT	2	8	302229	302236	50 %	25 %	25 %	0 %	549478351
6492	NC_022525	GC	3	6	302343	302348	0 %	0 %	50 %	50 %	549478351
6493	NC_022525	CTG	2	6	302352	302357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478351
6494	NC_022525	TAT	2	6	302399	302404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6495	NC_022525	AATGA	2	10	302408	302417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6496	NC_022525	ATCA	2	8	302492	302499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6497	NC_022525	CTG	2	6	302527	302532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6498	NC_022525	A	8	8	302705	302712	100 %	0 %	0 %	0 %	549481707
6499	NC_022525	TGG	3	9	302725	302733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481707
6500	NC_022525	CG	4	8	302753	302760	0 %	0 %	50 %	50 %	549481707

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