MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 8672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022443	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022443	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022443	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	545636472
4	NC_022443	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	545636472
5	NC_022443	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	545636472
6	NC_022443	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
7	NC_022443	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
8	NC_022443	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	545636473
9	NC_022443	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	545636473
10	NC_022443	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	545636473
11	NC_022443	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	545636473
12	NC_022443	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	545636473
13	NC_022443	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
14	NC_022443	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022443	AATA	2	8	3428	3435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022443	CCAA	2	8	3444	3451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022443	GAAA	2	8	3618	3625	75 %	0 %	25 %	0 %	545636474
18	NC_022443	AGTA	2	8	3677	3684	50 %	25 %	25 %	0 %	545636474
19	NC_022443	GTAG	2	8	3825	3832	25 %	25 %	50 %	0 %	545636474
20	NC_022443	AGAA	2	8	3948	3955	75 %	0 %	25 %	0 %	545636474
21	NC_022443	AAGG	2	8	4034	4041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022443	AAAT	2	8	4118	4125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022443	AATT	2	8	4317	4324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022443	ATTA	2	8	4536	4543	50 %	50 %	0 %	0 %	545636475
25	NC_022443	TTCT	2	8	4626	4633	0 %	75 %	0 %	25 %	545636475
26	NC_022443	TCAT	2	8	4637	4644	25 %	50 %	0 %	25 %	545636475
27	NC_022443	GTAT	2	8	5875	5882	25 %	50 %	25 %	0 %	545636477
28	NC_022443	TACG	2	8	6632	6639	25 %	25 %	25 %	25 %	545636477
29	NC_022443	TATC	2	8	6778	6785	25 %	50 %	0 %	25 %	545636477
30	NC_022443	TAGA	2	8	7183	7190	50 %	25 %	25 %	0 %	545636477
31	NC_022443	TGGA	2	8	7309	7316	25 %	25 %	50 %	0 %	545636477
32	NC_022443	AATG	2	8	7532	7539	50 %	25 %	25 %	0 %	545636477
33	NC_022443	TCAA	2	8	7763	7770	50 %	25 %	0 %	25 %	545636478
34	NC_022443	ATGG	2	8	8085	8092	25 %	25 %	50 %	0 %	545636478
35	NC_022443	GGTA	2	8	8276	8283	25 %	25 %	50 %	0 %	545636478
36	NC_022443	TAAG	2	8	8341	8348	50 %	25 %	25 %	0 %	545636478
37	NC_022443	TCGT	2	8	8587	8594	0 %	50 %	25 %	25 %	545636478
38	NC_022443	ACAA	2	8	8713	8720	75 %	0 %	0 %	25 %	545636478
39	NC_022443	AGTT	2	8	9148	9155	25 %	50 %	25 %	0 %	545636478
40	NC_022443	GTCA	2	8	9384	9391	25 %	25 %	25 %	25 %	545636478
41	NC_022443	AATA	2	8	9650	9657	75 %	25 %	0 %	0 %	545636478
42	NC_022443	TGTA	2	8	10010	10017	25 %	50 %	25 %	0 %	545636478
43	NC_022443	TGAT	2	8	10300	10307	25 %	50 %	25 %	0 %	545636478
44	NC_022443	GTCA	2	8	11040	11047	25 %	25 %	25 %	25 %	545636479
45	NC_022443	ACTA	2	8	11661	11668	50 %	25 %	0 %	25 %	545636480
46	NC_022443	AATG	2	8	12546	12553	50 %	25 %	25 %	0 %	545636480
47	NC_022443	CCAT	2	8	13054	13061	25 %	25 %	0 %	50 %	545636480
48	NC_022443	CAAT	2	8	13117	13124	50 %	25 %	0 %	25 %	545636480
49	NC_022443	CTAC	2	8	13312	13319	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022443	ATTA	2	8	13646	13653	50 %	50 %	0 %	0 %	545636481
51	NC_022443	ATTT	2	8	14176	14183	25 %	75 %	0 %	0 %	545636481
52	NC_022443	GCAA	2	8	14517	14524	50 %	0 %	25 %	25 %	545636481
53	NC_022443	TAAA	2	8	14807	14814	75 %	25 %	0 %	0 %	545636481
54	NC_022443	ATAA	2	8	15096	15103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022443	TAAA	2	8	15275	15282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022443	GTAT	2	8	15337	15344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022443	ATTT	2	8	15875	15882	25 %	75 %	0 %	0 %	545636482
58	NC_022443	GCAA	2	8	17248	17255	50 %	0 %	25 %	25 %	545636484
59	NC_022443	AAGG	2	8	17381	17388	50 %	0 %	50 %	0 %	545636484
60	NC_022443	AAAG	2	8	18405	18412	75 %	0 %	25 %	0 %	545636485
61	NC_022443	TTAA	2	8	18654	18661	50 %	50 %	0 %	0 %	545636485
62	NC_022443	TAGA	2	8	19437	19444	50 %	25 %	25 %	0 %	545636486
63	NC_022443	ACAA	2	8	19543	19550	75 %	0 %	0 %	25 %	545636486
64	NC_022443	ATGA	2	8	19625	19632	50 %	25 %	25 %	0 %	545636486
65	NC_022443	TAAA	2	8	20349	20356	75 %	25 %	0 %	0 %	545636486
66	NC_022443	CAAC	2	8	20483	20490	50 %	0 %	0 %	50 %	545636486
67	NC_022443	AATT	2	8	20682	20689	50 %	50 %	0 %	0 %	545636486
68	NC_022443	AGTA	2	8	21297	21304	50 %	25 %	25 %	0 %	545636487
69	NC_022443	ATTC	2	8	21382	21389	25 %	50 %	0 %	25 %	545636487
70	NC_022443	GTCT	2	8	21553	21560	0 %	50 %	25 %	25 %	545636488
71	NC_022443	TGAA	2	8	21738	21745	50 %	25 %	25 %	0 %	545636488
72	NC_022443	GCAT	2	8	21832	21839	25 %	25 %	25 %	25 %	545636488
73	NC_022443	GATT	2	8	21849	21856	25 %	50 %	25 %	0 %	545636488
74	NC_022443	GGTA	2	8	22339	22346	25 %	25 %	50 %	0 %	545636488
75	NC_022443	GGTT	2	8	24097	24104	0 %	50 %	50 %	0 %	545636489
76	NC_022443	AACA	2	8	24431	24438	75 %	0 %	0 %	25 %	545636489
77	NC_022443	AATA	2	8	24761	24768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022443	ATCT	2	8	24871	24878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_022443	GCCT	2	8	24999	25006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022443	ATTT	2	8	25324	25331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022443	GTAC	2	8	26241	26248	25 %	25 %	25 %	25 %	545636490
82	NC_022443	AATC	2	8	26708	26715	50 %	25 %	0 %	25 %	545636491
83	NC_022443	ATCT	2	8	28142	28149	25 %	50 %	0 %	25 %	545636491
84	NC_022443	ACAA	2	8	28801	28808	75 %	0 %	0 %	25 %	545636492
85	NC_022443	AATG	2	8	28905	28912	50 %	25 %	25 %	0 %	545636492
86	NC_022443	TCGT	2	8	28937	28944	0 %	50 %	25 %	25 %	545636492
87	NC_022443	AACA	2	8	29382	29389	75 %	0 %	0 %	25 %	545636492
88	NC_022443	CAAT	2	8	30034	30041	50 %	25 %	0 %	25 %	545636493
89	NC_022443	GATG	2	8	30042	30049	25 %	25 %	50 %	0 %	545636493
90	NC_022443	TACT	2	8	30264	30271	25 %	50 %	0 %	25 %	545636493
91	NC_022443	CATT	2	8	30523	30530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_022443	GGCA	2	8	30962	30969	25 %	0 %	50 %	25 %	545636494
93	NC_022443	AAAG	2	8	30975	30982	75 %	0 %	25 %	0 %	545636494
94	NC_022443	GAAC	2	8	31419	31426	50 %	0 %	25 %	25 %	545636494
95	NC_022443	ATCA	2	8	31664	31671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_022443	CAAC	2	8	31929	31936	50 %	0 %	0 %	50 %	545636495
97	NC_022443	ACAA	2	8	31970	31977	75 %	0 %	0 %	25 %	545636495
98	NC_022443	TACA	2	8	32172	32179	50 %	25 %	0 %	25 %	545636495
99	NC_022443	AATG	2	8	32347	32354	50 %	25 %	25 %	0 %	545636495
100	NC_022443	GATT	2	8	33037	33044	25 %	50 %	25 %	0 %	545636495
101	NC_022443	GACT	2	8	33145	33152	25 %	25 %	25 %	25 %	545636495
102	NC_022443	TAAA	2	8	33441	33448	75 %	25 %	0 %	0 %	545636495
103	NC_022443	ATGA	2	8	33500	33507	50 %	25 %	25 %	0 %	545636495
104	NC_022443	CAAG	2	8	33867	33874	50 %	0 %	25 %	25 %	545636495
105	NC_022443	AGCT	2	8	34027	34034	25 %	25 %	25 %	25 %	545636495
106	NC_022443	AAGC	2	8	34452	34459	50 %	0 %	25 %	25 %	545636497
107	NC_022443	TTCT	2	8	35104	35111	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_022443	ATAA	2	8	35142	35149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022443	ATTA	2	8	35234	35241	50 %	50 %	0 %	0 %	545636498
110	NC_022443	GGAT	2	8	35450	35457	25 %	25 %	50 %	0 %	545636498
111	NC_022443	AATA	2	8	35598	35605	75 %	25 %	0 %	0 %	545636498
112	NC_022443	TGAA	2	8	35734	35741	50 %	25 %	25 %	0 %	545636498
113	NC_022443	AAGA	2	8	36096	36103	75 %	0 %	25 %	0 %	545636498
114	NC_022443	TAAA	2	8	36519	36526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022443	ATTT	2	8	36961	36968	25 %	75 %	0 %	0 %	545636499
116	NC_022443	AAAT	2	8	37064	37071	75 %	25 %	0 %	0 %	545636499
117	NC_022443	TCTT	2	8	37290	37297	0 %	75 %	0 %	25 %	545636500
118	NC_022443	ATGT	2	8	37524	37531	25 %	50 %	25 %	0 %	545636500
119	NC_022443	AAAT	2	8	38296	38303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022443	TTAA	2	8	39048	39055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022443	TCAT	2	8	39225	39232	25 %	50 %	0 %	25 %	545636502
122	NC_022443	AAAC	2	8	39733	39740	75 %	0 %	0 %	25 %	545636502
123	NC_022443	AAGA	2	8	39906	39913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022443	GCAT	2	8	40086	40093	25 %	25 %	25 %	25 %	545636503
125	NC_022443	TAGC	2	8	40473	40480	25 %	25 %	25 %	25 %	545636504
126	NC_022443	TTTA	2	8	40661	40668	25 %	75 %	0 %	0 %	545636504
127	NC_022443	TTTG	2	8	40886	40893	0 %	75 %	25 %	0 %	545636504
128	NC_022443	CATA	2	8	41284	41291	50 %	25 %	0 %	25 %	545636504
129	NC_022443	TAGT	2	8	41422	41429	25 %	50 %	25 %	0 %	545636504
130	NC_022443	ATGT	2	8	41467	41474	25 %	50 %	25 %	0 %	545636504
131	NC_022443	GTTT	2	8	42092	42099	0 %	75 %	25 %	0 %	545636504
132	NC_022443	ATGA	2	8	43079	43086	50 %	25 %	25 %	0 %	545636505
133	NC_022443	ATAA	2	8	43337	43344	75 %	25 %	0 %	0 %	545636505
134	NC_022443	TGTA	2	8	43462	43469	25 %	50 %	25 %	0 %	545636505
135	NC_022443	AGCA	2	8	43690	43697	50 %	0 %	25 %	25 %	545636506
136	NC_022443	GACA	2	8	43916	43923	50 %	0 %	25 %	25 %	545636507
137	NC_022443	GTTT	2	8	44078	44085	0 %	75 %	25 %	0 %	545636507
138	NC_022443	TCAT	2	8	44907	44914	25 %	50 %	0 %	25 %	545636507
139	NC_022443	AATA	2	8	45050	45057	75 %	25 %	0 %	0 %	545636507
140	NC_022443	CTTT	2	8	45457	45464	0 %	75 %	0 %	25 %	545636508
141	NC_022443	ATTG	2	8	45697	45704	25 %	50 %	25 %	0 %	545636508
142	NC_022443	GATT	2	8	46191	46198	25 %	50 %	25 %	0 %	545636509
143	NC_022443	TCCC	2	8	46210	46217	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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