MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41006	NC_022443	ACCA	2	8	1705738	1705745	50 %	0 %	0 %	50 %	545638019
41007	NC_022443	TAA	2	6	1705768	1705773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638019
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41011	NC_022443	CTGA	2	8	1705924	1705931	25 %	25 %	25 %	25 %	545638019
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41121	NC_022443	TTA	2	6	1710590	1710595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638022
41122	NC_022443	GCT	2	6	1710614	1710619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638022
41123	NC_022443	CTAA	2	8	1710620	1710627	50 %	25 %	0 %	25 %	545638022
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41132	NC_022443	CTT	2	6	1711044	1711049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638022
41133	NC_022443	CAG	2	6	1711089	1711094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638022
41134	NC_022443	TGC	2	6	1711111	1711116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638022
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41136	NC_022443	T	6	6	1711206	1711211	0 %	100 %	0 %	0 %	545638022
41137	NC_022443	ATT	2	6	1711269	1711274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638023
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41151	NC_022443	AT	3	6	1711913	1711918	50 %	50 %	0 %	0 %	545638023
41152	NC_022443	ATG	2	6	1712001	1712006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638023
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41166	NC_022443	TA	3	6	1712683	1712688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41167	NC_022443	ATA	2	6	1712704	1712709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41201	NC_022443	TAA	2	6	1714211	1714216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41202	NC_022443	TAA	2	6	1714254	1714259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41203	NC_022443	TA	3	6	1714326	1714331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41204	NC_022443	ATTA	2	8	1714368	1714375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41205	NC_022443	A	6	6	1714399	1714404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41206	NC_022443	TTG	2	6	1714415	1714420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41207	NC_022443	T	6	6	1714436	1714441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41230	NC_022443	GAC	2	6	1715616	1715621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638025
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41233	NC_022443	CTT	2	6	1715781	1715786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638025
41234	NC_022443	T	6	6	1715785	1715790	0 %	100 %	0 %	0 %	545638025
41235	NC_022443	CAT	2	6	1715829	1715834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638025
41236	NC_022443	TTAA	2	8	1715867	1715874	50 %	50 %	0 %	0 %	545638025
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41359	NC_022443	ACA	2	6	1721259	1721264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638030
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41363	NC_022443	TTTG	2	8	1721338	1721345	0 %	75 %	25 %	0 %	545638030
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41389	NC_022443	CAA	2	6	1722622	1722627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638030
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41391	NC_022443	CTT	2	6	1722666	1722671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638030
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41421	NC_022443	T	6	6	1723967	1723972	0 %	100 %	0 %	0 %	545638030
41422	NC_022443	TAA	2	6	1724006	1724011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638030
41423	NC_022443	CATT	2	8	1724035	1724042	25 %	50 %	0 %	25 %	545638030
41424	NC_022443	GAT	2	6	1724052	1724057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638030
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41427	NC_022443	AT	3	6	1724135	1724140	50 %	50 %	0 %	0 %	545638030
41428	NC_022443	CAT	2	6	1724182	1724187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638030
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41440	NC_022443	CGA	2	6	1724829	1724834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638031
41441	NC_022443	TTA	2	6	1724864	1724869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638031
41442	NC_022443	TCA	2	6	1724879	1724884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638031
41443	NC_022443	GAT	3	9	1724976	1724984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638031
41444	NC_022443	TAA	2	6	1724991	1724996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638031
41445	NC_022443	TAC	2	6	1725000	1725005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638031
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41451	NC_022443	T	6	6	1725310	1725315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41452	NC_022443	ATT	2	6	1725407	1725412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41453	NC_022443	AT	4	8	1725416	1725423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41454	NC_022443	ATCA	2	8	1725458	1725465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41455	NC_022443	ATATT	2	10	1725466	1725475	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41456	NC_022443	A	6	6	1725494	1725499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41457	NC_022443	ACAA	2	8	1725621	1725628	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41458	NC_022443	TG	3	6	1725706	1725711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41459	NC_022443	ATCT	2	8	1725714	1725721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41460	NC_022443	TTC	2	6	1725836	1725841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638032
41461	NC_022443	T	6	6	1725936	1725941	0 %	100 %	0 %	0 %	545638032
41462	NC_022443	ATTGT	2	10	1725959	1725968	20 %	60 %	20 %	0 %	545638032
41463	NC_022443	TTC	2	6	1725969	1725974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638032
41464	NC_022443	TACT	2	8	1725998	1726005	25 %	50 %	0 %	25 %	545638032
41465	NC_022443	TGAT	2	8	1726015	1726022	25 %	50 %	25 %	0 %	545638032
41466	NC_022443	GTG	2	6	1726028	1726033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638032
41467	NC_022443	TA	3	6	1726068	1726073	50 %	50 %	0 %	0 %	545638032
41468	NC_022443	TTA	2	6	1726177	1726182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638032
41469	NC_022443	TCAAT	2	10	1726199	1726208	40 %	40 %	0 %	20 %	545638032
41470	NC_022443	ATC	2	6	1726219	1726224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638032
41471	NC_022443	TCA	2	6	1726280	1726285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638032
41472	NC_022443	TCG	3	9	1726297	1726305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638032
41473	NC_022443	ATC	2	6	1726318	1726323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638032
41474	NC_022443	TC	3	6	1726322	1726327	0 %	50 %	0 %	50 %	545638032
41475	NC_022443	CTA	2	6	1726343	1726348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638032
41476	NC_022443	ATC	2	6	1726449	1726454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638032
41477	NC_022443	ATA	2	6	1726525	1726530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638032
41478	NC_022443	TGA	2	6	1726557	1726562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638032
41479	NC_022443	TAA	2	6	1726595	1726600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638032
41480	NC_022443	TTA	2	6	1726603	1726608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638032
41481	NC_022443	CCA	2	6	1726621	1726626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638032
41482	NC_022443	TAAT	2	8	1726628	1726635	50 %	50 %	0 %	0 %	545638032
41483	NC_022443	CAAT	2	8	1726688	1726695	50 %	25 %	0 %	25 %	545638032
41484	NC_022443	TTG	2	6	1726780	1726785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638032
41485	NC_022443	AAT	2	6	1726806	1726811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638032
41486	NC_022443	ATTACG	2	12	1726848	1726859	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545638032
41487	NC_022443	TTCGA	2	10	1726863	1726872	20 %	40 %	20 %	20 %	545638032
41488	NC_022443	CTT	2	6	1727055	1727060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41489	NC_022443	TGAAA	2	10	1727114	1727123	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41490	NC_022443	TATTT	2	10	1727140	1727149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41491	NC_022443	T	6	6	1727147	1727152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41492	NC_022443	ACA	2	6	1727161	1727166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41493	NC_022443	ATT	3	9	1727210	1727218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41494	NC_022443	GAG	2	6	1727234	1727239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41495	NC_022443	AT	3	6	1727260	1727265	50 %	50 %	0 %	0 %	545638033
41496	NC_022443	AAG	2	6	1727308	1727313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638033
41497	NC_022443	AAAC	2	8	1727408	1727415	75 %	0 %	0 %	25 %	545638033
41498	NC_022443	GAA	2	6	1727421	1727426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638033
41499	NC_022443	AAGC	2	8	1727429	1727436	50 %	0 %	25 %	25 %	545638033
41500	NC_022443	A	6	6	1727443	1727448	100 %	0 %	0 %	0 %	545638033

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