MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022443	TGT	2	6	41386	41391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636504
1002	NC_022443	TAGT	2	8	41422	41429	25 %	50 %	25 %	0 %	545636504
1003	NC_022443	T	6	6	41447	41452	0 %	100 %	0 %	0 %	545636504
1004	NC_022443	ATGT	2	8	41467	41474	25 %	50 %	25 %	0 %	545636504
1005	NC_022443	TAT	2	6	41488	41493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636504
1006	NC_022443	CAT	2	6	41578	41583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636504
1007	NC_022443	TTC	2	6	41615	41620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636504
1008	NC_022443	T	7	7	41714	41720	0 %	100 %	0 %	0 %	545636504
1009	NC_022443	T	7	7	41746	41752	0 %	100 %	0 %	0 %	545636504
1010	NC_022443	ATC	2	6	41777	41782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636504
1011	NC_022443	TGT	2	6	41805	41810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636504
1012	NC_022443	T	6	6	41861	41866	0 %	100 %	0 %	0 %	545636504
1013	NC_022443	AAT	2	6	42005	42010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636504
1014	NC_022443	TCT	2	6	42045	42050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636504
1015	NC_022443	AAATT	2	10	42057	42066	60 %	40 %	0 %	0 %	545636504
1016	NC_022443	GTTT	2	8	42092	42099	0 %	75 %	25 %	0 %	545636504
1017	NC_022443	T	6	6	42125	42130	0 %	100 %	0 %	0 %	545636504
1018	NC_022443	T	7	7	42143	42149	0 %	100 %	0 %	0 %	545636504
1019	NC_022443	TAT	2	6	42190	42195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636504
1020	NC_022443	AT	3	6	42194	42199	50 %	50 %	0 %	0 %	545636504
1021	NC_022443	TAT	2	6	42307	42312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636504
1022	NC_022443	AT	3	6	42341	42346	50 %	50 %	0 %	0 %	545636504
1023	NC_022443	ACAACT	2	12	42357	42368	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	545636504
1024	NC_022443	TCA	2	6	42400	42405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636504
1025	NC_022443	TCC	2	6	42409	42414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_022443	TA	3	6	42416	42421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_022443	GTA	2	6	42433	42438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022443	GTA	2	6	42449	42454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_022443	AAT	2	6	42465	42470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_022443	ATC	2	6	42508	42513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636505
1031	NC_022443	T	6	6	42514	42519	0 %	100 %	0 %	0 %	545636505
1032	NC_022443	T	7	7	42561	42567	0 %	100 %	0 %	0 %	545636505
1033	NC_022443	TA	3	6	42581	42586	50 %	50 %	0 %	0 %	545636505
1034	NC_022443	TTA	2	6	42623	42628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636505
1035	NC_022443	ATG	2	6	42698	42703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636505
1036	NC_022443	CTT	2	6	42726	42731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636505
1037	NC_022443	CAA	2	6	42755	42760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636505
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1039	NC_022443	TTA	2	6	42900	42905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636505
1040	NC_022443	TAC	2	6	43053	43058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636505
1041	NC_022443	ATGA	2	8	43079	43086	50 %	25 %	25 %	0 %	545636505
1042	NC_022443	AT	3	6	43099	43104	50 %	50 %	0 %	0 %	545636505
1043	NC_022443	TGT	2	6	43162	43167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636505
1044	NC_022443	TA	4	8	43200	43207	50 %	50 %	0 %	0 %	545636505
1045	NC_022443	ATG	2	6	43217	43222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636505
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1050	NC_022443	AAG	2	6	43498	43503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636506
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1054	NC_022443	AGCA	2	8	43690	43697	50 %	0 %	25 %	25 %	545636506
1055	NC_022443	A	7	7	43720	43726	100 %	0 %	0 %	0 %	545636506
1056	NC_022443	A	6	6	43769	43774	100 %	0 %	0 %	0 %	545636507
1057	NC_022443	ATA	2	6	43791	43796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636507
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1059	NC_022443	T	6	6	43819	43824	0 %	100 %	0 %	0 %	545636507
1060	NC_022443	ATT	2	6	43826	43831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636507
1061	NC_022443	CTA	2	6	43846	43851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636507
1062	NC_022443	GACA	2	8	43916	43923	50 %	0 %	25 %	25 %	545636507
1063	NC_022443	T	6	6	43998	44003	0 %	100 %	0 %	0 %	545636507
1064	NC_022443	TTC	2	6	44061	44066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636507
1065	NC_022443	ATT	2	6	44067	44072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636507
1066	NC_022443	T	7	7	44071	44077	0 %	100 %	0 %	0 %	545636507
1067	NC_022443	GTTT	2	8	44078	44085	0 %	75 %	25 %	0 %	545636507
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1070	NC_022443	TAT	2	6	44215	44220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636507
1071	NC_022443	T	6	6	44291	44296	0 %	100 %	0 %	0 %	545636507
1072	NC_022443	AT	3	6	44403	44408	50 %	50 %	0 %	0 %	545636507
1073	NC_022443	TTGAA	2	10	44432	44441	40 %	40 %	20 %	0 %	545636507
1074	NC_022443	ATC	2	6	44454	44459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636507
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1079	NC_022443	T	6	6	44696	44701	0 %	100 %	0 %	0 %	545636507
1080	NC_022443	TTG	2	6	44754	44759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636507
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1083	NC_022443	TCAT	2	8	44907	44914	25 %	50 %	0 %	25 %	545636507
1084	NC_022443	ATC	2	6	45008	45013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636507
1085	NC_022443	AC	3	6	45030	45035	50 %	0 %	0 %	50 %	545636507
1086	NC_022443	AATA	2	8	45050	45057	75 %	25 %	0 %	0 %	545636507
1087	NC_022443	TAA	2	6	45065	45070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636507
1088	NC_022443	AAG	2	6	45115	45120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636507
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1091	NC_022443	TG	3	6	45201	45206	0 %	50 %	50 %	0 %	545636507
1092	NC_022443	CAT	2	6	45230	45235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636507
1093	NC_022443	CAC	2	6	45256	45261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_022443	TCG	2	6	45276	45281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_022443	CAA	2	6	45304	45309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_022443	TTTGT	2	10	45336	45345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_022443	TGA	2	6	45442	45447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636508
1098	NC_022443	T	6	6	45450	45455	0 %	100 %	0 %	0 %	545636508
1099	NC_022443	CTTT	2	8	45457	45464	0 %	75 %	0 %	25 %	545636508
1100	NC_022443	AAC	2	6	45509	45514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636508
1101	NC_022443	TCA	2	6	45574	45579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636508
1102	NC_022443	ATTG	2	8	45697	45704	25 %	50 %	25 %	0 %	545636508
1103	NC_022443	ATA	2	6	45733	45738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636508
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1106	NC_022443	TCA	2	6	45874	45879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636508
1107	NC_022443	TTC	2	6	45898	45903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636509
1108	NC_022443	ATA	2	6	45919	45924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636509
1109	NC_022443	A	6	6	45924	45929	100 %	0 %	0 %	0 %	545636509
1110	NC_022443	CAT	2	6	45936	45941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636509
1111	NC_022443	T	6	6	45983	45988	0 %	100 %	0 %	0 %	545636509
1112	NC_022443	GTT	2	6	46026	46031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636509
1113	NC_022443	TG	3	6	46040	46045	0 %	50 %	50 %	0 %	545636509
1114	NC_022443	TCT	2	6	46064	46069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636509
1115	NC_022443	T	8	8	46114	46121	0 %	100 %	0 %	0 %	545636509
1116	NC_022443	GATT	2	8	46191	46198	25 %	50 %	25 %	0 %	545636509
1117	NC_022443	TCCC	2	8	46210	46217	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1118	NC_022443	ATG	2	6	46233	46238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022443	GAT	2	6	46241	46246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022443	ATT	2	6	46289	46294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636510
1121	NC_022443	CCT	2	6	46306	46311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545636510
1122	NC_022443	TCA	2	6	46330	46335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636510
1123	NC_022443	TGA	2	6	46403	46408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636510
1124	NC_022443	GATA	2	8	46436	46443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022443	TCA	2	6	46459	46464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_022443	TAG	2	6	46468	46473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_022443	TAA	2	6	46514	46519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_022443	CTG	2	6	46541	46546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_022443	TCC	2	6	46549	46554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_022443	TTA	2	6	46579	46584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022443	TA	3	6	46605	46610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022443	ATT	2	6	46641	46646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_022443	CCT	2	6	46648	46653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_022443	CAT	2	6	46684	46689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_022443	ATA	2	6	46694	46699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_022443	TA	3	6	46698	46703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022443	TTA	2	6	46717	46722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022443	ACAA	2	8	46814	46821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1139	NC_022443	TGA	2	6	46844	46849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_022443	TA	4	8	46872	46879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_022443	TTAT	3	12	46880	46891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_022443	CTT	2	6	46936	46941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_022443	A	6	6	46972	46977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_022443	A	6	6	47029	47034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1145	NC_022443	ATT	2	6	47134	47139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1149	NC_022443	GTT	2	6	47245	47250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636511
1150	NC_022443	TTA	2	6	47262	47267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636511
1151	NC_022443	T	6	6	47291	47296	0 %	100 %	0 %	0 %	545636511
1152	NC_022443	T	6	6	47309	47314	0 %	100 %	0 %	0 %	545636511
1153	NC_022443	ATCA	2	8	47327	47334	50 %	25 %	0 %	25 %	545636511
1154	NC_022443	TGT	2	6	47394	47399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636511
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1157	NC_022443	TTAT	2	8	47568	47575	25 %	75 %	0 %	0 %	545636511
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1162	NC_022443	GT	3	6	47663	47668	0 %	50 %	50 %	0 %	545636511
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1165	NC_022443	TAC	2	6	47794	47799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636511
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1172	NC_022443	AT	4	8	48226	48233	50 %	50 %	0 %	0 %	545636511
1173	NC_022443	ATA	2	6	48320	48325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636511
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1178	NC_022443	GTTT	2	8	48536	48543	0 %	75 %	25 %	0 %	545636511
1179	NC_022443	CTT	2	6	48571	48576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636511
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1183	NC_022443	GTTTT	2	10	48769	48778	0 %	80 %	20 %	0 %	545636511
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1215	NC_022443	TTGT	2	8	50030	50037	0 %	75 %	25 %	0 %	545636512
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1221	NC_022443	TA	3	6	50188	50193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1222	NC_022443	AT	3	6	50209	50214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1223	NC_022443	TGAT	2	8	50262	50269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1224	NC_022443	TTC	2	6	50270	50275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1225	NC_022443	ATT	2	6	50354	50359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_022443	T	7	7	52135	52141	0 %	100 %	0 %	0 %	545636513
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1255	NC_022443	CCT	2	6	52198	52203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545636514
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1257	NC_022443	AAT	2	6	52278	52283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636514
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1259	NC_022443	TGT	2	6	52342	52347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636514
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1264	NC_022443	ATG	2	6	52516	52521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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