MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022443	TGC	2	6	209817	209822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636642
5002	NC_022443	ATG	2	6	209909	209914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636642
5003	NC_022443	TCA	2	6	209952	209957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636642
5004	NC_022443	TGT	2	6	209979	209984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636642
5005	NC_022443	GCA	2	6	210037	210042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636642
5006	NC_022443	ATG	2	6	210047	210052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636642
5007	NC_022443	AAG	2	6	210071	210076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636642
5008	NC_022443	AAC	2	6	210153	210158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636642
5009	NC_022443	TGG	2	6	210171	210176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636642
5010	NC_022443	TGGT	2	8	210207	210214	0 %	50 %	50 %	0 %	545636642
5011	NC_022443	ATC	2	6	210339	210344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636642
5012	NC_022443	AGCA	2	8	210371	210378	50 %	0 %	25 %	25 %	545636642
5013	NC_022443	CGA	2	6	210494	210499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636642
5014	NC_022443	TTC	2	6	210524	210529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636642
5015	NC_022443	ATT	2	6	210593	210598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636643
5016	NC_022443	TAA	2	6	210629	210634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636643
5017	NC_022443	T	6	6	210657	210662	0 %	100 %	0 %	0 %	545636643
5018	NC_022443	TCA	2	6	210670	210675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636643
5019	NC_022443	TAT	2	6	210782	210787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636643
5020	NC_022443	TACT	2	8	210933	210940	25 %	50 %	0 %	25 %	545636643
5021	NC_022443	AC	3	6	211046	211051	50 %	0 %	0 %	50 %	545636643
5022	NC_022443	GGTT	2	8	211061	211068	0 %	50 %	50 %	0 %	545636643
5023	NC_022443	TTA	2	6	211126	211131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636643
5024	NC_022443	TTG	2	6	211153	211158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636643
5025	NC_022443	ATT	2	6	211197	211202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636643
5026	NC_022443	TGT	2	6	211214	211219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636643
5027	NC_022443	CAT	2	6	211270	211275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636643
5028	NC_022443	ATG	2	6	211309	211314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636643
5029	NC_022443	ATAA	2	8	211326	211333	75 %	25 %	0 %	0 %	545636643
5030	NC_022443	AT	3	6	211336	211341	50 %	50 %	0 %	0 %	545636643
5031	NC_022443	TTA	2	6	211350	211355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636643
5032	NC_022443	TCA	2	6	211476	211481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636643
5033	NC_022443	AGC	2	6	211493	211498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636643
5034	NC_022443	ATGG	2	8	211503	211510	25 %	25 %	50 %	0 %	545636643
5035	NC_022443	AAT	2	6	211605	211610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636643
5036	NC_022443	TTAT	2	8	211618	211625	25 %	75 %	0 %	0 %	545636643
5037	NC_022443	TAA	2	6	211631	211636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636643
5038	NC_022443	GGT	2	6	211638	211643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636643
5039	NC_022443	CCA	2	6	211644	211649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636643
5040	NC_022443	GTA	2	6	211669	211674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636643
5041	NC_022443	AAC	2	6	211719	211724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636643
5042	NC_022443	ATTA	2	8	211748	211755	50 %	50 %	0 %	0 %	545636643
5043	NC_022443	TTG	2	6	211765	211770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636643
5044	NC_022443	ATTCA	2	10	211785	211794	40 %	40 %	0 %	20 %	545636643
5045	NC_022443	GAGG	2	8	211818	211825	25 %	0 %	75 %	0 %	545636643
5046	NC_022443	AGA	2	6	211841	211846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636644
5047	NC_022443	GAT	2	6	211887	211892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636644
5048	NC_022443	TCA	2	6	211898	211903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636644
5049	NC_022443	ACT	2	6	211914	211919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636644
5050	NC_022443	AGT	2	6	212026	212031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636644
5051	NC_022443	TTG	2	6	212138	212143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636644
5052	NC_022443	ATT	2	6	212238	212243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636644
5053	NC_022443	TA	3	6	212270	212275	50 %	50 %	0 %	0 %	545636644
5054	NC_022443	TGG	2	6	212277	212282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636644
5055	NC_022443	TGA	2	6	212343	212348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636644
5056	NC_022443	GTT	2	6	212428	212433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636644
5057	NC_022443	AAG	2	6	212490	212495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636644
5058	NC_022443	TTA	2	6	212534	212539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636644
5059	NC_022443	AAT	2	6	212554	212559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636644
5060	NC_022443	GCA	2	6	212572	212577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636644
5061	NC_022443	TTCTTG	2	12	212614	212625	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	545636644
5062	NC_022443	AAC	2	6	212649	212654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636644
5063	NC_022443	AAC	2	6	212704	212709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_022443	TTGA	2	8	212786	212793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_022443	AGG	2	6	212837	212842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_022443	ATG	2	6	212848	212853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636645
5067	NC_022443	GTG	2	6	212879	212884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636645
5068	NC_022443	AGC	2	6	212970	212975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636645
5069	NC_022443	ATG	2	6	213017	213022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636645
5070	NC_022443	ATGTG	2	10	213128	213137	20 %	40 %	40 %	0 %	545636645
5071	NC_022443	CAG	2	6	213161	213166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636645
5072	NC_022443	A	6	6	213173	213178	100 %	0 %	0 %	0 %	545636645
5073	NC_022443	GATA	2	8	213180	213187	50 %	25 %	25 %	0 %	545636645
5074	NC_022443	A	6	6	213205	213210	100 %	0 %	0 %	0 %	545636645
5075	NC_022443	TA	3	6	213257	213262	50 %	50 %	0 %	0 %	545636645
5076	NC_022443	ATTT	2	8	213292	213299	25 %	75 %	0 %	0 %	545636645
5077	NC_022443	TCG	3	9	213318	213326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636645
5078	NC_022443	GAA	2	6	213358	213363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636645
5079	NC_022443	GGA	2	6	213373	213378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545636645
5080	NC_022443	AC	3	6	213397	213402	50 %	0 %	0 %	50 %	545636645
5081	NC_022443	GAT	2	6	213423	213428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636645
5082	NC_022443	TAAAT	2	10	213471	213480	60 %	40 %	0 %	0 %	545636645
5083	NC_022443	ATG	2	6	213488	213493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636645
5084	NC_022443	TTA	2	6	213557	213562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636645
5085	NC_022443	GAA	2	6	213567	213572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636645
5086	NC_022443	CGA	2	6	213578	213583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636645
5087	NC_022443	GAA	3	9	213784	213792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636645
5088	NC_022443	CAT	2	6	213928	213933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_022443	AGG	2	6	213940	213945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_022443	CAT	2	6	213948	213953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636646
5091	NC_022443	TGG	2	6	213984	213989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636646
5092	NC_022443	GAT	2	6	214077	214082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636646
5093	NC_022443	TTG	2	6	214145	214150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636646
5094	NC_022443	GGT	2	6	214155	214160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636646
5095	NC_022443	TAA	2	6	214173	214178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636646
5096	NC_022443	TG	3	6	214229	214234	0 %	50 %	50 %	0 %	545636646
5097	NC_022443	GAC	2	6	214251	214256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636646
5098	NC_022443	AGA	2	6	214257	214262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636646
5099	NC_022443	TAA	2	6	214287	214292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636646
5100	NC_022443	TTA	2	6	214303	214308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636646
5101	NC_022443	CA	3	6	214330	214335	50 %	0 %	0 %	50 %	545636646
5102	NC_022443	A	6	6	214354	214359	100 %	0 %	0 %	0 %	545636646
5103	NC_022443	TGGT	2	8	214376	214383	0 %	50 %	50 %	0 %	545636646
5104	NC_022443	TAG	2	6	214391	214396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636646
5105	NC_022443	CTGG	2	8	214430	214437	0 %	25 %	50 %	25 %	545636646
5106	NC_022443	CTA	2	6	214519	214524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636646
5107	NC_022443	AAC	2	6	214580	214585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636646
5108	NC_022443	GAT	2	6	214636	214641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636646
5109	NC_022443	AGCA	2	8	214674	214681	50 %	0 %	25 %	25 %	545636646
5110	NC_022443	ATTT	2	8	214763	214770	25 %	75 %	0 %	0 %	545636646
5111	NC_022443	AT	3	6	214780	214785	50 %	50 %	0 %	0 %	545636646
5112	NC_022443	AAAGC	2	10	214811	214820	60 %	0 %	20 %	20 %	545636646
5113	NC_022443	GA	3	6	214852	214857	50 %	0 %	50 %	0 %	545636646
5114	NC_022443	AGA	2	6	214893	214898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636646
5115	NC_022443	GAA	2	6	214915	214920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636646
5116	NC_022443	ATT	2	6	214995	215000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_022443	AT	3	6	215001	215006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_022443	AAG	2	6	215029	215034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_022443	TAT	2	6	215069	215074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636647
5120	NC_022443	TGGAT	2	10	215121	215130	20 %	40 %	40 %	0 %	545636647
5121	NC_022443	GGT	2	6	215149	215154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636647
5122	NC_022443	GTT	2	6	215187	215192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636647
5123	NC_022443	CAGA	2	8	215234	215241	50 %	0 %	25 %	25 %	545636647
5124	NC_022443	AAG	2	6	215306	215311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636647
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5140	NC_022443	TTGT	2	8	216128	216135	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_022443	AAG	2	6	216137	216142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5143	NC_022443	TA	3	6	216159	216164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_022443	TA	3	6	216213	216218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_022443	ATA	2	6	216243	216248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_022443	A	7	7	216248	216254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_022443	TGT	2	6	216258	216263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5148	NC_022443	AATAT	2	10	216303	216312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5244	NC_022443	AT	3	6	220721	220726	50 %	50 %	0 %	0 %	545636651
5245	NC_022443	AAAT	2	8	220759	220766	75 %	25 %	0 %	0 %	545636651
5246	NC_022443	ATT	2	6	220795	220800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636651
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5248	NC_022443	TAA	2	6	220867	220872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636651
5249	NC_022443	CAT	2	6	220893	220898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636651
5250	NC_022443	GAT	2	6	220899	220904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636651
5251	NC_022443	ATT	2	6	220930	220935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636651
5252	NC_022443	TAA	2	6	220944	220949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636651
5253	NC_022443	ATG	2	6	220972	220977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636651
5254	NC_022443	TGAC	2	8	220984	220991	25 %	25 %	25 %	25 %	545636651
5255	NC_022443	TCA	2	6	220994	220999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636651
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5258	NC_022443	TAG	2	6	221091	221096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636651
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5262	NC_022443	GAT	2	6	221573	221578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636652
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5264	NC_022443	GTT	2	6	221617	221622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636652
5265	NC_022443	TAA	2	6	221667	221672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636652
5266	NC_022443	ACT	2	6	221719	221724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636652
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5273	NC_022443	A	7	7	222070	222076	100 %	0 %	0 %	0 %	545636652
5274	NC_022443	ATA	2	6	222083	222088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636652
5275	NC_022443	AAT	2	6	222147	222152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5276	NC_022443	TGT	2	6	222228	222233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5277	NC_022443	TTTG	2	8	222248	222255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5278	NC_022443	GAC	2	6	222260	222265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5279	NC_022443	TATTT	2	10	222294	222303	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5280	NC_022443	TA	3	6	222312	222317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5281	NC_022443	AT	3	6	222390	222395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5282	NC_022443	TC	3	6	222405	222410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5283	NC_022443	TTA	2	6	222429	222434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5284	NC_022443	T	6	6	222442	222447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5285	NC_022443	AT	3	6	222456	222461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5286	NC_022443	TGT	2	6	222509	222514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5287	NC_022443	ACAT	2	8	222574	222581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5288	NC_022443	TGA	2	6	222583	222588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5289	NC_022443	A	7	7	222610	222616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5290	NC_022443	CAA	2	6	222620	222625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5291	NC_022443	AG	3	6	222779	222784	50 %	0 %	50 %	0 %	545636653
5292	NC_022443	AGA	2	6	222889	222894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636653
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5342	NC_022443	CAGT	2	8	225196	225203	25 %	25 %	25 %	25 %	545636654
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5351	NC_022443	TTA	2	6	225544	225549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636654
5352	NC_022443	ATC	2	6	225589	225594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636654
5353	NC_022443	AGA	2	6	225641	225646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636654
5354	NC_022443	GAT	2	6	225660	225665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636654
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5357	NC_022443	CTT	2	6	225785	225790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5358	NC_022443	GTA	2	6	225821	225826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5359	NC_022443	GAAG	2	8	225855	225862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5360	NC_022443	ATC	2	6	225926	225931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5361	NC_022443	TTA	2	6	225953	225958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5362	NC_022443	ATATGA	2	12	225971	225982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_022443	AT	3	6	226083	226088	50 %	50 %	0 %	0 %	545636655
5364	NC_022443	TAG	2	6	226171	226176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636655
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5367	NC_022443	ATT	2	6	226376	226381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636655
5368	NC_022443	ATTT	2	8	226457	226464	25 %	75 %	0 %	0 %	545636655
5369	NC_022443	A	6	6	226513	226518	100 %	0 %	0 %	0 %	545636655
5370	NC_022443	GAA	2	6	226544	226549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636655
5371	NC_022443	ACG	2	6	226559	226564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636655
5372	NC_022443	TTTAC	2	10	226628	226637	20 %	60 %	0 %	20 %	545636655
5373	NC_022443	TCA	2	6	226746	226751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636655
5374	NC_022443	ATTA	2	8	226768	226775	50 %	50 %	0 %	0 %	545636655
5375	NC_022443	GAA	2	6	226811	226816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636655
5376	NC_022443	TCA	2	6	226835	226840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636655
5377	NC_022443	TGT	2	6	226849	226854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636655
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5381	NC_022443	TACT	2	8	227051	227058	25 %	50 %	0 %	25 %	545636655
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5392	NC_022443	A	7	7	227518	227524	100 %	0 %	0 %	0 %	545636655
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5403	NC_022443	TGCT	2	8	228248	228255	0 %	50 %	25 %	25 %	545636656
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5452	NC_022443	ACA	2	6	230642	230647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5453	NC_022443	ATG	2	6	230663	230668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5459	NC_022443	ATT	2	6	230942	230947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5483	NC_022443	TTGCT	2	10	232299	232308	0 %	60 %	20 %	20 %	545636658
5484	NC_022443	CAA	2	6	232334	232339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636658
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5487	NC_022443	CT	3	6	232366	232371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5488	NC_022443	T	6	6	232439	232444	0 %	100 %	0 %	0 %	545636659
5489	NC_022443	TTGA	2	8	232496	232503	25 %	50 %	25 %	0 %	545636659
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5493	NC_022443	GTTT	2	8	232679	232686	0 %	75 %	25 %	0 %	545636659
5494	NC_022443	AAT	2	6	232742	232747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636659
5495	NC_022443	TTGT	2	8	232847	232854	0 %	75 %	25 %	0 %	545636659
5496	NC_022443	TAA	2	6	232919	232924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636659
5497	NC_022443	CAA	2	6	232939	232944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636659
5498	NC_022443	AT	3	6	232950	232955	50 %	50 %	0 %	0 %	545636659
5499	NC_022443	ACA	2	6	232971	232976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636659
5500	NC_022443	ACT	2	6	233037	233042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636659

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