MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Serratia sp. ATCC 39006 genome

Total Repeats: 3081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022268	CGCTG	2	10	1831	1840	0 %	20 %	40 %	40 %	541862393
2	NC_022268	GGTTT	2	10	1917	1926	0 %	60 %	40 %	0 %	541862393
3	NC_022268	GGTGA	2	10	4203	4212	20 %	20 %	60 %	0 %	541862396
4	NC_022268	ACACC	2	10	5064	5073	40 %	0 %	0 %	60 %	541862397
5	NC_022268	GCCAG	2	10	6434	6443	20 %	0 %	40 %	40 %	541862398
6	NC_022268	CAGGA	2	10	8633	8642	40 %	0 %	40 %	20 %	541862398
7	NC_022268	GCCAG	2	10	8684	8693	20 %	0 %	40 %	40 %	541862398
8	NC_022268	TAGAA	2	10	8941	8950	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022268	GACCA	2	10	9441	9450	40 %	0 %	20 %	40 %	541862399
10	NC_022268	TGAAA	2	10	11801	11810	60 %	20 %	20 %	0 %	541862401
11	NC_022268	CTGGC	2	10	12330	12339	0 %	20 %	40 %	40 %	541862401
12	NC_022268	GGAAA	2	10	13035	13044	60 %	0 %	40 %	0 %	541862403
13	NC_022268	TCATT	2	10	19561	19570	20 %	60 %	0 %	20 %	541862408
14	NC_022268	AATAT	2	10	19904	19913	60 %	40 %	0 %	0 %	541862409
15	NC_022268	TATTT	2	10	20364	20373	20 %	80 %	0 %	0 %	541862409
16	NC_022268	TCGGT	2	10	20782	20791	0 %	40 %	40 %	20 %	541862410
17	NC_022268	CGGTA	2	10	20921	20930	20 %	20 %	40 %	20 %	541862410
18	NC_022268	TCCGT	2	10	21047	21056	0 %	40 %	20 %	40 %	541862410
19	NC_022268	CGGCA	2	10	22648	22657	20 %	0 %	40 %	40 %	541862411
20	NC_022268	GTGGA	2	10	23073	23082	20 %	20 %	60 %	0 %	541862411
21	NC_022268	ATTGG	2	10	23111	23120	20 %	40 %	40 %	0 %	541862411
22	NC_022268	TGGAT	2	10	26067	26076	20 %	40 %	40 %	0 %	541862414
23	NC_022268	GGCCT	2	10	28828	28837	0 %	20 %	40 %	40 %	541862416
24	NC_022268	ACCAC	2	10	30688	30697	40 %	0 %	0 %	60 %	541862417
25	NC_022268	GCAGG	2	10	33947	33956	20 %	0 %	60 %	20 %	541862418
26	NC_022268	TGAAC	2	10	36103	36112	40 %	20 %	20 %	20 %	541862419
27	NC_022268	ACTGC	2	10	38185	38194	20 %	20 %	20 %	40 %	541862421
28	NC_022268	CATAA	2	10	38672	38681	60 %	20 %	0 %	20 %	541862421
29	NC_022268	TAAAA	2	10	39594	39603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022268	AGTGA	2	10	39686	39695	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022268	ACATC	2	10	40495	40504	40 %	20 %	0 %	40 %	541862422
32	NC_022268	GCAAT	2	10	41899	41908	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_022268	TCGGT	2	10	43878	43887	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_022268	CACCC	2	10	44062	44071	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
35	NC_022268	CTTGT	2	10	44086	44095	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_022268	CATGA	2	10	44561	44570	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_022268	ACACA	2	10	45189	45198	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_022268	GTTGT	2	10	47159	47168	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022268	TTACT	2	10	47868	47877	20 %	60 %	0 %	20 %	541862423
40	NC_022268	GGGGA	2	10	48085	48094	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022268	TTCTG	2	10	49328	49337	0 %	60 %	20 %	20 %	541862425
42	NC_022268	CGAGC	2	10	52152	52161	20 %	0 %	40 %	40 %	541862429
43	NC_022268	TGCGC	2	10	54144	54153	0 %	20 %	40 %	40 %	541862431
44	NC_022268	TTTCC	2	10	56843	56852	0 %	60 %	0 %	40 %	541862434
45	NC_022268	TAAAC	2	10	57026	57035	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_022268	AAATG	2	10	57294	57303	60 %	20 %	20 %	0 %	541862435
47	NC_022268	GACAT	2	10	57514	57523	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_022268	GGATC	2	10	58241	58250	20 %	20 %	40 %	20 %	541862437
49	NC_022268	CCCAA	2	10	59931	59940	40 %	0 %	0 %	60 %	541862439
50	NC_022268	TCGGC	2	10	60605	60614	0 %	20 %	40 %	40 %	541862441
51	NC_022268	GACGG	2	10	64675	64684	20 %	0 %	60 %	20 %	541862449
52	NC_022268	GTCAG	2	10	65233	65242	20 %	20 %	40 %	20 %	541862450
53	NC_022268	TTTTG	2	10	66330	66339	0 %	80 %	20 %	0 %	541862453
54	NC_022268	AACCA	2	10	68067	68076	60 %	0 %	0 %	40 %	541862457
55	NC_022268	ATTCC	2	10	70256	70265	20 %	40 %	0 %	40 %	541862461
56	NC_022268	TACCG	2	10	72346	72355	20 %	20 %	20 %	40 %	541862465
57	NC_022268	ACCAG	2	10	74982	74991	40 %	0 %	20 %	40 %	541862466
58	NC_022268	ATCCA	2	10	75046	75055	40 %	20 %	0 %	40 %	541862466
59	NC_022268	AGTTT	2	10	75811	75820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022268	TTAAA	2	10	77107	77116	60 %	40 %	0 %	0 %	541862471
61	NC_022268	TAAAA	2	10	78789	78798	80 %	20 %	0 %	0 %	541862473
62	NC_022268	GAAGC	2	10	81781	81790	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022268	ATACC	2	10	82271	82280	40 %	20 %	0 %	40 %	541862476
64	NC_022268	CAGAC	2	10	88126	88135	40 %	0 %	20 %	40 %	541862482
65	NC_022268	GGAGA	2	10	88765	88774	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022268	TGCAC	2	10	89763	89772	20 %	20 %	20 %	40 %	541862484
67	NC_022268	CACTG	2	10	94602	94611	20 %	20 %	20 %	40 %	541862489
68	NC_022268	GATAA	2	10	95799	95808	60 %	20 %	20 %	0 %	541862489
69	NC_022268	GCAGC	2	10	96509	96518	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_022268	GATCC	2	10	98055	98064	20 %	20 %	20 %	40 %	541862491
71	NC_022268	GGAAA	2	10	99148	99157	60 %	0 %	40 %	0 %	541862492
72	NC_022268	GTGCA	2	10	100008	100017	20 %	20 %	40 %	20 %	541862493
73	NC_022268	ACAGA	2	10	101751	101760	60 %	0 %	20 %	20 %	541862496
74	NC_022268	CGGCC	2	10	103247	103256	0 %	0 %	40 %	60 %	541862497
75	NC_022268	CGCGG	2	10	105215	105224	0 %	0 %	60 %	40 %	541862498
76	NC_022268	CCCGT	2	10	106200	106209	0 %	20 %	20 %	60 %	541862499
77	NC_022268	CGGTC	2	10	110201	110210	0 %	20 %	40 %	40 %	541862503
78	NC_022268	GGTGC	2	10	113501	113510	0 %	20 %	60 %	20 %	541862507
79	NC_022268	AATGA	2	10	114883	114892	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022268	TCCCA	2	10	118081	118090	20 %	20 %	0 %	60 %	541862511
81	NC_022268	GAAAA	2	10	118874	118883	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022268	AGTTA	2	10	119863	119872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022268	TGATC	2	10	120269	120278	20 %	40 %	20 %	20 %	541862513
84	NC_022268	AAGGG	2	10	122211	122220	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022268	ATTGT	2	10	127100	127109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022268	CATTT	2	10	128324	128333	20 %	60 %	0 %	20 %	541862525
87	NC_022268	GCACC	2	10	129585	129594	20 %	0 %	20 %	60 %	541862527
88	NC_022268	AGCAA	2	10	130498	130507	60 %	0 %	20 %	20 %	541862528
89	NC_022268	TTTTC	2	10	130849	130858	0 %	80 %	0 %	20 %	541862529
90	NC_022268	AACGC	2	10	132695	132704	40 %	0 %	20 %	40 %	541862531
91	NC_022268	TGGAA	2	10	134683	134692	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022268	ATTAA	2	10	137692	137701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022268	AATCG	2	10	145433	145442	40 %	20 %	20 %	20 %	541862542
94	NC_022268	ATCAG	2	10	146543	146552	40 %	20 %	20 %	20 %	541862542
95	NC_022268	CATAT	2	10	148579	148588	40 %	40 %	0 %	20 %	541862543
96	NC_022268	CCAGC	2	10	148992	149001	20 %	0 %	20 %	60 %	541862543
97	NC_022268	ATCAC	2	10	149378	149387	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_022268	GGCAT	2	10	149774	149783	20 %	20 %	40 %	20 %	541862544
99	NC_022268	CAGGC	2	10	149951	149960	20 %	0 %	40 %	40 %	541862544
100	NC_022268	CATTC	2	10	151528	151537	20 %	40 %	0 %	40 %	541862545
101	NC_022268	ACCGC	2	10	151960	151969	20 %	0 %	20 %	60 %	541862545
102	NC_022268	CGCTC	2	10	152610	152619	0 %	20 %	20 %	60 %	541862545
103	NC_022268	AACCC	2	10	153459	153468	40 %	0 %	0 %	60 %	541862546
104	NC_022268	TAACC	2	10	155002	155011	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_022268	AAAAT	2	10	157159	157168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022268	CAGTC	2	10	160868	160877	20 %	20 %	20 %	40 %	541862552
107	NC_022268	AGTTG	2	10	161093	161102	20 %	40 %	40 %	0 %	541862553
108	NC_022268	TGGTT	2	10	163080	163089	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022268	ATGGG	2	10	163425	163434	20 %	20 %	60 %	0 %	541862554
110	NC_022268	CATCA	2	10	166500	166509	40 %	20 %	0 %	40 %	541862556
111	NC_022268	CAGCA	2	10	169035	169044	40 %	0 %	20 %	40 %	541862558
112	NC_022268	AACAT	2	10	169093	169102	60 %	20 %	0 %	20 %	541862558
113	NC_022268	CAAAC	2	10	169326	169335	60 %	0 %	0 %	40 %	541862558
114	NC_022268	CCCGG	2	10	169981	169990	0 %	0 %	40 %	60 %	541862559
115	NC_022268	GGTCA	2	10	170617	170626	20 %	20 %	40 %	20 %	541862560
116	NC_022268	ACAGT	2	10	173159	173168	40 %	20 %	20 %	20 %	541862562
117	NC_022268	ACCGA	2	10	173522	173531	40 %	0 %	20 %	40 %	541862562
118	NC_022268	CCGGG	2	10	175297	175306	0 %	0 %	60 %	40 %	541862564
119	NC_022268	ATTTA	2	10	175935	175944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022268	GACCA	2	10	176851	176860	40 %	0 %	20 %	40 %	541862566
121	NC_022268	CGCAC	2	10	179967	179976	20 %	0 %	20 %	60 %	541862569
122	NC_022268	AGGTT	2	10	180025	180034	20 %	40 %	40 %	0 %	541862569
123	NC_022268	ATGCA	2	10	181050	181059	40 %	20 %	20 %	20 %	541862569
124	NC_022268	TGTGG	2	10	181322	181331	0 %	40 %	60 %	0 %	541862570
125	NC_022268	CAGAC	2	10	181496	181505	40 %	0 %	20 %	40 %	541862570
126	NC_022268	GATCC	2	10	182245	182254	20 %	20 %	20 %	40 %	541862570
127	NC_022268	TGGTG	2	10	185600	185609	0 %	40 %	60 %	0 %	541862573
128	NC_022268	GCCAG	2	10	185848	185857	20 %	0 %	40 %	40 %	541862573
129	NC_022268	CGCTG	2	10	186882	186891	0 %	20 %	40 %	40 %	541862574
130	NC_022268	CATGG	2	10	192246	192255	20 %	20 %	40 %	20 %	541862579
131	NC_022268	TCACT	2	10	199694	199703	20 %	40 %	0 %	40 %	541862585
132	NC_022268	GACAA	2	10	202971	202980	60 %	0 %	20 %	20 %	541862588
133	NC_022268	ACCTT	2	10	203060	203069	20 %	40 %	0 %	40 %	541862588
134	NC_022268	GAATG	2	10	208672	208681	40 %	20 %	40 %	0 %	541862593
135	NC_022268	TCAGG	2	10	209317	209326	20 %	20 %	40 %	20 %	541862593
136	NC_022268	TTTTC	2	10	209901	209910	0 %	80 %	0 %	20 %	541862594
137	NC_022268	AATAC	2	10	211479	211488	60 %	20 %	0 %	20 %	541862596
138	NC_022268	CCCAC	2	10	211611	211620	20 %	0 %	0 %	80 %	541862596
139	NC_022268	GCCAA	2	10	212244	212253	40 %	0 %	20 %	40 %	541862596
140	NC_022268	CCACT	2	10	213559	213568	20 %	20 %	0 %	60 %	541862598
141	NC_022268	ACGTA	2	10	214553	214562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_022268	AAATT	2	10	214767	214776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022268	ATCAC	2	10	214892	214901	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_022268	ATCCA	2	10	218943	218952	40 %	20 %	0 %	40 %	541862603
145	NC_022268	GTTAA	2	10	220336	220345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022268	TTGCA	2	10	221236	221245	20 %	40 %	20 %	20 %	541862604
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151	NC_022268	TTAAA	2	10	231929	231938	60 %	40 %	0 %	0 %	541862615
152	NC_022268	AATAG	2	10	232063	232072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022268	CAAAT	2	10	232152	232161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_022268	AAGAT	2	10	233754	233763	60 %	20 %	20 %	0 %	541862617
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179	NC_022268	TGCTA	2	10	271806	271815	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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189	NC_022268	TTTCA	2	10	281895	281904	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_022268	ATGCA	2	10	291385	291394	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
198	NC_022268	GCAAT	2	10	292154	292163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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240	NC_022268	CCACG	2	10	355469	355478	20 %	0 %	20 %	60 %	541862717
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243	NC_022268	CAAAA	2	10	361469	361478	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
244	NC_022268	CACCC	2	10	363627	363636	20 %	0 %	0 %	80 %	541862725
245	NC_022268	TGCGC	2	10	364553	364562	0 %	20 %	40 %	40 %	541862725
246	NC_022268	AATCA	2	10	365563	365572	60 %	20 %	0 %	20 %	541862727
247	NC_022268	TACCG	2	10	367089	367098	20 %	20 %	20 %	40 %	541862728
248	NC_022268	GCCGG	2	10	367198	367207	0 %	0 %	60 %	40 %	541862728
249	NC_022268	TTTTA	2	10	369769	369778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_022268	ACAGG	2	10	369981	369990	40 %	0 %	40 %	20 %	541862731
251	NC_022268	CTATT	2	10	374800	374809	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
252	NC_022268	CAAAA	2	10	374862	374871	80 %	0 %	0 %	20 %	541862736
253	NC_022268	GTGGC	2	10	374914	374923	0 %	20 %	60 %	20 %	541862736
254	NC_022268	GCATG	2	10	375433	375442	20 %	20 %	40 %	20 %	541862736
255	NC_022268	TGTCA	2	10	376192	376201	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
256	NC_022268	TAACA	2	10	376225	376234	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
257	NC_022268	TTCTC	2	10	376438	376447	0 %	60 %	0 %	40 %	541862739
258	NC_022268	TACCC	2	10	381287	381296	20 %	20 %	0 %	60 %	541862743
259	NC_022268	TAGCG	2	10	382997	383006	20 %	20 %	40 %	20 %	541862745
260	NC_022268	GCAGA	2	10	383966	383975	40 %	0 %	40 %	20 %	541862746
261	NC_022268	AACTG	2	10	384100	384109	40 %	20 %	20 %	20 %	541862746
262	NC_022268	CCAGA	2	10	386032	386041	40 %	0 %	20 %	40 %	541862748
263	NC_022268	ATTCG	2	10	386694	386703	20 %	40 %	20 %	20 %	541862748
264	NC_022268	TCAGC	2	10	396205	396214	20 %	20 %	20 %	40 %	541862754
265	NC_022268	AACCG	2	10	397114	397123	40 %	0 %	20 %	40 %	541862755
266	NC_022268	AAATG	2	10	397466	397475	60 %	20 %	20 %	0 %	541862755
267	NC_022268	CTGGA	2	10	400041	400050	20 %	20 %	40 %	20 %	541862757
268	NC_022268	AGTTT	2	10	400602	400611	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_022268	AGCAA	2	10	401052	401061	60 %	0 %	20 %	20 %	541862758
270	NC_022268	GCGAC	2	10	401364	401373	20 %	0 %	40 %	40 %	541862758
271	NC_022268	CAGCC	2	10	401521	401530	20 %	0 %	20 %	60 %	541862758
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277	NC_022268	CGGGT	2	10	410712	410721	0 %	20 %	60 %	20 %	541862765
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282	NC_022268	AAAAT	2	10	415703	415712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_022268	GCCAC	2	10	454969	454978	20 %	0 %	20 %	60 %	541862806
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392	NC_022268	TGGGT	2	10	603410	603419	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_022268	CCGTT	2	10	614687	614696	0 %	40 %	20 %	40 %	541862950
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399	NC_022268	ACACC	2	10	619595	619604	40 %	0 %	0 %	60 %	541862952
400	NC_022268	AGATA	2	10	620727	620736	60 %	20 %	20 %	0 %	541862953
401	NC_022268	GCTCG	2	10	622230	622239	0 %	20 %	40 %	40 %	541862954
402	NC_022268	TTTAA	2	10	622705	622714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_022268	TTACC	2	10	623947	623956	20 %	40 %	0 %	40 %	541862956
404	NC_022268	GTTGA	2	10	625315	625324	20 %	40 %	40 %	0 %	541862957
405	NC_022268	TTACT	2	10	625569	625578	20 %	60 %	0 %	20 %	541862957
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407	NC_022268	TGGCA	2	10	626750	626759	20 %	20 %	40 %	20 %	541862959
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409	NC_022268	ATTTA	2	10	631522	631531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_022268	TGCAG	2	10	631662	631671	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
411	NC_022268	TGGGA	2	10	632135	632144	20 %	20 %	60 %	0 %	541862964
412	NC_022268	CCTTT	2	10	632964	632973	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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414	NC_022268	GGCCA	2	10	637013	637022	20 %	0 %	40 %	40 %	541862967
415	NC_022268	TAAAA	2	10	637443	637452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_022268	GCAGT	2	10	638934	638943	20 %	20 %	40 %	20 %	541862969
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423	NC_022268	CCGGC	2	10	643754	643763	0 %	0 %	40 %	60 %	541862974
424	NC_022268	AAATG	2	10	645436	645445	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_022268	AACAT	2	10	650912	650921	60 %	20 %	0 %	20 %	541862981
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431	NC_022268	CCATT	2	10	659607	659616	20 %	40 %	0 %	40 %	541862990
432	NC_022268	CCGCA	2	10	665149	665158	20 %	0 %	20 %	60 %	541862998
433	NC_022268	GTGAC	2	10	665761	665770	20 %	20 %	40 %	20 %	541862999
434	NC_022268	ACCTA	2	10	667670	667679	40 %	20 %	0 %	40 %	541863000
435	NC_022268	GATCA	2	10	668124	668133	40 %	20 %	20 %	20 %	541863001
436	NC_022268	GGTGT	2	10	671582	671591	0 %	40 %	60 %	0 %	541863003
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452	NC_022268	TCATC	2	10	694412	694421	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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455	NC_022268	TAACA	2	10	704467	704476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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461	NC_022268	GGCAG	2	10	710570	710579	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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463	NC_022268	CCATA	2	10	713917	713926	40 %	20 %	0 %	40 %	541863041
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499	NC_022268	TGCAA	2	10	777348	777357	40 %	20 %	20 %	20 %	541863100
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