MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	AG	3	6	2105	2110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022248	TA	3	6	5677	5682	50 %	50 %	0 %	0 %	538397729
3	NC_022248	AT	3	6	6357	6362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022248	TA	3	6	6857	6862	50 %	50 %	0 %	0 %	538397730
5	NC_022248	AG	3	6	7495	7500	50 %	0 %	50 %	0 %	538397732
6	NC_022248	AT	3	6	7638	7643	50 %	50 %	0 %	0 %	538397732
7	NC_022248	AT	3	6	8611	8616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022248	AT	3	6	8656	8661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022248	GC	3	6	9242	9247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022248	GT	3	6	10162	10167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022248	GC	3	6	10332	10337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022248	GC	3	6	10389	10394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022248	CA	3	6	10415	10420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_022248	GA	3	6	10441	10446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022248	GC	3	6	11432	11437	0 %	0 %	50 %	50 %	538397735
16	NC_022248	GC	3	6	11507	11512	0 %	0 %	50 %	50 %	538397735
17	NC_022248	GC	3	6	12346	12351	0 %	0 %	50 %	50 %	538397736
18	NC_022248	CT	3	6	12829	12834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_022248	GC	3	6	13068	13073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022248	CA	3	6	13615	13620	50 %	0 %	0 %	50 %	538397737
21	NC_022248	GC	3	6	14591	14596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022248	CA	3	6	14872	14877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022248	GA	3	6	14932	14937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022248	GA	3	6	15533	15538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022248	GA	3	6	15810	15815	50 %	0 %	50 %	0 %	538397740
26	NC_022248	CT	3	6	16260	16265	0 %	50 %	0 %	50 %	538397740
27	NC_022248	GC	3	6	16653	16658	0 %	0 %	50 %	50 %	538397741
28	NC_022248	CA	3	6	17787	17792	50 %	0 %	0 %	50 %	538397742
29	NC_022248	GA	3	6	18238	18243	50 %	0 %	50 %	0 %	538397742
30	NC_022248	CT	3	6	18957	18962	0 %	50 %	0 %	50 %	538397742
31	NC_022248	TC	3	6	20106	20111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_022248	GC	3	6	20271	20276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_022248	GA	3	6	20434	20439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022248	TC	3	6	20767	20772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022248	CT	3	6	21173	21178	0 %	50 %	0 %	50 %	538397743
36	NC_022248	CA	3	6	21393	21398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022248	CT	3	6	21751	21756	0 %	50 %	0 %	50 %	538397744
38	NC_022248	AT	3	6	22044	22049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022248	AT	3	6	22080	22085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022248	GC	3	6	22247	22252	0 %	0 %	50 %	50 %	538397745
41	NC_022248	AC	3	6	23436	23441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022248	AG	3	6	23938	23943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022248	TA	3	6	24373	24378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022248	TA	3	6	24582	24587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022248	CT	3	6	24668	24673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_022248	AT	3	6	25641	25646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022248	AT	3	6	25771	25776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022248	TA	3	6	25843	25848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022248	GT	3	6	26101	26106	0 %	50 %	50 %	0 %	538397747
50	NC_022248	GC	3	6	26310	26315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_022248	TA	3	6	26490	26495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022248	GT	3	6	28791	28796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022248	GC	3	6	29198	29203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022248	GC	3	6	29469	29474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_022248	GC	3	6	29541	29546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_022248	TG	3	6	30917	30922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022248	AT	3	6	31470	31475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022248	TA	3	6	32069	32074	50 %	50 %	0 %	0 %	538397751
59	NC_022248	GC	3	6	32288	32293	0 %	0 %	50 %	50 %	538397751
60	NC_022248	TG	3	6	32573	32578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022248	CG	3	6	33159	33164	0 %	0 %	50 %	50 %	538397752
62	NC_022248	GC	3	6	33508	33513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_022248	GC	3	6	33520	33525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_022248	GA	3	6	34026	34031	50 %	0 %	50 %	0 %	538397753
65	NC_022248	CG	3	6	34051	34056	0 %	0 %	50 %	50 %	538397753
66	NC_022248	AC	3	6	34764	34769	50 %	0 %	0 %	50 %	538397754
67	NC_022248	GA	3	6	36277	36282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022248	AC	3	6	36511	36516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_022248	AG	3	6	37570	37575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022248	AC	3	6	39648	39653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022248	GC	3	6	40425	40430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022248	CG	3	6	40713	40718	0 %	0 %	50 %	50 %	538397758
73	NC_022248	TG	3	6	40904	40909	0 %	50 %	50 %	0 %	538397758
74	NC_022248	TC	3	6	41956	41961	0 %	50 %	0 %	50 %	538397759
75	NC_022248	CA	3	6	42105	42110	50 %	0 %	0 %	50 %	538397760
76	NC_022248	TG	3	6	44948	44953	0 %	50 %	50 %	0 %	538397760
77	NC_022248	CT	3	6	45539	45544	0 %	50 %	0 %	50 %	538397760
78	NC_022248	GC	3	6	45690	45695	0 %	0 %	50 %	50 %	538397760
79	NC_022248	CG	3	6	46720	46725	0 %	0 %	50 %	50 %	538397760
80	NC_022248	TG	3	6	47007	47012	0 %	50 %	50 %	0 %	538397760
81	NC_022248	TG	3	6	49077	49082	0 %	50 %	50 %	0 %	538397762
82	NC_022248	CG	3	6	49518	49523	0 %	0 %	50 %	50 %	538397762
83	NC_022248	CA	3	6	49895	49900	50 %	0 %	0 %	50 %	538397762
84	NC_022248	TA	3	6	50670	50675	50 %	50 %	0 %	0 %	538397763
85	NC_022248	TA	3	6	50936	50941	50 %	50 %	0 %	0 %	538397763
86	NC_022248	TA	3	6	51220	51225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022248	AT	3	6	51265	51270	50 %	50 %	0 %	0 %	538397764
88	NC_022248	AT	3	6	52394	52399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022248	AG	3	6	53978	53983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022248	GA	3	6	54028	54033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022248	CA	3	6	54728	54733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_022248	TG	3	6	56462	56467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022248	GT	3	6	56692	56697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022248	GA	3	6	57131	57136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022248	AT	3	6	57445	57450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022248	GC	3	6	58676	58681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022248	TG	3	6	59812	59817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022248	TC	4	8	59939	59946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022248	CA	3	6	60788	60793	50 %	0 %	0 %	50 %	538397767
100	NC_022248	CT	3	6	61832	61837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022248	AC	3	6	62816	62821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022248	CG	3	6	63234	63239	0 %	0 %	50 %	50 %	538397768
103	NC_022248	GC	3	6	63526	63531	0 %	0 %	50 %	50 %	538397769
104	NC_022248	CG	3	6	64233	64238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_022248	CG	3	6	65683	65688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022248	TG	3	6	65884	65889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022248	GC	3	6	65978	65983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022248	CG	3	6	66200	66205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_022248	AC	3	6	67164	67169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022248	AC	3	6	67378	67383	50 %	0 %	0 %	50 %	538397770
111	NC_022248	GC	3	6	68164	68169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022248	CG	3	6	69540	69545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022248	CA	3	6	70557	70562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_022248	AT	3	6	71365	71370	50 %	50 %	0 %	0 %	538397772
115	NC_022248	TC	3	6	72547	72552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022248	AC	3	6	73158	73163	50 %	0 %	0 %	50 %	538397775
117	NC_022248	GA	3	6	73268	73273	50 %	0 %	50 %	0 %	538397775
118	NC_022248	GA	3	6	73761	73766	50 %	0 %	50 %	0 %	538397776
119	NC_022248	TC	3	6	73942	73947	0 %	50 %	0 %	50 %	538397776
120	NC_022248	TA	4	8	74007	74014	50 %	50 %	0 %	0 %	538397776
121	NC_022248	GA	3	6	74525	74530	50 %	0 %	50 %	0 %	538397777
122	NC_022248	AT	3	6	74971	74976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022248	TG	3	6	75629	75634	0 %	50 %	50 %	0 %	538397778
124	NC_022248	TA	3	6	76059	76064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022248	CG	3	6	76765	76770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022248	GC	3	6	76953	76958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022248	GC	3	6	77442	77447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022248	CA	3	6	78040	78045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_022248	GC	3	6	78210	78215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022248	CG	3	6	78902	78907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022248	TA	3	6	79347	79352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022248	CG	3	6	79914	79919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022248	GC	3	6	80243	80248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_022248	CG	3	6	80425	80430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_022248	GA	3	6	80470	80475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022248	TC	3	6	81172	81177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022248	GC	3	6	81271	81276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022248	GT	3	6	82426	82431	0 %	50 %	50 %	0 %	538397783
139	NC_022248	CA	3	6	82676	82681	50 %	0 %	0 %	50 %	538397783
140	NC_022248	TA	3	6	83195	83200	50 %	50 %	0 %	0 %	538397783
141	NC_022248	AT	3	6	83978	83983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022248	TA	3	6	84396	84401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022248	GA	3	6	84882	84887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022248	GA	3	6	85209	85214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022248	AG	3	6	85728	85733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022248	GC	3	6	86022	86027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022248	TG	3	6	86529	86534	0 %	50 %	50 %	0 %	538397785
148	NC_022248	GC	4	8	86661	86668	0 %	0 %	50 %	50 %	538397785
149	NC_022248	AC	3	6	88540	88545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_022248	AC	3	6	89334	89339	50 %	0 %	0 %	50 %	538397786
151	NC_022248	GT	4	8	91005	91012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022248	AT	3	6	92626	92631	50 %	50 %	0 %	0 %	538397787

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.