MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 plasmid pVIRBov complete sequence

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022248	CAGATT	2	12	2916	2927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_022248	GCGCTG	2	12	4486	4497	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538397729
3	NC_022248	CCACCG	2	12	5428	5439	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538397729
4	NC_022248	CAAAAT	2	12	5474	5485	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	538397729
5	NC_022248	AATCTA	2	12	6404	6415	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	538397730
6	NC_022248	TGCGCC	2	12	9904	9915	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538397733
7	NC_022248	ACAGGG	2	12	11194	11205	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538397734
8	NC_022248	CAGGCT	2	12	11735	11746	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538397735
9	NC_022248	GCTGTC	2	12	14157	14168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397739
10	NC_022248	CACTGT	2	12	14169	14180	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538397739
11	NC_022248	TATACA	2	12	14760	14771	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_022248	GGACAA	2	12	23269	23280	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_022248	TGGATA	2	12	23532	23543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022248	AATGTG	2	12	26436	26447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022248	AACCTG	2	12	28697	28708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022248	CGGGGA	2	12	34659	34670	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	538397754
17	NC_022248	CGTGGT	2	12	34862	34873	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_022248	GCCGGT	2	12	35468	35479	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538397755
19	NC_022248	TGGATG	2	12	36148	36159	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022248	TGTCAG	2	12	36461	36472	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_022248	ACCGCG	2	12	36967	36978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022248	CGGATT	2	12	38698	38709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022248	ACCAGC	2	12	41563	41574	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538397759
24	NC_022248	CATCGT	2	12	42042	42053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538397759
25	NC_022248	GCCCCA	2	12	44256	44267	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538397760
26	NC_022248	CCACAT	2	12	44562	44573	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	538397760
27	NC_022248	ACCGTC	2	12	45083	45094	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538397760
28	NC_022248	GGCTGT	2	12	48324	48335	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538397762
29	NC_022248	ACGGTT	2	12	48995	49006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538397762
30	NC_022248	CCAGCA	2	12	54187	54198	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022248	TAACTG	2	12	54444	54455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_022248	ACCTTA	2	12	66483	66494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_022248	CCACTG	2	12	66579	66590	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022248	CGGCAC	2	12	69804	69815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022248	GGCAGC	2	12	70293	70304	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_022248	ATAAAA	2	12	71605	71616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	538397772
37	NC_022248	AATTTT	2	12	74331	74342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022248	AGCGCC	2	12	78741	78752	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022248	CCAGCG	2	12	87043	87054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538397785
40	NC_022248	AGTCCG	2	12	89636	89647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_022248	GGTAAG	2	12	92657	92668	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	538397787

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.