MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 10853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022241	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_022241	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	538360567
3	NC_022241	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	538360567
4	NC_022241	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	538360568
5	NC_022241	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	538360569
6	NC_022241	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	538360569
7	NC_022241	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	538360569
8	NC_022241	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	538360569
9	NC_022241	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	538360569
10	NC_022241	TGAG	2	8	6624	6631	25 %	25 %	50 %	0 %	538360571
11	NC_022241	CCAA	2	8	6665	6672	50 %	0 %	0 %	50 %	538360571
12	NC_022241	TGAA	2	8	7268	7275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022241	GCGT	2	8	8134	8141	0 %	25 %	50 %	25 %	538360573
14	NC_022241	AAGA	2	8	8216	8223	75 %	0 %	25 %	0 %	538360573
15	NC_022241	CTGT	2	8	8644	8651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_022241	CCTT	2	8	8652	8659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_022241	GAAC	2	8	9696	9703	50 %	0 %	25 %	25 %	538360575
18	NC_022241	CAGG	2	8	10100	10107	25 %	0 %	50 %	25 %	538360576
19	NC_022241	TTGA	2	8	10955	10962	25 %	50 %	25 %	0 %	538360577
20	NC_022241	TGGC	2	8	10982	10989	0 %	25 %	50 %	25 %	538360577
21	NC_022241	TCGT	2	8	11102	11109	0 %	50 %	25 %	25 %	538360577
22	NC_022241	ATTT	2	8	11347	11354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022241	TGTT	2	8	11361	11368	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022241	ATGG	2	8	11625	11632	25 %	25 %	50 %	0 %	538360578
25	NC_022241	TGGT	2	8	11716	11723	0 %	50 %	50 %	0 %	538360578
26	NC_022241	CAAC	2	8	12229	12236	50 %	0 %	0 %	50 %	538360578
27	NC_022241	AAGA	2	8	12303	12310	75 %	0 %	25 %	0 %	538360578
28	NC_022241	CCAT	2	8	12880	12887	25 %	25 %	0 %	50 %	538360578
29	NC_022241	GCGT	2	8	12908	12915	0 %	25 %	50 %	25 %	538360578
30	NC_022241	GGCT	2	8	13400	13407	0 %	25 %	50 %	25 %	538360578
31	NC_022241	CGGT	2	8	14570	14577	0 %	25 %	50 %	25 %	538360579
32	NC_022241	TCAG	2	8	15223	15230	25 %	25 %	25 %	25 %	538360581
33	NC_022241	TTTG	2	8	15513	15520	0 %	75 %	25 %	0 %	538360581
34	NC_022241	CGAA	2	8	15728	15735	50 %	0 %	25 %	25 %	538360581
35	NC_022241	ATTG	2	8	15740	15747	25 %	50 %	25 %	0 %	538360581
36	NC_022241	ATTA	2	8	16408	16415	50 %	50 %	0 %	0 %	538360582
37	NC_022241	ATAA	2	8	16500	16507	75 %	25 %	0 %	0 %	538360583
38	NC_022241	AATA	2	8	17976	17983	75 %	25 %	0 %	0 %	538360585
39	NC_022241	GGGC	2	8	18562	18569	0 %	0 %	75 %	25 %	538360585
40	NC_022241	CGTG	2	8	19262	19269	0 %	25 %	50 %	25 %	538360585
41	NC_022241	CCAA	2	8	21263	21270	50 %	0 %	0 %	50 %	538360586
42	NC_022241	GACG	2	8	21609	21616	25 %	0 %	50 %	25 %	538360586
43	NC_022241	TGGC	2	8	22262	22269	0 %	25 %	50 %	25 %	538360586
44	NC_022241	TGGC	2	8	22368	22375	0 %	25 %	50 %	25 %	538360586
45	NC_022241	CGCC	2	8	22634	22641	0 %	0 %	25 %	75 %	538360586
46	NC_022241	CTGG	2	8	22980	22987	0 %	25 %	50 %	25 %	538360586
47	NC_022241	TTAT	2	8	23245	23252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022241	TTTA	2	8	23478	23485	25 %	75 %	0 %	0 %	538360587
49	NC_022241	CTGA	2	8	23831	23838	25 %	25 %	25 %	25 %	538360587
50	NC_022241	TCTG	2	8	23935	23942	0 %	50 %	25 %	25 %	538360587
51	NC_022241	TGAA	2	8	24446	24453	50 %	25 %	25 %	0 %	538360588
52	NC_022241	CCAG	2	8	24717	24724	25 %	0 %	25 %	50 %	538360588
53	NC_022241	ACCG	2	8	25394	25401	25 %	0 %	25 %	50 %	538360589
54	NC_022241	AAAT	2	8	25454	25461	75 %	25 %	0 %	0 %	538360589
55	NC_022241	TCTG	2	8	25911	25918	0 %	50 %	25 %	25 %	538360590
56	NC_022241	GCCT	2	8	26092	26099	0 %	25 %	25 %	50 %	538360590
57	NC_022241	CCTT	2	8	26598	26605	0 %	50 %	0 %	50 %	538360590
58	NC_022241	TCAG	2	8	26957	26964	25 %	25 %	25 %	25 %	538360590
59	NC_022241	AGCC	2	8	27904	27911	25 %	0 %	25 %	50 %	538360590
60	NC_022241	CCGA	2	8	28111	28118	25 %	0 %	25 %	50 %	538360590
61	NC_022241	ATTA	2	8	28504	28511	50 %	50 %	0 %	0 %	538360591
62	NC_022241	GGCG	2	8	28746	28753	0 %	0 %	75 %	25 %	538360591
63	NC_022241	ATGA	2	8	29951	29958	50 %	25 %	25 %	0 %	538360592
64	NC_022241	TGCT	2	8	30521	30528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_022241	TATC	2	8	30577	30584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_022241	GTAA	2	8	30614	30621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022241	TTCG	2	8	30876	30883	0 %	50 %	25 %	25 %	538360594
68	NC_022241	GTCA	2	8	31386	31393	25 %	25 %	25 %	25 %	538360595
69	NC_022241	ACCG	2	8	32206	32213	25 %	0 %	25 %	50 %	538360596
70	NC_022241	AGGC	2	8	32244	32251	25 %	0 %	50 %	25 %	538360596
71	NC_022241	CCTG	2	8	32680	32687	0 %	25 %	25 %	50 %	538360597
72	NC_022241	AACA	2	8	32696	32703	75 %	0 %	0 %	25 %	538360597
73	NC_022241	CGCA	2	8	32870	32877	25 %	0 %	25 %	50 %	538360597
74	NC_022241	TAAA	2	8	32940	32947	75 %	25 %	0 %	0 %	538360597
75	NC_022241	CCAG	2	8	33326	33333	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022241	TTAT	2	8	33509	33516	25 %	75 %	0 %	0 %	538360598
77	NC_022241	TTGG	2	8	33893	33900	0 %	50 %	50 %	0 %	538360598
78	NC_022241	CTTT	2	8	34273	34280	0 %	75 %	0 %	25 %	538360598
79	NC_022241	GAAG	2	8	34313	34320	50 %	0 %	50 %	0 %	538360598
80	NC_022241	TAAA	2	8	34365	34372	75 %	25 %	0 %	0 %	538360599
81	NC_022241	ATAA	2	8	34644	34651	75 %	25 %	0 %	0 %	538360599
82	NC_022241	GTGC	2	8	34767	34774	0 %	25 %	50 %	25 %	538360599
83	NC_022241	TTAA	2	8	34777	34784	50 %	50 %	0 %	0 %	538360599
84	NC_022241	TGAT	2	8	35012	35019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022241	TGGA	2	8	35529	35536	25 %	25 %	50 %	0 %	538360601
86	NC_022241	GTCA	2	8	35889	35896	25 %	25 %	25 %	25 %	538360601
87	NC_022241	GGGA	2	8	36473	36480	25 %	0 %	75 %	0 %	538360601
88	NC_022241	ATAC	2	8	37458	37465	50 %	25 %	0 %	25 %	538360602
89	NC_022241	GAAG	2	8	37530	37537	50 %	0 %	50 %	0 %	538360602
90	NC_022241	CACG	2	8	38093	38100	25 %	0 %	25 %	50 %	538360602
91	NC_022241	TAAT	2	8	38195	38202	50 %	50 %	0 %	0 %	538360602
92	NC_022241	CCAT	2	8	38651	38658	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_022241	ATTA	2	8	38731	38738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022241	AATT	2	8	40012	40019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022241	GCGG	2	8	40503	40510	0 %	0 %	75 %	25 %	538360604
96	NC_022241	CTGG	2	8	40721	40728	0 %	25 %	50 %	25 %	538360604
97	NC_022241	CCGA	2	8	41238	41245	25 %	0 %	25 %	50 %	538360604
98	NC_022241	ATCG	2	8	41394	41401	25 %	25 %	25 %	25 %	538360604
99	NC_022241	TCAA	2	8	41455	41462	50 %	25 %	0 %	25 %	538360604
100	NC_022241	AACC	2	8	41721	41728	50 %	0 %	0 %	50 %	538360605
101	NC_022241	GAAA	2	8	41773	41780	75 %	0 %	25 %	0 %	538360605
102	NC_022241	GGTC	2	8	42345	42352	0 %	25 %	50 %	25 %	538360605
103	NC_022241	TTTG	2	8	42869	42876	0 %	75 %	25 %	0 %	538360605
104	NC_022241	GTAT	2	8	43164	43171	25 %	50 %	25 %	0 %	538360606
105	NC_022241	TCCG	2	8	43558	43565	0 %	25 %	25 %	50 %	538360606
106	NC_022241	ATGA	2	8	45620	45627	50 %	25 %	25 %	0 %	538360607
107	NC_022241	AACG	2	8	45922	45929	50 %	0 %	25 %	25 %	538360607
108	NC_022241	TGAC	2	8	46006	46013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_022241	GAAA	2	8	46870	46877	75 %	0 %	25 %	0 %	538360608
110	NC_022241	TCGC	2	8	46885	46892	0 %	25 %	25 %	50 %	538360608
111	NC_022241	GCTG	2	8	47076	47083	0 %	25 %	50 %	25 %	538360608
112	NC_022241	CACG	2	8	47774	47781	25 %	0 %	25 %	50 %	538360609
113	NC_022241	CAGC	2	8	47801	47808	25 %	0 %	25 %	50 %	538360609
114	NC_022241	CTGC	2	8	47938	47945	0 %	25 %	25 %	50 %	538360609
115	NC_022241	TACC	2	8	48285	48292	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022241	CATG	2	8	48506	48513	25 %	25 %	25 %	25 %	538360610
117	NC_022241	AAGT	2	8	49300	49307	50 %	25 %	25 %	0 %	538360610
118	NC_022241	CCAG	2	8	49358	49365	25 %	0 %	25 %	50 %	538360610
119	NC_022241	TTGA	2	8	50139	50146	25 %	50 %	25 %	0 %	538360610
120	NC_022241	GAAA	2	8	50474	50481	75 %	0 %	25 %	0 %	538360611
121	NC_022241	GCCA	2	8	50815	50822	25 %	0 %	25 %	50 %	538360611
122	NC_022241	TAAA	2	8	51208	51215	75 %	25 %	0 %	0 %	538360611
123	NC_022241	TCTT	2	8	51327	51334	0 %	75 %	0 %	25 %	538360611
124	NC_022241	AGTA	2	8	51901	51908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022241	ATCA	2	8	51941	51948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_022241	GAAA	2	8	52061	52068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022241	GAGG	2	8	52093	52100	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022241	CATA	2	8	52853	52860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_022241	TCAG	2	8	52864	52871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_022241	GCCC	2	8	53036	53043	0 %	0 %	25 %	75 %	538360613
131	NC_022241	TGGC	2	8	53578	53585	0 %	25 %	50 %	25 %	538360613
132	NC_022241	AGCC	2	8	57405	57412	25 %	0 %	25 %	50 %	538360616
133	NC_022241	AAAG	2	8	57484	57491	75 %	0 %	25 %	0 %	538360616
134	NC_022241	ATGG	2	8	57617	57624	25 %	25 %	50 %	0 %	538360616
135	NC_022241	TGAT	2	8	58289	58296	25 %	50 %	25 %	0 %	538360617
136	NC_022241	TGGA	2	8	58958	58965	25 %	25 %	50 %	0 %	538360618
137	NC_022241	CCTG	2	8	58994	59001	0 %	25 %	25 %	50 %	538360618
138	NC_022241	GATT	2	8	59356	59363	25 %	50 %	25 %	0 %	538360618
139	NC_022241	GATC	2	8	59725	59732	25 %	25 %	25 %	25 %	538360618
140	NC_022241	CTGC	2	8	60743	60750	0 %	25 %	25 %	50 %	538360619
141	NC_022241	CTGG	2	8	60850	60857	0 %	25 %	50 %	25 %	538360619
142	NC_022241	GTGG	2	8	61015	61022	0 %	25 %	75 %	0 %	538360619
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