MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 98713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
98001	NC_022241	GCAT	2	8	4640644	4640651	25 %	25 %	25 %	25 %	538365144
98002	NC_022241	ATCG	2	8	4640706	4640713	25 %	25 %	25 %	25 %	538365144
98003	NC_022241	GCA	2	6	4640744	4640749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365144
98004	NC_022241	GGAA	2	8	4640790	4640797	50 %	0 %	50 %	0 %	538365144
98005	NC_022241	TGA	2	6	4640800	4640805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365144
98006	NC_022241	CAT	2	6	4640831	4640836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365144
98007	NC_022241	TTCCAG	2	12	4640853	4640864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538365144
98008	NC_022241	G	7	7	4640993	4640999	0 %	0 %	100 %	0 %	538365144
98009	NC_022241	GCT	2	6	4641089	4641094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365144
98010	NC_022241	AGGC	2	8	4641113	4641120	25 %	0 %	50 %	25 %	538365144
98011	NC_022241	GGC	2	6	4641168	4641173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98012	NC_022241	GAA	2	6	4641207	4641212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98013	NC_022241	CGG	2	6	4641223	4641228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98014	NC_022241	AGCA	2	8	4641396	4641403	50 %	0 %	25 %	25 %	538365145
98015	NC_022241	TGCG	2	8	4641407	4641414	0 %	25 %	50 %	25 %	538365145
98016	NC_022241	GAC	2	6	4641448	4641453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365145
98017	NC_022241	TCA	2	6	4641480	4641485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365145
98018	NC_022241	CGG	2	6	4641509	4641514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365145
98019	NC_022241	ATG	2	6	4641620	4641625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365145
98020	NC_022241	GCG	2	6	4641655	4641660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365145
98021	NC_022241	CG	3	6	4641703	4641708	0 %	0 %	50 %	50 %	538365145
98022	NC_022241	ATC	2	6	4641796	4641801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365145
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98024	NC_022241	TCA	2	6	4641875	4641880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365145
98025	NC_022241	GC	4	8	4641923	4641930	0 %	0 %	50 %	50 %	538365145
98026	NC_022241	ATG	2	6	4641934	4641939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365145
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98028	NC_022241	GCG	2	6	4641992	4641997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365145
98029	NC_022241	TACG	2	8	4641998	4642005	25 %	25 %	25 %	25 %	538365145
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98031	NC_022241	CTG	2	6	4642111	4642116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365145
98032	NC_022241	CAG	2	6	4642149	4642154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365145
98033	NC_022241	CTA	2	6	4642155	4642160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365145
98034	NC_022241	GCGCT	2	10	4642180	4642189	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98035	NC_022241	AGG	2	6	4642274	4642279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98036	NC_022241	ATT	2	6	4642303	4642308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98037	NC_022241	GAA	2	6	4642342	4642347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98038	NC_022241	TTA	2	6	4642358	4642363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98039	NC_022241	GCC	2	6	4642402	4642407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98040	NC_022241	TCT	2	6	4642421	4642426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538365146
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98061	NC_022241	ATT	2	6	4643627	4643632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98062	NC_022241	TAT	2	6	4643673	4643678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365147
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98089	NC_022241	GCG	2	6	4645638	4645643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365148
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98105	NC_022241	G	6	6	4646357	4646362	0 %	0 %	100 %	0 %	538365149
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98117	NC_022241	TGATGT	2	12	4647221	4647232	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538365150
98118	NC_022241	ATC	3	9	4647240	4647248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365150
98119	NC_022241	TCA	2	6	4647268	4647273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365150
98120	NC_022241	TGC	2	6	4647289	4647294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365150
98121	NC_022241	TAA	2	6	4647388	4647393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538365150
98122	NC_022241	GCT	2	6	4647447	4647452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365150
98123	NC_022241	GCGG	2	8	4647513	4647520	0 %	0 %	75 %	25 %	538365150
98124	NC_022241	GTTG	2	8	4647645	4647652	0 %	50 %	50 %	0 %	538365150
98125	NC_022241	GCA	2	6	4647662	4647667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365150
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98128	NC_022241	TGG	2	6	4647782	4647787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365150
98129	NC_022241	ACG	2	6	4647895	4647900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365150
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98131	NC_022241	ATG	2	6	4647928	4647933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365150
98132	NC_022241	AAT	2	6	4647981	4647986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538365150
98133	NC_022241	TGG	2	6	4648018	4648023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365150
98134	NC_022241	GC	3	6	4648106	4648111	0 %	0 %	50 %	50 %	538365150
98135	NC_022241	T	6	6	4648160	4648165	0 %	100 %	0 %	0 %	538365150
98136	NC_022241	TA	3	6	4648193	4648198	50 %	50 %	0 %	0 %	538365150
98137	NC_022241	CGGTA	2	10	4648205	4648214	20 %	20 %	40 %	20 %	538365150
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98146	NC_022241	GCGCG	2	10	4648662	4648671	0 %	0 %	60 %	40 %	538365150
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98148	NC_022241	CGT	2	6	4648761	4648766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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98169	NC_022241	TAA	2	6	4649583	4649588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98170	NC_022241	ATC	2	6	4649670	4649675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365152
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98196	NC_022241	GCGGG	2	10	4651098	4651107	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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98205	NC_022241	ATA	2	6	4651324	4651329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98206	NC_022241	TC	3	6	4651345	4651350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98207	NC_022241	ATT	2	6	4651355	4651360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98208	NC_022241	CG	3	6	4651466	4651471	0 %	0 %	50 %	50 %	538365155
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98224	NC_022241	CTCTTC	2	12	4652432	4652443	0 %	50 %	0 %	50 %	538365156
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98231	NC_022241	T	6	6	4652702	4652707	0 %	100 %	0 %	0 %	538365156
98232	NC_022241	TAA	2	6	4652758	4652763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538365156
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98235	NC_022241	GCA	2	6	4652824	4652829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365156
98236	NC_022241	GC	3	6	4652897	4652902	0 %	0 %	50 %	50 %	538365156
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98352	NC_022241	ATG	2	6	4658623	4658628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365161
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98468	NC_022241	GGT	2	6	4664573	4664578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365168
98469	NC_022241	CGG	2	6	4664608	4664613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365168
98470	NC_022241	CGC	2	6	4664635	4664640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538365168
98471	NC_022241	CTG	3	9	4664679	4664687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365168
98472	NC_022241	GTCTG	2	10	4664730	4664739	0 %	40 %	40 %	20 %	538365168
98473	NC_022241	AC	3	6	4664772	4664777	50 %	0 %	0 %	50 %	538365168
98474	NC_022241	GC	3	6	4664789	4664794	0 %	0 %	50 %	50 %	538365168
98475	NC_022241	CG	3	6	4664802	4664807	0 %	0 %	50 %	50 %	538365168
98476	NC_022241	TC	3	6	4664819	4664824	0 %	50 %	0 %	50 %	538365168
98477	NC_022241	TGGGA	2	10	4664843	4664852	20 %	20 %	60 %	0 %	538365168
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98479	NC_022241	TGC	2	6	4664892	4664897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365169
98480	NC_022241	GTCGCC	2	12	4664915	4664926	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538365169
98481	NC_022241	CCG	2	6	4664974	4664979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538365169
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98483	NC_022241	GCT	2	6	4665013	4665018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365169
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98488	NC_022241	GTT	2	6	4665184	4665189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538365169
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98491	NC_022241	TGC	2	6	4665289	4665294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365169
98492	NC_022241	TGG	2	6	4665482	4665487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365169
98493	NC_022241	CCGC	2	8	4665541	4665548	0 %	0 %	25 %	75 %	538365169
98494	NC_022241	GCA	2	6	4665567	4665572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365169
98495	NC_022241	GGC	2	6	4665685	4665690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365169
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98498	NC_022241	CTG	2	6	4665803	4665808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365169
98499	NC_022241	TGA	2	6	4665862	4665867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365169
98500	NC_022241	GGC	2	6	4665907	4665912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365169

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