MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 98713

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_022241	CGA	2	6	254009	254014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360795
5503	NC_022241	CAC	2	6	254124	254129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360795
5504	NC_022241	AGGC	2	8	254176	254183	25 %	0 %	50 %	25 %	538360795
5505	NC_022241	GTT	2	6	254195	254200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360795
5506	NC_022241	GGT	2	6	254241	254246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360795
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5508	NC_022241	GAT	2	6	254375	254380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_022241	AAT	2	6	254387	254392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_022241	TCAG	2	8	254415	254422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_022241	T	6	6	254491	254496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_022241	ACTG	2	8	254507	254514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5513	NC_022241	TGC	2	6	254543	254548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_022241	CAA	2	6	254593	254598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_022241	GC	3	6	254632	254637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_022241	AC	3	6	254663	254668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_022241	AAC	2	6	254701	254706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_022241	AC	4	8	254705	254712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_022241	GC	3	6	254902	254907	0 %	0 %	50 %	50 %	538360796
5520	NC_022241	CAT	2	6	254921	254926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360796
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5522	NC_022241	AAGCG	2	10	255032	255041	40 %	0 %	40 %	20 %	538360796
5523	NC_022241	GCT	2	6	255051	255056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360796
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5525	NC_022241	GCTG	2	8	255088	255095	0 %	25 %	50 %	25 %	538360796
5526	NC_022241	AAGA	2	8	255195	255202	75 %	0 %	25 %	0 %	538360796
5527	NC_022241	AAC	2	6	255333	255338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538360796
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5529	NC_022241	TAA	2	6	255528	255533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360796
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5531	NC_022241	GTA	2	6	255685	255690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_022241	ATG	2	6	255845	255850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360797
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5534	NC_022241	CTGA	2	8	255866	255873	25 %	25 %	25 %	25 %	538360797
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5538	NC_022241	GACT	2	8	256024	256031	25 %	25 %	25 %	25 %	538360797
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5543	NC_022241	GCAA	2	8	256310	256317	50 %	0 %	25 %	25 %	538360797
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5550	NC_022241	TGC	2	6	256615	256620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360797
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5552	NC_022241	CTT	2	6	256667	256672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_022241	CT	3	6	256680	256685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_022241	GAAA	2	8	256775	256782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_022241	GCG	2	6	256833	256838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360798
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5559	NC_022241	CTG	2	6	257156	257161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360798
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5570	NC_022241	GTCTG	2	10	257617	257626	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5609	NC_022241	GC	3	6	259277	259282	0 %	0 %	50 %	50 %	538360800
5610	NC_022241	GGC	2	6	259341	259346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360800
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5617	NC_022241	CG	3	6	259768	259773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_022241	A	6	6	259852	259857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5620	NC_022241	AAT	2	6	259926	259931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_022241	ATGG	2	8	259933	259940	25 %	25 %	50 %	0 %	538360801
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5626	NC_022241	TG	3	6	260127	260132	0 %	50 %	50 %	0 %	538360801
5627	NC_022241	TAT	2	6	260184	260189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360801
5628	NC_022241	ATA	2	6	260258	260263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360801
5629	NC_022241	CGG	2	6	260295	260300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360801
5630	NC_022241	TGC	2	6	260357	260362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360801
5631	NC_022241	TGA	2	6	260376	260381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360801
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5633	NC_022241	ACTTT	2	10	260499	260508	20 %	60 %	0 %	20 %	538360801
5634	NC_022241	CGT	2	6	260581	260586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360801
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5636	NC_022241	TGA	2	6	260607	260612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360801
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5638	NC_022241	GCC	2	6	260703	260708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5639	NC_022241	ATT	2	6	260722	260727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5640	NC_022241	CGC	2	6	260781	260786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360802
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5643	NC_022241	TTG	2	6	260848	260853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360802
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5679	NC_022241	TTAG	2	8	262862	262869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5680	NC_022241	GAA	2	6	262870	262875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5681	NC_022241	ATA	2	6	262879	262884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5726	NC_022241	TTA	2	6	265440	265445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5727	NC_022241	GCT	2	6	265485	265490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360805
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5733	NC_022241	A	6	6	265800	265805	100 %	0 %	0 %	0 %	538360805
5734	NC_022241	TGG	2	6	265831	265836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360805
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5740	NC_022241	TAC	2	6	266189	266194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360806
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5742	NC_022241	TCG	2	6	266338	266343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360806
5743	NC_022241	A	6	6	266345	266350	100 %	0 %	0 %	0 %	538360806
5744	NC_022241	TCCAG	2	10	266431	266440	20 %	20 %	20 %	40 %	538360806
5745	NC_022241	ATT	2	6	266520	266525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360806
5746	NC_022241	ACC	2	6	266553	266558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360806
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5869	NC_022241	GGC	2	6	272625	272630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360811
5870	NC_022241	GC	3	6	272656	272661	0 %	0 %	50 %	50 %	538360811
5871	NC_022241	CCG	2	6	272684	272689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360811
5872	NC_022241	CCGCG	2	10	272741	272750	0 %	0 %	40 %	60 %	538360811
5873	NC_022241	TGA	2	6	272752	272757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360811
5874	NC_022241	GCC	2	6	272781	272786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360811
5875	NC_022241	GGT	2	6	272900	272905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360811
5876	NC_022241	ATCA	2	8	272955	272962	50 %	25 %	0 %	25 %	538360811
5877	NC_022241	CGG	2	6	272990	272995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360811
5878	NC_022241	CAC	2	6	273038	273043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360811
5879	NC_022241	CAG	2	6	273174	273179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360811
5880	NC_022241	TGA	2	6	273227	273232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360811
5881	NC_022241	G	6	6	273240	273245	0 %	0 %	100 %	0 %	538360811
5882	NC_022241	CCGC	2	8	273256	273263	0 %	0 %	25 %	75 %	538360811
5883	NC_022241	TGA	2	6	273338	273343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360811
5884	NC_022241	CTA	2	6	273410	273415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360811
5885	NC_022241	TGCGCG	2	12	273428	273439	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538360811
5886	NC_022241	TC	3	6	273466	273471	0 %	50 %	0 %	50 %	538360811
5887	NC_022241	GCC	2	6	273631	273636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360812
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5889	NC_022241	A	6	6	273688	273693	100 %	0 %	0 %	0 %	538360812
5890	NC_022241	GC	3	6	273753	273758	0 %	0 %	50 %	50 %	538360812
5891	NC_022241	TGA	2	6	273803	273808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360812
5892	NC_022241	TGA	2	6	273812	273817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360812
5893	NC_022241	GGCG	2	8	273821	273828	0 %	0 %	75 %	25 %	538360812
5894	NC_022241	TGA	2	6	273842	273847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360812
5895	NC_022241	TCG	2	6	273856	273861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360812
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5897	NC_022241	TGA	2	6	273892	273897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360812
5898	NC_022241	TCA	2	6	273905	273910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360812
5899	NC_022241	A	6	6	273931	273936	100 %	0 %	0 %	0 %	538360812
5900	NC_022241	TCG	2	6	273938	273943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360812
5901	NC_022241	GGC	2	6	274161	274166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360812
5902	NC_022241	CGG	2	6	274169	274174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360812
5903	NC_022241	TGC	2	6	274210	274215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360812
5904	NC_022241	GCT	2	6	274293	274298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360812
5905	NC_022241	CAT	2	6	274310	274315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360812
5906	NC_022241	CGC	2	6	274318	274323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360812
5907	NC_022241	CAT	2	6	274352	274357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360812
5908	NC_022241	GCG	2	6	274372	274377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360812
5909	NC_022241	GGC	2	6	274400	274405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360812
5910	NC_022241	GCT	2	6	274421	274426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360812
5911	NC_022241	GAT	2	6	274461	274466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360812
5912	NC_022241	A	6	6	274469	274474	100 %	0 %	0 %	0 %	538360812
5913	NC_022241	CGT	2	6	274476	274481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360812
5914	NC_022241	TGA	2	6	274492	274497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360812
5915	NC_022241	AGG	2	6	274535	274540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5916	NC_022241	T	8	8	274558	274565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5917	NC_022241	GCAG	2	8	274661	274668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5918	NC_022241	A	6	6	274704	274709	100 %	0 %	0 %	0 %	538360813
5919	NC_022241	GGC	2	6	274729	274734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360813
5920	NC_022241	GCT	2	6	274774	274779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360813
5921	NC_022241	AGT	2	6	274784	274789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360813
5922	NC_022241	GGC	2	6	274819	274824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360813
5923	NC_022241	GC	3	6	274921	274926	0 %	0 %	50 %	50 %	538360813
5924	NC_022241	GC	4	8	274999	275006	0 %	0 %	50 %	50 %	538360813
5925	NC_022241	CGG	2	6	275052	275057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360813
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5928	NC_022241	CTG	2	6	275405	275410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360813
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5934	NC_022241	GCG	3	9	275607	275615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360813
5935	NC_022241	CTA	2	6	275650	275655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360813
5936	NC_022241	GTGCCG	2	12	275681	275692	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538360813
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5940	NC_022241	GAT	2	6	275912	275917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360813
5941	NC_022241	CG	3	6	275986	275991	0 %	0 %	50 %	50 %	538360813
5942	NC_022241	GCCGG	2	10	275996	276005	0 %	0 %	60 %	40 %	538360813
5943	NC_022241	CGAC	2	8	276054	276061	25 %	0 %	25 %	50 %	538360813
5944	NC_022241	GCC	2	6	276251	276256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360813
5945	NC_022241	ACC	2	6	276278	276283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538360813
5946	NC_022241	AGC	3	9	276299	276307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360813
5947	NC_022241	GCCT	2	8	276397	276404	0 %	25 %	25 %	50 %	538360813
5948	NC_022241	TAA	2	6	276455	276460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360813
5949	NC_022241	T	6	6	276516	276521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5950	NC_022241	CAT	2	6	276538	276543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360814
5951	NC_022241	TAT	2	6	276569	276574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538360814
5952	NC_022241	TTG	2	6	276656	276661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538360814
5953	NC_022241	GCG	2	6	276690	276695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360814
5954	NC_022241	T	6	6	276836	276841	0 %	100 %	0 %	0 %	538360814
5955	NC_022241	GCTG	2	8	276856	276863	0 %	25 %	50 %	25 %	538360814
5956	NC_022241	TCA	2	6	276883	276888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360814
5957	NC_022241	ATA	2	6	276909	276914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538360814
5958	NC_022241	CGC	2	6	276918	276923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360814
5959	NC_022241	AAG	2	6	276954	276959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360814
5960	NC_022241	T	6	6	277040	277045	0 %	100 %	0 %	0 %	538360814
5961	NC_022241	GGC	2	6	277046	277051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360814
5962	NC_022241	GCT	2	6	277099	277104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360814
5963	NC_022241	GTAT	2	8	277215	277222	25 %	50 %	25 %	0 %	538360814
5964	NC_022241	TGA	3	9	277287	277295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360814
5965	NC_022241	CT	3	6	277308	277313	0 %	50 %	0 %	50 %	538360814
5966	NC_022241	CGG	2	6	277348	277353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360814
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5970	NC_022241	ATG	2	6	277712	277717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360814
5971	NC_022241	CGG	2	6	277767	277772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360814
5972	NC_022241	TGC	2	6	277776	277781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360814
5973	NC_022241	GATT	2	8	277800	277807	25 %	50 %	25 %	0 %	538360814
5974	NC_022241	AAG	2	6	277842	277847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538360814
5975	NC_022241	TGA	2	6	277909	277914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360814
5976	NC_022241	GCCGAT	2	12	277961	277972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538360814
5977	NC_022241	GATG	2	8	278023	278030	25 %	25 %	50 %	0 %	538360814
5978	NC_022241	CGC	2	6	278062	278067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538360814
5979	NC_022241	TGG	2	6	278070	278075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360814
5980	NC_022241	GTG	3	9	278099	278107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538360814
5981	NC_022241	A	6	6	278109	278114	100 %	0 %	0 %	0 %	538360814
5982	NC_022241	CTG	2	6	278129	278134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360814
5983	NC_022241	GCT	2	6	278176	278181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360814
5984	NC_022241	TGC	2	6	278349	278354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360814
5985	NC_022241	GAT	2	6	278377	278382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538360814
5986	NC_022241	AGGTG	2	10	278419	278428	20 %	20 %	60 %	0 %	538360814
5987	NC_022241	CTG	2	6	278558	278563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360814
5988	NC_022241	TGCTC	2	10	278565	278574	0 %	40 %	20 %	40 %	538360814
5989	NC_022241	TCA	2	6	278750	278755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360815
5990	NC_022241	TCCCT	2	10	278912	278921	0 %	40 %	0 %	60 %	538360815
5991	NC_022241	T	6	6	279071	279076	0 %	100 %	0 %	0 %	538360815
5992	NC_022241	CT	3	6	279212	279217	0 %	50 %	0 %	50 %	538360816
5993	NC_022241	GCG	2	6	279243	279248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538360816
5994	NC_022241	TCA	2	6	279331	279336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538360816
5995	NC_022241	GC	3	6	279470	279475	0 %	0 %	50 %	50 %	538360816
5996	NC_022241	GCA	2	6	279526	279531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538360816
5997	NC_022241	CTG	2	6	279557	279562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538360816
5998	NC_022241	CCGG	2	8	279584	279591	0 %	0 %	50 %	50 %	538360816
5999	NC_022241	CTT	2	6	279635	279640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538360816
6000	NC_022241	GA	3	6	279652	279657	50 %	0 %	50 %	0 %	538360816

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