MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1 plasmid

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022227	CTA	2	6	266	271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022227	TAG	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022227	GTA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022227	CGA	2	6	360	365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022227	ACG	2	6	440	445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022227	TAA	2	6	556	561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022227	GAA	2	6	682	687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022227	ATT	2	6	817	822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022227	TAT	2	6	870	875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
10	NC_022227	GTT	2	6	886	891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537462573
11	NC_022227	GCT	3	9	892	900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537462573
12	NC_022227	CAG	2	6	917	922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537462573
13	NC_022227	TTA	2	6	928	933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
14	NC_022227	TTA	2	6	940	945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
15	NC_022227	TAT	2	6	1014	1019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
16	NC_022227	ATG	2	6	1133	1138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537462573
17	NC_022227	ATA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537462573
18	NC_022227	TCT	2	6	1328	1333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537462573
19	NC_022227	TTG	2	6	1382	1387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537462573
20	NC_022227	TTA	3	9	1439	1447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462573
21	NC_022227	AGA	2	6	1581	1586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462574
22	NC_022227	TGA	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537462574
23	NC_022227	GAA	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462574
24	NC_022227	AGA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462574
25	NC_022227	CAT	2	6	1732	1737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537462574
26	NC_022227	ATT	2	6	1796	1801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462574
27	NC_022227	TTA	2	6	1802	1807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462574
28	NC_022227	TCT	2	6	1875	1880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022227	TAT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022227	ATA	2	6	2026	2031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022227	ATA	2	6	2055	2060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537462575
32	NC_022227	CTA	2	6	2061	2066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537462575
33	NC_022227	ATA	2	6	2088	2093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537462575
34	NC_022227	AAC	2	6	2124	2129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537462575
35	NC_022227	TGA	2	6	2248	2253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537462575
36	NC_022227	GAA	2	6	2360	2365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462575
37	NC_022227	CAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537462575
38	NC_022227	TTG	2	6	2514	2519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537462575
39	NC_022227	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537462575
40	NC_022227	AAG	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462575
41	NC_022227	ATC	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537462575
42	NC_022227	TGA	4	12	2800	2811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537462575
43	NC_022227	TGG	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537462575
44	NC_022227	TGA	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537462575
45	NC_022227	ACA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537462575
46	NC_022227	GAA	3	9	2972	2980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537462575
47	NC_022227	ATT	3	9	3024	3032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537462575
48	NC_022227	CGA	2	6	3202	3207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.