MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 42437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022226	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022226	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_022226	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022226	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022226	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022226	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
7	NC_022226	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459745
8	NC_022226	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459745
9	NC_022226	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459745
10	NC_022226	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
11	NC_022226	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459745
12	NC_022226	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459745
13	NC_022226	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459745
14	NC_022226	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459745
15	NC_022226	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
16	NC_022226	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459745
17	NC_022226	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459745
18	NC_022226	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
19	NC_022226	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
20	NC_022226	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459745
21	NC_022226	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
22	NC_022226	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459745
23	NC_022226	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
24	NC_022226	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459745
25	NC_022226	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459745
26	NC_022226	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
27	NC_022226	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
28	NC_022226	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459745
29	NC_022226	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459745
30	NC_022226	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459745
31	NC_022226	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
32	NC_022226	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459745
33	NC_022226	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
34	NC_022226	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459745
35	NC_022226	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022226	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_022226	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022226	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
39	NC_022226	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
40	NC_022226	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459746
41	NC_022226	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
42	NC_022226	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459746
43	NC_022226	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
44	NC_022226	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459746
45	NC_022226	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459746
46	NC_022226	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459746
47	NC_022226	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459746
48	NC_022226	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
49	NC_022226	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459746
50	NC_022226	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
51	NC_022226	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459746
52	NC_022226	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459746
53	NC_022226	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
54	NC_022226	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459746
55	NC_022226	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459746
56	NC_022226	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459746
57	NC_022226	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459746
58	NC_022226	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459746
59	NC_022226	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459746
60	NC_022226	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459746
61	NC_022226	AAT	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022226	TAA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022226	ATT	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459747
64	NC_022226	AAG	2	6	3692	3697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459747
65	NC_022226	GTA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459747
66	NC_022226	ATT	2	6	3748	3753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459747
67	NC_022226	TGG	2	6	3759	3764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459747
68	NC_022226	ATG	2	6	3958	3963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459748
69	NC_022226	GTC	2	6	4222	4227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459748
70	NC_022226	AGA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459748
71	NC_022226	CTC	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537459748
72	NC_022226	GAC	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459748
73	NC_022226	CTG	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459748
74	NC_022226	AAT	2	6	4398	4403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459748
75	NC_022226	CAG	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459748
76	NC_022226	AAG	2	6	4570	4575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459748
77	NC_022226	ATT	2	6	4588	4593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459748
78	NC_022226	GAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459748
79	NC_022226	ATA	2	6	4666	4671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459748
80	NC_022226	GAT	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459748
81	NC_022226	TTA	3	9	4854	4862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459748
82	NC_022226	GAT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459748
83	NC_022226	TTA	2	6	4905	4910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459748
84	NC_022226	ACA	2	6	5065	5070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459749
85	NC_022226	ATA	2	6	5197	5202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459749
86	NC_022226	GTT	2	6	5244	5249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459749
87	NC_022226	TGG	2	6	5363	5368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459749
88	NC_022226	TGG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459749
89	NC_022226	TCA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459749
90	NC_022226	TCA	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459749
91	NC_022226	AAG	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
92	NC_022226	CAG	2	6	5625	5630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459749
93	NC_022226	TGA	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459749
94	NC_022226	AGA	2	6	5708	5713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
95	NC_022226	ATG	2	6	5782	5787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459749
96	NC_022226	TCA	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459749
97	NC_022226	GAT	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459749
98	NC_022226	GGT	2	6	5904	5909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459749
99	NC_022226	AGA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
100	NC_022226	ATT	2	6	6125	6130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
101	NC_022226	TAT	2	6	6197	6202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
102	NC_022226	GGC	2	6	6203	6208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537459749
103	NC_022226	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459749
104	NC_022226	CGT	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459749
105	NC_022226	GAA	2	6	6318	6323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
106	NC_022226	TTA	2	6	6597	6602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
107	NC_022226	TTC	2	6	6606	6611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459749
108	NC_022226	TAT	2	6	6699	6704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459749
109	NC_022226	ACA	2	6	6819	6824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459749
110	NC_022226	TGT	2	6	6911	6916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459749
111	NC_022226	AGA	2	6	6938	6943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459749
112	NC_022226	AGG	2	6	6997	7002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537459750
113	NC_022226	TCG	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459750
114	NC_022226	TTG	2	6	7318	7323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459750
115	NC_022226	GCA	3	9	7362	7370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459750
116	NC_022226	TAA	2	6	7427	7432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459750
117	NC_022226	ATG	2	6	7459	7464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
118	NC_022226	CCA	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537459750
119	NC_022226	GGA	2	6	7640	7645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537459750
120	NC_022226	CTG	2	6	7669	7674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459750
121	NC_022226	GAA	2	6	7758	7763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459750
122	NC_022226	TTG	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459750
123	NC_022226	TGA	2	6	7889	7894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
124	NC_022226	CAT	2	6	7996	8001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459750
125	NC_022226	TTA	2	6	8044	8049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459750
126	NC_022226	AAG	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459750
127	NC_022226	ATT	2	6	8071	8076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459750
128	NC_022226	GTT	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459750
129	NC_022226	AGA	2	6	8100	8105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459750
130	NC_022226	ATT	2	6	8190	8195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459750
131	NC_022226	CAA	2	6	8244	8249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459750
132	NC_022226	TTA	2	6	8352	8357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459750
133	NC_022226	TGA	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
134	NC_022226	TTA	2	6	8403	8408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459750
135	NC_022226	TGA	2	6	8453	8458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
136	NC_022226	TCG	2	6	8459	8464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459750
137	NC_022226	AGA	2	6	8519	8524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459750
138	NC_022226	ATA	2	6	8548	8553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459750
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140	NC_022226	GTG	2	6	8608	8613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459750
141	NC_022226	GAA	2	6	8634	8639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459750
142	NC_022226	ATG	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
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144	NC_022226	GTG	2	6	8872	8877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459750
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150	NC_022226	TAG	2	6	9157	9162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
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154	NC_022226	GCA	2	6	9375	9380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459750
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159	NC_022226	ATG	2	6	9535	9540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
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161	NC_022226	ATG	2	6	9589	9594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459750
162	NC_022226	GAA	2	6	9639	9644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459750
163	NC_022226	ACA	2	6	9650	9655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459750
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165	NC_022226	TAC	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_022226	TGG	2	6	9819	9824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459751
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179	NC_022226	ATT	2	6	10745	10750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_022226	TAT	2	6	14348	14353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_022226	AAC	2	6	14515	14520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_022226	TAT	2	6	14684	14689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_022226	AGG	2	6	14723	14728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537459754
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257	NC_022226	ATT	2	6	15319	15324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459754
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371	NC_022226	GAT	2	6	22205	22210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_022226	GAC	2	6	30822	30827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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