MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus CN1

Total Repeats: 65773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022226	ACA	2	6	20255	20260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459758
502	NC_022226	TAAAGG	2	12	20323	20334	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	537459759
503	NC_022226	A	6	6	20336	20341	100 %	0 %	0 %	0 %	537459759
504	NC_022226	AAG	2	6	20352	20357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459759
505	NC_022226	CTT	2	6	20380	20385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459759
506	NC_022226	A	6	6	20447	20452	100 %	0 %	0 %	0 %	537459759
507	NC_022226	CAA	2	6	20471	20476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459759
508	NC_022226	GTT	2	6	20560	20565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459759
509	NC_022226	AGTA	2	8	20572	20579	50 %	25 %	25 %	0 %	537459759
510	NC_022226	CATT	2	8	20660	20667	25 %	50 %	0 %	25 %	537459759
511	NC_022226	AAG	2	6	20700	20705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459759
512	NC_022226	AC	3	6	20725	20730	50 %	0 %	0 %	50 %	537459759
513	NC_022226	GTCT	2	8	20828	20835	0 %	50 %	25 %	25 %	537459760
514	NC_022226	ATT	2	6	20844	20849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459760
515	NC_022226	TAC	2	6	20870	20875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459760
516	NC_022226	ATG	2	6	20937	20942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459760
517	NC_022226	ATA	2	6	20956	20961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459760
518	NC_022226	TGT	2	6	20972	20977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459760
519	NC_022226	TGAA	2	8	21013	21020	50 %	25 %	25 %	0 %	537459760
520	NC_022226	ACG	2	6	21066	21071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459760
521	NC_022226	TAT	2	6	21084	21089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459760
522	NC_022226	GCAT	2	8	21107	21114	25 %	25 %	25 %	25 %	537459760
523	NC_022226	GATT	2	8	21124	21131	25 %	50 %	25 %	0 %	537459760
524	NC_022226	ATG	2	6	21154	21159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459760
525	NC_022226	ATG	2	6	21166	21171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459760
526	NC_022226	ATC	2	6	21224	21229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459760
527	NC_022226	CAG	2	6	21364	21369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537459760
528	NC_022226	GGTA	2	8	21614	21621	25 %	25 %	50 %	0 %	537459760
529	NC_022226	TGA	2	6	21647	21652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459760
530	NC_022226	GTC	2	6	21691	21696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459760
531	NC_022226	TGATTG	2	12	21724	21735	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	537459760
532	NC_022226	ACT	2	6	21736	21741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459760
533	NC_022226	ACA	2	6	21785	21790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459760
534	NC_022226	TC	3	6	21805	21810	0 %	50 %	0 %	50 %	537459760
535	NC_022226	GTG	2	6	21874	21879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459760
536	NC_022226	AAC	2	6	21883	21888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459760
537	NC_022226	ATG	2	6	21906	21911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459760
538	NC_022226	TGA	2	6	21974	21979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459760
539	NC_022226	GTG	2	6	21991	21996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459760
540	NC_022226	GAT	2	6	22005	22010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459760
541	NC_022226	GAT	2	6	22014	22019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459760
542	NC_022226	GGT	2	6	22020	22025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459760
543	NC_022226	ATG	2	6	22042	22047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459760
544	NC_022226	TGAAAT	2	12	22055	22066	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	537459760
545	NC_022226	AGTTA	2	10	22103	22112	40 %	40 %	20 %	0 %	537459760
546	NC_022226	ATA	2	6	22129	22134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459760
547	NC_022226	ATG	2	6	22167	22172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459760
548	NC_022226	A	7	7	22174	22180	100 %	0 %	0 %	0 %	537459760
549	NC_022226	AAT	2	6	22193	22198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_022226	GAT	2	6	22205	22210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_022226	AT	3	6	22248	22253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022226	TCA	2	6	22457	22462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459761
553	NC_022226	GTA	2	6	22466	22471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459761
554	NC_022226	AAGGAA	2	12	22494	22505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459761
555	NC_022226	CG	3	6	22543	22548	0 %	0 %	50 %	50 %	537459761
556	NC_022226	GGT	2	6	22556	22561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537459761
557	NC_022226	AAT	2	6	22562	22567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459761
558	NC_022226	GTT	2	6	22670	22675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459761
559	NC_022226	GAA	2	6	22799	22804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459761
560	NC_022226	A	6	6	22838	22843	100 %	0 %	0 %	0 %	537459761
561	NC_022226	ATT	2	6	22927	22932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459761
562	NC_022226	CAT	2	6	22992	22997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459761
563	NC_022226	TGA	2	6	22999	23004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459761
564	NC_022226	GAA	2	6	23012	23017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459761
565	NC_022226	TGC	2	6	23023	23028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459761
566	NC_022226	ATT	2	6	23293	23298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459761
567	NC_022226	CAT	2	6	23312	23317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537459761
568	NC_022226	ACA	3	9	23345	23353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459761
569	NC_022226	CGT	2	6	23363	23368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459761
570	NC_022226	GGTT	2	8	23372	23379	0 %	50 %	50 %	0 %	537459761
571	NC_022226	TCG	2	6	23404	23409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459761
572	NC_022226	AGA	2	6	23584	23589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459761
573	NC_022226	AGA	2	6	23611	23616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459761
574	NC_022226	ATGTA	2	10	23662	23671	40 %	40 %	20 %	0 %	537459761
575	NC_022226	TCT	2	6	23682	23687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537459761
576	NC_022226	AACA	2	8	23706	23713	75 %	0 %	0 %	25 %	537459761
577	NC_022226	TA	3	6	23743	23748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_022226	AGG	2	6	23797	23802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_022226	TCGAT	2	10	23826	23835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
580	NC_022226	GAT	2	6	23896	23901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_022226	AAG	2	6	23915	23920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_022226	TAA	2	6	23934	23939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_022226	ATT	2	6	24027	24032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_022226	ATA	2	6	24033	24038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_022226	TTC	2	6	24078	24083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_022226	A	6	6	24084	24089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_022226	A	6	6	24107	24112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_022226	ATCT	2	8	24145	24152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
589	NC_022226	CGG	2	6	24203	24208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_022226	T	6	6	24241	24246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_022226	GCCT	2	8	24273	24280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
592	NC_022226	T	7	7	24349	24355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_022226	ATATT	2	10	24363	24372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_022226	AT	3	6	24381	24386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_022226	TTA	2	6	24498	24503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_022226	TTC	2	6	24535	24540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_022226	CCA	2	6	24552	24557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_022226	TCC	2	6	24559	24564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_022226	AAT	2	6	24596	24601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_022226	ATTT	2	8	24605	24612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_022226	TAT	2	6	24657	24662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_022226	TCA	2	6	24676	24681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_022226	CCG	2	6	24707	24712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_022226	TAA	2	6	24721	24726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022226	A	6	6	24725	24730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022226	AT	3	6	24736	24741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022226	TA	3	6	24787	24792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022226	T	6	6	24861	24866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022226	A	6	6	24891	24896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022226	ATA	2	6	24904	24909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022226	GTT	2	6	24952	24957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537459762
612	NC_022226	TGA	3	9	24963	24971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459762
613	NC_022226	A	7	7	25005	25011	100 %	0 %	0 %	0 %	537459762
614	NC_022226	GAA	3	9	25069	25077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459762
615	NC_022226	TAT	2	6	25088	25093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459762
616	NC_022226	A	6	6	25147	25152	100 %	0 %	0 %	0 %	537459762
617	NC_022226	CGT	2	6	25291	25296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459762
618	NC_022226	A	6	6	25387	25392	100 %	0 %	0 %	0 %	537459762
619	NC_022226	TGAATT	2	12	25422	25433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	537459762
620	NC_022226	ATT	2	6	25439	25444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459762
621	NC_022226	TTA	2	6	25483	25488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459762
622	NC_022226	GTAC	2	8	25522	25529	25 %	25 %	25 %	25 %	537459762
623	NC_022226	TCG	2	6	25545	25550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459762
624	NC_022226	GAT	2	6	25570	25575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537459762
625	NC_022226	AT	3	6	25590	25595	50 %	50 %	0 %	0 %	537459762
626	NC_022226	TCC	2	6	25622	25627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537459762
627	NC_022226	AAC	2	6	25628	25633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459762
628	NC_022226	AAC	2	6	25667	25672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537459763
629	NC_022226	AAT	2	6	25756	25761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537459763
630	NC_022226	GCT	2	6	25773	25778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537459763
631	NC_022226	AAG	2	6	25789	25794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459763
632	NC_022226	TTA	2	6	25888	25893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459763
633	NC_022226	ATT	3	9	25951	25959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537459763
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745	NC_022226	A	6	6	30900	30905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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747	NC_022226	ATCA	2	8	30947	30954	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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755	NC_022226	GAA	2	6	31202	31207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537459767
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757	NC_022226	ATCAGC	2	12	31222	31233	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537459767
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