MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 9232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022221	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022221	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
3	NC_022221	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	537435371
4	NC_022221	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	537435371
5	NC_022221	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
6	NC_022221	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	537435371
7	NC_022221	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	537435371
8	NC_022221	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
9	NC_022221	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	537435371
10	NC_022221	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	537435372
11	NC_022221	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	537435372
12	NC_022221	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	537435373
13	NC_022221	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	537435373
14	NC_022221	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	537435374
15	NC_022221	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	537435374
16	NC_022221	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	537435374
17	NC_022221	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	537435374
18	NC_022221	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	537435375
19	NC_022221	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	537435375
20	NC_022221	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	537435376
21	NC_022221	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	537435376
22	NC_022221	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	537435376
23	NC_022221	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	537435376
24	NC_022221	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	537435376
25	NC_022221	TG	3	6	8901	8906	0 %	50 %	50 %	0 %	537435377
26	NC_022221	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	537435378
27	NC_022221	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	537435379
28	NC_022221	CG	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	537435381
29	NC_022221	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	537435382
30	NC_022221	GA	3	6	14662	14667	50 %	0 %	50 %	0 %	537435382
31	NC_022221	AT	3	6	15374	15379	50 %	50 %	0 %	0 %	537435384
32	NC_022221	AT	3	6	15649	15654	50 %	50 %	0 %	0 %	537435384
33	NC_022221	AT	3	6	15902	15907	50 %	50 %	0 %	0 %	537435384
34	NC_022221	GA	3	6	17066	17071	50 %	0 %	50 %	0 %	537435387
35	NC_022221	GC	3	6	18368	18373	0 %	0 %	50 %	50 %	537435388
36	NC_022221	CT	3	6	20342	20347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022221	GC	3	6	20658	20663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022221	GC	3	6	20778	20783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_022221	GC	3	6	21183	21188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_022221	GC	3	6	22041	22046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022221	CT	3	6	22796	22801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022221	AT	3	6	23584	23589	50 %	50 %	0 %	0 %	537435389
43	NC_022221	CG	3	6	23654	23659	0 %	0 %	50 %	50 %	537435389
44	NC_022221	GC	4	8	23797	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	537435389
45	NC_022221	AT	3	6	24058	24063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022221	CG	3	6	25066	25071	0 %	0 %	50 %	50 %	537435391
47	NC_022221	CT	3	6	25352	25357	0 %	50 %	0 %	50 %	537435391
48	NC_022221	AT	3	6	25382	25387	50 %	50 %	0 %	0 %	537435391
49	NC_022221	GC	3	6	26085	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
50	NC_022221	CG	3	6	28015	28020	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
51	NC_022221	GC	3	6	28143	28148	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
52	NC_022221	GC	3	6	28179	28184	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
53	NC_022221	GT	3	6	28357	28362	0 %	50 %	50 %	0 %	537435392
54	NC_022221	TC	3	6	28375	28380	0 %	50 %	0 %	50 %	537435392
55	NC_022221	GT	3	6	28622	28627	0 %	50 %	50 %	0 %	537435393
56	NC_022221	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	537435395
57	NC_022221	CG	3	6	30168	30173	0 %	0 %	50 %	50 %	537435395
58	NC_022221	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	537435395
59	NC_022221	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	537435395
60	NC_022221	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022221	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	537435396
62	NC_022221	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	537435396
63	NC_022221	GT	3	6	33040	33045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022221	CA	3	6	33218	33223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_022221	TC	3	6	33484	33489	0 %	50 %	0 %	50 %	537435400
66	NC_022221	AT	3	6	33734	33739	50 %	50 %	0 %	0 %	537435400
67	NC_022221	TA	3	6	33937	33942	50 %	50 %	0 %	0 %	537435400
68	NC_022221	AT	3	6	34433	34438	50 %	50 %	0 %	0 %	537435401
69	NC_022221	AT	3	6	34694	34699	50 %	50 %	0 %	0 %	537435401
70	NC_022221	AT	3	6	35440	35445	50 %	50 %	0 %	0 %	537435403
71	NC_022221	TG	4	8	35655	35662	0 %	50 %	50 %	0 %	537435403
72	NC_022221	GC	3	6	36248	36253	0 %	0 %	50 %	50 %	537435403
73	NC_022221	TA	3	6	37198	37203	50 %	50 %	0 %	0 %	537435404
74	NC_022221	GC	3	6	37965	37970	0 %	0 %	50 %	50 %	537435404
75	NC_022221	AT	3	6	39514	39519	50 %	50 %	0 %	0 %	537435405
76	NC_022221	AT	3	6	39830	39835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022221	AT	3	6	39945	39950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022221	AT	4	8	40031	40038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022221	AT	3	6	40085	40090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022221	CG	3	6	40373	40378	0 %	0 %	50 %	50 %	537435406
81	NC_022221	CG	3	6	41061	41066	0 %	0 %	50 %	50 %	537435406
82	NC_022221	GT	3	6	41767	41772	0 %	50 %	50 %	0 %	537435407
83	NC_022221	TG	3	6	42797	42802	0 %	50 %	50 %	0 %	537435407
84	NC_022221	CG	3	6	43312	43317	0 %	0 %	50 %	50 %	537435408
85	NC_022221	TA	3	6	43685	43690	50 %	50 %	0 %	0 %	537435408
86	NC_022221	CA	3	6	44706	44711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022221	CA	3	6	44998	45003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_022221	GC	3	6	45701	45706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_022221	TA	3	6	46106	46111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022221	GA	3	6	46173	46178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022221	TA	3	6	46805	46810	50 %	50 %	0 %	0 %	537435409
92	NC_022221	TG	3	6	47186	47191	0 %	50 %	50 %	0 %	537435409
93	NC_022221	GC	4	8	47325	47332	0 %	0 %	50 %	50 %	537435409
94	NC_022221	GA	3	6	47407	47412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022221	GA	3	6	48239	48244	50 %	0 %	50 %	0 %	537435410
96	NC_022221	CG	4	8	49306	49313	0 %	0 %	50 %	50 %	537435411
97	NC_022221	CG	3	6	49519	49524	0 %	0 %	50 %	50 %	537435411
98	NC_022221	TG	3	6	50137	50142	0 %	50 %	50 %	0 %	537435411
99	NC_022221	GC	3	6	51204	51209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022221	GC	3	6	52507	52512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_022221	GT	3	6	52914	52919	0 %	50 %	50 %	0 %	537435414
102	NC_022221	CG	3	6	53260	53265	0 %	0 %	50 %	50 %	537435414
103	NC_022221	CG	3	6	54348	54353	0 %	0 %	50 %	50 %	537435415
104	NC_022221	GC	3	6	55021	55026	0 %	0 %	50 %	50 %	537435415
105	NC_022221	CG	3	6	55095	55100	0 %	0 %	50 %	50 %	537435415
106	NC_022221	CG	3	6	55829	55834	0 %	0 %	50 %	50 %	537435415
107	NC_022221	CG	3	6	56084	56089	0 %	0 %	50 %	50 %	537435415
108	NC_022221	GC	3	6	57003	57008	0 %	0 %	50 %	50 %	537435416
109	NC_022221	GC	3	6	57879	57884	0 %	0 %	50 %	50 %	537435418
110	NC_022221	GC	4	8	58109	58116	0 %	0 %	50 %	50 %	537435418
111	NC_022221	CT	3	6	59099	59104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_022221	TG	3	6	60718	60723	0 %	50 %	50 %	0 %	537435421
113	NC_022221	TC	3	6	61122	61127	0 %	50 %	0 %	50 %	537435422
114	NC_022221	GC	3	6	62384	62389	0 %	0 %	50 %	50 %	537435423
115	NC_022221	AT	3	6	63059	63064	50 %	50 %	0 %	0 %	537435423
116	NC_022221	GC	4	8	64115	64122	0 %	0 %	50 %	50 %	537435424
117	NC_022221	GC	3	6	64580	64585	0 %	0 %	50 %	50 %	537435424
118	NC_022221	CG	3	6	66315	66320	0 %	0 %	50 %	50 %	537435425
119	NC_022221	AT	3	6	68146	68151	50 %	50 %	0 %	0 %	537435427
120	NC_022221	GC	3	6	69025	69030	0 %	0 %	50 %	50 %	537435428
121	NC_022221	GC	3	6	69599	69604	0 %	0 %	50 %	50 %	537435428
122	NC_022221	AC	3	6	69651	69656	50 %	0 %	0 %	50 %	537435428
123	NC_022221	AG	3	6	69797	69802	50 %	0 %	50 %	0 %	537435429
124	NC_022221	CG	3	6	69876	69881	0 %	0 %	50 %	50 %	537435429
125	NC_022221	GC	3	6	69904	69909	0 %	0 %	50 %	50 %	537435429
126	NC_022221	CG	3	6	70457	70462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022221	CG	3	6	70737	70742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022221	TG	3	6	71378	71383	0 %	50 %	50 %	0 %	537435430
129	NC_022221	GC	3	6	71889	71894	0 %	0 %	50 %	50 %	537435430
130	NC_022221	TG	3	6	72038	72043	0 %	50 %	50 %	0 %	537435430
131	NC_022221	GC	3	6	72196	72201	0 %	0 %	50 %	50 %	537435430
132	NC_022221	GC	3	6	72373	72378	0 %	0 %	50 %	50 %	537435431
133	NC_022221	CG	3	6	73234	73239	0 %	0 %	50 %	50 %	537435432
134	NC_022221	GC	3	6	73380	73385	0 %	0 %	50 %	50 %	537435432
135	NC_022221	TC	3	6	73767	73772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_022221	GC	3	6	73876	73881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022221	AT	3	6	74811	74816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_022221	CT	3	6	75904	75909	0 %	50 %	0 %	50 %	537435436
139	NC_022221	GC	3	6	77072	77077	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
140	NC_022221	CG	3	6	77208	77213	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
141	NC_022221	CG	3	6	77684	77689	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
142	NC_022221	GC	5	10	78730	78739	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
143	NC_022221	GC	3	6	79375	79380	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
144	NC_022221	GC	3	6	79874	79879	0 %	0 %	50 %	50 %	537435437
145	NC_022221	TG	3	6	80281	80286	0 %	50 %	50 %	0 %	537435438
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