MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022221	GCG	2	6	469493	469498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435760
10002	NC_022221	GATG	2	8	469588	469595	25 %	25 %	50 %	0 %	537435760
10003	NC_022221	CA	3	6	469614	469619	50 %	0 %	0 %	50 %	537435760
10004	NC_022221	A	6	6	469674	469679	100 %	0 %	0 %	0 %	537435760
10005	NC_022221	GCC	2	6	469681	469686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435760
10006	NC_022221	GCC	2	6	469727	469732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435760
10007	NC_022221	TG	3	6	469756	469761	0 %	50 %	50 %	0 %	537435760
10008	NC_022221	GTC	2	6	469777	469782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435760
10009	NC_022221	TGC	2	6	469794	469799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435760
10010	NC_022221	GC	3	6	469798	469803	0 %	0 %	50 %	50 %	537435760
10011	NC_022221	GTC	2	6	469846	469851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435760
10012	NC_022221	TGC	2	6	469863	469868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435760
10013	NC_022221	GTA	2	6	469910	469915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435760
10014	NC_022221	CGG	2	6	469926	469931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435760
10015	NC_022221	CG	3	6	469995	470000	0 %	0 %	50 %	50 %	537435760
10016	NC_022221	GCA	2	6	470059	470064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435760
10017	NC_022221	CGC	2	6	470128	470133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435760
10018	NC_022221	CGC	2	6	470149	470154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435760
10019	NC_022221	TGA	2	6	470196	470201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435760
10020	NC_022221	CGC	2	6	470298	470303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435760
10021	NC_022221	TGG	2	6	470355	470360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435760
10022	NC_022221	AC	4	8	470404	470411	50 %	0 %	0 %	50 %	537435760
10023	NC_022221	TGAA	2	8	470416	470423	50 %	25 %	25 %	0 %	537435760
10024	NC_022221	CGATG	2	10	470519	470528	20 %	20 %	40 %	20 %	537435761
10025	NC_022221	CG	4	8	470537	470544	0 %	0 %	50 %	50 %	537435761
10026	NC_022221	GGC	2	6	470609	470614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435761
10027	NC_022221	GCG	2	6	470646	470651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435761
10028	NC_022221	GAA	2	6	470709	470714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435761
10029	NC_022221	GC	3	6	470798	470803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_022221	GTC	2	6	470878	470883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435762
10031	NC_022221	TGG	2	6	470942	470947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435762
10032	NC_022221	CTG	2	6	471031	471036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435762
10033	NC_022221	CG	3	6	471051	471056	0 %	0 %	50 %	50 %	537435762
10034	NC_022221	TCG	2	6	471107	471112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435762
10035	NC_022221	GTG	2	6	471118	471123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435762
10036	NC_022221	CAT	2	6	471161	471166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435763
10037	NC_022221	GGT	2	6	471188	471193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435763
10038	NC_022221	TGC	2	6	471202	471207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435763
10039	NC_022221	CAG	2	6	471221	471226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435763
10040	NC_022221	GGC	2	6	471284	471289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435763
10041	NC_022221	CAG	2	6	471303	471308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435763
10042	NC_022221	GC	3	6	471456	471461	0 %	0 %	50 %	50 %	537435763
10043	NC_022221	GTG	2	6	471546	471551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435763
10044	NC_022221	CCA	2	6	471568	471573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435763
10045	NC_022221	GGC	2	6	471578	471583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435763
10046	NC_022221	TAA	2	6	471593	471598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435763
10047	NC_022221	CGT	2	6	471629	471634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435763
10048	NC_022221	CGG	2	6	471649	471654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435763
10049	NC_022221	TC	3	6	471664	471669	0 %	50 %	0 %	50 %	537435763
10050	NC_022221	CTC	2	6	471684	471689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435763
10051	NC_022221	GGT	2	6	471698	471703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435763
10052	NC_022221	CGC	2	6	471704	471709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435763
10053	NC_022221	GTT	2	6	471770	471775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435763
10054	NC_022221	CTG	2	6	471795	471800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435763
10055	NC_022221	GTG	2	6	471801	471806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435763
10056	NC_022221	GGC	2	6	471810	471815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435763
10057	NC_022221	GGT	2	6	471821	471826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435763
10058	NC_022221	GC	3	6	471834	471839	0 %	0 %	50 %	50 %	537435763
10059	NC_022221	TAA	2	6	471848	471853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435763
10060	NC_022221	GCC	2	6	471864	471869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435763
10061	NC_022221	GGT	3	9	471887	471895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435763
10062	NC_022221	CCG	2	6	471904	471909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435763
10063	NC_022221	CG	3	6	471916	471921	0 %	0 %	50 %	50 %	537435763
10064	NC_022221	AAC	2	6	471957	471962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435763
10065	NC_022221	ATC	2	6	471963	471968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435763
10066	NC_022221	CGA	2	6	471974	471979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435763
10067	NC_022221	TGG	2	6	471994	471999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435763
10068	NC_022221	CGA	2	6	472010	472015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435763
10069	NC_022221	CCG	2	6	472057	472062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435763
10070	NC_022221	TGC	2	6	472087	472092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435763
10071	NC_022221	GAA	2	6	472094	472099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435763
10072	NC_022221	GTCG	2	8	472140	472147	0 %	25 %	50 %	25 %	537435763
10073	NC_022221	CTG	2	6	472203	472208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435763
10074	NC_022221	ATG	3	9	472251	472259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435763
10075	NC_022221	GGT	2	6	472271	472276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435763
10076	NC_022221	GAA	2	6	472293	472298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435763
10077	NC_022221	CCA	2	6	472334	472339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435763
10078	NC_022221	CGG	2	6	472342	472347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435763
10079	NC_022221	ACA	2	6	472369	472374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435763
10080	NC_022221	ACC	2	6	472464	472469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435763
10081	NC_022221	TGG	2	6	472543	472548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435763
10082	NC_022221	ACG	2	6	472586	472591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435764
10083	NC_022221	AAC	2	6	472592	472597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435764
10084	NC_022221	GCG	2	6	472624	472629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435764
10085	NC_022221	CGCC	2	8	472646	472653	0 %	0 %	25 %	75 %	537435764
10086	NC_022221	CGC	2	6	472664	472669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435764
10087	NC_022221	GTG	2	6	472702	472707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435764
10088	NC_022221	TGG	2	6	472712	472717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435764
10089	NC_022221	TTC	2	6	472792	472797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435764
10090	NC_022221	GCC	2	6	472817	472822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435764
10091	NC_022221	CAG	2	6	472840	472845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435764
10092	NC_022221	CTG	2	6	472925	472930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435764
10093	NC_022221	CGG	2	6	472964	472969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435764
10094	NC_022221	CTG	2	6	472978	472983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435764
10095	NC_022221	GTG	2	6	473002	473007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435764
10096	NC_022221	GGC	3	9	473014	473022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435764
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10098	NC_022221	GCA	2	6	473156	473161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435764
10099	NC_022221	TCG	2	6	473216	473221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435764
10100	NC_022221	TGGC	2	8	473257	473264	0 %	25 %	50 %	25 %	537435764
10101	NC_022221	GCA	2	6	473340	473345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435764
10102	NC_022221	CCG	2	6	473486	473491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435765
10103	NC_022221	AAGCGC	2	12	473535	473546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435765
10104	NC_022221	CGC	2	6	473607	473612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435765
10105	NC_022221	GCG	2	6	473696	473701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435765
10106	NC_022221	GGC	2	6	473719	473724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435765
10107	NC_022221	GGC	2	6	473747	473752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435765
10108	NC_022221	CTG	2	6	473786	473791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435765
10109	NC_022221	ACC	2	6	473873	473878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435765
10110	NC_022221	ACC	2	6	473897	473902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435765
10111	NC_022221	TGC	2	6	473989	473994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435765
10112	NC_022221	GC	3	6	474072	474077	0 %	0 %	50 %	50 %	537435765
10113	NC_022221	ACGCC	2	10	474081	474090	20 %	0 %	20 %	60 %	537435765
10114	NC_022221	GAT	2	6	474124	474129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435765
10115	NC_022221	GGC	2	6	474172	474177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435765
10116	NC_022221	TGT	2	6	474189	474194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435765
10117	NC_022221	CCT	2	6	474198	474203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435765
10118	NC_022221	CCAG	2	8	474262	474269	25 %	0 %	25 %	50 %	537435765
10119	NC_022221	GCG	2	6	474272	474277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435765
10120	NC_022221	GGCCA	2	10	474293	474302	20 %	0 %	40 %	40 %	537435765
10121	NC_022221	TGC	2	6	474309	474314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435765
10122	NC_022221	TCGG	2	8	474369	474376	0 %	25 %	50 %	25 %	537435765
10123	NC_022221	GAGC	2	8	474424	474431	25 %	0 %	50 %	25 %	537435765
10124	NC_022221	GGCT	2	8	474459	474466	0 %	25 %	50 %	25 %	537435765
10125	NC_022221	GGA	2	6	474517	474522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435765
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10128	NC_022221	CAT	2	6	474741	474746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435766
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10130	NC_022221	CGG	2	6	474795	474800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435766
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10132	NC_022221	GGC	2	6	474847	474852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435766
10133	NC_022221	GC	3	6	474881	474886	0 %	0 %	50 %	50 %	537435766
10134	NC_022221	TTA	2	6	474950	474955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435766
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10139	NC_022221	GAT	2	6	475101	475106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435766
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10148	NC_022221	TGC	2	6	475562	475567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435766
10149	NC_022221	TGA	2	6	475619	475624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435766
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10183	NC_022221	CTGG	2	8	476918	476925	0 %	25 %	50 %	25 %	537435767
10184	NC_022221	AGGC	2	8	477000	477007	25 %	0 %	50 %	25 %	537435767
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10188	NC_022221	CTG	2	6	477150	477155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435767
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10191	NC_022221	CGGTGA	2	12	477307	477318	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537435767
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10204	NC_022221	GC	3	6	478295	478300	0 %	0 %	50 %	50 %	537435768
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10209	NC_022221	GCCGAC	2	12	478457	478468	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537435768
10210	NC_022221	TGA	2	6	478488	478493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435768
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10212	NC_022221	CGA	2	6	478543	478548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435768
10213	NC_022221	CAT	2	6	478549	478554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435768
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10215	NC_022221	CCGT	2	8	478593	478600	0 %	25 %	25 %	50 %	537435768
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10217	NC_022221	GTC	2	6	478671	478676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435768
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10219	NC_022221	TTC	2	6	478706	478711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435768
10220	NC_022221	TGA	2	6	478712	478717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435768
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10222	NC_022221	GCGCC	2	10	478842	478851	0 %	0 %	40 %	60 %	537435769
10223	NC_022221	GC	3	6	478869	478874	0 %	0 %	50 %	50 %	537435769
10224	NC_022221	AAG	2	6	479064	479069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435769
10225	NC_022221	GCT	2	6	479098	479103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435769
10226	NC_022221	CGT	2	6	479162	479167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435769
10227	NC_022221	TGA	2	6	479208	479213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435769
10228	NC_022221	CT	3	6	479246	479251	0 %	50 %	0 %	50 %	537435769
10229	NC_022221	GCC	2	6	479287	479292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435769
10230	NC_022221	GCT	2	6	479293	479298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435769
10231	NC_022221	GTC	2	6	479402	479407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435769
10232	NC_022221	CTG	2	6	479411	479416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435769
10233	NC_022221	CG	3	6	479478	479483	0 %	0 %	50 %	50 %	537435769
10234	NC_022221	ACC	2	6	479489	479494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435769
10235	NC_022221	TCA	2	6	479527	479532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435769
10236	NC_022221	G	7	7	479533	479539	0 %	0 %	100 %	0 %	537435769
10237	NC_022221	CGC	2	6	479541	479546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435769
10238	NC_022221	GCC	3	9	479555	479563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435769
10239	NC_022221	CAT	2	6	479635	479640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10240	NC_022221	TCA	2	6	479754	479759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10241	NC_022221	TGA	2	6	479770	479775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10242	NC_022221	TGG	2	6	479817	479822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_022221	AGT	2	6	479824	479829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_022221	GGC	2	6	479854	479859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10245	NC_022221	CGG	2	6	479916	479921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10246	NC_022221	GC	3	6	479926	479931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10247	NC_022221	CGGCG	2	10	479965	479974	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10248	NC_022221	TGG	2	6	480090	480095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10252	NC_022221	GCGT	2	8	480289	480296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10268	NC_022221	AGA	2	6	480845	480850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10299	NC_022221	GCAG	2	8	482602	482609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10302	NC_022221	GCG	2	6	482793	482798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10316	NC_022221	TGG	2	6	483291	483296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10320	NC_022221	CCG	2	6	483446	483451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10322	NC_022221	ATC	2	6	483550	483555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10344	NC_022221	GGC	2	6	484433	484438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435774
10345	NC_022221	TATCG	2	10	484512	484521	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10346	NC_022221	ACG	2	6	484533	484538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10347	NC_022221	TGA	2	6	484544	484549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10348	NC_022221	TTTCA	2	10	484563	484572	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10349	NC_022221	T	6	6	484599	484604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10350	NC_022221	CTG	2	6	484754	484759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435775
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10352	NC_022221	GTC	2	6	484847	484852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435775
10353	NC_022221	A	8	8	484962	484969	100 %	0 %	0 %	0 %	537435775
10354	NC_022221	GAT	2	6	485012	485017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435775
10355	NC_022221	ACG	2	6	485019	485024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435775
10356	NC_022221	TGAAGA	2	12	485095	485106	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	537435775
10357	NC_022221	ATG	2	6	485131	485136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435776
10358	NC_022221	TTCTG	2	10	485161	485170	0 %	60 %	20 %	20 %	537435776
10359	NC_022221	GC	4	8	485190	485197	0 %	0 %	50 %	50 %	537435776
10360	NC_022221	T	7	7	485256	485262	0 %	100 %	0 %	0 %	537435776
10361	NC_022221	CGG	2	6	485308	485313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435776
10362	NC_022221	GCGG	2	8	485332	485339	0 %	0 %	75 %	25 %	537435776
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10364	NC_022221	GCTG	2	8	485365	485372	0 %	25 %	50 %	25 %	537435776
10365	NC_022221	GCTG	2	8	485410	485417	0 %	25 %	50 %	25 %	537435776
10366	NC_022221	GCT	3	9	485465	485473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435776
10367	NC_022221	TCG	2	6	485482	485487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435776
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10487	NC_022221	ACA	2	6	491370	491375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435781
10488	NC_022221	TGC	2	6	491394	491399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435781
10489	NC_022221	CGCGA	2	10	491400	491409	20 %	0 %	40 %	40 %	537435781
10490	NC_022221	GCG	3	9	491420	491428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435781
10491	NC_022221	CGG	2	6	491506	491511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435781
10492	NC_022221	TGGCGC	2	12	491526	491537	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435781
10493	NC_022221	GC	5	10	491534	491543	0 %	0 %	50 %	50 %	537435781
10494	NC_022221	CTG	2	6	491567	491572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435781
10495	NC_022221	GC	3	6	491586	491591	0 %	0 %	50 %	50 %	537435781
10496	NC_022221	GAA	2	6	491642	491647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435781
10497	NC_022221	GAA	2	6	491684	491689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435781
10498	NC_022221	GTG	3	9	491711	491719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435781
10499	NC_022221	CGG	2	6	491836	491841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435781
10500	NC_022221	GC	3	6	491856	491861	0 %	0 %	50 %	50 %	537435781

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