MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022221	CGCC	2	8	22656	22663	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
502	NC_022221	GGC	2	6	22682	22687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_022221	AGA	2	6	22702	22707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022221	CGG	2	6	22744	22749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_022221	T	6	6	22754	22759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022221	CT	3	6	22796	22801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_022221	GGT	2	6	22949	22954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022221	CTA	2	6	22956	22961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_022221	CGG	2	6	22996	23001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_022221	CTGG	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_022221	TAT	2	6	23027	23032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022221	ATA	2	6	23053	23058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_022221	TTA	2	6	23168	23173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_022221	TCTTAA	2	12	23205	23216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
515	NC_022221	TTAT	2	8	23267	23274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022221	A	7	7	23340	23346	100 %	0 %	0 %	0 %	537435389
517	NC_022221	TGA	2	6	23347	23352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435389
518	NC_022221	ACG	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435389
519	NC_022221	ATA	2	6	23371	23376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435389
520	NC_022221	CTTTT	2	10	23395	23404	0 %	80 %	0 %	20 %	537435389
521	NC_022221	T	6	6	23401	23406	0 %	100 %	0 %	0 %	537435389
522	NC_022221	CAG	2	6	23409	23414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435389
523	NC_022221	TTG	2	6	23454	23459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435389
524	NC_022221	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	537435389
525	NC_022221	ATG	2	6	23515	23520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435389
526	NC_022221	GTT	2	6	23550	23555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435389
527	NC_022221	ATG	2	6	23566	23571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435389
528	NC_022221	AT	3	6	23584	23589	50 %	50 %	0 %	0 %	537435389
529	NC_022221	CG	3	6	23654	23659	0 %	0 %	50 %	50 %	537435389
530	NC_022221	ACG	2	6	23755	23760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435389
531	NC_022221	TGA	2	6	23791	23796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435389
532	NC_022221	GC	4	8	23797	23804	0 %	0 %	50 %	50 %	537435389
533	NC_022221	GCT	2	6	23849	23854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435389
534	NC_022221	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	537435389
535	NC_022221	A	7	7	23969	23975	100 %	0 %	0 %	0 %	537435389
536	NC_022221	GGC	2	6	24001	24006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435389
537	NC_022221	AT	3	6	24058	24063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_022221	GTT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_022221	ACA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_022221	GAT	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_022221	TAA	2	6	24261	24266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_022221	TAA	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_022221	ACG	2	6	24308	24313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_022221	AAG	2	6	24355	24360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_022221	T	7	7	24365	24371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_022221	GAA	2	6	24401	24406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_022221	CAG	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_022221	A	6	6	24427	24432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_022221	TGAA	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	537435390
550	NC_022221	TGT	2	6	24523	24528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435390
551	NC_022221	TAC	2	6	24545	24550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435390
552	NC_022221	CGGTA	2	10	24563	24572	20 %	20 %	40 %	20 %	537435390
553	NC_022221	CTGTT	2	10	24602	24611	0 %	60 %	20 %	20 %	537435390
554	NC_022221	TGG	2	6	24682	24687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435390
555	NC_022221	AGA	2	6	24698	24703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435390
556	NC_022221	CCAG	2	8	24739	24746	25 %	0 %	25 %	50 %	537435390
557	NC_022221	GCG	2	6	24750	24755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435390
558	NC_022221	CGA	2	6	24826	24831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435390
559	NC_022221	T	7	7	25027	25033	0 %	100 %	0 %	0 %	537435391
560	NC_022221	CG	3	6	25066	25071	0 %	0 %	50 %	50 %	537435391
561	NC_022221	A	8	8	25117	25124	100 %	0 %	0 %	0 %	537435391
562	NC_022221	ATT	2	6	25143	25148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435391
563	NC_022221	CTG	2	6	25153	25158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435391
564	NC_022221	CGG	2	6	25160	25165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435391
565	NC_022221	CCT	2	6	25247	25252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435391
566	NC_022221	ATT	2	6	25258	25263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435391
567	NC_022221	TTC	2	6	25266	25271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435391
568	NC_022221	T	7	7	25283	25289	0 %	100 %	0 %	0 %	537435391
569	NC_022221	CGC	2	6	25346	25351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435391
570	NC_022221	CT	3	6	25352	25357	0 %	50 %	0 %	50 %	537435391
571	NC_022221	A	6	6	25372	25377	100 %	0 %	0 %	0 %	537435391
572	NC_022221	AT	3	6	25382	25387	50 %	50 %	0 %	0 %	537435391
573	NC_022221	TAT	2	6	25392	25397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435391
574	NC_022221	ACCG	2	8	25416	25423	25 %	0 %	25 %	50 %	537435391
575	NC_022221	TATTT	2	10	25436	25445	20 %	80 %	0 %	0 %	537435391
576	NC_022221	AAAT	2	8	25476	25483	75 %	25 %	0 %	0 %	537435391
577	NC_022221	TAC	2	6	25633	25638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435391
578	NC_022221	A	6	6	25669	25674	100 %	0 %	0 %	0 %	537435391
579	NC_022221	CCG	2	6	25693	25698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435391
580	NC_022221	ACG	2	6	25768	25773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435391
581	NC_022221	ATG	2	6	25797	25802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435391
582	NC_022221	TCTG	2	8	25933	25940	0 %	50 %	25 %	25 %	537435392
583	NC_022221	GGC	2	6	25990	25995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
584	NC_022221	ACG	2	6	26072	26077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435392
585	NC_022221	GC	3	6	26085	26090	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
586	NC_022221	GCCT	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	537435392
587	NC_022221	GGC	3	9	26182	26190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
588	NC_022221	GCC	2	6	26225	26230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435392
589	NC_022221	GCA	2	6	26251	26256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435392
590	NC_022221	GGC	2	6	26281	26286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
591	NC_022221	GGC	2	6	26399	26404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
592	NC_022221	ACT	2	6	26472	26477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435392
593	NC_022221	GCG	2	6	26496	26501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
594	NC_022221	AGCGAC	2	12	26510	26521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435392
595	NC_022221	GCA	2	6	26524	26529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435392
596	NC_022221	ATT	2	6	26608	26613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435392
597	NC_022221	CCTT	2	8	26620	26627	0 %	50 %	0 %	50 %	537435392
598	NC_022221	GAC	2	6	26651	26656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435392
599	NC_022221	CAT	2	6	26749	26754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435392
600	NC_022221	GCC	2	6	26770	26775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435392
601	NC_022221	CCG	2	6	26808	26813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435392
602	NC_022221	GCG	2	6	26817	26822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
603	NC_022221	CCG	2	6	26883	26888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435392
604	NC_022221	GGC	2	6	26910	26915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
605	NC_022221	GCG	2	6	26924	26929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
606	NC_022221	AGT	2	6	26954	26959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435392
607	NC_022221	TCAG	2	8	26979	26986	25 %	25 %	25 %	25 %	537435392
608	NC_022221	GCG	2	6	27075	27080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
609	NC_022221	ATA	2	6	27144	27149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435392
610	NC_022221	GAT	2	6	27263	27268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435392
611	NC_022221	ATT	2	6	27345	27350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435392
612	NC_022221	TTA	2	6	27358	27363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435392
613	NC_022221	AGG	2	6	27368	27373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435392
614	NC_022221	ATCA	2	8	27392	27399	50 %	25 %	0 %	25 %	537435392
615	NC_022221	TTA	2	6	27426	27431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435392
616	NC_022221	CAGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	537435392
617	NC_022221	TGA	2	6	27460	27465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435392
618	NC_022221	TTG	2	6	27476	27481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435392
619	NC_022221	ACA	2	6	27531	27536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435392
620	NC_022221	GAT	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435392
621	NC_022221	CTG	2	6	27719	27724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435392
622	NC_022221	ACA	2	6	27744	27749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435392
623	NC_022221	GCG	2	6	27786	27791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
624	NC_022221	CAG	2	6	27866	27871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435392
625	NC_022221	GCG	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435392
626	NC_022221	TGG	2	6	27897	27902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435392
627	NC_022221	AGCC	2	8	27926	27933	25 %	0 %	25 %	50 %	537435392
628	NC_022221	CG	3	6	28015	28020	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
629	NC_022221	GGT	2	6	28030	28035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435392
630	NC_022221	ACA	2	6	28046	28051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435392
631	NC_022221	TGA	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435392
632	NC_022221	TGA	2	6	28108	28113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435392
633	NC_022221	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	537435392
634	NC_022221	GC	3	6	28143	28148	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
635	NC_022221	GC	3	6	28179	28184	0 %	0 %	50 %	50 %	537435392
636	NC_022221	ACGGTG	2	12	28235	28246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537435392
637	NC_022221	TTG	2	6	28269	28274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435392
638	NC_022221	GT	3	6	28357	28362	0 %	50 %	50 %	0 %	537435392
639	NC_022221	ATC	2	6	28371	28376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435392
640	NC_022221	TC	3	6	28375	28380	0 %	50 %	0 %	50 %	537435392
641	NC_022221	TCC	2	6	28382	28387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435392
642	NC_022221	ACA	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435392
643	NC_022221	CTG	2	6	28451	28456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435393
644	NC_022221	ATTA	2	8	28526	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	537435393
645	NC_022221	A	6	6	28593	28598	100 %	0 %	0 %	0 %	537435393
646	NC_022221	GT	3	6	28622	28627	0 %	50 %	50 %	0 %	537435393
647	NC_022221	CCG	2	6	28629	28634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435393
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649	NC_022221	GGCG	2	8	28768	28775	0 %	0 %	75 %	25 %	537435393
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652	NC_022221	TCG	2	6	28893	28898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435393
653	NC_022221	CCG	2	6	28947	28952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435393
654	NC_022221	A	6	6	29120	29125	100 %	0 %	0 %	0 %	537435393
655	NC_022221	ATG	2	6	29286	29291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435393
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657	NC_022221	GAC	2	6	29502	29507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435394
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659	NC_022221	ATG	2	6	29812	29817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435394
660	NC_022221	AAT	2	6	29838	29843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435394
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675	NC_022221	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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691	NC_022221	T	7	7	31211	31217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
692	NC_022221	TAT	2	6	31269	31274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435397
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739	NC_022221	ATA	2	6	33133	33138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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741	NC_022221	T	6	6	33153	33158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
742	NC_022221	T	6	6	33185	33190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
743	NC_022221	CAT	2	6	33200	33205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
744	NC_022221	CA	3	6	33218	33223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
745	NC_022221	TAA	2	6	33254	33259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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747	NC_022221	ATG	2	6	33326	33331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
748	NC_022221	CCAG	2	8	33345	33352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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762	NC_022221	TGTTTG	2	12	33884	33895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435400
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764	NC_022221	TTGG	2	8	33912	33919	0 %	50 %	50 %	0 %	537435400
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