MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022221	ATG	2	6	279144	279149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435609
6002	NC_022221	CGG	2	6	279199	279204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435609
6003	NC_022221	TGC	2	6	279208	279213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435609
6004	NC_022221	GATT	2	8	279232	279239	25 %	50 %	25 %	0 %	537435609
6005	NC_022221	AAG	2	6	279274	279279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435609
6006	NC_022221	TGA	2	6	279341	279346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435609
6007	NC_022221	TGA	2	6	279401	279406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435609
6008	NC_022221	GATG	2	8	279455	279462	25 %	25 %	50 %	0 %	537435609
6009	NC_022221	CGC	2	6	279494	279499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435609
6010	NC_022221	TGG	2	6	279502	279507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435609
6011	NC_022221	TGA	2	6	279518	279523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435609
6012	NC_022221	GTG	3	9	279531	279539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435609
6013	NC_022221	A	6	6	279541	279546	100 %	0 %	0 %	0 %	537435609
6014	NC_022221	CTG	2	6	279561	279566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435609
6015	NC_022221	GCT	2	6	279608	279613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435609
6016	NC_022221	TGC	2	6	279781	279786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435609
6017	NC_022221	GAT	2	6	279809	279814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435609
6018	NC_022221	CTG	2	6	279990	279995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435609
6019	NC_022221	TGCTC	2	10	279997	280006	0 %	40 %	20 %	40 %	537435609
6020	NC_022221	TCA	2	6	280182	280187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435610
6021	NC_022221	TCCCT	2	10	280344	280353	0 %	40 %	0 %	60 %	537435610
6022	NC_022221	T	6	6	280503	280508	0 %	100 %	0 %	0 %	537435610
6023	NC_022221	CT	3	6	280644	280649	0 %	50 %	0 %	50 %	537435611
6024	NC_022221	GCG	2	6	280675	280680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435611
6025	NC_022221	TCA	2	6	280763	280768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435611
6026	NC_022221	GC	3	6	280902	280907	0 %	0 %	50 %	50 %	537435611
6027	NC_022221	GCA	2	6	280958	280963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
6028	NC_022221	CTG	2	6	280989	280994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435611
6029	NC_022221	CCGG	2	8	281016	281023	0 %	0 %	50 %	50 %	537435611
6030	NC_022221	CTT	2	6	281067	281072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435611
6031	NC_022221	GA	3	6	281084	281089	50 %	0 %	50 %	0 %	537435611
6032	NC_022221	T	6	6	281180	281185	0 %	100 %	0 %	0 %	537435611
6033	NC_022221	GC	4	8	281192	281199	0 %	0 %	50 %	50 %	537435611
6034	NC_022221	GCA	2	6	281210	281215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
6035	NC_022221	GCT	2	6	281279	281284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435611
6036	NC_022221	CGG	2	6	281323	281328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435611
6037	NC_022221	CT	3	6	281343	281348	0 %	50 %	0 %	50 %	537435611
6038	NC_022221	CGG	2	6	281373	281378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435611
6039	NC_022221	GCG	2	6	281379	281384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435611
6040	NC_022221	GCTG	2	8	281395	281402	0 %	25 %	50 %	25 %	537435611
6041	NC_022221	AGG	2	6	281455	281460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435611
6042	NC_022221	TGGCGC	2	12	281461	281472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537435611
6043	NC_022221	CGA	2	6	281474	281479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
6044	NC_022221	TGG	2	6	281538	281543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435611
6045	NC_022221	ACA	2	6	281561	281566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435611
6046	NC_022221	ACG	2	6	281571	281576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
6047	NC_022221	CTGC	2	8	281610	281617	0 %	25 %	25 %	50 %	537435611
6048	NC_022221	GGC	2	6	281646	281651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435611
6049	NC_022221	GAA	2	6	281673	281678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435611
6050	NC_022221	CGA	2	6	281784	281789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
6051	NC_022221	GTT	3	9	281801	281809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435611
6052	NC_022221	AGC	2	6	281861	281866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435611
6053	NC_022221	AGA	2	6	281867	281872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435611
6054	NC_022221	AAG	2	6	281875	281880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435611
6055	NC_022221	GCGCT	2	10	281909	281918	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6056	NC_022221	CAC	2	6	281966	281971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_022221	CAA	2	6	281979	281984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_022221	ATG	2	6	282176	282181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435612
6059	NC_022221	TCAT	2	8	282237	282244	25 %	50 %	0 %	25 %	537435613
6060	NC_022221	GCA	2	6	282274	282279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435613
6061	NC_022221	GCC	2	6	282322	282327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435613
6062	NC_022221	CCT	2	6	282442	282447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_022221	CGT	2	6	282664	282669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435614
6064	NC_022221	ATG	2	6	282752	282757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435614
6065	NC_022221	TGA	2	6	282787	282792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435614
6066	NC_022221	ATC	2	6	282855	282860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435614
6067	NC_022221	GCGA	2	8	282929	282936	25 %	0 %	50 %	25 %	537435614
6068	NC_022221	GCG	2	6	282965	282970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435614
6069	NC_022221	TGG	2	6	282977	282982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435614
6070	NC_022221	CAG	2	6	282983	282988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435614
6071	NC_022221	GC	3	6	283002	283007	0 %	0 %	50 %	50 %	537435614
6072	NC_022221	CGA	2	6	283095	283100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435614
6073	NC_022221	AAT	2	6	283136	283141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435614
6074	NC_022221	CG	3	6	283237	283242	0 %	0 %	50 %	50 %	537435615
6075	NC_022221	GGT	2	6	283252	283257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435615
6076	NC_022221	TAT	2	6	283327	283332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435615
6077	NC_022221	GCCA	2	8	283351	283358	25 %	0 %	25 %	50 %	537435615
6078	NC_022221	GAT	2	6	283372	283377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435615
6079	NC_022221	TCATTA	2	12	283382	283393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	537435615
6080	NC_022221	CGC	2	6	283525	283530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435615
6081	NC_022221	TCT	2	6	283552	283557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435615
6082	NC_022221	TCG	2	6	283581	283586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435615
6083	NC_022221	TAA	2	6	283693	283698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435616
6084	NC_022221	GGC	2	6	283732	283737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435616
6085	NC_022221	GCA	2	6	283753	283758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435616
6086	NC_022221	GCG	2	6	283767	283772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435616
6087	NC_022221	TGC	2	6	283773	283778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435616
6088	NC_022221	TGA	2	6	283839	283844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435616
6089	NC_022221	GAA	2	6	283868	283873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435616
6090	NC_022221	TAT	2	6	283955	283960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435616
6091	NC_022221	CG	3	6	283961	283966	0 %	0 %	50 %	50 %	537435616
6092	NC_022221	GTAT	3	12	284082	284093	25 %	50 %	25 %	0 %	537435616
6093	NC_022221	GCG	2	6	284105	284110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435616
6094	NC_022221	TGC	2	6	284211	284216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435616
6095	NC_022221	CACT	2	8	284323	284330	25 %	25 %	0 %	50 %	537435616
6096	NC_022221	CAA	2	6	284392	284397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_022221	TCG	2	6	284497	284502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435617
6098	NC_022221	GTC	2	6	284592	284597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435617
6099	NC_022221	GC	4	8	284618	284625	0 %	0 %	50 %	50 %	537435617
6100	NC_022221	AGC	2	6	284795	284800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435617
6101	NC_022221	CAA	2	6	284972	284977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435617
6102	NC_022221	AGT	2	6	285014	285019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435617
6103	NC_022221	GGC	2	6	285060	285065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435617
6104	NC_022221	CGAT	2	8	285073	285080	25 %	25 %	25 %	25 %	537435617
6105	NC_022221	ATTA	2	8	285129	285136	50 %	50 %	0 %	0 %	537435617
6106	NC_022221	TCT	2	6	285148	285153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435617
6107	NC_022221	TTCA	2	8	285207	285214	25 %	50 %	0 %	25 %	537435617
6108	NC_022221	CGC	2	6	285224	285229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435617
6109	NC_022221	CAG	2	6	285234	285239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435617
6110	NC_022221	CCA	2	6	285242	285247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435617
6111	NC_022221	CAG	2	6	285279	285284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435617
6112	NC_022221	T	6	6	285296	285301	0 %	100 %	0 %	0 %	537435617
6113	NC_022221	CCA	2	6	285323	285328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435617
6114	NC_022221	CGC	2	6	285381	285386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435617
6115	NC_022221	GC	3	6	285388	285393	0 %	0 %	50 %	50 %	537435617
6116	NC_022221	GCG	2	6	285401	285406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435617
6117	NC_022221	CGC	2	6	285473	285478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435617
6118	NC_022221	GCC	2	6	285513	285518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435617
6119	NC_022221	CG	3	6	285543	285548	0 %	0 %	50 %	50 %	537435617
6120	NC_022221	TCA	2	6	285653	285658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435617
6121	NC_022221	CG	3	6	285665	285670	0 %	0 %	50 %	50 %	537435617
6122	NC_022221	TCA	2	6	285700	285705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435617
6123	NC_022221	GAA	2	6	285726	285731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435617
6124	NC_022221	CTT	2	6	285788	285793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435617
6125	NC_022221	GCA	2	6	285842	285847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435617
6126	NC_022221	CT	3	6	285877	285882	0 %	50 %	0 %	50 %	537435617
6127	NC_022221	GGCT	2	8	285894	285901	0 %	25 %	50 %	25 %	537435617
6128	NC_022221	GTT	2	6	285936	285941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435617
6129	NC_022221	CACG	2	8	285950	285957	25 %	0 %	25 %	50 %	537435617
6130	NC_022221	T	6	6	285969	285974	0 %	100 %	0 %	0 %	537435617
6131	NC_022221	TA	3	6	286004	286009	50 %	50 %	0 %	0 %	537435617
6132	NC_022221	ATC	2	6	286030	286035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435617
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6134	NC_022221	TGG	2	6	286054	286059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435617
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6136	NC_022221	A	7	7	286177	286183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_022221	AAAT	2	8	286381	286388	75 %	25 %	0 %	0 %	537435618
6138	NC_022221	CGT	2	6	286418	286423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435618
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6142	NC_022221	GCC	2	6	286726	286731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435618
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6154	NC_022221	AAT	2	6	287428	287433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6214	NC_022221	ATCA	2	8	290095	290102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6215	NC_022221	CTG	2	6	290130	290135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6216	NC_022221	A	8	8	290308	290315	100 %	0 %	0 %	0 %	537435623
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6234	NC_022221	GGC	2	6	291157	291162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6235	NC_022221	AGC	2	6	291197	291202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6241	NC_022221	GAA	2	6	291529	291534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_022221	GGA	2	6	291565	291570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_022221	TAA	2	6	291583	291588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_022221	GCA	2	6	291591	291596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6245	NC_022221	AGA	2	6	291612	291617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_022221	CAG	2	6	291638	291643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6247	NC_022221	G	6	6	291785	291790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_022221	GGA	2	6	291829	291834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_022221	GGC	2	6	291849	291854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6250	NC_022221	GAA	2	6	292092	292097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6251	NC_022221	AGA	2	6	292121	292126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6252	NC_022221	TGC	2	6	292168	292173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_022221	GTC	2	6	292180	292185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6254	NC_022221	TTG	2	6	292241	292246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_022221	GGA	2	6	292293	292298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_022221	TCA	2	6	292318	292323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6257	NC_022221	AC	3	6	292344	292349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6258	NC_022221	CGT	2	6	292412	292417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6259	NC_022221	AC	3	6	292513	292518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6260	NC_022221	GTAG	2	8	292554	292561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_022221	CCT	2	6	292654	292659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6262	NC_022221	AAG	2	6	292667	292672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6264	NC_022221	TGA	2	6	292702	292707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6266	NC_022221	GGT	2	6	292780	292785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6268	NC_022221	CCA	2	6	292989	292994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6278	NC_022221	G	6	6	293582	293587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6279	NC_022221	TCC	2	6	293592	293597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6281	NC_022221	GTAC	2	8	293696	293703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6282	NC_022221	TG	3	6	293728	293733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6283	NC_022221	GGA	2	6	293903	293908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6285	NC_022221	CGTC	2	8	294139	294146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6286	NC_022221	AAC	2	6	294158	294163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6290	NC_022221	AGCGA	2	10	294388	294397	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6291	NC_022221	AGTCG	2	10	294415	294424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6294	NC_022221	GT	4	8	294738	294745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6296	NC_022221	GGT	2	6	294880	294885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6322	NC_022221	GGC	2	6	296365	296370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6333	NC_022221	GAT	2	6	296902	296907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435625
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6340	NC_022221	CAA	2	6	297229	297234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6360	NC_022221	TG	3	6	298113	298118	0 %	50 %	50 %	0 %	537435626
6361	NC_022221	CTATG	2	10	298179	298188	20 %	40 %	20 %	20 %	537435626
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6363	NC_022221	GC	3	6	298281	298286	0 %	0 %	50 %	50 %	537435626
6364	NC_022221	ATTG	2	8	298288	298295	25 %	50 %	25 %	0 %	537435626
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6367	NC_022221	AAAGG	2	10	298523	298532	60 %	0 %	40 %	0 %	537435626
6368	NC_022221	TCCAGC	2	12	298611	298622	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537435627
6369	NC_022221	TGC	2	6	298623	298628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435627
6370	NC_022221	GGC	2	6	298635	298640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435627
6371	NC_022221	CGCTG	2	10	298693	298702	0 %	20 %	40 %	40 %	537435627
6372	NC_022221	GA	3	6	298829	298834	50 %	0 %	50 %	0 %	537435627
6373	NC_022221	AAC	2	6	298835	298840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435627
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6375	NC_022221	TG	3	6	299031	299036	0 %	50 %	50 %	0 %	537435628
6376	NC_022221	TCCAGA	2	12	299113	299124	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537435628
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6402	NC_022221	TCA	2	6	300388	300393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435629
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6499	NC_022221	GGC	2	6	305045	305050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435631
6500	NC_022221	ATG	2	6	305109	305114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435631

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