MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 97853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022221	TATTGA	2	12	209357	209368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_022221	CG	3	6	209483	209488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_022221	TGC	2	6	209510	209515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_022221	AC	3	6	209526	209531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_022221	AGCGC	2	10	209532	209541	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4506	NC_022221	ATAA	2	8	209543	209550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_022221	GTTT	2	8	209610	209617	0 %	75 %	25 %	0 %	537435551
4508	NC_022221	TGA	2	6	209647	209652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435551
4509	NC_022221	GGC	3	9	209675	209683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435551
4510	NC_022221	ATA	2	6	209774	209779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435551
4511	NC_022221	TTC	2	6	209790	209795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435551
4512	NC_022221	GTGTT	2	10	209916	209925	0 %	60 %	40 %	0 %	537435551
4513	NC_022221	TGC	2	6	209938	209943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435551
4514	NC_022221	CCAG	2	8	209962	209969	25 %	0 %	25 %	50 %	537435551
4515	NC_022221	GCC	2	6	209999	210004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435551
4516	NC_022221	GTA	2	6	210019	210024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435551
4517	NC_022221	CAA	2	6	210252	210257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435551
4518	NC_022221	TGA	2	6	210287	210292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_022221	CCA	2	6	210325	210330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_022221	GCGG	2	8	210409	210416	0 %	0 %	75 %	25 %	537435552
4521	NC_022221	CTG	2	6	210447	210452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435552
4522	NC_022221	CAT	2	6	210546	210551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435552
4523	NC_022221	GC	3	6	210601	210606	0 %	0 %	50 %	50 %	537435552
4524	NC_022221	CTG	2	6	210614	210619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435552
4525	NC_022221	AG	3	6	210695	210700	50 %	0 %	50 %	0 %	537435552
4526	NC_022221	TTC	2	6	210706	210711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435552
4527	NC_022221	GCG	2	6	210812	210817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435552
4528	NC_022221	GGC	2	6	210832	210837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435552
4529	NC_022221	AGTG	2	8	210847	210854	25 %	25 %	50 %	0 %	537435552
4530	NC_022221	GAT	2	6	210978	210983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_022221	GAA	2	6	210995	211000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_022221	AT	4	8	211034	211041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_022221	ATT	2	6	211049	211054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_022221	GTTT	2	8	211064	211071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_022221	GCT	2	6	211118	211123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_022221	AAT	2	6	211136	211141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_022221	T	7	7	211147	211153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_022221	A	6	6	211158	211163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_022221	GT	3	6	211178	211183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_022221	A	7	7	211192	211198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_022221	CAT	2	6	211207	211212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_022221	GGA	2	6	211231	211236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_022221	AAG	2	6	211306	211311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435553
4544	NC_022221	ATG	2	6	211381	211386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435553
4545	NC_022221	TG	3	6	211385	211390	0 %	50 %	50 %	0 %	537435553
4546	NC_022221	CGGCG	2	10	211446	211455	0 %	0 %	60 %	40 %	537435553
4547	NC_022221	TGA	2	6	211475	211480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435553
4548	NC_022221	GGA	2	6	211533	211538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435553
4549	NC_022221	GC	3	6	211601	211606	0 %	0 %	50 %	50 %	537435553
4550	NC_022221	CAG	3	9	211630	211638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435553
4551	NC_022221	TGC	2	6	211658	211663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435553
4552	NC_022221	GAC	2	6	211695	211700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_022221	T	6	6	211722	211727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_022221	AT	3	6	211741	211746	50 %	50 %	0 %	0 %	537435554
4555	NC_022221	GTT	2	6	211757	211762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537435554
4556	NC_022221	ACG	2	6	211826	211831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435554
4557	NC_022221	GCC	2	6	211838	211843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435554
4558	NC_022221	ATT	2	6	211929	211934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435554
4559	NC_022221	TGG	2	6	212124	212129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435554
4560	NC_022221	ATT	2	6	212147	212152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435554
4561	NC_022221	GGCT	2	8	212208	212215	0 %	25 %	50 %	25 %	537435554
4562	NC_022221	ATC	2	6	212268	212273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435554
4563	NC_022221	TGA	2	6	212284	212289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435554
4564	NC_022221	CCA	2	6	212316	212321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435554
4565	NC_022221	TTCGG	2	10	212326	212335	0 %	40 %	40 %	20 %	537435554
4566	NC_022221	GGA	2	6	212401	212406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537435554
4567	NC_022221	CG	3	6	212420	212425	0 %	0 %	50 %	50 %	537435554
4568	NC_022221	GC	4	8	212435	212442	0 %	0 %	50 %	50 %	537435554
4569	NC_022221	GGT	2	6	212443	212448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435554
4570	NC_022221	TAT	2	6	212533	212538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435554
4571	NC_022221	T	6	6	212653	212658	0 %	100 %	0 %	0 %	537435554
4572	NC_022221	TCG	2	6	212677	212682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435554
4573	NC_022221	TA	3	6	212691	212696	50 %	50 %	0 %	0 %	537435554
4574	NC_022221	ATA	2	6	212709	212714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435554
4575	NC_022221	CGG	2	6	212738	212743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435554
4576	NC_022221	TCTT	2	8	212776	212783	0 %	75 %	0 %	25 %	537435554
4577	NC_022221	AGC	2	6	212818	212823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435554
4578	NC_022221	CAC	2	6	212851	212856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435554
4579	NC_022221	TGC	2	6	212892	212897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435554
4580	NC_022221	CTT	2	6	213070	213075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435555
4581	NC_022221	GCC	2	6	213135	213140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435555
4582	NC_022221	GAT	2	6	213155	213160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537435555
4583	NC_022221	CTTGC	2	10	213335	213344	0 %	40 %	20 %	40 %	537435555
4584	NC_022221	CTT	2	6	213364	213369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_022221	GGC	3	9	213510	213518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435556
4586	NC_022221	GTC	2	6	213585	213590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435556
4587	NC_022221	TTCA	2	8	213606	213613	25 %	50 %	0 %	25 %	537435556
4588	NC_022221	GGCAAT	2	12	213624	213635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	537435556
4589	NC_022221	TCA	2	6	213686	213691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537435556
4590	NC_022221	GCT	2	6	213719	213724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435556
4591	NC_022221	TGAGC	2	10	213747	213756	20 %	20 %	40 %	20 %	537435556
4592	NC_022221	AAT	2	6	213777	213782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537435556
4593	NC_022221	CGA	2	6	213791	213796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435556
4594	NC_022221	CCA	2	6	213821	213826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435556
4595	NC_022221	CGC	2	6	213923	213928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435556
4596	NC_022221	TGG	2	6	213962	213967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435556
4597	NC_022221	ACGT	2	8	213985	213992	25 %	25 %	25 %	25 %	537435556
4598	NC_022221	CAC	2	6	214158	214163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537435556
4599	NC_022221	CGT	2	6	214205	214210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435556
4600	NC_022221	TGG	2	6	214223	214228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435556
4601	NC_022221	GAC	2	6	214262	214267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435556
4602	NC_022221	GCA	2	6	214280	214285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435556
4603	NC_022221	CAA	2	6	214310	214315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537435556
4604	NC_022221	TGA	2	6	214332	214337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_022221	GCGCT	2	10	214350	214359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4606	NC_022221	CGCGT	2	10	214402	214411	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4607	NC_022221	TTC	2	6	214451	214456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537435557
4608	NC_022221	CTG	2	6	214493	214498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435557
4609	NC_022221	CGG	2	6	214501	214506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435557
4610	NC_022221	CCG	2	6	214560	214565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435557
4611	NC_022221	GCCGAT	2	12	214622	214633	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537435557
4612	NC_022221	GCAC	2	8	214681	214688	25 %	0 %	25 %	50 %	537435557
4613	NC_022221	CCAGCA	2	12	214690	214701	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	537435557
4614	NC_022221	CAG	2	6	214739	214744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435557
4615	NC_022221	GCC	2	6	214781	214786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435557
4616	NC_022221	CGGCA	2	10	214832	214841	20 %	0 %	40 %	40 %	537435557
4617	NC_022221	CCAG	2	8	214870	214877	25 %	0 %	25 %	50 %	537435557
4618	NC_022221	GCC	2	6	214880	214885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435557
4619	NC_022221	CGCA	2	8	214910	214917	25 %	0 %	25 %	50 %	537435557
4620	NC_022221	GC	3	6	214999	215004	0 %	0 %	50 %	50 %	537435557
4621	NC_022221	GCACG	2	10	215011	215020	20 %	0 %	40 %	40 %	537435557
4622	NC_022221	TCG	2	6	215121	215126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435557
4623	NC_022221	T	6	6	215177	215182	0 %	100 %	0 %	0 %	537435557
4624	NC_022221	CTTG	2	8	215185	215192	0 %	50 %	25 %	25 %	537435557
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4733	NC_022221	A	6	6	220205	220210	100 %	0 %	0 %	0 %	537435563
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4735	NC_022221	AAAG	2	8	220276	220283	75 %	0 %	25 %	0 %	537435564
4736	NC_022221	GCC	2	6	220322	220327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537435564
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4740	NC_022221	CGGGG	2	10	220390	220399	0 %	0 %	80 %	20 %	537435564
4741	NC_022221	TCC	2	6	220455	220460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537435564
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4745	NC_022221	GC	4	8	220555	220562	0 %	0 %	50 %	50 %	537435564
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4747	NC_022221	TTAGCG	2	12	220703	220714	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537435564
4748	NC_022221	CGA	2	6	220818	220823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537435564
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4868	NC_022221	ATAA	2	8	225486	225493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4989	NC_022221	GC	3	6	230722	230727	0 %	0 %	50 %	50 %	537435570
4990	NC_022221	CTG	3	9	230730	230738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
4991	NC_022221	CT	3	6	230754	230759	0 %	50 %	0 %	50 %	537435570
4992	NC_022221	GCT	2	6	230801	230806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537435570
4993	NC_022221	GAA	2	6	230808	230813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537435570
4994	NC_022221	GGC	2	6	230843	230848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435570
4995	NC_022221	GGCG	2	8	230855	230862	0 %	0 %	75 %	25 %	537435570
4996	NC_022221	TGGCGG	2	12	230869	230880	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	537435570
4997	NC_022221	ATT	2	6	230886	230891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537435570
4998	NC_022221	GTG	2	6	230961	230966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537435570
4999	NC_022221	CTGC	2	8	231009	231016	0 %	25 %	25 %	50 %	537435570
5000	NC_022221	GCG	3	9	231030	231038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537435570

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