MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces collinus Tu 365 plasmid pSCO1

Total Repeats: 2195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022001	GCTGG	2	10	77324	77333	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2002	NC_022001	CAG	2	6	77340	77345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_022001	CGG	2	6	77417	77422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239252
2004	NC_022001	ATC	2	6	77454	77459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239252
2005	NC_022001	CGGA	2	8	77465	77472	25 %	0 %	50 %	25 %	529239252
2006	NC_022001	CAA	2	6	77528	77533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529239252
2007	NC_022001	TGG	2	6	77632	77637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239252
2008	NC_022001	TG	3	6	77654	77659	0 %	50 %	50 %	0 %	529239252
2009	NC_022001	GGGT	2	8	77718	77725	0 %	25 %	75 %	0 %	529239252
2010	NC_022001	GCTCG	2	10	77743	77752	0 %	20 %	40 %	40 %	529239252
2011	NC_022001	TGCC	2	8	77804	77811	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
2012	NC_022001	TG	3	6	77873	77878	0 %	50 %	50 %	0 %	529239252
2013	NC_022001	GCCG	2	8	77882	77889	0 %	0 %	50 %	50 %	529239252
2014	NC_022001	GGGT	2	8	77937	77944	0 %	25 %	75 %	0 %	529239252
2015	NC_022001	GCTCG	2	10	77962	77971	0 %	20 %	40 %	40 %	529239252
2016	NC_022001	GGGT	2	8	78036	78043	0 %	25 %	75 %	0 %	529239252
2017	NC_022001	GCTCG	2	10	78061	78070	0 %	20 %	40 %	40 %	529239252
2018	NC_022001	TGCC	2	8	78122	78129	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
2019	NC_022001	CCTGGC	2	12	78200	78211	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	529239252
2020	NC_022001	TGCT	2	8	78242	78249	0 %	50 %	25 %	25 %	529239252
2021	NC_022001	GGGT	2	8	78255	78262	0 %	25 %	75 %	0 %	529239252
2022	NC_022001	GGGT	2	8	78393	78400	0 %	25 %	75 %	0 %	529239252
2023	NC_022001	CTGC	2	8	78478	78485	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
2024	NC_022001	GGT	2	6	78493	78498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239252
2025	NC_022001	TGCC	2	8	78578	78585	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
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2030	NC_022001	CTGC	2	8	78796	78803	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
2031	NC_022001	CTGC	2	8	78899	78906	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
2032	NC_022001	GGT	2	6	78910	78915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239252
2033	NC_022001	GCTCG	2	10	78934	78943	0 %	20 %	40 %	40 %	529239252
2034	NC_022001	CTGC	2	8	78994	79001	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
2035	NC_022001	GGT	2	6	79009	79014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239252
2036	NC_022001	GCTCG	2	10	79033	79042	0 %	20 %	40 %	40 %	529239252
2037	NC_022001	TGCC	2	8	79094	79101	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
2038	NC_022001	TGGG	2	8	79106	79113	0 %	25 %	75 %	0 %	529239252
2039	NC_022001	CTG	2	6	79196	79201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239252
2040	NC_022001	GGC	2	6	79241	79246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239252
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2042	NC_022001	TG	3	6	79382	79387	0 %	50 %	50 %	0 %	529239252
2043	NC_022001	GGGT	2	8	79446	79453	0 %	25 %	75 %	0 %	529239252
2044	NC_022001	GCTCG	2	10	79471	79480	0 %	20 %	40 %	40 %	529239252
2045	NC_022001	GGGT	2	8	79545	79552	0 %	25 %	75 %	0 %	529239252
2046	NC_022001	GTGG	2	8	79577	79584	0 %	25 %	75 %	0 %	529239252
2047	NC_022001	GCCTGT	2	12	79647	79658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239252
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2050	NC_022001	GGTCCG	2	12	79807	79818	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	529239252
2051	NC_022001	GAG	2	6	79826	79831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239252
2052	NC_022001	GCG	2	6	79863	79868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239252
2053	NC_022001	CGC	2	6	79873	79878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239252
2054	NC_022001	GCG	2	6	79934	79939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239252
2055	NC_022001	CGG	2	6	79948	79953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239252
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2057	NC_022001	ACG	2	6	80008	80013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239252
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2059	NC_022001	AGT	2	6	80068	80073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529239252
2060	NC_022001	GGC	2	6	80105	80110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239252
2061	NC_022001	GCCT	2	8	80147	80154	0 %	25 %	25 %	50 %	529239252
2062	NC_022001	CGG	2	6	80178	80183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239252
2063	NC_022001	GGA	2	6	80209	80214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239252
2064	NC_022001	TCC	2	6	80217	80222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239252
2065	NC_022001	GCC	2	6	80273	80278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239252
2066	NC_022001	GCGG	2	8	80279	80286	0 %	0 %	75 %	25 %	529239252
2067	NC_022001	CAG	2	6	80291	80296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239252
2068	NC_022001	GAG	2	6	80330	80335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529239252
2069	NC_022001	G	6	6	80380	80385	0 %	0 %	100 %	0 %	529239252
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2084	NC_022001	GCCC	2	8	80852	80859	0 %	0 %	25 %	75 %	529239252
2085	NC_022001	CGGCC	2	10	80861	80870	0 %	0 %	40 %	60 %	529239252
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2088	NC_022001	GCT	2	6	80893	80898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239252
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2092	NC_022001	GCC	2	6	80977	80982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239252
2093	NC_022001	CGGCA	2	10	81005	81014	20 %	0 %	40 %	40 %	529239252
2094	NC_022001	TGG	2	6	81027	81032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239252
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2096	NC_022001	CCG	2	6	81069	81074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2097	NC_022001	GCAG	2	8	81117	81124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2098	NC_022001	CGC	2	6	81131	81136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2099	NC_022001	GGT	2	6	81149	81154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_022001	CCGGC	2	10	81178	81187	0 %	0 %	40 %	60 %	529239253
2101	NC_022001	TGGGCG	2	12	81278	81289	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	529239253
2102	NC_022001	CCG	3	9	81311	81319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239253
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2105	NC_022001	CTGC	2	8	81351	81358	0 %	25 %	25 %	50 %	529239253
2106	NC_022001	CCA	2	6	81366	81371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239253
2107	NC_022001	CGT	2	6	81396	81401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239253
2108	NC_022001	GC	3	6	81406	81411	0 %	0 %	50 %	50 %	529239253
2109	NC_022001	CTG	2	6	81436	81441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239253
2110	NC_022001	CTC	2	6	81466	81471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239253
2111	NC_022001	CCT	2	6	81480	81485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239253
2112	NC_022001	ATC	2	6	81493	81498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529239253
2113	NC_022001	GC	3	6	81510	81515	0 %	0 %	50 %	50 %	529239253
2114	NC_022001	GTG	2	6	81533	81538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239253
2115	NC_022001	GCCG	2	8	81592	81599	0 %	0 %	50 %	50 %	529239253
2116	NC_022001	CCA	2	6	81642	81647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529239253
2117	NC_022001	CAT	2	6	81705	81710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2118	NC_022001	CAGCG	2	10	81759	81768	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2119	NC_022001	GCC	2	6	81782	81787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2120	NC_022001	CCGC	2	8	81794	81801	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2121	NC_022001	GTTCA	2	10	81823	81832	20 %	40 %	20 %	20 %	529239254
2122	NC_022001	ACCC	2	8	81833	81840	25 %	0 %	0 %	75 %	529239254
2123	NC_022001	CCG	2	6	81869	81874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239254
2124	NC_022001	GCT	2	6	81965	81970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239254
2125	NC_022001	GTGC	2	8	82084	82091	0 %	25 %	50 %	25 %	529239254
2126	NC_022001	GGC	2	6	82128	82133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239254
2127	NC_022001	GCC	2	6	82137	82142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239254
2128	NC_022001	GGC	2	6	82146	82151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239254
2129	NC_022001	CCT	2	6	82163	82168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239254
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2133	NC_022001	CGA	2	6	82337	82342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529239254
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2139	NC_022001	TCC	2	6	82591	82596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239254
2140	NC_022001	CCG	2	6	82643	82648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239254
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2142	NC_022001	GCCA	2	8	82696	82703	25 %	0 %	25 %	50 %	529239254
2143	NC_022001	CGGC	2	8	82727	82734	0 %	0 %	50 %	50 %	529239254
2144	NC_022001	CCG	2	6	82793	82798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239254
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2153	NC_022001	GCCC	2	8	83284	83291	0 %	0 %	25 %	75 %	529239254
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2157	NC_022001	GGT	2	6	83450	83455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529239254
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2162	NC_022001	GCC	2	6	83746	83751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529239254
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2168	NC_022001	TCGCC	2	10	83843	83852	0 %	20 %	20 %	60 %	529239254
2169	NC_022001	TCC	2	6	83857	83862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239254
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2171	NC_022001	TCC	2	6	83890	83895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	529239254
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2177	NC_022001	GCG	2	6	84137	84142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529239254
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2179	NC_022001	GTC	3	9	84183	84191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529239254
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2182	NC_022001	GCACCA	2	12	84275	84286	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	529239254
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2193	NC_022001	CTG	3	9	84815	84823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2194	NC_022001	CCCG	2	8	84864	84871	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2195	NC_022001	CG	3	6	85015	85020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.