MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 98999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021984	CGTA	2	8	253600	253607	25 %	25 %	25 %	25 %	529218945
5502	NC_021984	ATA	2	6	253638	253643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218945
5503	NC_021984	CAG	2	6	253648	253653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218945
5504	NC_021984	CGC	2	6	253737	253742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218945
5505	NC_021984	GCC	2	6	253750	253755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218945
5506	NC_021984	TTCGG	2	10	253834	253843	0 %	40 %	40 %	20 %	529218945
5507	NC_021984	CCAG	2	8	253890	253897	25 %	0 %	25 %	50 %	529218945
5508	NC_021984	GC	3	6	253946	253951	0 %	0 %	50 %	50 %	529218945
5509	NC_021984	AGGG	2	8	253981	253988	25 %	0 %	75 %	0 %	529218945
5510	NC_021984	CT	3	6	254174	254179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5511	NC_021984	GCC	2	6	254181	254186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5512	NC_021984	ATT	2	6	254268	254273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218946
5513	NC_021984	CGT	2	6	254274	254279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218946
5514	NC_021984	GT	3	6	254278	254283	0 %	50 %	50 %	0 %	529218946
5515	NC_021984	GAT	2	6	254284	254289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218946
5516	NC_021984	ACG	2	6	254483	254488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218946
5517	NC_021984	CAT	2	6	254502	254507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218946
5518	NC_021984	GCA	2	6	254511	254516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218946
5519	NC_021984	TTC	2	6	254524	254529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218946
5520	NC_021984	CCTTCG	2	12	254582	254593	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	529218946
5521	NC_021984	GGC	2	6	254608	254613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218946
5522	NC_021984	CT	3	6	254669	254674	0 %	50 %	0 %	50 %	529218946
5523	NC_021984	CGA	2	6	254718	254723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218946
5524	NC_021984	CAC	2	6	254833	254838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218946
5525	NC_021984	AGGC	2	8	254885	254892	25 %	0 %	50 %	25 %	529218946
5526	NC_021984	GTT	2	6	254904	254909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218946
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5529	NC_021984	GAT	2	6	255084	255089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_021984	AAT	2	6	255096	255101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_021984	TCAG	2	8	255124	255131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5532	NC_021984	GT	3	6	255186	255191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_021984	T	6	6	255200	255205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_021984	ACTG	2	8	255216	255223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_021984	GCC	2	6	255253	255258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_021984	CAA	2	6	255302	255307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_021984	GC	3	6	255341	255346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_021984	AC	3	6	255372	255377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_021984	AAC	2	6	255410	255415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_021984	AC	4	8	255414	255421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_021984	GC	3	6	255611	255616	0 %	0 %	50 %	50 %	529218947
5542	NC_021984	CAT	2	6	255630	255635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218947
5543	NC_021984	CTGAA	2	10	255677	255686	40 %	20 %	20 %	20 %	529218947
5544	NC_021984	AAGCG	2	10	255741	255750	40 %	0 %	40 %	20 %	529218947
5545	NC_021984	GCT	2	6	255760	255765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218947
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5547	NC_021984	GCTG	2	8	255797	255804	0 %	25 %	50 %	25 %	529218947
5548	NC_021984	AAGA	2	8	255904	255911	75 %	0 %	25 %	0 %	529218947
5549	NC_021984	AAC	2	6	256042	256047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218947
5550	NC_021984	GAA	2	6	256213	256218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218947
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5552	NC_021984	GGC	2	6	256281	256286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_021984	GTA	2	6	256394	256399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_021984	ATG	2	6	256554	256559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218948
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5556	NC_021984	CTGA	2	8	256575	256582	25 %	25 %	25 %	25 %	529218948
5557	NC_021984	GCG	2	6	256641	256646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218948
5558	NC_021984	A	6	6	256647	256652	100 %	0 %	0 %	0 %	529218948
5559	NC_021984	GCT	2	6	256665	256670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218948
5560	NC_021984	GACT	2	8	256733	256740	25 %	25 %	25 %	25 %	529218948
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5565	NC_021984	GCAA	2	8	257019	257026	50 %	0 %	25 %	25 %	529218948
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5574	NC_021984	CTT	2	6	257376	257381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_021984	GAAA	2	8	257484	257491	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5591	NC_021984	TG	3	6	258317	258322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_021984	GTCTG	2	10	258326	258335	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5605	NC_021984	GTG	2	6	258974	258979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5607	NC_021984	GCG	2	6	259019	259024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_021984	GCA	2	6	259107	259112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530331563
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5624	NC_021984	CCA	2	6	259731	259736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530331563
5625	NC_021984	TGA	2	6	259737	259742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530331563
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5627	NC_021984	TCAT	2	8	259827	259834	25 %	50 %	0 %	25 %	530331563
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5635	NC_021984	TGA	2	6	260188	260193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530331563
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5639	NC_021984	T	6	6	260383	260388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5640	NC_021984	A	6	6	260561	260566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5740	NC_021984	CCAG	2	8	265848	265855	25 %	0 %	25 %	50 %	529218955
5741	NC_021984	TCT	2	6	265947	265952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218955
5742	NC_021984	TTA	2	6	266164	266169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218956
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5867	NC_021984	CGG	2	6	272600	272605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218962
5868	NC_021984	CG	3	6	272621	272626	0 %	0 %	50 %	50 %	529218962
5869	NC_021984	TGG	2	6	272684	272689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218962
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5872	NC_021984	GCA	2	6	272787	272792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218962
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5890	NC_021984	CCGCG	2	10	273465	273474	0 %	0 %	40 %	60 %	529218962
5891	NC_021984	TGA	2	6	273476	273481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218962
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5900	NC_021984	CCGC	2	8	273980	273987	0 %	0 %	25 %	75 %	529218962
5901	NC_021984	TGA	2	6	274062	274067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218962
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5904	NC_021984	TC	3	6	274190	274195	0 %	50 %	0 %	50 %	529218962
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5932	NC_021984	CGT	2	6	275200	275205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218963
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5935	NC_021984	GCAG	2	8	275386	275393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5936	NC_021984	A	6	6	275429	275434	100 %	0 %	0 %	0 %	529218964
5937	NC_021984	GCCGC	2	10	275491	275500	0 %	0 %	40 %	60 %	529218964
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5942	NC_021984	CGG	2	6	275777	275782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218964
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5959	NC_021984	GCCGG	2	10	276721	276730	0 %	0 %	60 %	40 %	529218964
5960	NC_021984	CGAC	2	8	276779	276786	25 %	0 %	25 %	50 %	529218964
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5964	NC_021984	AGC	3	9	277024	277032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218964
5965	NC_021984	GCCT	2	8	277122	277129	0 %	25 %	25 %	50 %	529218964
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5968	NC_021984	CAT	2	6	277263	277268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218965
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5971	NC_021984	GCG	2	6	277415	277420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218965
5972	NC_021984	CT	3	6	277490	277495	0 %	50 %	0 %	50 %	529218965
5973	NC_021984	T	6	6	277561	277566	0 %	100 %	0 %	0 %	529218965
5974	NC_021984	GCTG	2	8	277581	277588	0 %	25 %	50 %	25 %	529218965
5975	NC_021984	TCA	2	6	277608	277613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218965
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5980	NC_021984	GGC	2	6	277771	277776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218965
5981	NC_021984	GCT	2	6	277824	277829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218965
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5983	NC_021984	TGA	3	9	278012	278020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218965
5984	NC_021984	CT	3	6	278033	278038	0 %	50 %	0 %	50 %	529218965
5985	NC_021984	CGG	2	6	278073	278078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218965
5986	NC_021984	CTG	2	6	278188	278193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218965
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5988	NC_021984	GGC	2	6	278364	278369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218965
5989	NC_021984	ATG	2	6	278437	278442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218965
5990	NC_021984	CGG	2	6	278492	278497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218965
5991	NC_021984	TGC	2	6	278501	278506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218965
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5997	NC_021984	CGC	2	6	278787	278792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218965
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