MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pullorum str. S06004

Total Repeats: 98999

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021984	CTG	2	6	230880	230885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_021984	ATT	2	6	230886	230891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021984	GCC	2	6	230898	230903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_021984	GCG	2	6	230908	230913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_021984	CGC	2	6	230920	230925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_021984	TGC	2	6	230971	230976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_021984	ATG	2	6	230979	230984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021984	GCG	2	6	230995	231000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_021984	CGC	2	6	231119	231124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_021984	GCG	2	6	231147	231152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_021984	CG	5	10	231157	231166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_021984	GCT	2	6	231199	231204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_021984	GGC	2	6	231211	231216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_021984	CGA	2	6	231234	231239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_021984	CGG	2	6	231391	231396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_021984	GC	3	6	231418	231423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_021984	A	8	8	231460	231467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_021984	CAATAT	2	12	231524	231535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5019	NC_021984	CTGTC	2	10	231591	231600	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5020	NC_021984	AAG	2	6	231637	231642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021984	GC	3	6	231686	231691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_021984	TGA	2	6	231744	231749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021984	AAT	2	6	231772	231777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021984	TAA	3	9	231866	231874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021984	ATA	2	6	231895	231900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_021984	ATT	2	6	231905	231910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021984	T	7	7	231909	231915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021984	TAA	2	6	231923	231928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021984	A	6	6	231927	231932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021984	AAAT	2	8	231944	231951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_021984	A	7	7	231970	231976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021984	T	6	6	231989	231994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021984	T	8	8	231996	232003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021984	AAAT	2	8	232021	232028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021984	TA	3	6	232044	232049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021984	T	7	7	232071	232077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021984	T	7	7	232100	232106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021984	CTTG	2	8	232118	232125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_021984	TTTG	2	8	232127	232134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021984	T	6	6	232135	232140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_021984	TAT	2	6	232157	232162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021984	TGA	2	6	232170	232175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_021984	TAAA	2	8	232181	232188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021984	A	6	6	232186	232191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021984	CG	3	6	232228	232233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_021984	TTAT	2	8	232243	232250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021984	GTT	2	6	232257	232262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021984	CTT	2	6	232265	232270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_021984	ATATA	2	10	232304	232313	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021984	CTA	2	6	232317	232322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_021984	TAA	2	6	232385	232390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021984	CAG	2	6	232407	232412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_021984	TGC	2	6	232426	232431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_021984	TGC	2	6	232465	232470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_021984	CGA	2	6	232540	232545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_021984	GAT	2	6	232691	232696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021984	TC	3	6	232708	232713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_021984	ATC	2	6	232752	232757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_021984	TTA	2	6	232800	232805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_021984	ATA	2	6	232818	232823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021984	GCT	2	6	232870	232875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_021984	ATT	2	6	232997	233002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021984	TAT	2	6	233076	233081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021984	ATG	2	6	233121	233126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021984	GGTG	2	8	233161	233168	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021984	GC	3	6	233191	233196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_021984	GGCG	2	8	233298	233305	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_021984	GGC	2	6	233384	233389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_021984	CGA	2	6	233401	233406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_021984	AT	3	6	233445	233450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_021984	GC	3	6	233459	233464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_021984	GCGG	2	8	233493	233500	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_021984	GAA	2	6	233588	233593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021984	GGC	2	6	233717	233722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_021984	CCT	2	6	233742	233747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_021984	CGG	2	6	233776	233781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_021984	GCT	2	6	233839	233844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_021984	TGA	2	6	233959	233964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021984	GAA	2	6	234005	234010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021984	TGA	2	6	234286	234291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021984	CAA	2	6	234325	234330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_021984	ACA	3	9	234366	234374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_021984	CG	3	6	234437	234442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_021984	TCA	2	6	234475	234480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_021984	CGG	2	6	234538	234543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_021984	GCACC	2	10	234592	234601	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5087	NC_021984	CGG	2	6	234610	234615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_021984	TGG	2	6	234627	234632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021984	TA	3	6	234681	234686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021984	ACT	2	6	234726	234731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_021984	CGC	2	6	234833	234838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_021984	A	6	6	234857	234862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021984	GGC	2	6	234890	234895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_021984	CGC	2	6	234897	234902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_021984	ACA	2	6	234921	234926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_021984	GCG	2	6	235037	235042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021984	TGC	2	6	235083	235088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_021984	TCA	2	6	235106	235111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_021984	GCG	2	6	235162	235167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_021984	CT	3	6	235193	235198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_021984	ATG	2	6	235237	235242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218931
5102	NC_021984	TGC	2	6	235274	235279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218931
5103	NC_021984	GGC	2	6	235288	235293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218931
5104	NC_021984	GCC	2	6	235309	235314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218931
5105	NC_021984	TCACC	2	10	235445	235454	20 %	20 %	0 %	60 %	529218931
5106	NC_021984	TCG	2	6	235460	235465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218931
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5108	NC_021984	CCG	2	6	235588	235593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218931
5109	NC_021984	T	6	6	235646	235651	0 %	100 %	0 %	0 %	529218931
5110	NC_021984	GCA	2	6	235683	235688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218931
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5113	NC_021984	GC	3	6	235913	235918	0 %	0 %	50 %	50 %	529218931
5114	NC_021984	ACA	2	6	235946	235951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218931
5115	NC_021984	GCA	2	6	236080	236085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218932
5116	NC_021984	GCCGC	2	10	236128	236137	0 %	0 %	40 %	60 %	529218932
5117	NC_021984	CGG	2	6	236151	236156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218932
5118	NC_021984	GAC	2	6	236181	236186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218932
5119	NC_021984	GC	3	6	236363	236368	0 %	0 %	50 %	50 %	529218932
5120	NC_021984	AAT	2	6	236434	236439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218932
5121	NC_021984	TGG	3	9	236483	236491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218932
5122	NC_021984	A	7	7	236502	236508	100 %	0 %	0 %	0 %	529218932
5123	NC_021984	TAA	2	6	236524	236529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021984	GCA	2	6	236530	236535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_021984	CCG	2	6	236589	236594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_021984	CTG	2	6	236643	236648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_021984	TAA	2	6	236651	236656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021984	GTGA	2	8	236760	236767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_021984	CGG	3	9	236776	236784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_021984	CCA	2	6	236851	236856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_021984	GGC	2	6	236931	236936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_021984	TTA	2	6	236993	236998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218933
5133	NC_021984	TGG	2	6	237078	237083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218933
5134	NC_021984	TCG	2	6	237137	237142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218933
5135	NC_021984	G	6	6	237233	237238	0 %	0 %	100 %	0 %	529218933
5136	NC_021984	TTC	2	6	237467	237472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218933
5137	NC_021984	ATG	2	6	237502	237507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218933
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5139	NC_021984	TGC	2	6	237530	237535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221993
5140	NC_021984	CTG	2	6	237646	237651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221993
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5142	NC_021984	AGG	2	6	237702	237707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_021984	GC	3	6	237799	237804	0 %	0 %	50 %	50 %	529221994
5144	NC_021984	CTGG	2	8	237894	237901	0 %	25 %	50 %	25 %	529221994
5145	NC_021984	CTG	3	9	237917	237925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529221994
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5154	NC_021984	A	8	8	238395	238402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5155	NC_021984	GGC	2	6	238410	238415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5240	NC_021984	TTGG	2	8	242231	242238	0 %	50 %	50 %	0 %	529218937
5241	NC_021984	CAG	2	6	242244	242249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218937
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5244	NC_021984	ACG	2	6	242365	242370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218937
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5247	NC_021984	ATA	2	6	242560	242565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218938
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5250	NC_021984	GAA	2	6	242834	242839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218938
5251	NC_021984	GCG	2	6	242881	242886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218938
5252	NC_021984	CTGC	2	8	242909	242916	0 %	25 %	25 %	50 %	529218938
5253	NC_021984	GGC	2	6	242943	242948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218938
5254	NC_021984	CCAC	2	8	242993	243000	25 %	0 %	0 %	75 %	529218938
5255	NC_021984	CCG	2	6	243052	243057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218938
5256	NC_021984	CGA	2	6	243065	243070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218938
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5258	NC_021984	T	6	6	243137	243142	0 %	100 %	0 %	0 %	529218938
5259	NC_021984	CGGG	2	8	243149	243156	0 %	0 %	75 %	25 %	529218938
5260	NC_021984	GCT	2	6	243168	243173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218938
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5263	NC_021984	GA	3	6	243224	243229	50 %	0 %	50 %	0 %	529218938
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5333	NC_021984	GCA	2	6	246818	246823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218941
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5344	NC_021984	C	6	6	247216	247221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5345	NC_021984	TGCTC	2	10	247294	247303	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5346	NC_021984	AGG	2	6	247306	247311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5347	NC_021984	TGGC	2	8	247318	247325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5348	NC_021984	GC	3	6	247358	247363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5349	NC_021984	CAT	2	6	247372	247377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5350	NC_021984	TAT	2	6	247414	247419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5351	NC_021984	GCG	2	6	247425	247430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5352	NC_021984	GC	3	6	247461	247466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5353	NC_021984	GT	3	6	247634	247639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5354	NC_021984	ATG	2	6	247652	247657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_021984	TGA	2	6	247719	247724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_021984	GAA	2	6	247739	247744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5357	NC_021984	TGG	2	6	247758	247763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5358	NC_021984	GGC	2	6	247782	247787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5359	NC_021984	GGT	2	6	247788	247793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5360	NC_021984	CAG	2	6	247843	247848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5362	NC_021984	TGG	2	6	247913	247918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_021984	ATC	2	6	247964	247969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5365	NC_021984	CCGGG	2	10	248051	248060	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5366	NC_021984	GC	3	6	248086	248091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5367	NC_021984	GAT	2	6	248097	248102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_021984	AG	3	6	248124	248129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_021984	TGC	2	6	248156	248161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5370	NC_021984	GGC	2	6	248185	248190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5371	NC_021984	GC	3	6	248209	248214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5372	NC_021984	AAC	2	6	248242	248247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5373	NC_021984	TTA	2	6	248251	248256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_021984	CGG	2	6	248449	248454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5375	NC_021984	AT	3	6	248480	248485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5376	NC_021984	AC	3	6	248525	248530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5377	NC_021984	CTTA	2	8	248533	248540	25 %	50 %	0 %	25 %	529218942
5378	NC_021984	CGA	2	6	248587	248592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218942
5379	NC_021984	GTC	2	6	248612	248617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218942
5380	NC_021984	CTT	2	6	248716	248721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218942
5381	NC_021984	CCA	2	6	248746	248751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218942
5382	NC_021984	CTT	2	6	248848	248853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218942
5383	NC_021984	CGAT	2	8	248868	248875	25 %	25 %	25 %	25 %	529218942
5384	NC_021984	CATA	2	8	248914	248921	50 %	25 %	0 %	25 %	529218942
5385	NC_021984	TCA	2	6	248932	248937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5387	NC_021984	CCA	2	6	248979	248984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5388	NC_021984	A	7	7	248993	248999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5433	NC_021984	ATG	2	6	250797	250802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218944
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5444	NC_021984	CGGCG	2	10	251281	251290	0 %	0 %	60 %	40 %	529218944
5445	NC_021984	CTG	2	6	251321	251326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218944
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5456	NC_021984	A	6	6	251612	251617	100 %	0 %	0 %	0 %	529218945
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5500	NC_021984	CAG	2	6	253582	253587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218945

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