MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 3383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021902	GTTTC	2	10	2364	2373	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021902	ATCGA	2	10	2443	2452	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021902	GGCGC	2	10	4242	4251	0 %	0 %	60 %	40 %	528816722
4	NC_021902	CTGAT	2	10	4258	4267	20 %	40 %	20 %	20 %	528816722
5	NC_021902	GGCCA	2	10	4454	4463	20 %	0 %	40 %	40 %	528816723
6	NC_021902	AGCAG	2	10	4708	4717	40 %	0 %	40 %	20 %	528816723
7	NC_021902	CGCTG	2	10	6153	6162	0 %	20 %	40 %	40 %	528816725
8	NC_021902	GTGAA	2	10	6404	6413	40 %	20 %	40 %	0 %	528816725
9	NC_021902	TGACT	2	10	8848	8857	20 %	40 %	20 %	20 %	528816728
10	NC_021902	GAAGC	2	10	9634	9643	40 %	0 %	40 %	20 %	528816729
11	NC_021902	CTTTT	2	10	10429	10438	0 %	80 %	0 %	20 %	528816730
12	NC_021902	TGAAA	2	10	12056	12065	60 %	20 %	20 %	0 %	528816731
13	NC_021902	AATCT	2	10	13278	13287	40 %	40 %	0 %	20 %	528816732
14	NC_021902	TGGCG	2	10	14776	14785	0 %	20 %	60 %	20 %	528816733
15	NC_021902	TTTGC	2	10	16776	16785	0 %	60 %	20 %	20 %	528816734
16	NC_021902	TTAAA	2	10	17243	17252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021902	CGGCG	2	10	17522	17531	0 %	0 %	60 %	40 %	528816735
18	NC_021902	CTGGT	2	10	18663	18672	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021902	CCGGC	2	10	20470	20479	0 %	0 %	40 %	60 %	528816737
20	NC_021902	GCGCT	2	10	23457	23466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_021902	ACGCC	2	10	26809	26818	20 %	0 %	20 %	60 %	528816744
22	NC_021902	GCGCG	2	10	27429	27438	0 %	0 %	60 %	40 %	528816745
23	NC_021902	TGCTT	2	10	29780	29789	0 %	60 %	20 %	20 %	528816747
24	NC_021902	GGTGC	2	10	31724	31733	0 %	20 %	60 %	20 %	528816748
25	NC_021902	CTGGC	2	10	31797	31806	0 %	20 %	40 %	40 %	528816748
26	NC_021902	TTGCG	2	10	32677	32686	0 %	40 %	40 %	20 %	528816748
27	NC_021902	TTTAC	2	10	37110	37119	20 %	60 %	0 %	20 %	528816753
28	NC_021902	CTCTC	2	10	39232	39241	0 %	40 %	0 %	60 %	528816754
29	NC_021902	AGGAG	2	10	42754	42763	40 %	0 %	60 %	0 %	528816757
30	NC_021902	TGAAA	2	10	47331	47340	60 %	20 %	20 %	0 %	528816761
31	NC_021902	GAGCA	2	10	48262	48271	40 %	0 %	40 %	20 %	528816762
32	NC_021902	GTACC	2	10	51265	51274	20 %	20 %	20 %	40 %	528816764
33	NC_021902	TCGTT	2	10	51717	51726	0 %	60 %	20 %	20 %	528816764
34	NC_021902	ATGTG	2	10	54438	54447	20 %	40 %	40 %	0 %	528816767
35	NC_021902	CGATG	2	10	55012	55021	20 %	20 %	40 %	20 %	528816768
36	NC_021902	CGGCG	2	10	56330	56339	0 %	0 %	60 %	40 %	528816769
37	NC_021902	CGGTC	2	10	58241	58250	0 %	20 %	40 %	40 %	528816769
38	NC_021902	TGTTA	2	10	59168	59177	20 %	60 %	20 %	0 %	528816771
39	NC_021902	TCCTG	2	10	59979	59988	0 %	40 %	20 %	40 %	528816771
40	NC_021902	CGCGC	2	10	60954	60963	0 %	0 %	40 %	60 %	528816772
41	NC_021902	CGGCG	2	10	62182	62191	0 %	0 %	60 %	40 %	528816774
42	NC_021902	GCTCG	2	10	63943	63952	0 %	20 %	40 %	40 %	528816777
43	NC_021902	GCTGG	2	10	63970	63979	0 %	20 %	60 %	20 %	528816777
44	NC_021902	GTGGC	2	10	66813	66822	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021902	CGATG	2	10	67245	67254	20 %	20 %	40 %	20 %	528816780
46	NC_021902	GCCGT	2	10	67405	67414	0 %	20 %	40 %	40 %	528816780
47	NC_021902	CCTTG	2	10	69747	69756	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_021902	TGAAA	2	10	71860	71869	60 %	20 %	20 %	0 %	528816786
49	NC_021902	TCATG	2	10	72622	72631	20 %	40 %	20 %	20 %	528816789
50	NC_021902	CGGAA	2	10	72880	72889	40 %	0 %	40 %	20 %	528816790
51	NC_021902	TACTG	2	10	74184	74193	20 %	40 %	20 %	20 %	528816791
52	NC_021902	TTCAG	2	10	75268	75277	20 %	40 %	20 %	20 %	528816792
53	NC_021902	TGGCG	2	10	76991	77000	0 %	20 %	60 %	20 %	528816793
54	NC_021902	GAACG	2	10	77380	77389	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021902	CAGCG	2	10	78505	78514	20 %	0 %	40 %	40 %	528816794
56	NC_021902	GCGCG	2	10	78850	78859	0 %	0 %	60 %	40 %	528816794
57	NC_021902	CGGGC	2	10	81763	81772	0 %	0 %	60 %	40 %	528816796
58	NC_021902	ATTCC	2	10	81813	81822	20 %	40 %	0 %	40 %	528816796
59	NC_021902	CCCGG	2	10	81998	82007	0 %	0 %	40 %	60 %	528816796
60	NC_021902	GGCGC	2	10	82793	82802	0 %	0 %	60 %	40 %	528816796
61	NC_021902	CGGCG	2	10	86030	86039	0 %	0 %	60 %	40 %	528816800
62	NC_021902	TACGC	2	10	86282	86291	20 %	20 %	20 %	40 %	528816800
63	NC_021902	CGGCG	2	10	86711	86720	0 %	0 %	60 %	40 %	528816800
64	NC_021902	TTGCT	2	10	87148	87157	0 %	60 %	20 %	20 %	528816801
65	NC_021902	TGCCC	2	10	87781	87790	0 %	20 %	20 %	60 %	528816801
66	NC_021902	CCCTG	2	10	88942	88951	0 %	20 %	20 %	60 %	528816803
67	NC_021902	ATCTG	2	10	89116	89125	20 %	40 %	20 %	20 %	528816803
68	NC_021902	CACCT	2	10	91406	91415	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_021902	TGGCG	2	10	92658	92667	0 %	20 %	60 %	20 %	528816805
70	NC_021902	CTTAT	2	10	92729	92738	20 %	60 %	0 %	20 %	528816805
71	NC_021902	ATGGT	2	10	94796	94805	20 %	40 %	40 %	0 %	528816808
72	NC_021902	GTTTT	2	10	95971	95980	0 %	80 %	20 %	0 %	528816810
73	NC_021902	GATTG	2	10	96113	96122	20 %	40 %	40 %	0 %	528816810
74	NC_021902	GATCA	2	10	96161	96170	40 %	20 %	20 %	20 %	528816811
75	NC_021902	GCAAA	2	10	96203	96212	60 %	0 %	20 %	20 %	528816811
76	NC_021902	GGCGC	2	10	99805	99814	0 %	0 %	60 %	40 %	528816814
77	NC_021902	TTCCC	2	10	101657	101666	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_021902	CGCGG	2	10	104561	104570	0 %	0 %	60 %	40 %	528816819
79	NC_021902	GGTCG	2	10	106848	106857	0 %	20 %	60 %	20 %	528816822
80	NC_021902	AGCGC	2	10	108497	108506	20 %	0 %	40 %	40 %	528816822
81	NC_021902	CGCGG	2	10	109313	109322	0 %	0 %	60 %	40 %	528816823
82	NC_021902	GCCGC	2	10	109663	109672	0 %	0 %	40 %	60 %	528816824
83	NC_021902	ATAAA	2	10	116974	116983	80 %	20 %	0 %	0 %	528816832
84	NC_021902	CTGGC	2	10	118346	118355	0 %	20 %	40 %	40 %	528816833
85	NC_021902	GTGTT	2	10	119930	119939	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021902	GTCAG	2	10	125315	125324	20 %	20 %	40 %	20 %	528816839
87	NC_021902	TCCCG	2	10	126310	126319	0 %	20 %	20 %	60 %	528816839
88	NC_021902	GTGAT	2	10	127656	127665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021902	TATGG	2	10	129368	129377	20 %	40 %	40 %	0 %	528816843
90	NC_021902	GCCGC	2	10	130828	130837	0 %	0 %	40 %	60 %	528816844
91	NC_021902	AGTTC	2	10	131403	131412	20 %	40 %	20 %	20 %	528816844
92	NC_021902	AGGCG	2	10	132906	132915	20 %	0 %	60 %	20 %	528816844
93	NC_021902	ACACC	2	10	133182	133191	40 %	0 %	0 %	60 %	528816845
94	NC_021902	GATGG	2	10	134670	134679	20 %	20 %	60 %	0 %	528816845
95	NC_021902	TTTGA	2	10	136102	136111	20 %	60 %	20 %	0 %	528816846
96	NC_021902	CGGCG	2	10	137012	137021	0 %	0 %	60 %	40 %	528816847
97	NC_021902	TGCCT	2	10	138044	138053	0 %	40 %	20 %	40 %	528816848
98	NC_021902	ATTTA	2	10	138363	138372	40 %	60 %	0 %	0 %	528816848
99	NC_021902	GCGAC	2	10	138960	138969	20 %	0 %	40 %	40 %	528816849
100	NC_021902	CGCTT	2	10	140375	140384	0 %	40 %	20 %	40 %	528816849
101	NC_021902	TGCGC	2	10	140675	140684	0 %	20 %	40 %	40 %	528816849
102	NC_021902	TGATG	2	10	143013	143022	20 %	40 %	40 %	0 %	528816851
103	NC_021902	ACCCA	2	10	146900	146909	40 %	0 %	0 %	60 %	528816856
104	NC_021902	TAAAT	2	10	147278	147287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021902	GTTGG	2	10	147806	147815	0 %	40 %	60 %	0 %	528816857
106	NC_021902	GGGAA	2	10	148444	148453	40 %	0 %	60 %	0 %	528816858
107	NC_021902	GCAGC	2	10	157855	157864	20 %	0 %	40 %	40 %	528816871
108	NC_021902	ACGGC	2	10	159256	159265	20 %	0 %	40 %	40 %	528816873
109	NC_021902	CTTTG	2	10	161807	161816	0 %	60 %	20 %	20 %	528816876
110	NC_021902	TTGAA	2	10	161940	161949	40 %	40 %	20 %	0 %	528816876
111	NC_021902	TACGC	2	10	164045	164054	20 %	20 %	20 %	40 %	528816878
112	NC_021902	TTTTA	2	10	164353	164362	20 %	80 %	0 %	0 %	528816878
113	NC_021902	TTCCC	2	10	165844	165853	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_021902	ATGGT	2	10	166326	166335	20 %	40 %	40 %	0 %	528816880
115	NC_021902	TTTAA	2	10	166583	166592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021902	AAATT	2	10	167102	167111	60 %	40 %	0 %	0 %	528816881
117	NC_021902	AAAGA	2	10	169437	169446	80 %	0 %	20 %	0 %	528816883
118	NC_021902	GCGTC	2	10	172263	172272	0 %	20 %	40 %	40 %	528816886
119	NC_021902	AAGCG	2	10	173655	173664	40 %	0 %	40 %	20 %	528816887
120	NC_021902	GGGGC	2	10	174932	174941	0 %	0 %	80 %	20 %	528816888
121	NC_021902	GCGTA	2	10	177085	177094	20 %	20 %	40 %	20 %	528816890
122	NC_021902	GCGCG	2	10	177149	177158	0 %	0 %	60 %	40 %	528816890
123	NC_021902	CGCTC	2	10	178431	178440	0 %	20 %	20 %	60 %	528816891
124	NC_021902	TCATC	2	10	178891	178900	20 %	40 %	0 %	40 %	528816891
125	NC_021902	GCACA	2	10	181709	181718	40 %	0 %	20 %	40 %	528816894
126	NC_021902	GTATT	2	10	183230	183239	20 %	60 %	20 %	0 %	528816896
127	NC_021902	CACGC	2	10	183484	183493	20 %	0 %	20 %	60 %	528816897
128	NC_021902	GCGCG	2	10	184035	184044	0 %	0 %	60 %	40 %	528816897
129	NC_021902	AGGCC	2	10	185446	185455	20 %	0 %	40 %	40 %	528816898
130	NC_021902	GTAAG	2	10	185640	185649	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021902	TGGCG	2	10	190446	190455	0 %	20 %	60 %	20 %	528816905
132	NC_021902	GCGAT	2	10	192353	192362	20 %	20 %	40 %	20 %	528816906
133	NC_021902	TTAAT	2	10	192579	192588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021902	GCAGT	2	10	199306	199315	20 %	20 %	40 %	20 %	528816912
135	NC_021902	CCGTG	2	10	201351	201360	0 %	20 %	40 %	40 %	528816914
136	NC_021902	TCATG	2	10	201954	201963	20 %	40 %	20 %	20 %	528816914
137	NC_021902	TGTAG	2	10	203101	203110	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021902	CGGAA	2	10	207140	207149	40 %	0 %	40 %	20 %	528816917
139	NC_021902	GGATT	2	10	207367	207376	20 %	40 %	40 %	0 %	528816917
140	NC_021902	TTAAA	2	10	207446	207455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021902	GCGCT	2	10	210298	210307	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_021902	GCGCT	2	10	210354	210363	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_021902	TATCG	2	10	210940	210949	20 %	40 %	20 %	20 %	528816920
144	NC_021902	ATGGC	2	10	212369	212378	20 %	20 %	40 %	20 %	528816920
145	NC_021902	GGGCC	2	10	216242	216251	0 %	0 %	60 %	40 %	528816925
146	NC_021902	CGGAA	2	10	219037	219046	40 %	0 %	40 %	20 %	528816927
147	NC_021902	GCGCC	2	10	219181	219190	0 %	0 %	40 %	60 %	528816927
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149	NC_021902	CGTAA	2	10	220125	220134	40 %	20 %	20 %	20 %	528816928
150	NC_021902	TGATT	2	10	221492	221501	20 %	60 %	20 %	0 %	528816930
151	NC_021902	GCACC	2	10	223290	223299	20 %	0 %	20 %	60 %	528816932
152	NC_021902	GGTTG	2	10	225110	225119	0 %	40 %	60 %	0 %	528816934
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154	NC_021902	AAATA	2	10	226963	226972	80 %	20 %	0 %	0 %	528816935
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156	NC_021902	CTGGG	2	10	231536	231545	0 %	20 %	60 %	20 %	528816938
157	NC_021902	TCTGT	2	10	235231	235240	0 %	60 %	20 %	20 %	528816944
158	NC_021902	TTTTA	2	10	239823	239832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021902	TACGC	2	10	240327	240336	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_021902	AATAA	2	10	240480	240489	80 %	20 %	0 %	0 %	528816951
161	NC_021902	CGGTA	2	10	242580	242589	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_021902	GCGCC	2	10	243038	243047	0 %	0 %	40 %	60 %	528816954
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164	NC_021902	GGTTT	2	10	244473	244482	0 %	60 %	40 %	0 %	528816955
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167	NC_021902	CCGGC	2	10	245691	245700	0 %	0 %	40 %	60 %	528816955
168	NC_021902	GGTGG	2	10	245745	245754	0 %	20 %	80 %	0 %	528816956
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176	NC_021902	AGCGA	2	10	255741	255750	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
177	NC_021902	AGCGA	2	10	255909	255918	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_021902	CGCTG	2	10	263466	263475	0 %	20 %	40 %	40 %	528816972
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184	NC_021902	ATGCG	2	10	266517	266526	20 %	20 %	40 %	20 %	528816975
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195	NC_021902	GCCCG	2	10	291656	291665	0 %	0 %	40 %	60 %	528816994
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197	NC_021902	CGGCG	2	10	292323	292332	0 %	0 %	60 %	40 %	528816995
198	NC_021902	ATGAG	2	10	293388	293397	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
199	NC_021902	GCGTT	2	10	293516	293525	0 %	40 %	40 %	20 %	528816996
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212	NC_021902	TGCGC	2	10	311014	311023	0 %	20 %	40 %	40 %	528817012
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214	NC_021902	ACTTT	2	10	315304	315313	20 %	60 %	0 %	20 %	528817015
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232	NC_021902	GTCCG	2	10	340708	340717	0 %	20 %	40 %	40 %	528817041
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234	NC_021902	CGTGG	2	10	345102	345111	0 %	20 %	60 %	20 %	528817046
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236	NC_021902	GCCAG	2	10	346522	346531	20 %	0 %	40 %	40 %	528817047
237	NC_021902	CTTTT	2	10	348371	348380	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
238	NC_021902	CATGT	2	10	348465	348474	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
239	NC_021902	GTACT	2	10	348974	348983	20 %	40 %	20 %	20 %	528817051
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241	NC_021902	CGGGG	2	10	350351	350360	0 %	0 %	80 %	20 %	528817052
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249	NC_021902	CTTTT	2	10	362335	362344	0 %	80 %	0 %	20 %	528817065
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253	NC_021902	GCCAG	2	10	370344	370353	20 %	0 %	40 %	40 %	528817072
254	NC_021902	CGGCA	2	10	372490	372499	20 %	0 %	40 %	40 %	528817073
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258	NC_021902	GATCA	2	10	375542	375551	40 %	20 %	20 %	20 %	528817075
259	NC_021902	TCAGC	2	10	376387	376396	20 %	20 %	20 %	40 %	528817075
260	NC_021902	CAGAT	2	10	377994	378003	40 %	20 %	20 %	20 %	528817076
261	NC_021902	TGCGC	2	10	390190	390199	0 %	20 %	40 %	40 %	528817087
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264	NC_021902	TCGCT	2	10	392296	392305	0 %	40 %	20 %	40 %	528817087
265	NC_021902	TCACT	2	10	392587	392596	20 %	40 %	0 %	40 %	528817087
266	NC_021902	TCGAT	2	10	393546	393555	20 %	40 %	20 %	20 %	528817088
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268	NC_021902	AGCTG	2	10	394155	394164	20 %	20 %	40 %	20 %	528817088
269	NC_021902	CCTGG	2	10	394332	394341	0 %	20 %	40 %	40 %	528817088
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286	NC_021902	AGCGC	2	10	415076	415085	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
287	NC_021902	ACGGT	2	10	416802	416811	20 %	20 %	40 %	20 %	528817107
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291	NC_021902	CAGTT	2	10	428165	428174	20 %	40 %	20 %	20 %	528817117
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385	NC_021902	ATGAA	2	10	543290	543299	60 %	20 %	20 %	0 %	528817253
386	NC_021902	CCGTT	2	10	546053	546062	0 %	40 %	20 %	40 %	528817255
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388	NC_021902	TATGA	2	10	549061	549070	40 %	40 %	20 %	0 %	528817257
389	NC_021902	ATAAC	2	10	549760	549769	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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