MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021902	GGT	2	6	187371	187376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816900
4002	NC_021902	GTC	2	6	187407	187412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816900
4003	NC_021902	AAC	3	9	187425	187433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816900
4004	NC_021902	TGG	2	6	187537	187542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816900
4005	NC_021902	CGC	2	6	187557	187562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816900
4006	NC_021902	GTG	2	6	187572	187577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816900
4007	NC_021902	GGT	2	6	187637	187642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816900
4008	NC_021902	CGC	2	6	187666	187671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816900
4009	NC_021902	TCT	2	6	187727	187732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816900
4010	NC_021902	TCG	2	6	187745	187750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816900
4011	NC_021902	TTG	2	6	187758	187763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816900
4012	NC_021902	CCG	2	6	187768	187773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816900
4013	NC_021902	TTC	2	6	187813	187818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816900
4014	NC_021902	GAT	2	6	187964	187969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816900
4015	NC_021902	GCC	2	6	188040	188045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816900
4016	NC_021902	TAC	2	6	188063	188068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816900
4017	NC_021902	GC	3	6	188099	188104	0 %	0 %	50 %	50 %	528816900
4018	NC_021902	TTGA	2	8	188175	188182	25 %	50 %	25 %	0 %	528816900
4019	NC_021902	GCC	2	6	188243	188248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816902
4020	NC_021902	AT	3	6	188261	188266	50 %	50 %	0 %	0 %	528816902
4021	NC_021902	ACC	3	9	188318	188326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816903
4022	NC_021902	CAT	2	6	188365	188370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816903
4023	NC_021902	TCT	2	6	188382	188387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816903
4024	NC_021902	CG	3	6	188427	188432	0 %	0 %	50 %	50 %	528816903
4025	NC_021902	AAT	2	6	188451	188456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816903
4026	NC_021902	GGGC	2	8	188484	188491	0 %	0 %	75 %	25 %	528816903
4027	NC_021902	GTC	2	6	188501	188506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816903
4028	NC_021902	CGG	2	6	188532	188537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816903
4029	NC_021902	GGC	2	6	188545	188550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816903
4030	NC_021902	GCG	2	6	188602	188607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816903
4031	NC_021902	ATC	2	6	188617	188622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816903
4032	NC_021902	GAT	2	6	188644	188649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816903
4033	NC_021902	ATG	2	6	188684	188689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816903
4034	NC_021902	CGG	2	6	188701	188706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816903
4035	NC_021902	ATG	2	6	188738	188743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816903
4036	NC_021902	G	6	6	188757	188762	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_021902	GGC	2	6	188807	188812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816904
4038	NC_021902	CAG	2	6	188951	188956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816904
4039	NC_021902	CAG	2	6	189011	189016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816904
4040	NC_021902	GCGG	2	8	189131	189138	0 %	0 %	75 %	25 %	528816904
4041	NC_021902	AG	3	6	189140	189145	50 %	0 %	50 %	0 %	528816904
4042	NC_021902	GGC	2	6	189160	189165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816904
4043	NC_021902	TCT	2	6	189222	189227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816904
4044	NC_021902	GCCA	2	8	189321	189328	25 %	0 %	25 %	50 %	528816904
4045	NC_021902	CGGT	2	8	189349	189356	0 %	25 %	50 %	25 %	528816904
4046	NC_021902	GC	4	8	189503	189510	0 %	0 %	50 %	50 %	528816904
4047	NC_021902	AGC	2	6	189547	189552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816904
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4049	NC_021902	TGGT	2	8	189637	189644	0 %	50 %	50 %	0 %	528816904
4050	NC_021902	CTT	2	6	189649	189654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816904
4051	NC_021902	AGACGG	2	12	189664	189675	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	528816904
4052	NC_021902	GCG	4	12	189708	189719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816904
4053	NC_021902	CGC	2	6	189730	189735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816904
4054	NC_021902	CGC	2	6	189910	189915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816904
4055	NC_021902	AGG	2	6	189938	189943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528816904
4056	NC_021902	GCG	2	6	189960	189965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816904
4057	NC_021902	GCTG	2	8	189974	189981	0 %	25 %	50 %	25 %	528816904
4058	NC_021902	AAT	2	6	189986	189991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816904
4059	NC_021902	TCA	2	6	190067	190072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816905
4060	NC_021902	GTG	2	6	190085	190090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816905
4061	NC_021902	CAT	2	6	190111	190116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816905
4062	NC_021902	CG	3	6	190124	190129	0 %	0 %	50 %	50 %	528816905
4063	NC_021902	GTT	2	6	190173	190178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816905
4064	NC_021902	ATAC	2	8	190210	190217	50 %	25 %	0 %	25 %	528816905
4065	NC_021902	GGA	2	6	190237	190242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528816905
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4069	NC_021902	TGGCG	2	10	190446	190455	0 %	20 %	60 %	20 %	528816905
4070	NC_021902	TGC	2	6	190544	190549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816905
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4072	NC_021902	GAC	2	6	190575	190580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816905
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4078	NC_021902	GGCGAT	2	12	190899	190910	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528816906
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4080	NC_021902	ATC	2	6	190924	190929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816906
4081	NC_021902	GTG	2	6	190948	190953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816906
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4083	NC_021902	TGC	2	6	190990	190995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816906
4084	NC_021902	AG	3	6	191011	191016	50 %	0 %	50 %	0 %	528816906
4085	NC_021902	CAGC	2	8	191064	191071	25 %	0 %	25 %	50 %	528816906
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4088	NC_021902	TGC	2	6	191219	191224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816906
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4092	NC_021902	GC	3	6	191429	191434	0 %	0 %	50 %	50 %	528816906
4093	NC_021902	AAC	2	6	191446	191451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816906
4094	NC_021902	CGG	2	6	191460	191465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816906
4095	NC_021902	AG	3	6	191474	191479	50 %	0 %	50 %	0 %	528816906
4096	NC_021902	AC	3	6	191637	191642	50 %	0 %	0 %	50 %	528816906
4097	NC_021902	GAT	2	6	191661	191666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816906
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4100	NC_021902	CGC	2	6	191762	191767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816906
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4104	NC_021902	GC	3	6	192008	192013	0 %	0 %	50 %	50 %	528816906
4105	NC_021902	CTG	2	6	192020	192025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816906
4106	NC_021902	TGA	2	6	192102	192107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816906
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4108	NC_021902	GAT	2	6	192165	192170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816906
4109	NC_021902	AGA	2	6	192197	192202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816906
4110	NC_021902	CAG	2	6	192252	192257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816906
4111	NC_021902	ACC	2	6	192277	192282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816906
4112	NC_021902	GAA	2	6	192330	192335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816906
4113	NC_021902	GCGAT	2	10	192353	192362	20 %	20 %	40 %	20 %	528816906
4114	NC_021902	CCG	2	6	192386	192391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816906
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4117	NC_021902	ACA	2	6	192530	192535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_021902	TTAT	2	8	192552	192559	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021902	TTAAT	2	10	192579	192588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_021902	ACA	2	6	192648	192653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_021902	GTT	2	6	192706	192711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021902	GCCATC	2	12	192911	192922	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	528816907
4123	NC_021902	CCG	2	6	192935	192940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816907
4124	NC_021902	CTT	2	6	193011	193016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816907
4125	NC_021902	CCG	2	6	193065	193070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816907
4126	NC_021902	GTG	2	6	193091	193096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816907
4127	NC_021902	GTT	2	6	193216	193221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816907
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4226	NC_021902	TTAT	2	8	197836	197843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4227	NC_021902	TCA	2	6	197853	197858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4230	NC_021902	TTAT	2	8	197945	197952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_021902	TATG	2	8	197997	198004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_021902	T	6	6	198010	198015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_021902	GAT	2	6	198020	198025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_021902	A	6	6	198083	198088	100 %	0 %	0 %	0 %	528816909
4235	NC_021902	TA	3	6	198170	198175	50 %	50 %	0 %	0 %	528816909
4236	NC_021902	TCC	2	6	198232	198237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4237	NC_021902	ACA	2	6	198349	198354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816910
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4241	NC_021902	CG	3	6	198414	198419	0 %	0 %	50 %	50 %	528816910
4242	NC_021902	TCA	2	6	198434	198439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816910
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4244	NC_021902	TCTTTT	2	12	198511	198522	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	528816910
4245	NC_021902	CGG	2	6	198542	198547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816910
4246	NC_021902	AG	4	8	198556	198563	50 %	0 %	50 %	0 %	528816910
4247	NC_021902	CCTG	2	8	198565	198572	0 %	25 %	25 %	50 %	528816910
4248	NC_021902	TGG	2	6	198574	198579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816910
4249	NC_021902	T	7	7	198619	198625	0 %	100 %	0 %	0 %	528816910
4250	NC_021902	CTT	2	6	198629	198634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816910
4251	NC_021902	GATA	2	8	198662	198669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_021902	GC	3	6	198681	198686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4253	NC_021902	AGTG	2	8	198687	198694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_021902	TTC	2	6	198696	198701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_021902	ATT	2	6	198751	198756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_021902	ATA	2	6	198771	198776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_021902	T	7	7	198782	198788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_021902	GAAA	2	8	198790	198797	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_021902	GGA	2	6	198916	198921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_021902	CTT	2	6	198955	198960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816911
4261	NC_021902	CCAG	2	8	198989	198996	25 %	0 %	25 %	50 %	528816911
4262	NC_021902	CGC	3	9	199022	199030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816911
4263	NC_021902	TTCC	2	8	199040	199047	0 %	50 %	0 %	50 %	528816911
4264	NC_021902	GC	3	6	199064	199069	0 %	0 %	50 %	50 %	528816911
4265	NC_021902	ATTT	2	8	199072	199079	25 %	75 %	0 %	0 %	528816911
4266	NC_021902	CGG	2	6	199099	199104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816911
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4268	NC_021902	CGG	2	6	199138	199143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4269	NC_021902	T	6	6	199163	199168	0 %	100 %	0 %	0 %	528816912
4270	NC_021902	TCG	2	6	199209	199214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816912
4271	NC_021902	CTG	2	6	199225	199230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816912
4272	NC_021902	GCG	4	12	199281	199292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816912
4273	NC_021902	GCAGT	2	10	199306	199315	20 %	20 %	40 %	20 %	528816912
4274	NC_021902	TCG	2	6	199340	199345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816912
4275	NC_021902	CGT	2	6	199365	199370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816912
4276	NC_021902	GTC	2	6	199528	199533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816912
4277	NC_021902	CGG	2	6	199587	199592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816912
4278	NC_021902	ATT	2	6	199670	199675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816912
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4280	NC_021902	GCC	2	6	199843	199848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816913
4281	NC_021902	CGC	3	9	199890	199898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816913
4282	NC_021902	AGC	2	6	199948	199953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816913
4283	NC_021902	GAC	2	6	199997	200002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816913
4284	NC_021902	CGC	2	6	200114	200119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816913
4285	NC_021902	TTC	2	6	200121	200126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816913
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4287	NC_021902	CG	3	6	200145	200150	0 %	0 %	50 %	50 %	528816913
4288	NC_021902	TGA	2	6	200185	200190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816913
4289	NC_021902	CGA	2	6	200330	200335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816913
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4291	NC_021902	CGG	2	6	200414	200419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816913
4292	NC_021902	GTG	2	6	200500	200505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816913
4293	NC_021902	GAT	2	6	200529	200534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816913
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4295	NC_021902	GTG	2	6	200629	200634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816913
4296	NC_021902	ACA	2	6	200662	200667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816913
4297	NC_021902	TGC	2	6	200678	200683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816913
4298	NC_021902	CAGC	2	8	200819	200826	25 %	0 %	25 %	50 %	528816913
4299	NC_021902	CTC	2	6	201005	201010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4300	NC_021902	GCC	2	6	201060	201065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4301	NC_021902	T	6	6	201109	201114	0 %	100 %	0 %	0 %	528816914
4302	NC_021902	CAG	2	6	201121	201126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816914
4303	NC_021902	TGG	2	6	201147	201152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816914
4304	NC_021902	TCA	2	6	201179	201184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816914
4305	NC_021902	TGA	2	6	201207	201212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816914
4306	NC_021902	GCG	2	6	201236	201241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816914
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4313	NC_021902	CTC	2	6	201556	201561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816914
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4315	NC_021902	CG	3	6	201709	201714	0 %	0 %	50 %	50 %	528816914
4316	NC_021902	CGG	2	6	201754	201759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816914
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4330	NC_021902	GAA	2	6	202375	202380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816914
4331	NC_021902	CTG	2	6	202405	202410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816914
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4336	NC_021902	CCG	2	6	202560	202565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816914
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4343	NC_021902	GAC	2	6	202809	202814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816914
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4348	NC_021902	ACC	2	6	202893	202898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816914
4349	NC_021902	AATA	2	8	202906	202913	75 %	25 %	0 %	0 %	528816914
4350	NC_021902	ATA	2	6	202922	202927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816914
4351	NC_021902	CTT	2	6	203030	203035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4352	NC_021902	TGTAG	2	10	203101	203110	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4353	NC_021902	AG	3	6	203194	203199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4354	NC_021902	A	7	7	203236	203242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4355	NC_021902	TTG	2	6	203313	203318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4356	NC_021902	CCT	2	6	203422	203427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4357	NC_021902	CTG	2	6	203546	203551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816915
4358	NC_021902	TTA	2	6	203577	203582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816915
4359	NC_021902	ATC	2	6	203687	203692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816915
4360	NC_021902	AT	3	6	203698	203703	50 %	50 %	0 %	0 %	528816915
4361	NC_021902	GCT	2	6	203707	203712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816915
4362	NC_021902	GC	3	6	203828	203833	0 %	0 %	50 %	50 %	528816915
4363	NC_021902	CGG	2	6	203835	203840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816915
4364	NC_021902	CAA	2	6	203843	203848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816915
4365	NC_021902	A	6	6	203877	203882	100 %	0 %	0 %	0 %	528816915
4366	NC_021902	CCG	2	6	203995	204000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816915
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4368	NC_021902	GCC	2	6	204024	204029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816915
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4490	NC_021902	CGC	2	6	209333	209338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816919
4491	NC_021902	CTG	2	6	209347	209352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816919
4492	NC_021902	CCG	2	6	209380	209385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816919
4493	NC_021902	CGT	2	6	209388	209393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816919
4494	NC_021902	CGT	2	6	209397	209402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816919
4495	NC_021902	GCGG	2	8	209410	209417	0 %	0 %	75 %	25 %	528816919
4496	NC_021902	ATT	2	6	209521	209526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816919
4497	NC_021902	GGC	2	6	209545	209550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816919
4498	NC_021902	TCT	2	6	209564	209569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816919
4499	NC_021902	GATG	2	8	209580	209587	25 %	25 %	50 %	0 %	528816919
4500	NC_021902	GT	3	6	209653	209658	0 %	50 %	50 %	0 %	528816919

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