MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021902	GCG	2	6	67725	67730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816780
1502	NC_021902	TCAC	2	8	67739	67746	25 %	25 %	0 %	50 %	528816780
1503	NC_021902	CAT	2	6	67900	67905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816780
1504	NC_021902	CTG	2	6	67983	67988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816780
1505	NC_021902	CTT	2	6	68013	68018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816780
1506	NC_021902	CCG	2	6	68038	68043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816780
1507	NC_021902	CGT	2	6	68055	68060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816780
1508	NC_021902	T	6	6	68060	68065	0 %	100 %	0 %	0 %	528816780
1509	NC_021902	ATGG	2	8	68088	68095	25 %	25 %	50 %	0 %	528816780
1510	NC_021902	GAG	2	6	68152	68157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528816782
1511	NC_021902	G	6	6	68169	68174	0 %	0 %	100 %	0 %	528816782
1512	NC_021902	TCC	2	6	68199	68204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816782
1513	NC_021902	CG	3	6	68218	68223	0 %	0 %	50 %	50 %	528816782
1514	NC_021902	CGG	2	6	68281	68286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816782
1515	NC_021902	ATC	2	6	68346	68351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816782
1516	NC_021902	GC	3	6	68361	68366	0 %	0 %	50 %	50 %	528816782
1517	NC_021902	CCG	2	6	68391	68396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816782
1518	NC_021902	AAC	2	6	68416	68421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816781
1519	NC_021902	TAA	2	6	68426	68431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816781
1520	NC_021902	T	6	6	68469	68474	0 %	100 %	0 %	0 %	528816781
1521	NC_021902	ATC	2	6	68475	68480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816781
1522	NC_021902	TCAT	2	8	68483	68490	25 %	50 %	0 %	25 %	528816781
1523	NC_021902	GTTG	2	8	68493	68500	0 %	50 %	50 %	0 %	528816781
1524	NC_021902	ATG	2	6	68512	68517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816781
1525	NC_021902	A	8	8	68633	68640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021902	ATG	2	6	68743	68748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021902	CCAAAG	2	12	68866	68877	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	528816783
1528	NC_021902	GGC	2	6	68882	68887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816783
1529	NC_021902	TTGCCG	2	12	68940	68951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816783
1530	NC_021902	TGG	2	6	68997	69002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816783
1531	NC_021902	AGAA	2	8	69027	69034	75 %	0 %	25 %	0 %	528816783
1532	NC_021902	GCT	2	6	69133	69138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816783
1533	NC_021902	CTT	2	6	69290	69295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_021902	CTG	2	6	69336	69341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816784
1535	NC_021902	GCG	2	6	69388	69393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816784
1536	NC_021902	A	6	6	69424	69429	100 %	0 %	0 %	0 %	528816784
1537	NC_021902	CGA	2	6	69431	69436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816784
1538	NC_021902	GCTG	2	8	69605	69612	0 %	25 %	50 %	25 %	528816784
1539	NC_021902	CTG	2	6	69651	69656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816784
1540	NC_021902	AACG	2	8	69714	69721	50 %	0 %	25 %	25 %	528816784
1541	NC_021902	TAA	2	6	69738	69743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816784
1542	NC_021902	CCTTG	2	10	69747	69756	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1543	NC_021902	T	6	6	69778	69783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021902	TA	3	6	69863	69868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021902	GAA	2	6	69920	69925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021902	TGG	2	6	69966	69971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816785
1547	NC_021902	CGG	2	6	70042	70047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816785
1548	NC_021902	TAT	2	6	70048	70053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816785
1549	NC_021902	TCG	2	6	70065	70070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1550	NC_021902	GCG	2	6	70092	70097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816785
1551	NC_021902	TGC	2	6	70101	70106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1552	NC_021902	GGT	2	6	70288	70293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816785
1553	NC_021902	TGG	2	6	70383	70388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816785
1554	NC_021902	GAGGCG	2	12	70487	70498	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	528816785
1555	NC_021902	CT	3	6	70513	70518	0 %	50 %	0 %	50 %	528816785
1556	NC_021902	TCAT	2	8	70528	70535	25 %	50 %	0 %	25 %	528816785
1557	NC_021902	AAT	2	6	70577	70582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816785
1558	NC_021902	CGA	2	6	70645	70650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1559	NC_021902	CAGG	2	8	70685	70692	25 %	0 %	50 %	25 %	528816785
1560	NC_021902	CTG	2	6	70697	70702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1561	NC_021902	TCG	2	6	70707	70712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1562	NC_021902	CG	3	6	70779	70784	0 %	0 %	50 %	50 %	528816785
1563	NC_021902	GTC	2	6	70811	70816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1564	NC_021902	CG	3	6	70898	70903	0 %	0 %	50 %	50 %	528816785
1565	NC_021902	CAG	2	6	70921	70926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1566	NC_021902	TGG	2	6	70962	70967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816785
1567	NC_021902	GCA	2	6	71014	71019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1568	NC_021902	CAG	2	6	71027	71032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1569	NC_021902	TGC	2	6	71040	71045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1570	NC_021902	GTT	2	6	71092	71097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816785
1571	NC_021902	GCTG	2	8	71131	71138	0 %	25 %	50 %	25 %	528816785
1572	NC_021902	GCA	2	6	71178	71183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1573	NC_021902	GCC	2	6	71206	71211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816785
1574	NC_021902	CGG	2	6	71278	71283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816785
1575	NC_021902	TCA	2	6	71343	71348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816785
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1577	NC_021902	CCA	2	6	71481	71486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816785
1578	NC_021902	GCG	2	6	71487	71492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816785
1579	NC_021902	CGG	2	6	71493	71498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816785
1580	NC_021902	CT	3	6	71501	71506	0 %	50 %	0 %	50 %	528816785
1581	NC_021902	TAT	2	6	71542	71547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816785
1582	NC_021902	CTG	2	6	71558	71563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816785
1583	NC_021902	T	6	6	71571	71576	0 %	100 %	0 %	0 %	528816785
1584	NC_021902	CG	3	6	71649	71654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_021902	CTT	3	9	71677	71685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_021902	TCT	2	6	71687	71692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_021902	T	7	7	71742	71748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021902	AGTT	2	8	71750	71757	25 %	50 %	25 %	0 %	528816786
1589	NC_021902	TCT	2	6	71763	71768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816786
1590	NC_021902	T	8	8	71774	71781	0 %	100 %	0 %	0 %	528816786
1591	NC_021902	GGT	2	6	71792	71797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816786
1592	NC_021902	AAT	2	6	71818	71823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816786
1593	NC_021902	TGAAA	2	10	71860	71869	60 %	20 %	20 %	0 %	528816786
1594	NC_021902	TGC	2	6	71944	71949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816787
1595	NC_021902	CAA	2	6	71972	71977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816787
1596	NC_021902	AACG	2	8	71996	72003	50 %	0 %	25 %	25 %	528816787
1597	NC_021902	GTC	2	6	72028	72033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_021902	GGC	2	6	72132	72137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816788
1599	NC_021902	CTG	2	6	72193	72198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816788
1600	NC_021902	TTG	2	6	72205	72210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816788
1601	NC_021902	GCGG	2	8	72220	72227	0 %	0 %	75 %	25 %	528816788
1602	NC_021902	ATC	2	6	72316	72321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816788
1603	NC_021902	TGA	2	6	72332	72337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816788
1604	NC_021902	GCT	2	6	72451	72456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816789
1605	NC_021902	CAC	2	6	72491	72496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816789
1606	NC_021902	GATG	2	8	72589	72596	25 %	25 %	50 %	0 %	528816789
1607	NC_021902	TCATG	2	10	72622	72631	20 %	40 %	20 %	20 %	528816789
1608	NC_021902	TCGC	2	8	72665	72672	0 %	25 %	25 %	50 %	528816789
1609	NC_021902	GTGA	2	8	72754	72761	25 %	25 %	50 %	0 %	528816790
1610	NC_021902	GTC	2	6	72775	72780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816790
1611	NC_021902	TTG	2	6	72865	72870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528816790
1612	NC_021902	CGGAA	2	10	72880	72889	40 %	0 %	40 %	20 %	528816790
1613	NC_021902	CAG	2	6	72914	72919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816790
1614	NC_021902	TGA	2	6	72996	73001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816790
1615	NC_021902	CAG	2	6	73009	73014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816790
1616	NC_021902	GCG	2	6	73019	73024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816790
1617	NC_021902	TTA	2	6	73087	73092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816790
1618	NC_021902	GCG	3	9	73100	73108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816790
1619	NC_021902	T	6	6	73168	73173	0 %	100 %	0 %	0 %	528816790
1620	NC_021902	ACT	2	6	73175	73180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816790
1621	NC_021902	CGC	2	6	73184	73189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816790
1622	NC_021902	AGC	2	6	73217	73222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816790
1623	NC_021902	TCGC	2	8	73224	73231	0 %	25 %	25 %	50 %	528816790
1624	NC_021902	GGA	2	6	73233	73238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528816790
1625	NC_021902	TGC	2	6	73250	73255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816790
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1627	NC_021902	GCC	2	6	73390	73395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816791
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