MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_021902	CGC	2	6	511353	511358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817216
11003	NC_021902	CGC	2	6	511385	511390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817216
11004	NC_021902	GCC	2	6	511418	511423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817216
11005	NC_021902	AGA	2	6	511527	511532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817216
11006	NC_021902	CAG	2	6	511564	511569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817216
11007	NC_021902	GCG	2	6	511577	511582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817216
11008	NC_021902	ATT	2	6	511588	511593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528817216
11009	NC_021902	GCG	2	6	511630	511635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817216
11010	NC_021902	CTC	2	6	511701	511706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528817216
11011	NC_021902	CAT	2	6	511801	511806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817216
11012	NC_021902	GTG	3	9	511837	511845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817216
11013	NC_021902	TGA	2	6	511854	511859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817216
11014	NC_021902	GCC	2	6	511901	511906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817216
11015	NC_021902	CCG	2	6	511942	511947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817216
11016	NC_021902	CAT	2	6	511953	511958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817216
11017	NC_021902	CAA	2	6	512004	512009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817216
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11019	NC_021902	CTA	2	6	512151	512156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817216
11020	NC_021902	GAC	2	6	512215	512220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817216
11021	NC_021902	CTGC	2	8	512221	512228	0 %	25 %	25 %	50 %	528817216
11022	NC_021902	GCA	2	6	512318	512323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817216
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11027	NC_021902	CCCG	2	8	512459	512466	0 %	0 %	25 %	75 %	528817216
11028	NC_021902	GGT	2	6	512550	512555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817216
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11032	NC_021902	TCG	2	6	512729	512734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817216
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11052	NC_021902	CGG	2	6	513591	513596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817216
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11054	NC_021902	ACG	2	6	513638	513643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817216
11055	NC_021902	ACG	2	6	513764	513769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817216
11056	NC_021902	CCTG	2	8	513817	513824	0 %	25 %	25 %	50 %	528817216
11057	NC_021902	AC	3	6	513876	513881	50 %	0 %	0 %	50 %	528817216
11058	NC_021902	TGGC	2	8	514048	514055	0 %	25 %	50 %	25 %	528817216
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11060	NC_021902	TCTT	2	8	514141	514148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11061	NC_021902	GAAG	2	8	514168	514175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_021902	GGC	2	6	514199	514204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_021902	CAG	2	6	514263	514268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11091	NC_021902	GGC	2	6	515639	515644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817217
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11102	NC_021902	AGTGA	2	10	516284	516293	40 %	20 %	40 %	0 %	528817218
11103	NC_021902	CGA	2	6	516343	516348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817218
11104	NC_021902	GGCA	2	8	516379	516386	25 %	0 %	50 %	25 %	528817218
11105	NC_021902	GC	3	6	516418	516423	0 %	0 %	50 %	50 %	528817218
11106	NC_021902	CAG	2	6	516452	516457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817218
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11109	NC_021902	CGC	2	6	516533	516538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817218
11110	NC_021902	CCAG	2	8	516709	516716	25 %	0 %	25 %	50 %	528817218
11111	NC_021902	TAA	2	6	516743	516748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817218
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11113	NC_021902	TAA	2	6	516794	516799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_021902	ATG	2	6	516839	516844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_021902	GAC	2	6	516882	516887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_021902	ATT	2	6	516942	516947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_021902	A	7	7	517022	517028	100 %	0 %	0 %	0 %	528817219
11118	NC_021902	A	6	6	517052	517057	100 %	0 %	0 %	0 %	528817219
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11120	NC_021902	AAC	2	6	517128	517133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817219
11121	NC_021902	ATA	2	6	517251	517256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817219
11122	NC_021902	TCA	2	6	517260	517265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817219
11123	NC_021902	A	7	7	517265	517271	100 %	0 %	0 %	0 %	528817219
11124	NC_021902	GC	3	6	517325	517330	0 %	0 %	50 %	50 %	528817219
11125	NC_021902	GTGAAT	2	12	517350	517361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817219
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11129	NC_021902	TAA	2	6	517580	517585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817220
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11151	NC_021902	CTT	3	9	518492	518500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817221
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11153	NC_021902	T	6	6	518562	518567	0 %	100 %	0 %	0 %	528817221
11154	NC_021902	GAC	2	6	518596	518601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817221
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11158	NC_021902	CTT	2	6	518949	518954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817222
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11162	NC_021902	CGC	2	6	519087	519092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817222
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11229	NC_021902	GACC	2	8	521629	521636	25 %	0 %	25 %	50 %	528817225
11230	NC_021902	CAG	2	6	521681	521686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817225
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11232	NC_021902	ACCAG	2	10	521742	521751	40 %	0 %	20 %	40 %	528817225
11233	NC_021902	CAG	2	6	521753	521758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817225
11234	NC_021902	CAG	2	6	521840	521845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817225
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11241	NC_021902	ATG	2	6	522207	522212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817225
11242	NC_021902	TGG	2	6	522349	522354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817225
11243	NC_021902	GTT	2	6	522360	522365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817225
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11254	NC_021902	TGT	2	6	522865	522870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11256	NC_021902	GTT	2	6	522919	522924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11257	NC_021902	TGT	2	6	522996	523001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11260	NC_021902	CCG	2	6	523106	523111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11261	NC_021902	CCG	2	6	523131	523136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11262	NC_021902	TA	3	6	523218	523223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11274	NC_021902	CAC	2	6	523854	523859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817227
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11307	NC_021902	CGGT	2	8	525126	525133	0 %	25 %	50 %	25 %	528817227
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11315	NC_021902	ATA	2	6	525599	525604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817228
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11327	NC_021902	CGT	2	6	526105	526110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817229
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11330	NC_021902	AAG	2	6	526243	526248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817229
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11342	NC_021902	CTT	2	6	526926	526931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817229
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11350	NC_021902	ATG	2	6	527248	527253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817230
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11356	NC_021902	AAT	2	6	527407	527412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11357	NC_021902	CGG	2	6	527441	527446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817231
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11361	NC_021902	GCT	2	6	527658	527663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817232
11362	NC_021902	ATA	2	6	527672	527677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817232
11363	NC_021902	CGT	2	6	527707	527712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817232
11364	NC_021902	AAT	2	6	527754	527759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817232
11365	NC_021902	CTTT	2	8	527769	527776	0 %	75 %	0 %	25 %	528817232
11366	NC_021902	ATA	2	6	527797	527802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817232
11367	NC_021902	CAG	2	6	527814	527819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817232
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11369	NC_021902	ATA	2	6	527869	527874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817232
11370	NC_021902	GAT	2	6	527881	527886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817232
11371	NC_021902	T	6	6	527925	527930	0 %	100 %	0 %	0 %	528817232
11372	NC_021902	T	7	7	527955	527961	0 %	100 %	0 %	0 %	528817232
11373	NC_021902	CGA	2	6	528033	528038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817232
11374	NC_021902	CGC	2	6	528051	528056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817232
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11382	NC_021902	GCA	2	6	528665	528670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817232
11383	NC_021902	GAA	2	6	528724	528729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528817232
11384	NC_021902	AAT	2	6	528740	528745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528817232
11385	NC_021902	AGT	2	6	528747	528752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817232
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11394	NC_021902	AT	3	6	529138	529143	50 %	50 %	0 %	0 %	528817233
11395	NC_021902	ATG	2	6	529150	529155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817233
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11399	NC_021902	AT	3	6	529266	529271	50 %	50 %	0 %	0 %	528817233
11400	NC_021902	TA	3	6	529299	529304	50 %	50 %	0 %	0 %	528817233
11401	NC_021902	ACA	2	6	529423	529428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817233
11402	NC_021902	CG	3	6	529511	529516	0 %	0 %	50 %	50 %	528817233
11403	NC_021902	CGAT	2	8	529627	529634	25 %	25 %	25 %	25 %	528817233
11404	NC_021902	CAC	2	6	529731	529736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817233
11405	NC_021902	AATCC	2	10	529751	529760	40 %	20 %	0 %	40 %	528817233
11406	NC_021902	AAC	2	6	529809	529814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528817233
11407	NC_021902	TGA	2	6	529841	529846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528817233
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11409	NC_021902	ACG	2	6	530112	530117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817234
11410	NC_021902	A	6	6	530202	530207	100 %	0 %	0 %	0 %	528817234
11411	NC_021902	GACAGC	2	12	530216	530227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817234
11412	NC_021902	AAT	2	6	530340	530345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11413	NC_021902	AAG	2	6	530364	530369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11414	NC_021902	CAG	2	6	530420	530425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11415	NC_021902	A	6	6	530455	530460	100 %	0 %	0 %	0 %	528817235
11416	NC_021902	AT	3	6	530483	530488	50 %	50 %	0 %	0 %	528817235
11417	NC_021902	AAAT	2	8	530564	530571	75 %	25 %	0 %	0 %	528817235
11418	NC_021902	TCC	2	6	530573	530578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528817235
11419	NC_021902	CCA	2	6	530655	530660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528817235
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11423	NC_021902	GCC	2	6	530803	530808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817236
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11430	NC_021902	GCC	2	6	531058	531063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817236
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11432	NC_021902	GCG	2	6	531150	531155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817236
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11434	NC_021902	GTC	2	6	531208	531213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817236
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11441	NC_021902	GCC	2	6	531457	531462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817237
11442	NC_021902	ATCA	2	8	531490	531497	50 %	25 %	0 %	25 %	528817237
11443	NC_021902	TTG	2	6	531539	531544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817237
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11445	NC_021902	GCGCC	2	10	531636	531645	0 %	0 %	40 %	60 %	528817237
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11450	NC_021902	CAGCG	2	10	531863	531872	20 %	0 %	40 %	40 %	528817237
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11454	NC_021902	CTC	2	6	532069	532074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528817237
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11457	NC_021902	AGC	2	6	532196	532201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817237
11458	NC_021902	CCG	2	6	532427	532432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817237
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11465	NC_021902	CG	3	6	532717	532722	0 %	0 %	50 %	50 %	528817239
11466	NC_021902	GCT	2	6	532769	532774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817239
11467	NC_021902	GCC	2	6	532878	532883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817239
11468	NC_021902	GCT	2	6	532924	532929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528817239
11469	NC_021902	T	7	7	532957	532963	0 %	100 %	0 %	0 %	528817239
11470	NC_021902	CGC	2	6	532981	532986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817239
11471	NC_021902	TTTC	2	8	532990	532997	0 %	75 %	0 %	25 %	528817239
11472	NC_021902	CTTC	2	8	533008	533015	0 %	50 %	0 %	50 %	528817239
11473	NC_021902	T	7	7	533041	533047	0 %	100 %	0 %	0 %	528817239
11474	NC_021902	TCA	2	6	533052	533057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817239
11475	NC_021902	CATC	2	8	533074	533081	25 %	25 %	0 %	50 %	528817239
11476	NC_021902	TCA	2	6	533119	533124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528817239
11477	NC_021902	GTG	2	6	533193	533198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817239
11478	NC_021902	GCC	2	6	533258	533263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817239
11479	NC_021902	TGG	2	6	533298	533303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817239
11480	NC_021902	GGT	2	6	533411	533416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528817239
11481	NC_021902	CGA	2	6	533563	533568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528817239
11482	NC_021902	GTT	2	6	533622	533627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817240
11483	NC_021902	TC	3	6	533650	533655	0 %	50 %	0 %	50 %	528817240
11484	NC_021902	GTT	2	6	533683	533688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528817240
11485	NC_021902	GGC	2	6	533698	533703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817240
11486	NC_021902	CGC	2	6	533709	533714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11487	NC_021902	TGCG	2	8	533762	533769	0 %	25 %	50 %	25 %	528817240
11488	NC_021902	CCG	2	6	533792	533797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528817240
11489	NC_021902	CGG	2	6	533824	533829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817240
11490	NC_021902	GGC	2	6	533833	533838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817240
11491	NC_021902	GCG	2	6	533859	533864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817240
11492	NC_021902	GCG	2	6	533913	533918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817240
11493	NC_021902	CGG	3	9	533961	533969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817240
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11495	NC_021902	TCT	2	6	534036	534041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528817240
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11498	NC_021902	CCAGT	2	10	534148	534157	20 %	20 %	20 %	40 %	528817240
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11500	NC_021902	GGC	2	6	534313	534318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528817240

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